Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016558.4

Sequence Length

1021 nt

GC Content

0.6758

AGACGGUGUGUUGUACUUUGUCAUCGUCGCAGUAAGGCCGGUGCUAUCGCCCUCCUAGUUUGACCAAGCGAGAGGACUUUCUCCAGAUGGGCCCCUCCCGAGAGAAUGGUCGCCGUCCCGCUCUCCUGUUCGGGUCACCACCGGCCGGGCGCCACUCGAACGAGCCCCGGCCAGCCGUCACCCUAAUCAUUCCCGAAGGAGGGGCCAUCAGAGCUACAGCUCAUCAGGGUCAAUCAGAAGGGGCGCCCGCACGCAAAGGUCACCUACUUUCGCUUCCGGCUGCCGCAGGCGCUUCGCUGGUGCAGACGCAGUGCUGAGCACACAGCUACCGGACAAAGAGUGACGCCCGGAGCUGGAGUUAUGGCGGCUACGGAGCCGAUCUUGGCGGCCACUGGGAGUCCCGCGGCGGUGCCACCGGAGAAACUGGAAGGAGCCGGUUCGAGCUCAGCCCCUGAGCGUAACUGUGUGGGCUCCUCGCUGCCAGAGGCCUCACCGCCUGCCCCUGAGCCUUCCAGUCCCAACGCCGCGGUCCCUGAAGCCAUCCCUACGCCCCGAGCUGCGGCCUCCGCGGCCCUGGAGCUGCCUCUCGGGCCCGCACCCGUGAGCGUAGCGCCUCAGGCCGAAGCUGAAGCGCGCUCCACACCAGGCCCCGCCGGCUCUAGACUCGGUCCCGAGACGUUCCGCCAGCGUUUCCGGCAGUUCCGCUACCAGGAUGCGGCGGGUCCCCGGGAGGCUUUCCGGCAGCUGCGGGAGCUGUCCCGCCAGUGGCUGCGGCCUGACAUCCGCACCAAGGAGCAGAUCGUGGAGAUGCUGGUGCAAGAGCAGCUGCUCGCCAUCCUGCCCGAGGCGGCUCGGGCCCGGCGGAUCCGCCGCCGCACGGAUGUGCGCAUCACUGGCUGAGCGGUGGAGCUGCGGGCGGCCAGGGCCGGGCGCUCUGUGCGGACUGGGGCCAUGAUCGGGCCCGGGGGCCUGAGCCUGGGACCCCACCCCGUGUUAAUGAAAAAUGAGUUUUGGCAGCGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-475.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -490.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 195.49

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.............))))))).((((..((((.((((...((((((.((.(.((((((....(((((....)))))..(((((.(((((((...(.(((((((.((......))..........((((.((..(.(((((((.(((........).))))))))).)..)).))))..))))))).)...)))))))))))).((((....)))).....)))))).)))..))))))...))))((((((........)))).)).((((((((((((.((((((.(((((...))).)).))))))..))...(((((.((((..............))))))))).......))))))..))))((((....))))))))))))((((((((((((((((.((.((((.....))))..)).))))......((((((...))))))....))))).))))))).((((((((((((((((...(((((..(.((.(((..(((((((((.((((.(((.(((((..(((..(((......((((((((.((((..((.((((.((((((((((((.((((......)))).))).)))((((.((((.......)))).)))))))))).....)))).))..)))).))).)))))....((((((((.....))))))))..(((((((((((.((((((((((((((((((((((((.....))).((((((((((((....))))))....))))))(((((((...((((.....((.((((...((((.((.((.(.(((....))).).)))).)))).))))))...)))).)))))))))).)))))))))...((((....))))))))).))))......)))))))))))))).))))))))))))))).....)).)))))))))))).)..)))))...))))))).(((.((((.......)))).)))...............)))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((((((.............))))))).((((....((((((.{{{((((({.{{.(.((((((..,.(((((....})))),.((({(((((((((,{.(,(({((({.,,....|||},|,,..,...((((.((..{.(((((((.(({........).))))))))).}..)).))))..}}}}}}}.},..)))))))))))).((((....)))).....)))))).},}..|||||,{{{{|.|((.{(((({.....,,,|.{|{((((((((((((.((((((.(((((...))).)).))))))..)),{.(((((.((((.{..........,.)))))))))..},...)))))),.}))))}|)},,,,})))))},,})||,}|}}}|,)))))}).))))))....)))),.{(((((({(({...((((((...))))))..}))),....)))))))((((((((((((((((...(((((..(.((.(((..(((((((((.((((.(((.(((((..(((.,(({......((((((((.((((..((.((((.((((((((((((.((((......)))).))).)))((((.((((.......)))).)))))))))).....)))).))..)))).))).)))))..,.((((((((.....)))))))).}(((((((((((,(((((((((((((((((((((((({...,})),(({(((((((((....)))))).,,,}))))}(((((((...((((.,,..((.((((...((((.((.((.(.(((....))).).)))).)))).))))))|.|)))).)))))))))).)))))))))),{((((....)))))}))).)))).,....)))))))))))))).))))))))))))))).....)).)))))))))))).}..)))))..,))))))}.(((.{(((.......)))).)))..............,)))))))))..