Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_019839.5
Sequence Length
1500 nt
GC Content
0.6587
AUUCUUGUCUUACCCUCUGCAAAUGUGAUAGGCACAGGACAGGAGUAGGCACCUCGCCUACUGCUGCUUAACCUUUCAGCUUCUCCAGGCCCCCAAUCCUGCUUGCUCCCAGCUUGGCCCAGAAGGAUGUCGGUCUGCUACCGUCCCCCAGGGAACGAGACACUGCUGAGCUGGAAGACUUCGCGGGCCACAGGCACAGCCUUCCUGCUGCUGGCGGCGCUGCUGGGGCUGCCUGGCAACGGCUUCGUGGUGUGGAGCUUGGCGGGCUGGCGGCCUGCACGGGGGCGACCGCUGGCGGCCACGCUUGUGCUGCACCUGGCGCUGGCCGACGGCGCGGUGCUGCUGCUCACGCCGCUCUUUGUGGCCUUCCUGACCCGGCAGGCCUGGCCGCUGGGCCAGGCGGGCUGCAAGGCGGUGUACUACGUGUGCGCGCUCAGCAUGUACGCCAGCGUGCUGCUCACCGGCCUGCUCAGCCUGCAGCGCUGCCUCGCAGUCACCCGCCCCUUCCUGGCGCCUCGGCUGCGCAGCCCGGCCCUGGCCCGCCGCCUGCUGCUGGCGGUCUGGCUGGCCGCCCUGUUGCUCGCCGUCCCGGCCGCCGUCUACCGCCACCUGUGGAGGGACCGCGUAUGCCAGCUGUGCCACCCGUCGCCGGUCCACGCCGCCGCCCACCUGAGCCUGGAGACUCUGACCGCUUUCGUGCUUCCUUUCGGGCUGAUGCUCGGCUGCUACAGCGUGACGCUGGCACGGCUGCGGGGCGCCCGCUGGGGCUCCGGGCGGCACGGGGCGCGGGUGGGCCGGCUGGUGAGCGCCAUCGUGCUUGCCUUCGGCUUGCUCUGGGCCCCCUACCACGCAGUCAACCUUCUGCAGGCGGUCGCAGCGCUGGCUCCACCGGAAGGGGCCUUGGCGAAGCUGGGCGGAGCCGGCCAGGCGGCGCGAGCGGGAACUACGGCCUUGGCCUUCUUCAGUUCUAGCGUCAACCCGGUGCUCUACGUCUUCACCGCUGGAGAUCUGCUGCCCCGGGCAGGUCCCCGUUUCCUCACGCGGCUCUUCGAAGGCUCUGGGGAGGCCCGAGGGGGCGGCCGCUCUAGGGAAGGGACCAUGGAGCUCCGAACUACCCCUCAGCUGAAAGUGGUGGGGCAGGGCCGCGGCAAUGGAGACCCGGGGGGUGGGAUGGAGAAGGACGGUCCGGAAUGGGACCUUUGACAGCAGACCCUACAACCUGCUGCCCUUCCCUGUCCCUUUCCACCCCCCACCCACCCUCCAGAGGUCAGUGUUCUGGGACAUUUGGGGACCCUUCUUUGACUAGAGUUUGGAUCUGGCUGGGUAGGAUUACUAUACACUUGGGGCAGGCCCAGGCUCCUCCAAACUGAGGGAUUAUGAGGGUGGUGAUGGUCCCUGUUAAGGACUAUUGUGUGCUUGCAAGUUGGCAUGUACCCAUGUGCCAGCAUUGCUUACUUGUUGCCAAUAGCUGUUAUUGUGAAAUACACUGGGAAGCCAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-740.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -759.85
Frequency: 0.0000
Diversity: 284.14
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((.(((.((((((.(((((((((.(((...(((.(((.(((((((.....))))))).))))))..))).))....((((((.(((.....((((((((((.((((((.((((((.((((..(.((((((.((..(((((((...))).))).).....)).)).)))).)..))))..)))))).((((...))))...(((((....)))))..))))))((((((((((..((((((((((.(((((.(((.((((((((((.(((..(((((..((((((.(((((((((((((...((((.(((((..((((((.....))))))))))).)).))..((((((((..(((((((((.((((.((((((.(((...))))))))).)))).)))))))))))))))))....)))).)).))).))))..)).))))..))))).)).).)))))))))).)))))))).))).((((.((..((.((.((((((((((((.(((...((((((((((.((((........))))...)))))((((((((.((.((((.((......))..)))).)).))))))))...((((((....((((((((...((.