Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_016459.4
Sequence Length
925 nt
GC Content
0.5838
ACACACACAUCUGCACCUCAACCACAGACUACACUUGCUGAACUGGCUCCUGGGGCCAUGAGGCUGUCACUGCCACUGCUGCUGCUGCUGCUGGGAGCCUGGGCCAUCCCAGGGGGCCUCGGGGACAGGGCGCCACUCACAGCCACAGCCCCACAACUGGAUGAUGAGGAGAUGUACUCAGCCCACAUGCCCGCUCACCUGCGCUGUGAUGCCUGCAGAGCUGUGGCUUACCAGAUGUGGCAAAAUCUGGCAAAGGCAGAGACCAAACUUCAUACCUCAAACUCUGGGGGGCGGCGGGAGCUGAGCGAGUUGGUCUACACGGAUGUCCUGGACCGGAGCUGCUCCCGGAACUGGCAGGACUACGGAGUUCGAGAAGUGGACCAAGUGAAACGUCUCACAGGCCCAGGACUUAGCGAGGGGCCAGAGCCAAGCAUCAGCGUGAUGGUCACAGGGGGCCCCUGGCCUACCAGGCUCUCCAGGACAUGUUUGCACUACUUGGGGGAGUUUGGAGAAGACCAGAUCUAUGAAGCCCACCAACAAGGCCGAGGGGCUCUGGAGGCAUUGCUAUGUGGGGGACCCCAGGGGGCCUGCUCAGAGAAGGUGUCAGCCACAAGAGAAGAGCUCUAGUCCUGGACUCUACCCUCCUCUGAAAGAAGCUGGGGCUUGCUCUGACGGUCUCCACUCCCGUCUGCAGGCAGCCAGGAGGGCAGGAAGCCCUUGCUCUGUGCUGCCAUCCUGCCUCCCUCCUCCAGCCUCAGGGCACUCGGGCCUGGGUGGGAGUCAACGCCUUCCCCUCUGGACUCAAAUAAAACCCAGUGACCUCACUUCUUUUCUCUGCAAAAGGUGCUUGUGGGGCUGGGAGUGCAGACAUUGGUGUUUCUGCUGAUGUCCCUUGUGAAAAAAAAAAAAAAACUCUCAAAAUCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-358.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -376.00
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.91
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((((.(((.....((((..((((((((..(((((..((((((.((((((..((.((((((..((.(((..((.((....)).))))).))((((((....))))))((((((.(....).)))).))....)))))).))))))))((..(((....((((........))))..)))..))..((((((.((.((((((....(((.(((((((.((.(((.((((((........))))))..))).)).))....................))))).)))))))))..)).))))))..(((((((((.(((((((((((..((((..(((....)))..))))))))))......)))))....)))))))))((((......)))).(((((.............))))).))))))....)))))))).))))).(..((((..(((((....)))))..))))..)..(((((((((((....((((((((((((......)))))....(((..((((((....((((.((((((....(((((((.(((....((((((......(((((((.(.((((((.((((.(((((......(((.(((....((((...)))).....))).))).......))))).)))).)))))))))))))).))))))...)))(((((((((((((((.....))))))...))).))))))....)))))))))))))..))))((((.(.....).))))))))))..)))....))))))).................(((((...((((((..(((((.......))))).....)))))))))))))))))))))))))).....))).)))))....))))............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{{{{,,.{(((((((({.((((({....{.((((((({...{(.((((((({({.((((((,.((((((((({,{((.(((((({{.(({((((((((((....)))))},((((({,{{..|{||||{|{.,....(((((((((.(({....}))....((((........)))}.,.,|,,|{{.,((||,...|||{,}}}..)}..)))).)))))))))..((((((.,......))))))....||,.|(({{{,,.{{|....{||{,..,}}),))}}}||||,}.,)))).}}}}}}||||||,{.{||,|||||||..||,|}}|||}}}})))..,})))))|||,....,)))),,,.,)))),)},))))).,.))))))..)})))))))))))))))).(((....)))..((.,,.}}((((.((((((.(((((((.,,||}|,.((((((((((((((...,(....}}...)))}))))))))))).,.,{.|{{{,....(((..((((((..,.{((({(((({(,,..(((((({.{((...,((((((......(((((((.{.((((((.{(((.(((((....{(((,{(((.{{{(,,,.}}))))}}...})},))).......))))).)))}.))))))}))))))).}))))}...)))(((((((((((((((.....)))))}..,))).))))))....))))))))))))),.|||}|||}}}.,...)})))}))))))..))}......,,,.,))})).}}}........))).))))))))))..{{{{,....,.}}}}))}),))))))...)))).)))))|{(((((((,....,)))))))),...))))............................
Back