Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_017448.5

Sequence Length

2035 nt

GC Content

0.3956

GAGUCGCACGGAGGGCAACCGUCGACGGGCUUAGCGCCUCAACUGUCGUUGGUGUAUUUUUCUGGUGUCACUUCUGUGCCUUCCUUCAAAGGUUCUCCAAAUGUCAACUGUCAAGGAGCAGCUAAUUGAGAAGCUAAUUGAGGAUGAUGAAAACUCCCAGUGUAAAAUUACUAUUGUUGGAACUGGUGCCGUAGGCAUGGCUUGUGCUAUUAGUAUCUUACUGAAGGAUUUGGCUGAUGAACUUGCCCUUGUUGAUGUUGCAUUGGACAAACUGAAGGGAGAAAUGAUGGAUCUUCAGCAUGGCAGUCUUUUCUUUAGUACUUCAAAGAUUACUUCUGGAAAAGAUUACAGUGUAUCUGCAAACUCCAGAAUAGUUAUUGUCACAGCAGGUGCAAGGCAGCAGGAGGGAGAAACUCGCCUUGCCCUGGUCCAACGUAAUGUGGCUAUAAUGAAAUCAAUCAUUCCUGCCAUAGUCCAUUAUAGUCCUGAUUGUAAAAUUCUUGUUGUUUCAAAUCCAGUGGAUAUUUUGACAUAUAUAGUCUGGAAGAUAAGUGGCUUACCUGUAACUCGUGUAAUUGGAAGUGGUUGUAAUCUAGACUCUGCCCGUUUCCGUUACCUAAUUGGAGAAAAGUUGGGUGUCCACCCCACAAGCUGCCAUGGUUGGAUUAUUGGAGAACAUGGUGAUUCUAGUGUGCCCUUAUGGAGUGGGGUGAAUGUUGCUGGUGUUGCUCUGAAGACUCUGGACCCUAAAUUAGGAACGGAUUCAGAUAAGGAACACUGGAAAAAUAUCCAUAAACAAGUUAUUCAAAGUGCCUAUGAAAUUAUCAAGCUGAAGGGGUAUACCUCUUGGGCUAUUGGACUGUCUGUGAUGGAUUUGGUAGGAUCCAUUUUGAAAAAUCUUAGGAGAGUGCACCCAGUUUCCACCAUGGUUAAGGGAUUAUAUGGAAUAAAAGAAGAACUCUUUCUCAGUAUCCCUUGUGUCUUGGGGCGGAAUGGUGUCUCAGAUGUUGUGAAAAUUAACUUGAAUUCUGAGGAGGAGGCCCUUUUCAAGAAGAGUGCAGAAACACUUUGGAAUAUUCAAAAGGAUCUAAUAUUUUAAAUUAAAGCCUUCUAAUGUUCCACUGUUUGGAGAACAGAAGAUAGCAGGCUGUGUAUUUUAAAUUUUGAAAGUAUUUUCAUUUGAUCUUUAAAAAAUAAAAACAAAUUGGAGACCUGUGACAUAACUCUAGUCUCUCAAGAUUAGAACGAGCAAAUGGUAAAGAGAUUUUCCUCUUUAAGAAUCAUUUAUAGCUCUAUUCUAAUGAUACCCAAUCUGUACAGGUGUAAGUUAUACUUCUGAGGUAUGUCACAUAUGUUAGAGUGCCUUCAGAUGUAGUAGAAUAUGUAUAAUCACUAUAAUACAGAGCUUUGAUUCUUUUCACAAACCAAGCCCUUUUUCUAGUAUUACAAUUUUAUCUUGUACUUUCAUCCGUUAGAGUACCAGCAUAUUCACUUCAUUACAUUAGCGUCAUAUGUUUAUGUAUAAUCAUUAUAAAUGUGGCCGGGCACUGCAGCCUGGGUGAAAGAGUGAGGCUCUGUCUCAAAAAAAAUCAUUAUAAAUGCUUAUUUUUAAGACCAUAUAUAUCAAAAAGAAAUAAAAAGCUGAGUGCUGUGGCUCAUGGCUGUAAUCCCAGUGCUUUGGGAGGGUGAGGCAAGAGGAUCACAUGAGUCCAGGAGUUUGAGACCAGCCUUGGCAACAUAGCAACACCCCAUCUCUACAAAAAUAAAGAAAUUAGAUGUGGUGGCCUGCAUCUGUAGUCCAGCUACUUGGGAGACUGAGACCAGUAGAUAACUUGAGCCCAGGAGUUCAAGGCUAUGAUUGUGUCACUGCACUCCAGCCUGGGCCACAGAGGAAGACUCAGACUCAAAAGAAGAAGAAGAACACAGAAGAAAAGCAGAAACAAGAAGAAGAUACAGAUGUAACUUUACGAUGUAAAAAAUCUAAAUAAGAUUGUAUUCAACUCUGCAAGUAUUAUACUAGUCAUAUAAACUCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-560.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -603.03

Frequency: 0.0000

Diversity: 497.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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