Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018975.4
Sequence Length
2131 nt
GC Content
0.5016
AGUGCUGCGCUUCGCGGCAGAGGCGUCUGCGGUGACAGCUCAGUCAGUUGAGCUCUGUGUGCCAGGCGCUCGCGAGGGGGUAGCUCUUCUAGUAGUGCUCGGCGUCAGACAUGGCGGAGGCGAUGGAUUUGGGCAAAGACCCCAACGGGCCCACCCAUUCCUCGACUCUGUUCGUGAGGGACGACGGCAGCUCCAUGUCCUUCUACGUGCGGCCCAGCCCGGCCAAGCGUCGGCUGUCGACGCUCAUCCUGCACGGCGGCGGCACCGUGUGCCGAGUGCAGGAGCCCGGGGCCGUGCUGCUGGCCCAGCCCGGGGAGGCGCUGGCCGAGGCCUCGGGUGAUUUCAUCUCCACGCAGUACAUCCUGGACUGCGUGGAGCGCAACGAGAGGCUGGAGCUGGAGGCCUAUCGGCUGGGCCCCGCCUCGGCGGCGGACACCGGCUCGGAAGCAAAGCCCGGGGCCCUGGCCGAGGGCGCCGCGGAGCCGGAGCCGCAGCGGCACGCCGGGCGGAUCGCCUUCACGGAUGCGGACGACGUAGCCAUCCUUACCUACGUGAAGGAAAAUGCCCGCUCGCCCAGCUCCGUCACCGGUAACGCCUUGUGGAAAGCGAUGGAGAAGAGCUCGCUCACGCAGCACUCGUGGCAGUCCCUGAAGGACCGCUACCUCAAGCACCUGCGGGGCCAGGAGCAUAAGUACCUGCUGGGGGACGCGCCGGUGAGCCCCUCCUCCCAGAAGCUCAAGCGGAAGGCGGAGGAGGACCCGGAGGCCGCGGAUAGCGGGGAACCACAGAAUAAGAGAACUCCAGAUUUGCCUGAAGAAGAGUAUGUGAAGGAAGAAAUCCAGGAGAAUGAAGAAGCAGUCAAAAAGAUGCUUGUGGAAGCCACCCGGGAGUUUGAGGAGGUUGUGGUGGAUGAGAGCCCUCCUGAUUUUGAAAUACAUAUAACUAUGUGUGAUGAUGAUCCACCCACACCUGAGGAAGACUCAGAAACACAGCCUGAUGAGGAGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAAAGUUUCUCAACCAGAGGUGGGAGCUGCCAUUAAGAUCAUUCGGCAGUUAAUGGAGAAGUUUAACUUGGAUCUAUCAACAGUUACACAGGCCUUCCUAAAAAAUAGUGGUGAGCUGGAGGCUACUUCCGCCUUCUUAGCGUCUGGUCAGAGAGCUGAUGGAUAUCCCAUUUGGUCCCGACAAGAUGACAUAGAUUUGCAAAAAGAUGAUGAGGAUACCAGAGAGGCAUUGGUCAAAAAAUUUGGUGCUCAGAAUGUAGCUCGGAGGAUUGAAUUUCGAAAGAAAUAAUUGGCAAGAUAAUGAGAAAAGAAAAAAGUCAUGGUAGGUGAGGUGGUUAAAAAAAAUUGUGACCAAUGAACUUUAGAGAGUUCUUGCAUUGGAACUGGCACUUAUUUUCUGACCAUCGCUGCUGUUGCUCUGUGAGUCCUAGAUUUUUGUAGCCAAGCAGAGUUGUAGAGGGGGAUAAAAAGAAAAGAAAUUGGAUGUAUUUACAGCUGUCCUUGAACAAGUAUCAAUGUGUUUAUGAAAGGAAGAUCUAAAUCAGACAGGAGUUGGUCUACAUAGUAGUAAUCCAUUGUUGGAAUGGAACCCUUGCUAUAGUAGUGACAAAGUGAAAGGAAAUUUAGGAGGCAUAGGCCAUUUCAGGCAGCAUAAGUAAUCUCCUGUCCUUUGGCAGAAGCUCCUUUAGAUUGGGAUAGAUUCCAAAUAAAGAAUCUAGAAAUAGGAGAAGAUUUAAUUAUGAGGCCUUGAACACGGAUUAUCCCCAAACCCUUGUCAUUUCCCCCAGUGAGCUCUGAUUUCUAGACUGCUUUGAAAAUGCUGUAUUCAUUUUGCUAACUUAGUAUUUGGGUACCCUGCUCUUUGGCUGUUCUUUUUUUGGAGCCCUUCUCAGUCAAGUCUGCCGGAUGUCUUUCUUUACCUACCCCUCAGUUUUCCUUAAAACGCGCACACAACUCUAGAGAGUGUUAAGAAUAAUGUUACUUGGUUAAUGUGUUAUUUAUUGAGUAUUGUUUGUGCUAAGCAUUGUGUUAGAUUUAAAAAAUUAGUGGAUUGACUCCACUUUGUUGUGUUGUUUUCAUUGUUGAAAAUAAAUAUAACUUUGUAUUCGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-737.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -781.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 616.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((((.((((.(((((....))))).)))).((((((......))))))(((..((((.(((((((..((((((....))))))..).)))))).)))).)))(((.((((..((.((((((.((((((.....((((...((((...................((.(((((((((((..((.....)).)))))))).))).))((((......)))).(((((((.....)))))))..((((((((..(((((........))))).)))))))))))))))).((((((((((((((.(((((.((..((.(((((((.((((((((((..((((..(((((((((((.((...)).))))))))))).((........))..(((((((.((((((.....))))))(((((.....)))))...))))))))))).....)))))))))).))))).)).)).)).))).)).)).)))..))))))))).((((((.....((((((((..((((.....))))..............))))))))....))))))...)))))).)))))).)).....)))).)))(((((((...((....(((((.((((.(((((..((.(((((.((((.....)))).)))))....))...)))))))))((((.((....)).))))((((((((.(.((......)).).))).))))).)))))....((.(((.((((((((((((((...((((.....)))).......................((((((((.((((.((((.((.(.(((((((((((..(((((((......((((((((((((.(((.((((.(((.........(((((..(((.((((...(((.