Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016479.6

Sequence Length

2034 nt

GC Content

0.5939

GGGCGGCCGCGCGGAUCACUGAGGCUGUGGCGGCACUGCGCCCGGCGCUCGCGUCCGUCCGCCCGUCCGCCCGCCCAGCCAUGACUGCGCCGGUCCCCGCGCCGCGGAUCCUGUUGCCGUUGCUGUUGCUGCUGCUGCUAACGCCGCCUCCGGGUGCACGUGGUGAGGUGUGUAUGGCUUCCCGUGGACUCAGCCUCUUCCCCGAGUCCUGUCCAGAUUUCUGCUGUGGUACCUGUGAUGACCAAUACUGCUGCUCUGACGUGCUGAAGAAAUUUGUGUGGAGCGAGGAAAGGUGUGCUGUGCCUGAGGCCAGCGUGCCUGCCAGUGUAGAGCCGGUGGAGCAGCUGGGCUCGGCGCUGAGGUUUCGCCCUGGCUACAACGACCCCAUGUCAGGGUUCGGAGCGACCUUGGCCGUUGGCCUGACCAUCUUUGUGCUGUCUGUCGUCACUAUCAUCAUCUGCUUCACCUGCUCCUGCUGCUGCCUUUACAAGACGUGCCGCCGACCACGUCCGGUUGUCACCACCACCACAUCCACCACUGUGGUGCAUGCCCCUUAUCCUCAGCCUCCAAGUGUGCCGCCCAGCUACCCUGGACCAAGCUACCAGGGCUACCACACCAUGCCGCCUCAGCCAGGGAUGCCAGCAGCACCCUACCCAAUGCAGUACCCACCACCUUACCCAGCCCAGCCCAUGGGCCCACCGGCCUACCACGAGACCCUGGCUGGAGGAGCAGCCGCGCCCUACCCCGCCAGCCAGCCUCCUUACAACCCGGCCUACAUGGAUGCCCCGAAGGCGGCCCUCUGAGCAUUCCCUGGCCUCUCUGGCUGCCACUUGGUUAUGUUGUGUGUGUGCGUGAGUGGUGUGCAGGCGCGGUUCCUUACGCCCCAUGUGUGCUGUGUGUGUCCAGGCACGGUUCCUUACGCCCCAUGUGUGCUGUGUGUGUCCUGCCUGUAUAUGUGGCUUCCUCUGAUGCUGACAAGGUGGGGAACAAUCCUUGCCAGAGUGGGCUGGGACCAGACUUUGUUCUCUUCCUCACCUGAAAUUAUGCUUCCUAAAAUCUCAAGCCAAACUCAAAGAAUGGGGUGGUGGGGGGCACCCUGUGAGGUGGCCCCUGAGAGGUGGGGGCCUCUCCAGGGCACAUCUGGAGUUCUUCUCCAGCUUACCCUAGGGUGACCAAGUAGGGCCUGUCACACCAGGGUGGCGCAGCUUUCUGUGUGAUGCAGAUGUGUCCUGGUUUCGGCAGCGUAGCCAGCUGCUGCUUGAGGCCAUGGCUCGUCCCCGGAGUUGGGGGUACCCGUUGCAGAGCCAGGGACAUGAUGCAGGCGAAGCUUGGGAUCUGGCCAAGUUGGACUUUGAUCCUUUGGGCAGAUGUCCCAUUGCUCCCUGGAGCCUGUCAUGCCUGUUGGGGAUCAGGCAGCCUCCUGAUGCCAGAACACCUCAGGCAGAGCCCUACUCAGCUGUACCUGUCUGCCUGGACUGUCCCCUGUCCCCGCAUCUCCCCUGGGACCAGCUGGAGGGCCACAUGCACACACAGCCUAGCUGCCCCCAGGGAGCUCUGCUGCCCUUGCUGGCCCUGCCCUUCCCACAGGUGAGCAGGGCUCCUGUCCACCAGCACACUCAGUUCUCUUCCCUGCAGUGUUUUCAUUUUAUUUUAGCCAAACAUUUUGCCUGUUUUCUGUUUCAAACAUGAUAGUUGAUAUGAGACUGAAACCCCUGGGUUGUGGAGGGAAAUUGGCUCAGAGAUGGACAACCUGGCAACUGUGAGUCCCUGCUUCCCGACACCAGCCUCAUGGAAUAUGCAACAACUCCUGUACCCCAGUCCACGGUGUUCUGGCAGCAGGGACACCUGGGCCAAUGGGCCAUCUGGACCAAAGGUGGGGUGUGGGGCCCUGGAUGGCAGCUCUGGCCCAGACAUGAAUACCUCGUGUUCCUCCUCCCUCUAUUACUGUUUCACCAGAGCUGUCUUAGCUCAAAUCUGUUGUGUUUCUGAGUCUAGGGUCUGUACACUUGUUUAUAAUAAAUGCAAUCGUUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-812.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -849.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 427.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((..(((...((((((.((.((.((((.((((((.((((..((....))..)))).....(((.((.(((......))).)).))).((((.(..((((.....((.((.((.((....)).)).)).)).....))))..))))).(((.((((((.((((((.((((....))))((((((............))))))....(((....)))..(((((....(((((((((.....(.(((((((.(((.............)))..))))).)).).((((((((((.(((...)))))))))))))..(((((((((((.((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((..............))))))))...))..)))))))).))))))))...........(((.((.....)).)))......)).)))))))))).))).)))).)))).........((((((........)))))).))))))))).)))))))))))))))))))))))))))))))).)).))))))..)))..))).)))))))....((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((.((.......((((.(((.....))))))).......)).)))....(((((((..((((....((((((.((((((((((........(((...(((((((((((.((......)))))......)))))))).)))........))))....(((((.((((....(((..(((((((((((.((((((((((.....))))(((....)))........((((((..(((..