Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018134.3
Sequence Length
2012 nt
GC Content
0.5393
AGUUGGCGCCCAUGGAGCCAGAGCUGCUGGUUCGGAAGGUGUCUGCAUUGCAGGCCUGCGUCCGGGGCUUCUUGGUCCGACGCCAGUUCCAGAGCCUGCGAGCUGAGUAUGAGGCGAUUGUACGAGAGGUCGAGGGCGACCUGGGCACGCUUCAGUGGACCGAGGGCCGCAUUCCCAGGCCGCGAUUCCUCCCAGAGAAGGCAAAAUCCCAUCAGACCUGGAAAGCAGGAGACAGGGUAGCAAAUCCAGAGCAGGGGCUGUGGAACCACUUCCCAUGUGAAGAGUCUGAGGGAGAGGCCACCUGGGAGGAGAUGGUGCUGAAGAAGUCAGGAGAGAGCUCAGCAAAUCAAGGAAGCCUCUGCAGAGAUCACAGCUCCUGGCUUCAGAUGAAGCAGAACAGGAAACCCAGCCAAGAGAAGACCAGAGACACGACAAGGAUGGAGAAUCCAGAAGCCACAGAUCAAAGACUGCCCCACAGCCAACCUCAGCUUCAAGAGCUUCAGUACCACCGCAGCCACUUGGCCAUGGAAUUGCUGUGGCUGCAACAGGCCAUCAAUAGCCGUAAGGAGUACCUACUUCUUAAACAAACACUGAGAUCCCCAGAGGCGGGCCCGAUCAGAGAGGAACCCCGCGUGUUCCUAGAACAUGGGGAACAGGCCUGUGAGAGGGACCAGUCACAACCAAGCGCACCACUGGAGGACCAGUCCUACAGAGACAGGACCACUGGAGAGCUAGAACAGGAGGAUGACUCCUGUCACAGGGUCAAAUCACCCCACAGAUCCCCAGGAAGUUUGGCCACUACACAAAAAAACAUUGCUGGGGCUAAGUGCAGAGAACCAUGCUACAGCAAGUCUGGACCACCGUCGUCUAUACCAUCAAACAGCCAGGCCUUGGGGGACAGGCUCACCAAAGGGCCAGACGAUGGAAGACAGACCUUUGGAGGGACCUGCCUGCUGCAGAUGAAAAUCCUGGAGGACCAGACCCCCAGAGGUUUAAAACCUAGGAACCAUUGUCCCAGGAAGUCCAGGACACAGCUGUCUGCACUCUAUGAGGACUCAAAUAUUAAGGAGAUGUCUCCCAGAAAACUAGACCACAAAGAGCCUGACUGCCGAACAGUCAGGACACAAGAGUUGGGCCUCUCAGAGGACCACAUCAUCUGGGAUGGUACCUUGGGGGGGCCAGAGCAUAGUGUCCUCGAUCUCUGGAGGACUAAACCACCCAAAGGCCAGGCCCCCACUGAUAGAAGCUCCAGAGAUGGAACCUCCAAUGAGCCUAGUCAUGAAGGACAGAAAAAGCAGAGGACUAUACCAUGGAGAUCAAAGUCACCUGAGAUUCUGUCUUCUACAAAGGCAGGCUGUACAGGAGAGGAACAGUGGAGGGGCAGGCCAUGGAAAACAGAACCACCUGGCUAGACCCUAGGAAGCCAGGAGAGGAUCAGGUUCCAAAGGGGAAUGCUAUGAAAGGGCAGUGAGACAAGACCUCAUCCUACCUCCCUGACCAGCUCUGGCUUCUGCUCCUGCCCCUGGCCAUUGGUGACUAGUGGGGCCAAGAGAAGCUGGAGCAGAGAGCUGGCAUGAGUAUAGGGAAGGAGGAAGGACACAUUUUCAAUCCUCUGCCUGUAGCUCAAUCCAAAUUUGUGGAUAAGGGGCCGGGUGCAGUGGCUCACACCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGUGAGUGGAUCACCUGAGGUCAGAAGUUUGAGACCAGCCUGACCAACAUGGUGAAAUGAAACCCCAUCUCAACUAAAAAUAUAAAAAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGCAUGCCUGUAGUCCCAGUUACUCGGGAGGCUGAGACAGGAGAAUCGCUUGAACCCAGGAGAUGGAGAUUGCAGUAGGCCAAGAUGAUGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCUACAGAGCGAGACACGGUCUCAAAAAACAAAUGUGUGGCUAAGGAGUUACCUGGGGGAAGUAGAAUGAGAGGUCUGUUGGGAAUAAAGGUUUUUCUUAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-764.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -797.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 333.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((...((((((((((((((.(((((((((.(((.(((..(((((.((((((.(...(.((((.((((((((.(((((((((((((...))).)))))).)).(((((((..(((.....((((((....))))))..)))))))))))))))))))))))).)...).)))))))))))(((((((((.(..(((....((((.((((((((.....(((((.((.(((((......((((.(((....))).))))))).)))))).)))..)).))))))))))...))).))))))))))(((..((((((.(...((....))...))))))).)))..))).)))))))....)))))))))).)))))))))......))......((....)).)))))(((((((((.............((((.....)))).....(((((((((....(((((((((.(((...(((((((((...)))))(((((......((((((((..(((.........)))))))))))....(((........))).((((((((....)))))))).......))))).(((..(((((((((((((..((((((.((....))((.(((((((........))))))).)).(((((..(....)..))))).((((((......((((.(((.(.(((((........)))))..((((....)))).(((((((.....)))))))....((((......))))....).)))))))...))))))..................((((((.