Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_019845.3
Sequence Length
1425 nt
GC Content
0.5923
AGAAGAGCCUAGCUGCUGCGCGCGUCGGAGAGGCUCCUGGGAAACUCCCACGGCCCAGGGACUUUCGAAAGCAGAGCGAGGAGCCCUCGCACGCGCUAGUCUGCGAGUGAGCGCUCAGCCCGGCACCUGUUCCUCCAGCGCCGCCGCCUUCCCACCCCUCGGACCCGCGCCGCUCGCGGCGCCCGCCCGUUCCUGCGAUGAAUCCGGCCCUAGGCAACCAGACGGACGUGGCGGGCCUGUUCCUGGCCAACAGCAGCGAGGCGCUGGAGCGAGCCGUGCGCUGCUGCACCCAGGCGUCCGUGGUGACCGACGACGGCUUCGCGGAGGGAGGCCCGGACGAGCGUAGCCUGUACAUAAUGCGCGUGGUGCAGAUCGCGGUCAUGUGCGUGCUCUCACUCACCGUGGUCUUCGGCAUCUUCUUCCUCGGCUGCAAUCUGCUCAUCAAGUCCGAGGGCAUGAUCAACUUCCUCGUGAAGGACCGGAGGCCGUCUAAGGAGGUGGAGGCGGUGGUCGUGGGGCCCUACUGACCCGCCCUCUGCCCCCGCGGCAACCGCUCCCACGCCUGCCCACUUUGCUAGCCCGGCUGUGCCCCUCACUAUCAGAGACUGGGCGAAGCAAACCUGUCGGAGUCAAUUAUUUCUCUCGACUUCGGCCUUUCGGAAAGAAGCGACCGGUUUCUCCCUCGCCCUCUGAAAGUCCUCAUGCCUGGCAGUCGGAGGAGAGCGCCCAGACUCUGAACUCAGCAGAAAGUGGCAAGAAGAGGGCGAUUAGGGCGCAGAACUUUGGAAGCUGCUACUUACUUGGAAUGCGGGGAGACCGACGGUGCGAAGGCCCUUCUCCACCCGCAGGUGGGCCAAGCUCUGGGGGCAGGUGGAGAGGGCGGGCAGGGGAGAGACCCAGCGGCACUGAUCGCCUUGUGACCGGAAGAGUGACCUGUUAAAAGCCACGCAGCAGACUCAUGGGGUCUCACAAAUCCGUGUCCGGGUGCGCUCCCACUCUUCUCCUGCUCCCCCCCUGCCCUGGAGGGGAGGGGCGAUAAAUACCUUUGAUUGUAACGUGCCGUUUUAAGAGGUUUUGUGUUUGUUUGCUUGAAUACAAAUGUUUGAUAAGUCUUUUUCUGCCCCAGUGGCCUGUUUGCCUGCCUGAGGAGUUACAGUUUUGUCAUUGUGGGAGAAGGGGUGGGGGGAGGGGGAGCCUGCGAAUUUGAACGGGGUGAGUUGUUUCUUUUAGUGCAUUUCCCACUGGGUCUUUUGGGAGGCGUCUAGCGUUCCUGCUGGCCCUGGGACAAAGACCCAGAAUAGAACUCGUAGCUCGUGACUGCACGGUUUACGCCACAAAAGUGCUCUUGACAUCCGUGACACCGUUUUGACUUUUUGUUUUUUUCUUAUUUAACAUUUCCUUAAUAAAUGCAACAUUUAAGCGUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-574.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -597.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 383.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((....((....))((((((..(((.(((((((.(((((.((((........)))).))))..........).))))))))))..))))))(((((.((((((((((((...(((((((((......(((((..((((((((((..((((((((.((((..(((((((..((((.(((((((((((((((.(.((...((.......)))).))))..))))).))))))))))).(((((....(((((((((.(.(((......)))).).))))))))...)))))((((((.(((..((..((.((....))))..))...))))))))).(((((............)))))))))))).....(((((...(((.(....).)))..)))))(((((((((....(((((((..((..(..((((((((.((......))))))).)))...)..))..).))))))))))))))))))).))).)))))))))))))))..)))))(((..(((.((((((((((......((((...)))).....(((((((((.((..(((.(((((.(((((.(((((....((((((.(((((((..........(((((((((.............))))))))).....(((..(((((.....))))))))(((..(((((((..(.((........)))..))))))).)))))))))).)))))).....((........)).....)))))(((.((((..((((...........))))..)))).)))......(((((((.....((.((....)))).))))).))))))).)))))..)))...))))))))))).)))))))))))))))).(((((((..((((((..........))).)))...((((...((((..........))))...))))...)))))))........))).))))))))))))((.(((((((((((((((((((((.(((....))).))))).)......((((((......((((...))))...))))))((((((((((......))))))))))................((((.((((((((((((((...(((.....)))....))))....))))))).)))))))))))))))))))))))).((((.((........))))))(((((.(((((....((.....(((((..(((((....((((.((.....)).))))....)))))))))).....))..)))).).)))))...))))))))))).((((((((((......(((....)))......))))).)))))...(((.....))))))))))...................((((((.........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((({...({.{,,||((((((..(((.(((((((.(((((.((((........)))).))))..........).))))))))))..))))))|{({(.(((((((((((((((.(((((((((((...(((((..((((((((((..((((((((.((((,,((((((,..{|||,(((((((((((((((,(.{{...{{,,,,...)))..|}}}..))))).)))))))|}},.(((((....((((((((.,(((({......}))),}.))))))))...)))))||{({(|{{{..{{..{{.||},,|)))),,))|,|))}|||}}|{(,(,({{.{{{{{{,..,||,|({(((,..,|}||||||.}}|||)}.}}},.),)}},))),(((((((((..{({{,.{(((((((({{,...,}}......)).))))))},{,||......,,.}}}})}))),))))))))))))).))).)))))))))))))))..)))))(((,.(((.(((((((((({({...,,||,.,||||{{{{{.((,((((({(({{(((.((((({((.((.,,,,,....,||,||.||||||,.}}}},....(((((((((.............)))))))))...,,({,.{({(((....,|}}}}}||((({{(((((,,..({((,..{{..,||,..||||||,.},,,,,}},,.)))))).,}}}||}...,}.}))....})))))))}.,{||}.{{{{..,,..,,.,}))))..}}},...,...{(((((,.((..{{.((.((....)))).))))..)))))))))))))...))..})))))),)))}.)))))))))))))))).(((((((..((((((..........))).)))...((((...((((..........))))...))))...))))))),{......,}},.)))))))((((((.(,((((((((((((({(((((.(((....))).))))).}......((((((...,,.((((...)))).,,)))))){(((((((((......})))))))))................((((.((((((((((((((...(((.....)))....))))....))))))).))))))))))))))))))))))))))).............)))).))))}|}|}},.....,,|,...{{.,.((((((({{{,(..(((.(.({(((,....,)))))))))....}))))))))))....,,}}}}}}})}}}|}}}}}},((((((((((......{((....)))......))))).)))))...|{{.....}}}.,,},,,...................{(((({.........))))),
Back