Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_018955.4

Sequence Length

933 nt

GC Content

0.5230

AUUUAGGGGCGGUUGGCUUUGUUGGGUGAGCUUGUUUGUGUCCCUGUGGGUGGACGUGGUUGGUGAUUGGCAGGAUCCUGGUAUCCGCUAACAGGUCAAAAUGCAGAUCUUCGUGAAAACCCUUACCGGCAAGACCAUCACCCUUGAGGUGGAGCCCAGUGACACCAUCGAAAAUGUGAAGGCCAAGAUCCAGGAUAAGGAAGGCAUUCCCCCCGACCAGCAGAGGCUCAUCUUUGCAGGCAAGCAGCUGGAAGAUGGCCGUACUCUUUCUGACUACAACAUCCAGAAGGAGUCGACCCUGCACCUGGUCCUGCGUCUGAGAGGUGGUAUGCAGAUCUUCGUGAAGACCCUGACCGGCAAGACCAUCACCCUGGAAGUGGAGCCCAGUGACACCAUCGAAAAUGUGAAGGCCAAGAUCCAGGAUAAAGAAGGCAUCCCUCCCGACCAGCAGAGGCUCAUCUUUGCAGGCAAGCAGCUGGAAGAUGGCCGCACUCUUUCUGACUACAACAUCCAGAAGGAGUCGACCCUGCACCUGGUCCUGCGUCUGAGAGGUGGUAUGCAGAUCUUCGUGAAGACCCUGACCGGCAAGACCAUCACUCUGGAGGUGGAGCCCAGUGACACCAUCGAAAAUGUGAAGGCCAAGAUCCAAGAUAAAGAAGGCAUCCCCCCCGACCAGCAGAGGCUCAUCUUUGCAGGCAAGCAGCUGGAAGAUGGCCGCACUCUUUCUGACUACAACAUCCAGAAAGAGUCGACCCUGCACCUGGUCCUGCGCCUGAGGGGUGGCUGUUAAUUCUUCAGUCAUGGCAUUCGCAGUGCCCAGUGAUGGCAUUACUCUGCACUAUAGCCAUUUGCCCCAACUUAAGUUUAGAAAUUACAAGUUUCAGUAAUAGCUGAACCUGUUCAAAAUGUUAAUAAAGGUUUCGUUGCAUGGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-314.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -327.84

Frequency: 0.0000

Diversity: 186.29

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((((((.(((((.....(((((((((((((.((((((((...)).))))...(((((((..((.(((....))).))..))))))).((((...(((.((((((.((((...(((((((...(((.(((((((((..((((((((..((...))..)))).))))....)))).(((((...(((((.....((((....))))......((.((((((......)))))).)).......)))))...)))))(.((((((((((...........)))))))))))...........))))).)))...)))).)))..)))).)))))).)))...))))...)).)))))).)..))))))....((((.((...(((((..((((((....((((((.((((.(((..((((......((.((((((((.......((((((......))))))((((..((((.((((...(((((...(((((((((...........)))))))))((((...(((((..(((.((((.((((((.((((((.(((.(.((...((....))...)).).)))..)))))).))).))).)))).)))..))).))...)))).........)))))...))))..........((........))(((((((((.(((.(((((((.(((........)))))))))))))..((((((((((...........)))))))))).....))))...))))))))))))))))))))).))......))))..))).)))).))))))........))))))..))))))).))))..))))).))))))).........((((..(((((........)))))..))))((((((.(.((((.((....)).)))).)..))).))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((((((.(((((.,.,.(((((((((((((.(((((({{...}}.))))...(((((((..((.(((....))).))..))))))).((((...(((.((((((.((((...(((((((...(((.(((((((((..((((((((..((...))..)))).))))....)))).(((((...(((((.....((((....))))....,.((.(((((({....|)))))).)),......)))))...))))){.((((((((((...........)))))))))),...........))))).)))...)))).)))..)))).)))))).)))...))))...}).)))))).)..)))))).,.,{(((.{(,..(((((..((((({....((((({.((((.(((..((((,.....((.((((((((.......(((((({...,||}}}}}((((..{{{{||{{|,,,||{{(.,((((((((((...........)))))))))|(((...(((((.,(({{((((.((((((.((((((.(((.{.((...((....))...)).,.)))..)))))).))).))).)))).)}),,))).))...))),....|||..))))}...}}}}.,........({...,,,,.,,(((((((((.(((.(((((((.(((........))))))))))))){.((((((((((...........)))))))))),,.,.)))}...))))))))))))})))))))).))......))))..))).)))).)))))).,......})))))..))))))),))))..))))).))))))).,.....{{({{(..(((((......,,||}}}.,))))||{(((.,.{(((.({....}).)))).,..))).)},.