Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018724.4
Sequence Length
1284 nt
GC Content
0.4097
GCACUCAGACUCUGAACUCAGACCUGAAAUCUUCUCUUCACGGGAGGCUUGGCAGUUUUUCUUACUCCUGUGGUCUCCAGAUUUCAGGCCUAAGAUGAAAGCCUCUAGUCUUGCCUUCAGCCUUCUCUCUGCUGCGUUUUAUCUCCUAUGGACUCCUUCCACUGGACUGAAGACACUCAAUUUGGGAAGCUGUGUGAUCGCCACAAACCUUCAGGAAAUACGAAAUGGAUUUUCUGAGAUACGGGGCAGUGUGCAAGCCAAAGAUGGAAACAUUGACAUCAGAAUCUUAAGGAGGACUGAGUCUUUGCAAGACACAAAGCCUGCGAAUCGAUGCUGCCUCCUGCGCCAUUUGCUAAGACUCUAUCUGGACAGGGUAUUUAAAAACUACCAGACCCCUGACCAUUAUACUCUCCGGAAGAUCAGCAGCCUCGCCAAUUCCUUUCUUACCAUCAAGAAGGACCUCCGGCUCUGUCAUGCCCACAUGACAUGCCAUUGUGGGGAGGAAGCAAUGAAGAAAUACAGCCAGAUUCUGAGUCACUUUGAAAAGCUGGAACCUCAGGCAGCAGUUGUGAAGGCUUUGGGGGAACUAGACAUUCUUCUGCAAUGGAUGGAGGAGACAGAAUAGGAGGAAAGUGAUGCUGCUGCUAAGAAUAUUCGAGGUCAAGAGCUCCAGUCUUCAAUACCUGCAGAGGAGGCAUGACCCCAAACCACCAUCUCUUUACUGUACUAGUCUUGUGCUGGUCACAGUGUAUCUUAUUUAUGCAUUACUUGCUUCCUUGCAUGAUUGUCUUUAUGCAUCCCCAAUCUUAAUUGAGACCAUACUUGUAUAAGAUUUUUGUAAUAUCUUUCUGCUAUUGGAUAUAUUUAUUAGUUAAUAUAUUUAUUUAUUUUUUGCUAUUUAAUGUAUUUAUUUUUUUACUUGGACAUGAAACUUUAAAAAAAUUCACAGAUUAUAUUUAUAACCUGACUAGAGCAGGUGAUGUAUUUUUAUACAGUAAAAAAAAAAAACCUUGUAAAUUCUAGAAGAGUGGCUAGGGGGGUUAUUCAUUUGUAUUCAACUAAGGACAUAUUUACUCAUGCUGAUGCUCUGUGAGAUAUUUGAAAUUGAACCAAUGACUACUUAGGAUGGGUUGUGGAAUAAGUUUUGAUGUGGAAUUGCACAUCUACCUUACAAUUACUGACCAUCCCCAGUAGACUCCCCAGUCCCAUAAUUGUGUAUCUUCCAGCCAGGAAUCCUACACGGCCAGCAUGUAUUUCUACAAAUAAAGUUUUCUUUGCAUAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-347.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -374.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 325.29
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((...)))).((.((.((((((((((.....(((((((((..................))))))))).....)))))))))).)).))(((...(((((((((.((.(((..(((((((.(.((((((((((((...(((..((((.....))))..)))...))))).((((...))))..(((((((..(((((((...((((((((((((.(......)))))))))).....)))...))).))........((((..........))))...(((((..((((((..(((((((.(((((.(.((..((..((........)).))....)).)...))))).)))))))..))(((.(((((...................))))).))).......))))..)))))..((..((((.(((....(((((((......)))))))......(((..(((((((....))))))).)))....))).))))..))......)).)))))))......(((((((((((....))).)))...))))))))))))..).)))))))..))).))))))))((((((((((.((((((((.(.(((((((.((((((((.(((((((((......(((((......(.(((((.(..((((..(((.((.....)).))))))).).))))).)...............((((((((((((.....)))))).))))))..))))).....))))))))).))))))...))..)))))))..).)))))....((((....))))...((((.((((((((.....(((.((((..((((((...(((((((((...((((....(((......))).....))))...)))))))))(((((((((...((........)).)))))))))...(((.((((....)))).))).....)))))).)))))))))))))))))))...................))).))))))))))(((.(((((((...(((((.((..((((....(((.((.(((((....((....))...))))))).)))....)))))).)))))(((((..((((((...((((..((((....((((((......))))))...))))...))))...))))))..))))))))))))))).........(((((..((((.....))))...))))))))...)))(((....)))....((((....))))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({.,,((,,{||||.,{|||,((((((((((.....(((((((((....{{........|,..))))))))).....)))))))))).,,.||{,(,,.({{((((((.((.(((..(((((((.{.((((((((((((...(((..((((.....))))..)))...))))).((((,{{{||,..(((((((..({(((,{...,,((((((((((.(.....,})))))))))}....}})||.|||{}}...|,,..{{{{....,,,},,|,||,(,{((((..(((((,,.({(((((,((({(.{.,,..{|.,|||,...,,}}}.)}}},,)|,|...,}))).,}}}}}},.||(((.(((((,...............,..))))).}}}......,)))),,)))))}.((..((((.(({..{((((((((......)))))))}.....(((..(((((((....))))))).)))....))).))))..))...,..,,.})}))))})))),|||||||,{{|.....,,{{||...,)))))))))))..}.)))))))..))).)))))))){{{(({{{{{.,,{{{{{(.{|((|{{{,.||((((((.{((((((((....,.(((({...,..{.(((((.|.,((((..(((.({.....}).))))))).}.))))),|...............((((((((((((.....)))))).))))))..))))).....))))))))|.)))))),{{{{{{,,,,,,))})})),}}..{{(({{...,|||....,,|||{{{|||||,,...,,,{{{{{..{((({{..{(((((((((...((((.{{.(((......)))..,..))))...))))))))}|((((((((...{{........},.)))))))}}...(((.((((....)))).)))....,)))))),)))))}}}}}})))))))).............,,.,..,,,.})))))))))(((.(((((((...(((((.({.,((((....,{{.{({({{,(.{{,((....))...)))))})})})....)))))}.)))))(((((..((((((...((((..((((....((((((......))))))...))))...))))...))))))..))))))))))))))),.......,(((((..((((.....))))...)))))))}...}}|{{{....}}}}.....,}}}},)},)))......
Back