Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018441.6
Sequence Length
1867 nt
GC Content
0.4381
GCCCGCCUCGAAUGUCCCUGAGACCCAGAAGGGCCUGCGCUCAGCUGCUCUGGCACCCCGCUGCAGGGAUGGCCUCCUGGGCUAAGGGCAGGAGCUACCUGGCGCCUGGUUUGCUGCAGGGCCAAGUGGCCAUCGUCACCGGCGGGGCCACGGGCAUCGGAAAAGCCAUCGUGAAGGAGCUCCUGGAGCUGGGGAGUAAUGUGGUCAUUGCAUCCCGUAAGUUGGAGAGAUUGAAGUCUGCGGCAGAUGAACUGCAGGCCAACCUACCUCCCACAAAGCAGGCACGAGUCAUUCCCAUACAAUGCAACAUCCGGAAUGAGGAGGAGGUGAAUAAUUUGGUCAAAUCUACCUUAGAUACUUUUGGUAAGAUCAAUUUCUUGGUGAACAAUGGAGGAGGCCAGUUUCUUUCCCCUGCUGAACACAUCAGUUCUAAGGGAUGGCACGCUGUGCUUGAGACCAACCUGACGGGUACCUUCUACAUGUGCAAAGCAGUUUACAGCUCCUGGAUGAAAGAGCAUGGAGGAUCUAUCGUCAAUAUCAUUGUCCCUACUAAAGCUGGAUUUCCAUUAGCUGUGCAUUCUGGAGCUGCAAGAGCAGGUGUUUACAACCUCACCAAAUCUUUAGCUUUGGAAUGGGCCUGCAGUGGAAUACGGAUCAAUUGUGUUGCCCCUGGAGUUAUUUAUUCCCAGACUGCUGUGGAGAACUAUGGUUCCUGGGGACAAAGCUUCUUUGAAGGGUCUUUUCAGAAAAUCCCCGCUAAACGAAUUGGUGUUCCUGAGGAGGUCUCCUCUGUGGUCUGCUUCCUACUGUCUCCUGCAGCUUCCUUCAUCACUGGACAGUCGGUGGAUGUGGAUGGGGGCCGGAGUCUCUAUACUCACUCGUAUGAGGUACCAGAUCAUGACAACUGGCCCAAGGGAGCAGGGGACCUUUCUGUUGUCAAAAAGAUGAAGGAGACCUUUAAGGAGAAAGCUAAGCUCUGAGCUGAGGAAACAAGGUGUCCUCCAUCCCCCAGUGCCUUCACAUCUUGAGGAUAUGCUUCUGUACUUUUUAAAAGCUUAUAGUUGGUAUGGAAAACAUUUUUCUUAUUUUUAAGUGUUAUUAAUUAUAUCUAUGGAAAAACUAUUCCUGAAAUAUAUACAGUCUUAUGUCCCAAUCAGAGUCUUUUAACCUAUGAUUUAAAAAUGUAUAAGUAACAGAAAUUAACAUAUUUUAAUGACUUUACUUUUUAUUUCUAAGAAAAGUAUUUGAAAAAUGGAAUAAUUUUAAAUCAAUGAUAAUUCUAGGGAUCAUGAACUCCCAGAAGAUUUUAUUAUUUAAUUGUAAAGGUAGAGGCCAGACGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUUCCAGCACUUUGGGAGGCCGAGGUAGGCGGGUCAGUUGAGGUCAGGAGUUCAAGACCAGGCUGGCCAACAUGGUAAAACCCUGUCUCUACUGAAAAACAACAAAAACAAAAACACAAAUUAGUCGGGUGUGGUGGCACACACCUGUAGUCCCAGGUACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAACCCAGGAAGCAGAGGUUGCAGUGAGCUGAGAUCAUGCUACUGCAGUCCAGCCUGGGCUACAGAGUGAGACUGCAUCUCAAAAAAAACCCAAAAAACAAAAACAAACAACAACAACAAAAUUAUAAAGGUAGAAAAUAAACCUAAAUUGUGUCGUAAUUAAGAUUAUUAAAAUUAGAAUUAUACAAUGACUUAUUUUUGGUGGCAAAUACUUUAGGAGCAAUAAUGCCUUAUGGUAAUUAUUGAUGUAUAGUUUCUUUUGUUUAUGAAGUCAAAUUUGUAUAAAUUCUCUUAAUUCAAAGAAAAAGUUUUAUGUGAUUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-570.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -606.87
Frequency: 0.0000
Diversity: 392.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.......((((.((.(((((..(((((..(.(((((((((....)))....)))).)).)..))))).))))))).))))((((((((.(((.(((..((((((.(((....(((..((((((.(((((...))))))))))).)))..)))..)))))).)))..)))))))))))..((((((((((((((....)))))).))))....((.((((((.(((..((((((((........))))))))))).))..)))).))...((((((..((((((((..........((..(.(((.......))).)..))......(((((((...((((((((...(((.((((.(((((......))))).))))..((((((((.(((.(((((((..((((...((((......))))..))))...(((((.((((...(((....((((...))))..))).)))))))))....(((((((.((((...(((....(((.((((((((.........((((((.(((((((.((............(((((((.((.((.(((((((((((((.((((...((((..........))))...))))))))))))))))).))..))))))))))).))).)))).))))))((((.((((((((...(((((((....))).))))....)))))))).)))).(((((...)))))..((((((((((((.((.....((((((.....)))))))).)))))))))))))))))))).)))