Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_016464.5
Sequence Length
1475 nt
GC Content
0.4773
GGAAGCCGGGACGAUGUCCGCAUGACAACCGACGUUGGAGUUUGGAGGUGCUUGCCUUAGAGCAAGGGAAACAGCUCUCAUUCAAAGGAACUAGAAGCCUCUCCCUCAGUGGUAGGGAGACAGCCAGGAGCGGUUUUCUGGGAACUGUGGGAUGUGCCCUUGGGGGCCCGAGAAAACAGAAGGAAGAUGCUCCAGACCAGUAACUACAGCCUGGUGCUCUCUCUGCAGUUCCUGCUGCUGUCCUAUGACCUCUUUGUCAAUUCCUUCUCAGAACUGCUCCAAAAGACUCCUGUCAUCCAGCUUGUGCUCUUCAUCAUCCAGGAUAUUGCAGUCCUCUUCAACAUCAUCAUCAUUUUCCUCAUGUUCUUCAACACCUUCGUCUUCCAGGCUGGCCUGGUCAACCUCCUAUUCCAUAAGUUCAAAGGGACCAUCAUCCUGACAGCUGUGUACUUUGCCCUCAGCAUCUCCCUUCAUGUCUGGGUCAUGAACUUACGCUGGAAAAACUCCAACAGCUUCAUAUGGACAGAUGGACUUCAAAUGCUGUUUGUAUUCCAGAGACUAGCAGCAGUGUUGUACUGCUACUUCUAUAAACGGACAGCCGUAAGACUAGGCGAUCCUCACUUCUACCAGGACUCUUUGUGGCUGCGCAAGGAGUUCAUGCAAGUUCGAAGGUGACCUCUUGUCACACUGAUGGAUACUUUUCCUUCCUGAUAGAAGCCACAUUUGCUGCUUUGCAGGGAGAGUUGGCCCUAUGCAUGGGCAAACAGCUGGACUUUCCAAGGAAGGUUCAGACUAGCUGUGUUCAGCAUUCAAGAAGGAAGAUCCUCCCUCUUGCACAAUUAGAGUGUCCCCAUCGGUCUCCAGUGCGGCAUCCCUUCCUUGCCUUCUACCUCUGUUCCACCCCCUUUCCUUCCUUUCCUCUCUGUACCAUUCAUUCUCCCUGACCGGCCUUUCUUGCCGAGGGUUCUGUGGCUCUUACCCUUGUGAAGCUUUUCCUUUAGCCUGGGACAGAAGGACCUCCCAGCCCCCAAAGGAUCUCCCAGUGACCAAAGGAUGCGAAGAGUGAUAGUUACGUGCUCCUGACUGAUCACACCGCAGACAUUUAGAUUUUUAUACCCAAGGCACUUUAAAAAAAUGUUUUAUAAAUAGAGAAUAAAUUGAAUUCUUGUUCCAUAAAUGGGGGAGUCUGUCUGUCUAGCUAGAUCUCUUCAUGUUAAGAGGCGUGCCAAGGUCCAGCUUAACAUCUACUUGACCCAGAGGGAAGAUGGAGCCACAGAUGAAAUACAGAUCUUUGUUGAGAUCCAUUAUGAGUACAAAGUAUUUUAGCAGAAAUUCAAGAUGGAAUCUGAUGCUGCAUCCCCCACUCCUGGAGCUCCAGAUGUGUGUGCUCUGUUCAGACUCUCUUUCCUUAUCAGAAGCCUUAACUGCCCUCAGAAGAAUAAAAAUAUUCCCUUAGCCAGCUUUGGCAAAAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-433.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -462.03
Frequency: 0.0000
Diversity: 423.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((((((((((.(........).)))))))(((..((((((((.(((....(((((((((((((..(((((..(((....)))..)).))).((((((((....).)))))))......((((((((((((((((..((..(((.....)))...))..))).)))....((((((((((.((.((((...............)))).)))))....(((((....))))).......((((......))))..)))))))..))))))))))....(((....)))....(((....)))...........(((((......))))).................)))))))..)))))).))))))))))).)))(((((....)))))......)))).)))).........((((((....((((.(((...((((((((((((..((((....((((((((.(.(((((((((.(.......((((............)))).......(((((((((((((((...(((((((.((.........)).)))))))(((((((((((..............(((..(((.........)))..)))...((((.((((((((((((((((....)))))))))))).))...))..))))(((((.....)))))(((((((((((((((..(((((((...(((((..(....)..))))).))))))).(((.((((.......)))).)))((((((((((((....)))))))))).)).((((....))))...(((((.(((......))).))))).......)))))))))..))))))...)))))))))))(((.....(((((((((..(((((........((((.(.((((((..((.(((.......(((...((((...((((.......))))))))....)))(((.((((....)))))))...((((((.(.((((((..........))))))...).)))))).....))).))..)))))).).)))).((((((((((.(....).))))).)))))...)))))....))))............)))))..............(((((..(..((((((.......))))))..)..))))).))))))))))))))))))((((.(((((...((((((....))))))...))))).)))).........).))))))))).)))))..))))................((((((....)))))).....))))..))))))))....))))....))).))))((.(((((....((((....(((..((((....))))..))).)))).....))))).))(((((......(((.........)))......)))))..........)))))).((((....))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((.((((.((((.({{((({{,.,({((,{,{((((..,((((((({(((....(({(((((({{,(,,(((((..(((....)))..)),.||.((((((({....}.)))))))..,,..(((((((({{(((((({{{{,,((({{,.{{||...,)}})}},,|,..,,{{,(((((((.((.((((.,..{,....,,.,.)))).)))}).,,.(((((....))))).,,....{(((......)))}..,}}))))}}))))))))))....(((....)))....(((....)))...........(((((...,..)}}}}..................}}}}}}..))))}}.}}})}}}}}}|...,||(((.,.{|||||{{..,....,.,,,,,,..}}|,..,)))}|||,,.|||||{.||||||...}}}||}.||||||}|}}}}}|||}}}}}.}})}))}),,.....||{(|{.....}}}}})}))},,,..,|||{,|||||.........(((((((({.,,..|{({,..((,(((((({...})))))).}))))....}}||}}}}},,,..|,,,|))).||))..,(({{.,,{{((((((((((((....)))))))))))).})..,)}..}}}}(((((.....))))),{{{{{(((((((({..(((((((..,(((((..,....)..))))).))))))).(({.((((.......)))).}))((((((((((((....)))))))))).)).((((....))))...(((((.(((......))).))))).......})))))))).,})))))....,)))}))))))...}})),)},}}}}...,|||................,,,.,.....((((((...((((,...((((...((((.......)))))))).{((((((((((..((((({{{{{(,,.....,{{|||.,,(((((((.((((((((({....,....{{.{{.......},}}...|,.((((..,.((((((((((.{....,.))))),}))))..)))).,|{{{{,..{{{{{{,....,,||{{.,,|...,}},))))||,,..|,,|||{{{,......}}}})},,},.,,,,.)))))).)))).))))))){|||,||{{{...{(((((,,,.|||}}}...)}))).}})),,,}},...}}},}}.,.))))).....)))))))))))}))}.)))))|{(((....|||}{{{{{{.{((({.,...||,,....}},,..}}}}}.}}}))}.(((((.,,.((({....(((..((((....))))..))).)))).,,|.}}))}...,..,,......,})},||,....{{|..,,}||..(((((....))))).,,..{{{|....})))..,,),..
Back