Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018324.3
Sequence Length
1788 nt
GC Content
0.4301
AUCUUUCAGAUUGUCUGCUCAGAGUUCAUCUCAAAGCCUGGCAAGGAUUGGAGAGGUCAAUAAGAGUCAGCGCCUUUAAAAAGAAAUCUACUCACUCUUCUGUGUGCAUAAGGCCGAGCAGAGGUUCUUCGUCUCAAGAGGAACUGACUUCUGUUGAGCACUCAACACGCCACAGAGACCAGCCAUCUUGCAACCUCACCUCACAGCAUGGAGAGAGGAGACCAACCUAAGAGAACCAGGAAUGAAAACAUUUUCAACUGCUUAUACAAAAACCCUGAGGCAACUUUUAAGCUGAUUUGCUUUCCCUGGAUGGGAGGUGGCUCCACUCAUUUUGCCAAAUGGGGCCAAGAUACUCAUGAUUUGCUGGAAGAGACAGCAUCUCACCAUGUUGCCAAGGCUGGUCUCAAACUCCGGCGCUCAAGUGAUCCUCCUGCUUCAGCCUACCCAUGUGCUGGCGUGAGCCACCGUAGGCGUGAGCCACCGUGCCUGGCCAAAAUUCUUGGUCUAUUCUGGAUUCUAAUUUUUUUUAUGCACUCCUUAAGGCUUCCUGGAAGAGAAAGCAGAGUUGAAGAACCUCUUGAAAAUGACAUCUCCCAGUUAGUUGAUGAAGUUGUUUGUGCUCUGCAGCCAGUCAUCCAGGAUAAACCAUUUGCAUUUUUUGGCCACAGUAUGGGAUCCUACAUUGCUUUUAGGACUGCACUAGGUCUAAAAGAAAACAAUCAACCAGAACCAUUGCAUUUAUUUUUGUCAAGUGCAACUCCUGUACAUUCAAAGGCCUGGCAUCGCAUUCCCAAAGAUGAUGAAUUGUCAGAAGAACAAAUAAGUCAUUACCUUAUGGAAUUUGGAGGCACCCCCAAGCAUUUUGCUGAAGCCAAGGAAUUUGUGAAACAAUGUAGUCCCAUCAUAAGGGCAGAUCUGAACAUUGUUAGAAGUUGCACCUCUAACGUACCAUCUAAGGCUGUUCUUUCCUGUGACUUGACAUGUUUUGUUGGAUCUGAAGACAUAGCAAAGGACAUGGAAGCCUGGAAAGAUGUAACCAGUGGAAAUGCUAAAAUUUACCAGCUUCCAGGGGGUCACUUUUAUCUUCUGGAUCCUGCGAACGAGAAAUUAAUCAAGAACUACAUAAUCAAGUGUCUAGAAGUAUCAUCGAUAUCCAAUUUUUAGAUAUUUUCCCUUUCACUUUUAAAAUAAUCAAAGUAAUAUCAUACUCUUCUCAGUUAUUCAGAUAUAGCUCAGUUUUAUUCAGAUUGGAAAUUACACAUUUUCUACUGUCAGGGAGAUUCGUUACAUAAAUAUAUUUACGUAUCUGGGGACAAAGGUCAAGCCAGUAAAGAAUACUUCUGGCAGCACUUUGGGAGGCCAAGGCGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCGUCCUGGCUAACACCGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACACAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGUGGGCACCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGUGUGAACCUGGGAGGUGGAGCUUGCAGUGAACCGAGAUCGCUCCACUGCACUCCAGCCUGGGUGACAGAUCCAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUACUUCUGGCAGAGUCUUUUAUCUUCCUAUUAAAAUCUCACUUGAUUCUCCUUUAUGGGAAGUUUGUCGACAAAAUUCAUGAUUAGUAAAUUAUCCAUUUUUUCCUUCAGUUAGUUUAAUGGUGAAGAUGAUUAACAGGGGAAAUGCUUGAAGUAAAUGAUUGUUUCAAUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-518.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -553.66
Frequency: 0.0000
Diversity: 493.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..........((.(((((((((.((((((.(((...((((((((((..(((...((((....(((((.((....................)).)))))((((((.((...((((..((((((((((.(((.((....)).)))..))))))))))..)).))......))))))))))))..)))))))))..(((((((((...(((.((.(((.((((.(((.(((.......(((((..(((((....)))))..(((((..............)))))......((((......))))..))))).....)))))))))).))).)).)))...(((((.........)))))....(((((.......)))))..((((..((((((((.((.(((((((...(((((((.(((..(((((((.(((((((..((((.((((.((((((.((.(((.(((.((.(((....))))).)))..(((((((((....((((.((((((((((.((...............(((.((.(((...))).)).)))...(((((((.(((.(((.((.(.((..((((........)))).)).).)).))).)))..)))))))....))..)))))))))).))))........)))))))))..(.((((((..(((((((((((((((.(((......))))))))))