Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_019113.4
Sequence Length
1347 nt
GC Content
0.5650
ACAGAUGAGGUUGAGGUUGGCCCACGGCCAGGUGAGAGGCUUCCAAGGCAGGAUACUUGUGUCUCAGAUGCGGUCGCUUCUUUCAUACAGCAAUUGCCGCCUUGCUGAGGAUCAAGGAACCUCAGUGUCAGAUCACGCCCUCCCCCCAAACUUAGAAAUUCAGAUGGGGCGCAGAAAUUUCUCUUGUUCUGCGUGAUCUGCAUAGAUGGUCCAAGAGGUGGUUUUUCCAGGAGCCCAGCACCCCUCCUCCCUCCGACUCAGACCCAGGAGUCUGGCCCUCCAUUGAAAGGACCCCAGGUUACAUCAUCCAUUCAGGCUGCCCUUGCCACGAUGGAAUUCUGUAGCUCCUGCCAAAUGGGUCAAAUAUCAUGGUUCAGGCGCAGGGAGGGUGAUUGGGCGGGCCUGUCUGGGUAUAAAUUCUGGAGCUUCUGCAUCUAUCCCAAAAAACAAGGGUGUUCUGUCAGCUGAGGAUCCAGCCGAAAGAGGAGCCAGGCACUCAGGCCACCUGAGUCUACUCACCUGGACAACUGGAAUCUGGCACCAAUUCUAAACCACUCAGCUUCUCCGAGCUCACACCCCGGAGAUCACCUGAGGACCCGAGCCAUUGAUGGACUCGGACGAGACCGGGUUCGAGCACUCAGGACUGUGGGUUUCUGUGCUGGCUGGUCUUCUGCUGGGAGCCUGCCAGGCACACCCCAUCCCUGACUCCAGUCCUCUCCUGCAAUUCGGGGGCCAAGUCCGGCAGCGGUACCUCUACACAGAUGAUGCCCAGCAGACAGAAGCCCACCUGGAGAUCAGGGAGGAUGGGACGGUGGGGGGCGCUGCUGACCAGAGCCCCGAAAGUCUCCUGCAGCUGAAAGCCUUGAAGCCGGGAGUUAUUCAAAUCUUGGGAGUCAAGACAUCCAGGUUCCUGUGCCAGCGGCCAGAUGGGGCCCUGUAUGGAUCGCUCCACUUUGACCCUGAGGCCUGCAGCUUCCGGGAGCUGCUUCUUGAGGACGGAUACAAUGUUUACCAGUCCGAAGCCCACGGCCUCCCGCUGCACCUGCCAGGGAACAAGUCCCCACACCGGGACCCUGCACCCCGAGGACCAGCUCGCUUCCUGCCACUACCAGGCCUGCCCCCCGCACUCCCGGAGCCACCCGGAAUCCUGGCCCCCCAGCCCCCCGAUGUGGGCUCCUCGGACCCUCUGAGCAUGGUGGGACCUUCCCAGGGCCGAAGCCCCAGCUACGCUUCCUGAAGCCAGAGGCUGUUUACUAUGACAUCUCCUCUUUAUUUAUUAGGUUAUUUAUCUUAUUUAUUUUUUUAUUUUUCUUACUUGAGAUAAUAAAGAGUUCCAGAGGAGGAUAA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-506.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -529.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 234.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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