Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016582.3

Sequence Length

2506 nt

GC Content

0.6441

AGAGUUUCUCAAGAAGCCGAGAGAGGGACAGAGGCUGAGCCUGGGGGGAGGGCUGCAGGGGACUGAGAGGGGAGUGUAGGCAGUGGGGGUGAGGGGGACAGGGAGGAGGUGGAGAAGACGGCAAGGGGCAGCAGGGUGACUGGGGCAGAGGGAGCCCCCACCCCACGCCCAGGGCAGGCCAGGAGUCAUAAGGAGAGGGGACAACAGGAAGGGGCGACAAACGGGGAGGGGAAAGGGAGGCGGAGGGGCAGCGAAGUGAAGCAGGGAGGGUCGCAGUGUGAACAAGAGUGCGAGGAAGGGUCAAGGUGGAGGGAGGAGAGGGGAGAGUUAGGGAGAAACAGCUGCAGGAGAGGCGCGGGGAGGAAGCCUUAGGGGUGGGGGAAGGGAGAGGGGAGUUGAGAAUUAGGGAGGAGGUGGUAGAGUCCGGGUAGUGAGCGGAGGGACAGGAAGGGUAGGGCAAGAAAGGGAGAGGGGACAGGAGGGAAGGGUGGGCCAAAGCGGUGAGAAAGGAGGGCCAGCCAGUUGGGUGGGGGAGAGGGCCGAGGCCCGGGGGCAGGAGUGCAGGGCUCUGAGGCGGGGAGAGGAGAGGAGAGAAGAGCCGCGGGGGGCCCAGCCCGGAGCCAGGAUGCCCGCGCCGCGCGCCCGGGAGCAGCCCCGCGUGCCCGGGGAGCGCCAGCCGCUGCUGCCUCGCGGUGCGCGGGGCCCUCGACGGUGGCGGCGGGCGGCGGGCGCGGCCGUGCUGCUGGUGGAGAUGCUGGAGCGCGCCGCCUUCUUCGGCGUCACCGCCAACCUCGUGCUGUACCUCAACAGCACCAACUUCAACUGGACCGGCGAGCAGGCGACGCGCGCCGCGCUGGUAUUCCUGGGCGCCUCCUACCUGCUGGCGCCCGUGGGCGGCUGGCUGGCCGACGUGUACCUGGGCCGCUACCGCGCGGUCGCGCUCAGCCUGCUGCUCUACCUGGCCGCCUCGGGCCUGCUGCCCGCCACCGCCUUCCCCGACGGCCGCAGCUCCUUCUGCGGAGAGAUGCCCGCGUCGCCGCUGGGACCUGCCUGCCCCUCGGCCGGCUGCCCGCGCUCCUCGCCCAGCCCCUACUGCGCGCCCGUCCUCUACGCGGGCCUGCUGCUACUCGGCCUGGCCGCCAGCUCCGUCCGGAGCAACCUCACCUCCUUCGGUGCCGACCAGGUGAUGGAUCUCGGCCGCGACGCCACCCGCCGCUUCUUCAACUGGUUUUACUGGAGCAUCAACCUGGGUGCUGUGCUGUCGCUGCUGGUGGUGGCGUUUAUUCAGCAGAACAUCAGCUUCCUGCUGGGCUACAGCAUCCCUGUGGGCUGUGUGGGCCUGGCAUUUUUCAUCUUCCUCUUUGCCACCCCCGUCUUCAUCACCAAGCCCCCGAUGGGCAGCCAAGUGUCCUCUAUGCUUAAGCUCGCUCUCCAAAACUGCUGCCCCCAGCUGUGGCAACGACACUCGGCCAGAGACCGUCAAUGUGCCCGCGUGCUGGCCGACGAGAGGUCUCCCCAGCCAGGGGCUUCCCCGCAAGAGGACAUCGCCAACUUCCAGGUGCUGGUGAAGAUCUUGCCCGUCAUGGUGACCCUGGUGCCCUACUGGAUGGUCUACUUCCAGAUGCAGUCCACCUAUGUCCUGCAGGGUCUUCACCUCCACAUCCCAAACAUUUUCCCAGCCAACCCGGCCAACAUCUCUGUGGCCCUGAGAGCCCAGGGCAGCAGCUACACGAUCCCGGAAGCCUGGCUCCUCCUGGCCAAUGUUGUGGUGGUGCUGAUUCUGGUCCCUCUGAAGGACCGCUUGAUCGACCCUUUACUGCUGCGGUGCAAGCUGCUUCCCUCUGCUCUGCAGAAGAUGGCGCUGGGGAUGUUCUUUGGUUUUACCUCCGUCAUUGUGGCAGGAGUCCUGGAGAUGGAGCGCUUACACUACAUCCACCACAACGAGACCGUGUCCCAGCAGAUUGGGGAGGUCCUGUACAACGCGGCACCACUGUCCAUCUGGUGGCAGAUCCCUCAGUACCUGCUCAUUGGGAUCAGUGAGAUCUUUGCCAGCAUCCCAGGCCUGGAGUUUGCCUACUCAGAGGCCCCGCGCUCCAUGCAGGGCGCCAUCAUGGGCAUCUUCUUCUGCCUGUCGGGGGUGGGCUCACUGUUGGGCUCCAGCCUAGUGGCACUGCUGUCCUUGCCCGGGGGCUGGCUGCACUGCCCCAAGGACUUUGGGAACAUCAACAAUUGCCGGAUGGACCUCUACUUCUUCCUGCUGGCUGGCAUUCAGGCCGUCACGGCUCUCCUAUUUGUCUGGAUCGCUGGACGCUAUGAGAGGGCGUCCCAGGGCCCAGCCUCCCACAGCCGUUUCAGCAGGGACAGGGGCUGAACAGGCCCUAUUCCAGCCCCCUUGCUUCACUCUACCGGACAGACGGCAGCAGUCCCAGCUCUGGUUUCCUUCUCGGUUUAUUCUGUUAGAAUGAAAUGGUUCCCAUAAAUAAGGGGCAUGAGCCCUUCCUCACGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-1170.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1209.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 468.56