((.((.(((((...........((((((((((.((((.((((.(.((.((((((((.((((..((((..(((((((.....(((.((((..((......))..)))).)))....)))))))..))))(((....)))))))))))))))..)).))))))))))))))))))).(((((((((....)))))))))..))))).))..)).)).)))).))))((((........)))).)))))).)))))...))).)))..)))))))))...)).)).)).)))))))))))))))))))))))))))))))....((((((((.(((.((((((((..((........(((.((((((.(((((..((.((((((....((((((((((((...((((((...(((..((........)).)))...)))))).))))...))))))))..))))))))..)))))..)))))).)))........)).))))))....)).))).)))))))).)))..))))))...((((((((((.((((((.((((((...((((.(((........((((((..........))))))))))))))))))).))))))...))))))).)))(((((((.......)))))))))))))).)))....((((((((...((((((((...(.((((((..(....(((......)))..)..)))))).)...)))))))).(((((((((.(......).)))))))))))))))))((((((.((((..((((((((((((((....)))))))))).))))......).)))))))))........(((.....))).)))))).))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....{(.(((.(((,((.(((((((((.(((...(((.(((.(((((((.....))))))).))))))..))).)).,..((((((.(((.....((((((((((.((((((.((((((.((((..(.((((((.((..{((((((...))),})).}.....)).)},)))).)..))))..)))))).{(((...)))}..,{(({{..,,)))},..))))))((((((((((..((((((((((.(((((.(((.((((((((((.(((..(((((..((((((.((((((({{(((({..{{((.(((((..((((((.....))))))))))).)).,,..(((((((,,,(((((((((.((((.((((((.(((...))))))))).)))).)))))))))))))))))....,)))})}.))).))))..)).))))..))))).)).).)))))))))).)))))))).))).((((.((.,((,{{.((((((((((((.(((...((((((({((,(((({..{({{.{({{{{.,,.,,.|||||||.}}}})||}|,..,|{,||,{||||{||{|||||||{{{{,((((,....||||,,||}}.|||,..{{{((((((((((..(((((((({(..,.{(,((((,,(,..{.(((((((((...,.,,,{((..,,||||,...,}|||}|||,,,|,.})}}.))..}}})}))))).})))))))}})}||({{.|||}},))))),})))))))),.|||||,|||||||{{|||,.(((((((((....))))))))).})))))})).}}),))})),,.,,,,((((........)))).)))})}})))))...))).)))..)))))))))..,)),}}.)).)))))))))))))))))))))))))))))))....((((((((.(((.((((((((..,(.{,.....(((.((((((.(((((..((.((((((....((((((((((((...((((((...(((..,,,{......)).)))...)))))).))))...))))))))..))))))))..)))))..)))))).)))....,,..,,.)))))),...)).))).)))))))).)))..))))))...((((((((((.((((((.((((((...((((.(((........((((((..........))))))))))))))))))).))))))...))))))).)))(((((((.......))))))}})))))).))|(((((,,....((..((((((((...(.((((((..,....(((......)))..}..)))))).)...))))))))..))......)))))},.,((((((((,,....})))))))){.{{{...((((((((((((((....)))))))))).))))...,..{{,,{{{{{{|...,}}}}}.}.,,}}})}.)))))).)}...
Back