Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_017521.3

Sequence Length

1406 nt

GC Content

0.6679

CUUGUCACCCGCGGUCGCUUCGGGCGGGGAUCGGUGCCACCGAGCGCAAAGCCUGCCUCGCCCCCCUUCCCCGUCCCCCCCAUCUCCCACCGCCCAGUCCCCGGCGGCGAUGAGACAGAGCGGCGCCUCCCAGCCCCUGCUGAUCAACAUGUACCUGCCAGAUCCCGUCGGAGACGGUCUCUUCAAGGACGGGAAGAACCCGAGCUGGGGGCCGCUGAGCCCCGCGGUUCAGAAAGGCAGCGGACAGAUCCAGCUGUGGCAGUUUCUGCUGGAGCUGCUGGCUGACCGCGCGAACGCCGGCUGCAUCGCGUGGGAGGGCGGUCACGGCGAGUUCAAGCUCACGGACCCGGACGAGGUGGCGCGGCGGUGGGGCGAGCGCAAGAGCAAGCCCAACAUGAACUACGACAAGCUGAGCCGCGCCCUGCGCUACUACUACGACAAGAACAUCAUGAGCAAGGUGCAUGGCAAGCGCUACGCCUACCGCUUCGACUUCCAGGGCCUGGCGCAGGCCUGCCAGCCGCCGCCCGCGCACGCUCAUGCCGCCGCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCGGCCGCCCAGGACGGCGCGCUCUACAAGCUGCCCGCCGGCCUCGCCCCGCUGCCCUUCCCCGGCCUCUCCAAACUCAACCUCAUGGCCGCCUCGGCCGGGGUCGCGCCCGCCGGCUUCUCCUACUGGCCGGGCCCGGGCCCCGCCGCCACCGCUGCCGCCGCCACCGCCGCGCUCUACCCCAGUCCCAGCUUGCAGCCCCCGCCCGGGCCCUUCGGGGCCGUGGCCGCAGCCUCGCACUUGGGGGGCCAUUACCACUAGACGGGGCGGUCGGGUGCCUGCGGCCUCGCCCGCACGCCUAGAGUCUCGCCCGAUCCCAUCGGCAUCCCGGGGAGGGCCCGGGAGCCUCCGUCAACCGUCCUCUAAUCCAGAGUUUACUCCACCUGCCGCACUUAGCAGGGGGACGGGACCGAAGCUCCCUCAAUCCUUGUCUGGUACUAGAUUUGCUCCUGUCCCACCCCGCAGUCCCCUGAGGAGGGCGAUGUGCGCCCUCUUUCACUUUUUUUCUUCUAGGUCUCCAGGUCCCGGAGGGGAUUUGUGGACCUCUCUUGUCUCCCCACCACUCCAGUGCAUUUCCGCCUGGCUCCUAGAAGCCCCAUUCAAUAUCACUACUCUUUAACGAGUGCCAAAUCUUUUCCCACUUUUGCUCUUCCCCAAGGAACUGCUCCCACCUCAGCACGUGGAGGCCUCUCACGGUCCUCCUUCCUGGGACCUGAGCAGGUUUGGUGAAAGCCACCGUCCUCCGUGACACACGGCCCCCUUCCUCCUGUCCCCACACUCCCAGGAGAAACUCCCGGUGUGUUUCUGACCCUUUCAGCCCCAUUAAAGCUCCUGAGCUCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-587.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -607.61

Frequency: 0.0000

Diversity: 475.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((((..((((.(((((((((..((.(....((((.(((.....)))))))..)))..)))))))))((((((.(((...(((((........))))).(((.((.(((.(.(((........))))))))).))).....((.(((...(((..(((((...)))))..)))...)))))(((.....)))))).)))))).....)))).)))))).(((((((.(((.(((.......(((((..(((((((((....)))))))))))))).((((((((..((.....)).))))))))(((((((((...((((.(((((((((...((((..((....((((((((((((((((((((((((((.(.((..((.((.(.((........)).).)).))...))).))))))...................(((((((...((((.((((..((((((.((((................)))).)))))).(((......)))))))...))))..)))))))..((.(((((.((.((....)).)).))))).))..(((.(((((.((..........)).))))).))).((((((..(((......(((((...................)))))....)))))))))...(((((((((((.........))))))...)))))...((.((....)).)))))).)))))))))))))..))))).)))).)))))).)))...))))..(((((((((((..((.(((....))).))..)))))))))))..........(((((((.((((((((((.(((((......))))).))..........))))))))))...(((.(((((((.....)))))))))).))))).))))))))).......((((((.((((..((((........))))((((((((((..((((.................(((....(((((((...((((........))))......((((((((((.....))))))))))..........((((((((...(((((...(((((((((.....(((....)))....)))))..(((....)))....)))))))))..))))))))................(((((......))))).)))))))....))).....((..((((....))))..))..((((........))))((((((((((.((((((.......)))))))))).))))))((((.....)))).....(((((...)))))....)))).)))))))))).........))))))))))))).))).)))))))..................((((....))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

........((((((,,(((,.(((((((((..((.(....((((.(((.....)))))))..,))..))))))))){{{{{{.(((.,.(((((........))))).{{(,{{.(((.(,(((......,,||}}}}})).}}}.....{{.(((...(((..(((((...)))))..)))...)))))(((.....))))}),)))))),,,||||||,}}}}))}||||{{{.((({(((,..,..,((((|,,(((((((((....)))))))))))))).|||||{{{..((,,,..}}.}})))))}{{{{|||{{{,|||{(,(((((((((,,,(((,..(({{..(((((((((({((((((((({((((,.{.((..((.{{.{.{{........}}.}.)}.}}.{{||,.})))||..,,{{,.{{,,{{.....{{{((((..{((({.{(((..(({{{{,{{{|...||,,.........}|||.}||}}},{|||,||||||}||}|,..||}}..))))}}|,,((.(({((.((.{{.,,.)).)).))))).))..{||.|||||,|{......,}},)}.}))})|))}.||,..},.||{||.,,,((({{..............,,,..|||}|...,((|{(((((((,(((((((((.........))))},)))).,|||||||||||{{.{{||{|,|||}{|},,}))})))}....||||,||}|.||}|||,,||,.,,|||,.(({{{..,.))))}),))),)),})))},.}}..||||(({,....,|,,.}|{||||||||,||||,||}|||||},,,),)))},.))}..}}}....|||||||,,.,,}|||...|||||}}}}})..((((((.((.(((..(((((((,.......(((....}}}..(((((........))))))))))))))).)).))))))......}})}}}}))}|.|||,,||||||.,||}}}}}}}}}},{.....{((((((((((.....)))))))))},,........((((((((...((((({..((({(((({,..,.{(|,...,,,.,..}))))..{{{....}}}....}}}))))))..))))))))................{((((......)))))........,{{{{{{..{{{(({{.,,({,.,||{{{((((........)))).},(((((((......)).))))).}}}))))},..))))))),,))),)}},)))})))))}}}}))),,,,,,}|}}}}}},.((((((............))))))......))),))),),,||||.....}}}}.........||||..}})))),..