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((........))))(((((((((((..((((((.(((((((((.(.((..(((((((.....((((((.((((((.((((((..(((((((.((((((((((((((.....((((((((.((((((.((.((((((......(((((((..(((((((.(((..(((((((.(((((......((((.(.((......(((((.(((((....(((((((((((..(((.(((((.((((.(((((.((.(((((.((((((.(((.((....))....(((.(((((.(((....(((((((((((((((.((((((((((((.....(((((((((((.(((((.(((.((((((((.....((((((.(...(((((..(((.((((......(.((((..((((((..((.(((((((((.(((((.(.(.(((...((((.((((......(((((.((((.((((((((..(((((((((..((((((((..((((((.((..(((.((((((.(((((...((((....)))).(((((.((.(((((((.(.(((((((((((((((.(((((.(((....((((((.(((((((((..(((((((((..((((((((((((.((((...(((..((((((((((((((((((((((.....)).))).))))).)))))))))))).)))...)))))))))(.((((((.(((..(((.((((((((((((.((((((((((.((...))...)))))))))).)).........(((((((......))))))).............)))))).)))))))..))).)))))).).((....)).(((((((..(.....)..)))))))))))))).))))))..)))........)))))))....)).))))))....)))..))).)).)))).))...))))))))))))))).))))))).)).)))))))))))))).))..)))))).(((((........))))))))))))).)).)))))))..)))))......)))))).).))))).)))).))))...)))).)((((((.......)))))))))))))))))))).)).))))))..)))).)......)))))))..)))))(((..((((((((.....)))...)))))..)))).))))))...))))))))..)))))))).....((((((......))))))(((((((.((.(((((((...((.........))....)))))))..((....)))).))))))).))))).)))))).....)))))).)))))).)).)))))))).)))))))).)))))..)))...((((.....))))......))))))))).)))))..)))))))))))....))))).)))((((((((((((..(((.(((.....)))...)))....)).))))).)))))..(((.....))))))))((((...))))))))))..........)))))..))))).((((((((((((((((((((((((((.((((((..(((((((...(((((.(.....).)))))..((((..((....))..))))((((((..((((.(((((......(((((..((.(((((..((((.........((((.((((((......)))))).))))..........)))).....)))))......))..)))))))))).))))..))))))(((((.......)))))((..((((..(((..(.((((((.((.((.(((.(((..(.(((((...))))).)..))))))((((((((.....(((.....(((((((.(((.(((....))).))).))))))).)))......)))))).))...(((....))))))))))))))..)))..))))..)).......)))))))..)).))))))))))..((((((..(((....)))....)))))).))))))))))))))))))))...(((((.((((......))))..))))))).).))))....((((.(((......))).))))))))))))))))))).)))))......)).)))))))..)))))).)).))))))))))))))..(((((.(......).)))))..(..((((((.((.........)).))))).)..)))))))))))))))..((((.(((......)))))))..((((((.(((.(((((((....)))))))..))).)))))))))))(((((((((((((((...((.......)).))))....)))))....))))))...)).)))))))))))))))))).(((......)))...))))))).))...).))))))))).)))))))))))))........((((...)))).....((((((....))))))))))....