((((((..(((.((((((((((....(((...(((((.(((.((((...((((..((.....(((((.....)))))(((((((..((((.((((.(((((...................(((((..(((....))).(((((((.............)))))))....)))))((.(((((.(..........)))))).)).(((((((.........(((.....)))))))))).))))).)))).))))(((((.(((.(.((.(.(((((.....))))).).))).))).))))).(((..((((......)))).)))(((((.((((((.(((..((((((.(((((..(((((.((((((((((((((.....(((.(((((....)))))......))).....))))............((((.....))))..((((((..........))))))..((((((....)))))))))))))....)))))))).))))).))))))..))).......))))).).))))).(((.(((((...((((.(.(((((((((..............................))))))))).).)))).))))).)))..)))))))......))..))))...)))).)))..)))))..(((((((((((...((((((.....))))))....))))))).)))).......)))....)))).))))))))).....((..(((((((..(((((.(((((((((((.((((....)))).((((.......))))(((((((........)))))))...))))))))....))).)))))..))).))))...)).)))))))))...)))).))).))))))))..)))))))..)))...))))))))).........(((((((...(((((...)))))..)))))))....))).))))...))))))))))).))).)))))))).))))))))))))..)))))))))).))).))))...))))))).......))))))))...((((((.((((((.((.((((...((((((((.((((...)))).))))))))....)))).)).)))))).).)))))...........((((((.....))))))..(((((((((((((((....))))))).))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((((((({,({{(.,({{((((((...(((((((((((((,....,)))))}{((..{{{{.(({(((,{{((({((,,,.}|||||..|,||}||}.|}||,|}}.,,,{((((((.(((.(((..((((....{.(((....)))}...)))).)))))).)))))}|{(((((((,(({.{{{{{{{||{,|||||||,,||{((((((,.,,,,||||.(((((((,...,)))))))..((((((((..(((((.{....,,))))).))))))))((((((((((.{,..,,{((((({((((.....)).)))))))}.))))))))))........(((((((((((.({...}).))))))))))).}}..}}}}}))))))})))),.{(((({,,,,,||||||(((((.{{{{|{(|{.,.|((((({,{..,|...}|||||}||||{,}}}.))))),)))}|),})}|},)))}..,)})).)}))|||||}.}}}|||||||||||{{{|,,,.}},,}},.}},....,,,}}})))))....)))))}}))))}},))})))))))))...)))))))})}}..|||||.{{,{.....}))}}),.})))))))|((((((.((((.....)))).))))((((((((.((((.(((((((.((((({..,,.|{{|((((((..(((.,..)}}..}}||(((((({....((....}}.....).)))))))}.|}}||.}}{{{(.....)))),...||.,............((((.(((((.(((..{.,......}.}..)))...}))))..))))........||||},,......)))))).))}..})).)))))).))))))))((({{((((((((((((....)))...........(((((((....})))))).......)))))}}})))))|(((((((((((((.........)))}(((((.((.((..((((({,..,....{{{||({{.,{{...}||||}}}}}.,,.,..(((.((((((((((....,.((((((..{((({,({,....,,..,})))}.,,.(((..{{(.{,,,,,,,|{,|.||||}{(((((.......))))}|,..{(((((.(((.(.((.(.(((((.....))))).).))}.))).))))).,,,}}|,{{,{,,{{{|,,...{((((({(((((((((({{((((,,{(((((((((.(((((.(..((((({((,,,,.....{{(((....))}}}..,{{,{..,,..,{{{.............||||,,,,,|||,,,((((((.{{,....|{|}||||,,((((({....}))))},..,}}}}}..}),)))}},})))).))))))}},))})})))))..).))))).)))))))))),..)))}}.(((((((.((..((((((...............{((..((.(((((...((.((((((((((.{{....}}.))))),...,))))))...)))))))..))}..,{({..(((((((((((...((((((.....))))))....))))))).)))).,}),,{((((((((...(((.((.((.(((..((..(((((((..(((((.{((((((((((..,..|{{.,..}}{(((.......})}|{((((((........)))))))...))))))))..,})},.)))))..)))},)))...)).,)))))))))).)))).))))}))))))..))))))))).,{{{.,{...,|,..}}},..,,.(((((((...{((((...)))))..)))))))..,))))))))),))))))))))}})))))}))))))........)))))))))))))))))))..)).)))))))))))))))).....,,,,{{({(({(((({(.((((((.((.{{(({,.((((((((.((({...}))).)))))))).,}})})).)).)))))).).)))))...........((((((.....))))))..|||||||((((((((....))))))))||||||,,..,}},,,}).
Back