(((((((((((((((........))).((((((((((.(.(((.(..((.(((((((.....((((.....))))))))))).))..))))).))))))))))..................(((((((((((((((((.(((......))).)))).......)))).....))))))))).......(((((((((..((((((..(..........)..))))))..)))))))))(((((.((((.(((((((.......)))))))))))))))).....((((((.....)))))).(((((....)))))((.....))))))).))))))).((.((.((((((..(((((((.((((..((.((((((((((((((((((........)))))).)))))))..((((.(((((.((((.((((((..((((..((((.((....((((.(.(.((((.((.((.(((((((((.(((((..(((......)))))))).))))..)))))..)))))))).).).))))..)))))))))).((((((......))))))..(((.(((..(((((((((....(((......)))....)))))))))..)))...))).)))).)).))))...))))).))))..)))))))..)))))))))))...)))))))))).((((((((((((..(((((..(((...))).....)).)))..))))))))))))...)))..))))))(((((.(((.((.(((..((((((...........(((.((((...)))).)))...........))))))..)))..))...))))))))((((....))))....))))))....))))))))..)).)..))))))).))))).(((((((((.((.((((((.......(((....((((........))))..)))......))))))..)).)))))))))...)))))).))))))...))))....))))))))))))))))))))))..(((((((((((..(((((((((.....)))))).................))).....))))))))))).))))).................)).)))))))))(((.((..((((...........))))..)).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((((((..(((...((((((.({.((.((((.(((((({((((,.,(,{,.||..}||.,|..,({{.({.{((....,.}}),)),))}.,{||,|,.||||,....((.((.((.((....)).)).)).))...,,)})}..,})))}}|{,((((((.((((((.((((....)))}((((((.{........,.))))))....(((....)))..(((((....(((((((((.....{.,((((((.(({.............})),})))))},},..(((({(((((.(((...))))))))})))){.(((((((((((.((((((((((.(((((.(((((((((((((((((((((((..............))))))))..,)}..})))))))}})))))))|{{{.......{{{..|...,,,}.}},......)).)))))))))).)))},))).)))),,.......((((((........)))))).))))))))).))))))))))))))))),)})))))))))))).}}.))))))..)))..))).))))))).,,.(((((((((({{{{,.((((((((.(((((((.(((.((....,..((((.(((.....))))))).......)).)))....(((((((..((((....((((((.(((((({{((,,......(((...(((((((({((.({......}}}))...,,.)))))))).)))........}})),,..(((((.((((....(((..(((((((((((.{(((((((((.....))))((({{,.|||,,,,,...{,{,{,{|{{||{|||||{||,{{|||{,...,,||))),||||((((((((.(((,{,.((((((.((.....{((((..{{...,}),.))))}.}.)))))))).}}}{(((((.{(....}}.))},}}}(((((((((({{{((((.(((......))).)))).......}})}}},.}})))))))).......(((((((((..((((((..{..........}..))))))..)))))))))(((((.((((.((((((({.....})))))))))))))))).....((((((.....))))))..,(((((.(((((((...{,...},,}))))).)))))))((.((((((..(((((((.((((..((.((((((((((((((((((......,,}))))),,))))))..((((.(((((.((((.(({(((.,(.,,..((((.{{,,{{((((,(.{.((((.(,{((.(((((((((.(((({..(((......)))})))).))))..)))))..)))))))}.,,},)))),})))}|||,{(.((((((......)))))).)).,,|||..{((((((((....(((......)))....))))))))).})))..,,,)))))).)).))))...))))).)))),.))))))),.)))))))))))...)))))),},|,((((((((((((..(({{(.,(({...},,....,)),)))..)))))))))))),..)))))))))))((((,,(((.,,.{{(,,((((((...........{{{.{|||,,.,})),}||,,..,.{,,..}}}}}},.)))..))...))))))))|{{{...,))}}},)})))))}....))))))))..)).)..))))))).))))).(((((((((.((.((((((.......(((....((((........))))..)))......))))))}.)).)))))))))...)))))).))))))...))))....))))))))))))))))))))))..(((((((((((...{(((({((,,,..}}))))},................}),,...))))))))))).||{(.,,.....,}}}.}},..)).))))))))),,|,{{..{{({.......,,.,}}}}..}}.,},.