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.({(.{((,...|||{((((({{{(((((((((,((({{((({.{{,..||||}.|}}{((((((.....((((((.((((((.((((((..(((((((.((((((((((((((....{(((((((((((((((.((.((((((.,....(((((((.,(,(((((.(((..(((((({{(((((......((((.(.((......(((((.(((((,...(((((((((((..(((.(((((.((((.(((({,((.(((((.((((((.(((.,(.,..,,....{||.(((((.(((....(((((((((((((((,((((({((((((.....(((((((((((.(((((.{({.((((((((.....((((((.(..,(((((..(((.((((......,.((((..((((((,,,(.(((((((((.(((((.(.(.(((...((((.((((..,...(((((.((((.((((((((..(((((((((..(((((((({,{(((((.((..(((.((((((.(((((...((((....))))((((((.((.{{{({{{|(,({(((((((((((((.(((((.(((..,,{(((((.(((((((((,,(((((((((..((((((((((((.((((...(((..((((((((((((((((((((((.....)).))).))))).)))))))))))).)))...)))))))))(.((((((.(((..(((.((((((((((((.((((((((((.((...))...)))))))))).))}}}......(((((((......)))))))...........}}},,))).)))))))..))).)))))).).((....)).(((((((..(.....)..)))))))))))))).))))))..)))..,.,...)))))))....)).)))))),...)))..))).)).)))).))...))))))))))))))).)))),)).)).)))))))))))))).))..)))))))|((((........)))),}))))))).)).)))))))..)))))......)))))).).))))),)))).))))...)))).)((((((.......)))))))))))))))))))),)).))))))..)))).}......)))))))..)))))|((..((((((((.....)))...)))))..))}).))))))...))))))))..)}}))))).....((((((......)))))){((((({.(((((((({({,,|,..,,,.,}}}}}}..,.,}}}}...,,}}|}}}}.))))))}.)))))})))))).....)))))).)))))).))}}))))))).)))))))).)))))..}}}...((((.....))))......))))))))).)))))..)))))))))))....))))).)))((((((((((((..(((.(((.....)))...)))....))}}}))).)))))..(((.....)))}))}){{{{.,,))))))))))..........)))))..))))).(((((((((((((((((((({{((((,((((((..(((((((...(((((.(.....).))))).,((((..({....})..))))|(((((..((((.(((({......({{{{..,{,{(({,..{{((|........{(((.((((((......)))))).}))},....,,...}))}..,,.}||||......)),,)}}))))))).))))..)))))}(((((.......))))){{..((((..(((..{.((((((.((.{{.{((.(((.,|.(((((...))))).}..)))))}((((((((.....{{{....,(((((((.{{,.{|(.,,.)}),})),))))))).},,..},..)))))).)),..{((....))))}))))))))}..)))..))))..)).....}.)))))))..))}})))}})))),.((((((..(({....)))....)))))).))))))))))))))))))))...(((((.((((......))))..))))))).).))))....{(((.(((......))).)))}))))))))))))))).)))))......),.))))))).,)))))).)).)))))))))))}}|..(((((.(......).)))))..|,.{,((((.,..........,),)))}}.}..})))))))))))))),.((((.(((......)))))))..((((((.(((.(((((((....)))))))..))).)))))))))))(((((((((((((((...((.......)).)))...}))))))....))))))...)).)))))))))))))))))).(((......)))...))))))),}))))).,))))))))))))||{{|||...}))}}},.((((...)))).....{(((((....)))))).)))....