Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018445.6
Sequence Length
1218 nt
GC Content
0.4803
AGGAGCGCACCGGAAGCGCCCGGCUGGAGGCGCGGCGGCAGGGCUGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGUCAUGGAACGCCAAGAGGAGUCUCUGUCCGCGCGGCCGGCCCUGGAGACCGAGGGGCUGCGCUUCCUGCACACCACGGUGGGCUCCCUGCUGGCCACCUAUGGCUGGUACAUCGUCUUCAGCUGCAUCCUUCUCUACGUGGUCUUUCAGAAGCUUUCCGCCCGGCUAAGAGCCUUGAGGCAGAGGCAGCUGGACCGAGCUGCGGCUGCUGUGGAACCUGAUGUUGUUGUUAAACGACAAGAAGCUUUAGCAGCUGCUCGACUGAAAAUGCAAGAAGAACUAAAUGCGCAAGUUGAAAAGCAUAAGGAAAAACUGAAACAACUUGAAGAAGAAAAAAGGAGACAGAAGAUUGAAAUGUGGGACAGCAUGCAAGAAGGAAAAAGUUACAAAGGAAAUGCAAAGAAGCCCCAGGAGGAAGACAGUCCUGGGCCUUCCACUUCAUCUGUCCUGAAACGGAAAUCGGACAGAAAGCCUUUGCGGGGAGGAGGUUAUAACCCGUUGUCUGGUGAAGGAGGCGGAGCUUGCUCCUGGAGACCUGGACGCAGAGGCCCGUCAUCUGGCGGAUGAGGCUAAGAAUCUUGUUAGUGUCACUUUUGACAUUAGCAAGAUGAACCCUUAACCCUCGAUUCAAUUGCCUUACGCACGCUUUUCACAGUGACUAGCCAAGGGGAGGUGGGGUUGAUUUCUGUUCCUAACUACACCUGCAUAUGUCAGGGCUCCAGUCAGCAAAAGGUAUAGAUGUUGCCUCUAGGCAUGAGGUCAUUGGUCACAUUCUACUUGGAGACAGUGAUUGCAUUCAUUGAUUUCAUGGUUAAUUGCUAGUUGGUAGGUAAAGGCCUCUAGAUGAUUAGCAAUCUUGAUAAAAGAGGCCUAGUAAUGUUCUUUUGAGGUUAGAAAUCCUUGCUGCUAGGACAGUCUCUGUGACAGGUUGCGUUGAAUGAUGUCUUCCUUAUCAAUGGUGAGCCCACCAGUGAGGAUUACUGAUGUGGACAGUUGAUGGGGUUUGUUUCUGUAUAUUUAUUUUUAUGUACAGAACUUUGUAAAAACGAAACUAUUUAAAAAACAAGAAUAACAUUUUUAGCAUCUUUAUUCAAGGAGAUUUAUGGACUUCAAUUUGUCUAUCAAACAUUAAAUAGCUUUUUAUUACAACCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-414.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -437.63
Frequency: 0.0000
Diversity: 289.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(((((..........((.(((((((((((..(((((((((.(((((((((.(((((((.........)))).......))).))).)))).)).)))))))))...........))))))))))).))......))))).))))).(((((((((....))))))))).....(((((...(((((.((((.(((((((((((((....(((((...(.((((((....(((((......))))))))))).).)))))((((((((((.((...((..(((((((....)))))))))...)).))))))))))((((((.....((((............))))..))))))........((......)).......(((....))).............)))))))...)))))))).)).))))).)))))(((((((((((((((((.((....((((.(((((((.........))))))).)))))).))).(((((((.((........)))))))))..((((((((((((((.(((((.....(((((.(((.....))).)))))))))).)))))...........)))))))))(((((....))))).(((((......(((((((((((((((....)))))))))))))))....)))))((((.((..(((((((((..(((((.((((.((((((.((((..((...((..(((((((...(((((((..(((.......(((((....).)))).((((((.((((((.(((((.......))))).(((.((((((((((.(((((((..(((......)))..)))))......)).)))))))))).))).))))).))))).))....((((((((((((........)))).......))))))))...............))).)))))))))))))).)).))..)))).)))))).)))))))))........((..(((((((...(((((....))))))))))))..))......)).)))))))))))))....((((((((((........))))))))))))))))))........((((((((.....((((((...))))))...((((((......))))))..((((((........))))))......))))))))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((.(((((...{,.....((.(((((((((((..(((((((((.((((((((({((,(((,.((.{((..,.))}.}}...))).))).)))),)).)))))))))....||....,))))))))))).))......))))).))))).(((((((((....}))))))))...,,(((((..,(({{({(((((((,(({((({(((({{.,{{(({{,(,((((((....(((((......))))))))))).},}}))}((((((((((.((...((..(((((((....)))))))}}...)).)))))))))){{{{{{.....{(((.,......,...)))}{,|||||,...,.....|......))},,.,,})}}}..,.,}....,|}}},,|,},}}}|||,.}||}|||,.,},}}}}}.}}}},,....,{{{{{{{{,,..||....((((.(((((((.........))))))).)))),,.,,,.(((((((.((........)))))))))..((((((((((((((.(((((.....(((((.(((.....})).)))))))))).))))){{...,}....)))))))))(((((....))))).{((((......(((((((((((((((....)))))))))))))))....))))}{{((,||..{((((((((,.(((((.((((.((((((.((((.,((.,(,(,{((((,(({{{{,,,{,{..{,|}}},.}}|||{|....}.)}})|{(((((.{(((({.(((((.......))))}.(((.((((((((((.((({{{(,.(({,,..,.}}},,)))),,,...})).)))))))))).))).|||||,|||||.||||..{{||||||{{{{.,,,,,,,))}}.......)))))))}......,,,,,...}}}}.}},,,}}))))})),)).))..)))).)))))).))))))))).,......{{..(((((((...(((((....))))))))))))..)),.,...)).))))))),))))},...((((((((((........))))))))))}}||||||..,.||{.((((((({......{{{{,....,)))}...{(((((......)))))},.((((((........))))))......}))))))),)))},....,......
Back