Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_018081.2

Sequence Length

1982 nt

GC Content

0.5817

GUCCCGGCUCCGCGGGUUCCGUGGGUCGCCCGCGAAAUCUGAUCCGGGAUGCGGCGGCCCAAUCGGAAGGUGGACCGAAAUCCCGCGACAGCAAGAGGCCCGUAGCGACCCGCGGUGCUAAGGAACACAGUGCUUUCAAAAGAAUUGGCGUCCGCUGUUCGCCUCUCCUCCCGGGAGUCUUCUGCCUACUCCCAGAAGAGGAGGGAAGCACAGGUGGGUUUCUUUAGCUCUGCGUCGGAUCCCUGAGAACUUCGAAGCCAUCCUGGCUGAGGCUAAUCUCCGCUGUGCUUCCUCUGCAGUAUGAAGACUUUGGAGACUCAACCGUUAGCUCCGGACUGCUGUCCUUCAGACCAGGACCCAGCUCCAGCCCAUCCUUCUCCCCACGCUUCCCCGAUGAAUAAAAAUGCGGACUCUGAACUGAUGCCACCGCCUCCCGAAAGGGGGGAUCCGCCCCGGUUGUCCCCAGAUCCUGUGGCUGGCUCAGCUGUGUCCCAGGAGCUACGGGAGGGGGACCCAGUUUCUCUCUCCACUCCCCUGGAAACAGAGUUUGGUUCCCCUAGUGAGUUGAGUCCUCGAAUCGAGGAGCAAGAACUUUCUGAAAAUACAAGCCUUCCUGCAGAAGAAGCAAACGGGAGCCUUUCUGAAGAAGAAGCGAACGGGCCAGAGUUGGGGUCUGGAAAAGCCAUGGAAGAUACCUCUGGGGAACCCGCUGCAGAGGACGAGGGAGACACCGCUUGGAACUACAGCUUCUCCCAGCUGCCUCGAUUUCUCAGUGGUUCCUGGUCAGAGUUCAGCACCCAACCUGAGAACUUCUUGAAAGGCUGUAAGUGGGCUCCUGACGGUUCCUGCAUCUUGACCAAUAGUGCUGAUAACAUCUUGCGAAUUUAUAACCUGCCCCCAGAGCUGUACCAUGAGGGGGAGCAGGUGGAAUAUGCAGAAAUGGUCCCUGUCCUUCGAAUGGUGGAAGGUGAUACCAUCUAUGAUUACUGCUGGUAUUCUCUGAUGUCCUCAGCCCAGCCAGACACCUCCUACGUGGCCAGCAGCAGCCGGGAGAACCCGAUUCAUAUCUGGGACGCAUUCACUGGAGAGCUCCGGGCUUCCUUUCGCGCCUACAACCACCUGGAUGAGCUGACGGCAGCCCAUUCGCUCUGCUUCUCCCCGGAUGGCUCCCAGCUCUUCUGUGGCUUCAACCGGACUGUGCGUGUUUUUUCCACGGCCCGGCCUGGCCGAGACUGCGAGGUCCGAGCCACAUUUGCAAAAAAGCAGGGCCAGAGCGGCAUCAUCUCCUGCAUAGCCUUCAGCCCAGCCCAGCCCCUCUAUGCCUGUGGCUCCUACGGCCGCUCCCUGGGUCUGUAUGCCUGGGAUGAUGGCUCCCCUCUCGCCUUGCUGGGAGGGCACCAAGGGGGCAUCACCCACCUCUGCUUUCAUCCCGAUGGCAACCGCUUCUUCUCAGGAGCCCGCAAGGAUGCUGAGCUCCUGUGCUGGGAUCUCCGGCAGUCUGGUUACCCACUGUGGUCCCUGGGUCGAGAGGUGACCACCAAUCAGCGCAUCUACUUCGAUCUGGACCCGACCGGGCAGUUCCUAGUGAGUGGCAGCACGAGCGGGGCUGUCUCUGUGUGGGACACGGACGGGCCUGGCAAUGAUGGGAAGCCGGAGCCCGUGUUGAGUUUUCUGCCCCAGAAGGACUGCACCAAUGGCGUGAGCCUGCACCCUAGCCUGCCUCUCCUGGCCACUGCCUCCGGUCAGCGUGUGUUUCCUGAGCCCACAGAGAGUGGGGACGAAGGAGAGGAGCUGGGCCUUCCCUUGCUCUCCACGCGCCACGUCCACCUUGAAUGUCGGCUUCAGCUCUGGUGGUGUGGGGGGGCGCCAGACUCCAGCAUCCCUGAUGAUCACCAGGGCGAGAAAGGGCAGGGAGGAACGGAGGGAGGUGUGGGUGAGCUGAUAUAAAAAGGUUUUUAUGAUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-790.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -822.40