...)))..((.((((((..((.((((((((((.((((((..(((...((.((((((((((((....)))))))).).)))))...))).)).))))....(((((((.(((((..(....)..))).)).....)))))))....))))))))))..))...)))))).))...)))).))))))))))))))..))).))))))))......(((....)))...(((.(((((((...(((((..(((((..((..(((((((((((......((((((...........))))))))))))))))).))..((((......)))))))))....)))))...))))))))))(((((..(((((...((..((..((((((.(((.((((....(((((......)))))....)))))))))))))..))..)))))))..)))))..............((((((.(((((...((((.((((........))))))))....)))))))))))..))))))))))))))))))...))))))))..)))))).....))))(((((((....))))))))))))))(((((.((((.((((.(((....((((((....))....))))..))))))))))).))))).(((..((((((((....((((((.((((.((((((((......))))))))...((((((....))))))...(((((..(.((..((((((...((((((.......(((((((((.(((((....)).)))))))))).))..)))))).....))))))..)).).))))).............................................................)))).)))))).(.((((((((............(((((((((((((((((.........((((((.(((.((....((((((((((....))).)))))))...)).)))....))))))....))))))...)))))).)))))))))))))).........))))).)))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((.......((((.((.(((((..(((((..(.(((((((((....)))....)))).)).)..))))).))))))).))))((((((((.(((.(((..((((((.(((....(((..((((((.(((((...))))))))))).)))..)))..)))))).)))..)))))))))))..((((((((((((((....)))))).))))....((.(((({(.{((..((((((((........))))))))))}.}}..)))).))...((((((..((((((((,,........{{..{.(((.......))),},.}},.....(((((((...((((((((..,,,...,(((((((({{...,||||{{.|,...((((((((.(((.(((((((,.((((,,,(({{...,,,))}}..))))...(((((.((((...({{,,,.,,{,...})))..},},)))))))))....(((((({.((((....(((({.{((.{...,,.}.}}}.))})),,,,,.,{{({(({{,......,|||..(((((((.((.((.(((((((((((((.((((...((((..........))))...))))))))))))))))).))..))))))))},,||},.},}},)))}|{((((.((((((((...{((((((....))).))))....)))))))).)))).)},(((((((((.(((((((((({((((((.((((((((((.....))))))..{(.{{(((,,..}))))...)}.(((((((((.((((,....))))(,(((..(((((((({....}))))}}))).))).},(((((((.((((((.,,((({......}))),,...)))....)))..))))))).)))))))))))))..)))))){{(((.....)))))))))))))))).,))))},}))).}))).))))))))))))))..))).))))))))...,,,{{{.,.,|}}...,{|,||{{(({.,,(((((,{,..,,..,{..{{|||,,||||}||||{((({{{...........))))))).,,,,.||||{.{..((((......))))..}.}}}}}}}}}}...}})))}||},(((((..(((((...,{..((..((((((.(((.((((....(((((......)))))....)))))))))))))..))..,})))))..)))))....{{{{{{.|||,|..,,.,,,||,.,||||,((((........))))))))))}})))))),,.,,.,,),))))))))))))))).}.))))))))..))))))....,))))(((((((....))))))))))))))|((((.((((.((((.(((....((((,,........}.))))..))))))))))).))))}.,,,..{{{{((((....((((((.{{{{.((((((((......))))))))...((((((....})))))...(((((..(.((..((((((...((((((.......(((((((((,{((((....)).)))))))))).)).,)))))).,.,.))))))..)).).)))))..............................................,{{{.........}}))}}.)))))).,.{{({{(({...........,(((((((((((((((((.....,,..{(((({.(((.((....((((((((((....))),,))))))...}}.)))....}))))}.,..))))))...))))))}}}))))|||}}},...,,.....))))).))),.}}}.
Back