Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016829.3

Sequence Length

2178 nt

GC Content

0.5496

GGUGGUGCUGUGGUCUGCCCCUGGAGAACCCAGAAGAACACAGCUGUGCGCGCCCACAGGCUCUGGGGGCGGGAGAAGAUAAGUCGCAAGGAGGGGGCGGGACCUACACCUCAGGAAAGCCGGAGAAUUGGGGCACGAAGCGGGGCUUUGAUGACCCGCAAAGGGCGAGGCAUGCAGGAGGUGGAGGAAUUAAGUGAAACAGGGAAGGUUGUUAAACAGCACCGUGUGGGCGAGGCCUUAAGGGUCGUGGUCCUUGUCUGGGCGGGGUCUUUGGGCGUCGACGAGGCCUGGUUCUGGGUAGGCGGGGCUACUACGGGGCGGUGCCUGCUGUGGAAAUGCCUGCCCGCGCGCUUCUGCCCAGGCGCAUGGGGCAUCGUACUCUAGCCUCCACUCCUGCCCUGUGGGCCUCCAUCCCGUGCCCUCGCUCUGAGCUGCGCCUGGACCUGGUUCUGCCUUCUGGACAAUCUUUCCGGUGGAGGGAGCAAAGUCCUGCACACUGGAGUGGUGUACUAGCGGAUCAAGUAUGGACACUGACUCAGACUGAGGAGCAGCUCCACUGCACUGUGUACCGAGGAGACAAGAGCCAGGCUAGCAGGCCCACACCAGACGAGCUGGAGGCCGUGCGCAAGUACUUCCAGCUAGAUGUUACCCUGGCUCAACUGUAUCACCACUGGGGUUCCGUGGACUCCCACUUCCAAGAGGUGGCUCAGAAAUUCCAAGGUGUGCGACUGCUGCGACAAGACCCCAUCGAAUGCCUUUUCUCUUUUAUCUGUUCCUCCAACAACAACAUCGCCCGCAUCACUGGCAUGGUGGAGCGGCUGUGCCAGGCUUUUGGACCUCGGCUCAUCCAGCUUGAUGAUGUCACCUACCAUGGCUUCCCCAGCCUGCAGGCCCUGGCUGGGCCAGAGGUGGAGGCUCAUCUCAGGAAGCUGGGCCUGGGCUAUCGUGCCCGUUACGUGAGUGCCAGUGCCCGAGCCAUCCUGGAAGAACAGGGCGGGCUAGCCUGGCUGCAGCAGCUACGAGAGUCCUCAUAUGAGGAGGCCCACAAGGCCCUCUGCAUCCUGCCUGGAGUGGGCACCAAGGUGGCUGACUGCAUCUGCCUGAUGGCCCUAGACAAGCCCCAGGCUGUGCCCGUGGAUGUCCAUAUGUGGCACAUUGCCCAACGUGACUACAGCUGGCACCCUACCACGUCCCAGGCGAAGGGACCGAGCCCCCAGACCAACAAGGAACUGGGAAACUUUUUCCGGAGCCUGUGGGGACCUUAUGCUGGCUGGGCCCAAGCGGCUGGAUCAGAUGCCUCCUGAAGAAUUACAGACUUCUUCCUCUAGACUUGGAGGGCCUCCUUGGCAAUGCAUUUGAUGGCCACCAGCUUCUGCGUCCUCUUAUCUUCUGCCAGGAUCACCUCCGAGAAGGCCCCCCUAUCGGGAGAGGGGAUUCACAAGGUGAAGAACUGGAACCCCAGCUUCCCUCCAGCCUCUCCUCCAUUCCCUAUGGGUUCUGUGACCACUGCUGGACCAAGGACGUGGAUGACCCUCCCCUAGUCACUCAUCCAUCCCCUGGCUCCAGAGAUGGUCACAUGACCCAGGCCUGGCCAGUCAAAGUAGUCUCUCCCCUGGCCACAGUAAUUGGUCAUGUGAUGCAAGCCAGCUUACUAGCACUUUGAGAAUGAGUCUCCUGUUGAGCUGGUAGGAUGUAAGCCUGGAGCUAAUGGCGAUCAUCUUUGCCACCACCUGGGGAGAGCCUGCUUGGGAAUGAAAUUAACACAAAGGAAGUCCAACCUGAGAAAUGGCCAAAUAUAUUUCCUGAUAACAUUAUGUGGCCCUCUGGAUCCAGCCAUGCCUGAGGUCUACCCCUGGGCUUUUGGAUUAUGUGUACAGUUGGUUCAUCCCUUUUUCUGCUAAUUCGAGUCAUGGCUAAUUUAACACCCUUUAGAACCUUAAAGAACCAUCAGCAUCACCCGGGAACUUUUUUAGAAAUGCAAAAUCUCUACUGCUUUGGAUCCUGGGUCAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAUGCAAAACUUUAGGCCCUGCCCCAGAUUUACUAAAUCAAUCUGCAGUUUAACAAAAUCCUCAGGUGAUUUGUAUGCUCAUUGAACUUUAAGAAGCAGUGUUUUAGAACAGGUUCUUAAAAAGGAACAAAUAAACUCAUUUAACUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-842.64 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -878.49

Frequency: 0.0000

Diversity: 616.53

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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