Frequency: 0.0000

Diversity: 702.68

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..((((......))))..(((((((((((..((.....(((.((((((((.((((.(((.........))).).)))..)))))).)))))......)).....)))))))))))(((..((((((((((((.........((((((((.((.((.....))((((((((..((((((.........))))))....)))))))).(((.((((..((((((...((.((....((((....)))))).))..))))))..))))))))).)))))).))))))))).)))))..))).((((((((((((((((.((........))))))((((....))))........(((.(((((((((......(((((((((((((.(((................((.((.(((.((((..((((.((((((((((....)))))).......(((((((...(((((((((((((.(((.(((.((.((.((((((.(((((((..((((((.((((.((((...((((......))))...)))).)))).)))).(((.(((((...((((((...)))))).....))))).))).......(((((.....((((((((.((....(((((((..((((.(((((.((((((.(((((((.((((((..(((((...((((.(((....(((.((((((((..((..((((.......((((((....(((.(......)))).))))))..))))..)).)))))))).)))))))))).....)))))..)))))))))..............(((((...(((((..((....))..)))))...............(((((..((((((((((.((((...((((((((((....(........)..)))).)))))).)))).)))))..(((((..(...(((((........))))).)..)))))....((.((((...)))).))...)))))..))))).)))))...(((.......)))(((..((((...((((....)))).........((((.(((.......(((.((((...)))))))....)))))))((.((....)).)).))))..))).)))).))))))...)))))...)))).))))))).)))))))))))))))...((((.(((((.(........)))))).))))..(((((.((((((((((((((.(((..............((((((((.((((.(((((((((((..(((((.....((((((((....((........))..((((((.....))))))...))))).))))))))..)))))))))...)).)))).))))))))(((((((((...((((((.....))).))).)))))...))))((.(((....)))))....((((((((.(((....))).).))))))).))).)))))))..))))))))))))))..))))))).)))))).).).)).)))))))))..)))............)))))))...)))))))(((((..((((.(((.(((((.....((((((.(((..((((((...))))))(((((((((((...........))))).))))))((..(((((((((...))))).))))..))....(((....))).))))))).))))))).)))))))..)))))...))))..))))..))))...))).)).))))).))))))).))))))..))))))))))))......((((.((.((((((.(.(((.((((...((((...(((.(((((((((((((.(((((((...........)).))))).)).)))))))))))..)))..))))..))))...))).)..)))))))).)))).........))))))))))))......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,({(((,{{{{{|||{{((((((((((({{(({...(((,..,||||||}||||}|}|}}..}}}},|}}}}.))}..,,}}}},}|,,{{..{{{{{,{{{,|||||||||||.(({{((((((((,((((((({....,.,..((({.,.,,.,..)))|,((((((,.((((((.........)))))).}..))))))))}}))}|,,|}},,.}}}}}}||}.||}}}{{((,,..|||||,..,|||,||{{,.,|})))}||||||..,,||||}}}||{|||}|||||{,,{{(((({(((((({{.{(,..,,,..||||||((((....))))........{((,({(((((((,,,,,.(({{((({{{(((.{,,...,|,|.........|,}{(,{{{,{{{({{,.((....,((((((....))))))....}}..}|||||,,.{||||{{{{|,||||||,{{|}||,{||||{{||,|||||||{{(((((({{{{{.{{((,|.((({......)))).,.)))).)}))|)))))|((.(((((...((((((...)))))).....))))).))}.......|||{||||,,|||||{|}}||,...|||||||,{(((,.{{{||,||{,,,.|||||{|.{{{{{||,{{{{{..,{{{,.||,.,...{({((({(({{..,{||{||||||.(,,((((({,,,,(({.({.....|||}.,,,,|||||||}|}}}.}}}}))))}))})))}|||||||||||||,,}||}}||||{{,...}))}...}}}|||...((((({,((,,,,||{,}|}||,............|,{{{{{..{{{{{{{(((.(({{...((((((((((....{,.......,..)))).)))))).}))}.))))}..{{{({,,{,.,(({((.,...,,|))})}.,..}))}),,,,,|,|,{{|{{|||}.}}...|}}||..}}}}}.,,||||},||,.,.....,}}}}|,}}|}|,}||(((,,..||||{,....,}},|||,.{{.,,,...{|||{|||.,|||||,||..|,|,||},.,,.{{..,,)}.||.||||,.}}}}))}),}}})}},,.)}})}|},}})}.}}})))),||||}}|||||||||...{(((,(({((,(.,,,,...|}}}||,}}}),,|||{{}||||{||{{|||||,|||,|,...,.......((((((((.((((.(((((((((((..(((((.....((((((((...{((........{{{.{{|||......))),)),..))))).))))))))..)))))))))...,).)))).))))))))(((((((((...((((((.....))).))).)))))...)))){{.{({....))},,....||(((((|,(({....))).).))))))).))),))))))).,))))}))))}},..,.}}}}||||||,{(((({({(((((.,{........)..))))}.,,,})))))))}}}}(((((((((((..((((.(((.(((((.....({(((({((((((,,,,.}))))),|,(((((((((((...........))))).)))))),|.,(((((((((...)))}}}}})),||,....(((....))),)),)))}.))))))).)))))))..)))))}.,))))),}}},},)}}}}}}}}),}}})}))),))))))).))))))},)))))))))))},,.,,.((((.((.((((((.(.(((.((((...((((...(((.((((((((((({(.(((((((...........)).))))).)}.)))))))))))..)},..))))..))))...))).)..)))))))).)))).,.......}}))}))))))}......................