............(((.....((((((((((....)).))))))))...)))......((((..((((((.((..(((((..(((.((((((.((((..(.....)..)))).)))))).)))..))))).(((.((...)))))((((...)))))).))).)))..)))).....)))))))))))))))...(((((((.(((((......)))))..)))).)))........((......)).((((((((.(((.(.((((((....(((((.(((((((((((......(((((((.(((((((((((..........))))(((((((......)))).))))))))))....))).))))..))))).)))))).))))).(((((......................(((((((((((((((((...))))).....)))))))))))).........................((((......)))).)))))((((((......))))))((((((.....))))))((((........))))...((((....((((.(((...............))).))))...))))...)))))))))).))))))))))).)).))))))..))))))))..))))))).))))))))))))).))))...))))))).)))))).))))..))))...((((((.((((.........................)))).))))))..((.(((((....)))))..)))))).)))))))))....))).)))))))))))((((((((..(((((((....(((....))))))))))))))).)))((((.....))))((((((((((.............................)))))))))).((((((((((((((((..((.(((.((.........(((((.((((((.(.................))))))).)))))........))))).)))))))))).))))))))....)))).))..((((((((((((....))))))))..))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,,,,,.{(,(({((((((.((({{{|||,.,,|{{|||||{|..{{{||.((((,..,,((((,((..,,(({....,||,.....}}.}}}||((((((.((...{{((..((((((((({,{((.{,....))})}},,)))))))))),.)).))......)}}}}})|}||}.,|||||||||..(((((((((.,,((({((.(((.((((.((,,(((.......(((((..(((((....})))}..{((((.............,}))}}......{(((......))))..))))).,...)))))))))).))),|{{|||{..,,,{|}.,}}}},.....|{{..(((((.......)))))..||||,,||||(({,.((,{((((((...(((((((.(((..(((((((.(((((((..((((.((((.((((((((..,.{|{,,.,,.|||.,..)))}|{|{{{,(((((((((....((((.((((((((((.,{...,,,,,,,..,..{((,...{||...}}},}),))),..(((((((.(((.(((.((.{.{{..((((........)))).}).}.)).))).)))..)))))))....,,..)))))))))).))))...,....))))))))}..|,||||({..((((((((((((((({(((......))))))))))............{{{.....{(((((((,,....}}.)))))))}...}))......((((..((((((.(({,(((((..(((.((((((.((((..,.....)..)))}.)))))).)))..))))}{(((.((...)))))|{{,...})),)).))),,))..)))).,...))))))))}|||}},,,,(((((((.((({{....{{(((({.{|.,,,),)}))}}}.....,,..}))}|||||||,.{{|||.((((((,,(((((((.(((((((((((..{{,.{((((((.{((((({{(((,,{...,,..}|}}{{|{{{|,,....}))).)))))))))}....))).))))}}))))).)))))).)))))}|||,......}},,}............{((((((((((((({{{...}}}},...,})))))))))))},{{{{...,................{(({......}}}}...||.((((((......)))))).||,.,.....,||,{(((((........)))))},})}}}))}|(({.(((.,.,{,....,,,..))).))))}}}|||....)))..{{|||.,|||....})}))))))))))..))))))))..))))))).))))))))))))).))))...))))))).)})))),|}},..||}}..}|||||,.,..,...............,}}}|,}}},}}||{||||||,,||.{,,||}}}.)))))..)})))).)))))))))},..))),}))}}||||}}{({(((((..(((((((...,(,,..,,,),)))))))))))).))){({{.....)))){(((((((((.............................)))))))))}.((((((((((((((((..({.{(,,((,..,,,,..{{|||}{{{{{{.,{{,{{,,,..,{{{{{...,))))}),})),,,.,,..}}))}.}}}))))))).))))))))....}}))})}..|{{{{((({{{,....})))))))..))),
Back