(((...((.......))...))).))))))(((((.....(((((((((.................((((((..((((.....)).))..)))))))))))))))....))))))))))).))).))))))).)))..))).......((((.((......)).))))(((((...))))).((((((...(((((.(((.(((.(((((((.((.....)).((((.((.((.((..........((((....)))).........)).)).)).))))((((((((.....))))))))........(((.((((((((.((((((((..((....))..)))).)))).))))))))..)))...))))))).))).))).).))))........(((..((((.(.(((((((((........((((....))))..((((....(((((.(((.((.(((((((((....(((..((((................))))..)))...)))))))))...))..)))))))).....)))).....)))))).))).).)))).)))......((.((.(((((((...((...)).)))))))...)).)).))))))...))))...))).))...)))))))..........(((((.((((.((((((.((((((((.(((((.((((((((((((.(((...))).).....)))))..)).).))).)))))..))))))))))((((((((((...((((((..((.......))..)))))).))))).)))))(((((......)))))......((((((((..((((.(((((.(((..((((((....))))))((((.((((((.....))))))..)))).....(((((((((..((((((((...))))((.(((......))).)).................(((((((((((((......)))))))....((((........))))))))))..)))).(..((((((...((((((...(((((..((((((.(((.........)))))))))))))).)))))).....))))))..)..)))))))))..)))...)))))))))..)...))))))))))).)))).))))).)))))).))).......)).)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((((({(,..({((((((({{{{{,||||||{|..||{.(((,,(((((.((((((.(...(.((({{((((((((,,{{((((((((((...))).)))))).)).(((((((..(((.....((((((....))))))..)))))))))),))))))))))))).)...}.)))))))))))(((((((((.{..(((....((((.((((((((.....{{{{{.{(.(((({......((((.(((....))).))))}}}.))}))).)))..}}.))))))))))...))).}))))))))){{(..(((((,.(...((....}}...})))))}.}})..|},.})))))),.},}}))})))))||)))))))}...}..))....,.{{....)).))}||(((((((((.............((((.....)))).....(((((((((....(((((((((.(((...(((((((((...)))))(((((......((((((((..(((.{......,)))))))))))....(((........))).((((((((....)))))))).......))))){.(((((((.(({((((((..(((.((.({....}}((.(((((((......,.))))))).)))).)))..))).)).,|,.........},}.,,.)))).))).,((((({.(((((({(((({,((((..,.,({.{.(((((((.....)))))))}...((((......)))),,,....((((((.((((((...............)))).)).)))))).,..|||{{{,......,,,.{((((..((((((((..(((((((((.................((((((,{(((.....})).)),.,)))))))))))))).....((((((((((.(((..(((..{.((.(((((....)),})).)).,.))).)))))))))))))....(((.(((.,....,))).)))..)))))))})...)))))}})))|{((.((.((.((......,,..((((....))))..,......}).)).)).))}}((((((((.....)))))))).,......,||,((((((((.((((((((..((....}},.)))).)))).)))))))),,,}).))))))))).}.)))))).})))))............((((.(.(((((((((........((((....)))).{((((..,.(((((.(((.((.(((((((((....(((..((((................))))..)))...)))))))))...}}..)))))))).....)))).,...)))))).))).).)))).{((({..,.((.((.(((((((...((...)).)))))))...)).)).,.))))}..))))...))).))...)))))))..........(((((.((((.((((((.((((((({...,((((((((.(({{(((((({{(({...))))}},)))),,).)..)).))))))))))))))))}((((((((((...((((((..((.......))..)))))).))))),}))))(((((......)))))......((((((((..((((.(((((.(((..(((((,....})))))((((.((((((.....))))))..)))).....(((((((((..{{{|{{{,...}))}{{.{{{......)}}.}},.||.............|||{,((((((((......)))))))}...((((........))))})}))}|,},}}.{..((((((...((((((...(((((..((((((.(((.........)))))))))))))).)))))).....))))))..}..))))))))}..)))...)))))))))..,.,.))))))))))).)))).))))).))))))}})).......))))))))))...
Back