Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_020863.4
Sequence Length
4594 nt
GC Content
0.5424
AUCCGCCAUGUUGGAUGCCGCAGAUUCGCCAUAACCUCGCCGGCUCUUUUCUUAAAAAAAUAAAAAUAAAAAGCGAAGCGUCAGCAGGGCGCCCCGCCCCCUCGGUCGGCACGGGAGGGGGCCCGGAAGAGCCCGAGGCUUUUUUUUCCUCCGCGGUGGGGCGUUGCCAUGGAGACGCGGGCGGCAGAAAACACGGCCAUCUUUAUGUGUAAAUGUUGUAACCUCUUCUCACCAAAUCAGUCGGAACUCCUCUCCCACGUUUCAGAGAAGCACAUGGAAGAAGGGGUUAAUGUUGAUGAGAUUAUUAUUCCCCUUAGGCCUCUGAGUACACCUGAACCCCCCAACUCAAGCAAAACCGGAGAUGAGUUUUUGGUCAUGAAGAGGAAGAGAGGCAGGCCUAAGGGGUCCACGAAGAAGUCCAGCACAGAAGAGGAGCUGGCAGAAAACAUCGUGAGUCCGACUGAGGACAGCCCGCUGGCUCCGGAGGAAGGGAACAGCCUGCCUCCAAGCAGCUUGGAGUGUAGCAAGUGCUGUCGGAAGUUCUCCAACACGCGCCAGCUGCGGAAGCACAUCUGCAUUAUCGUGCUGAAUUUGGGUGAGGAGGAAGGAGAAGCAGGUAACGAGUCUGACCUUGAACUAGAAAAGAAGUGUAAGGAAGAUGAUCGGGAAAAAGCCUCGAAAAGACCACGGUCACAGAAAACAGAGAAAGUCCAGAAGAUCUCAGGAAAGGAGGCCAGACAGCUUUCUGGGGCGAAGAAACCCAUCAUAAGUGUGGUUUUAACUGCACACGAAGCAAUUCCAGGUGCUACCAAGAUUGUGCCAGUGGAGGCUGGGCCCCCUGAAACAGGAGCUACAAAUUCUGAGACCACUUCAGCAGACCUGGUGCCUCGGAGAGGCUACCAGGAAUACGCCAUUCAGCAGACACCUUAUGAGCAACCAAUGAAGUCAAGCAGGCUAGGUCCCACUCAGCUCAAAAUCUUCACUUGUGAAUACUGCAACAAGGUCUUCAAGUUCAAGCACUCGCUGCAGGCCCACCUGAGGAUCCACACCAAUGAAAAGCCAUACAAGUGCCCCCAGUGCAGCUAUGCCAGUGCCAUCAAGGCCAACCUCAAUGUGCACCUGCGCAAGCACACUGGAGAGAAGUUCGCCUGCGACUAUUGCUCGUUCACCUGCCUGAGCAAGGGCCACCUCAAGGUGCACAUCGAGCGAGUGCACAAGAAGAUCAAGCAGCACUGCCGCUUCUGCAAGAAGAAGUACUCUGACGUCAAGAACCUCAUCAAGCACAUCCGAGACGCGCAUGACCCACAGGACAAGAAGGUCAAAGAGGCCUUGGACGAGCUCUGCCUGAUGACGAGGGAGGGCAAGCGGCAGCUGCUCUAUGACUGCCACAUCUGUGAGCGCAAGUUCAAGAACGAGCUGGACCGUGACCGCCAUAUGCUGGUCCACGGAGACAAGUGGCCUUUUGCCUGUGAGCUCUGUGGCCAUGGGGCCACCAAGUACCAGGCGCUGGAACUGCAUGUCAGGAAGCACCCCUUCGUGUACGUCUGUGCCGUCUGCCGCAAGAAGUUCGUCAGCUCCAUCAGGCUGCGCACCCACAUCAAAGAGGUGCACGGGGCUGCCCAGGAGGCCUUGGUCUUCACCAGUUCCAUCAACCAGAGCUUCUGCCUCCUGGAACCUGGUGGGGACAUCCAGCAAGAAGCUCUGGGGGACCAGCUACAGCUGGUGGAAGAGGAGUUUGCCCUCCAGGGCGUGAAUGCACUCAAGGAAGAGGCCUGUCCUGGGGACACUCAGCUGGAGGAGGGCCGGAAGGAGCCGGAGGCCCCUGGGGAAAUGCCUGCCCCAGCUGUGCACCUGGCCUCCCCGCAGGCCGAAAGCACAGCCCUGCCACCCUGUGAGCUGGAAACCACCGUGGUCUCCUCCUCAGACCUGCAUUCUCAAGAGGUGGUUUCAGAUGAUUUUUUGUUGAAAAAUGAUACCUCCUCCGCAGAGGCUCAUGCUGCUCCUGAGAAGCCCCCAGACAUGCAGCACAGAAGCUCAGUCCAGACGCAAGGUGAAGUGAUCACACUACUGCUGUCCAAGGCCCAGAGUGCUGGGUCAGAUCAGGAAAGCCAUGGCGCCCAGAGCCCCCUAGGGGAAGGGCAGAACAUGGCUGUGCUUUCAGCUGGUGACCCAGAUCCCAGCAGGUGUCUCAGGUCAAACCCAGCUGAGGCCUCAGACCUCCUCCCUCCAGUAGCUGGUGGUGGGGACACCAUCACACAUCAGCCUGACUCUUGCAAAGCUGCCCCUGAGCACCGGUCAGGCAUCACCGCUUUCAUGAAGGUCCUGAACAGUUUACAGAAGAAGCAAAUGAACACCAGCUUGUGUGAGCGGAUCCGGAAGGUUUAUGGAGACCUGGAGUGUGAAUACUGUGGCAAACUUUUUUGGUACCAAGUGCAUUUUGAUAUGCAUGUCCGCACCCACACCCGGGAACAUCUGUAUUAUUGCUCUCAGUGUCAUUAUUCUUCCAUCACCAAAAACUGCCUUAAACGCCACGUAAUUCAGAAACACAGUAACAUCUUGCUGAAGUGUCCCACCGAUGGCUGUGACUACUCAACUCCAGAUAAAUAUAAGCUACAGGCACAUCUUAAAGUUCACACAGCACUGGACAAAAGGAGUUAUUCUUGUCCUGUUUGUGAAAAGUCUUUUUCAGAGGAUCGAUUGAUAAAGUCACAUAUCAAGACCAACCAUCCUGAGGUCUCCAUGAGCACCAUUUCUGAGGUUCUCGGGAGGAGGGUUCAGCUGAAAGGGCUAAUUGGAAAGAGAGCCAUGAAAUGCCCAUAUUGUGACUUUUAUUUCAUGAAGAAUGGCUCAGACCUUCAGCGUCAUAUUUGGGCUCAUGAAGGUGUGAAGCCCUUCAAGUGUUCUUUGUGUGAGUAUGCAACUCGUAGCAAGAGUAACCUCAAGGCUCAUAUGAAUCGUCACAGCACUGAGAAAACCCACCUAUGUGACAUGUGUGGCAAGAAAUUCAAAUCAAAAGGGACACUGAAAAGUCACAAACUCCUUCACACUGCAGAUGGGAAGCAGUUUAAGUGCACGGUGUGUGACUACACAGCGGCCCAGAAGCCACAGCUGCUGCGGCACAUGGAACAGCAUGUCUCCUUCAAGCCUUUCCGCUGUGCCCAUUGCCAUUACUCCUGCAACAUAUCUGGCUCUCUGAAGCGGCACUACAACAGGAAGCACCCUAAUGAGGAGUAUGCCAACGUGGGCACCGGGGAGCUGGCAGCGGAGGUGCUCAUCCAGCAAGGUGGUUUGAAGUGUCCUGUUUGCAGCUUUGUAUAUGGCACCAAAUGGGAGUUCAAUAGGCACUUGAAGAACAAACAUGGCUUGAAGGUGGUGGAAAUUGAUGGAGACCCCAAGUGGGAGACAGCAACAGAAGCUCCUGAGGAGCCCUCCACCCAGUAUCUCCACAUCACAGAGGCCGAAGAAGACGUUCAAGGGACACAGGCAGCGGUGGCCGCGCUCCAGGACCUGAGAUACACCUCUGAGAGUGGCGACCGACUGGACCCCACGGCCGUGAACAUCCUGCAGCAGAUCAUUGAGCUGGGCGCCGAGACCCAUGACGCCACUGCCCUUGCCUCGGUGGUUGCCAUGGCACCAGGGACGGUGACUGUGGUUAAGCAGGUCACCGAGGAGGAGCCCAGCUCCAACCACACGGUCAUGAUCCAGGAGACGGUCCAGCAAGCGUCCGUGGAGCUUGCCGAGCAGCACCACCUGGUGGUGUCCUCCGACGACGUGGAGGGCAUUGAGACGGUGACUGUCUACACGCAGGGCGGGGAGGCCUCGGAGUUCAUCGUCUACGUGCAGGAGGCCAUGCAGCCUGUGGAGGAGCAGGCUGUGGAGCAGCCGGCCCAGGAACUCUAGAGGACAUGUGGCAUCGGAUGGCCACAGGGCGGGGCUGCCAGGCUCUGCAGGCACCCAGGGUGGGGAGGCCACCCUUCCUGCCCUACCCGCAGAAUGGUGCUCUCCUUUGCCCUCCCUGCCCAGCAGCCUGAUAGGACUCUCCUAGUCCAACUUGGGGUGGGCAAGGCAGUCAGCAUCACCAGCAAUACCACAGGACCCUCACCCCAGCAUAGACACACACCCCCUGACCCUUACCAUCUGCUUCCUGAAAGACUUCAGUGUCAGCUCCCCUACACACACCCCACACCUUCACCCCUUGCUUCAAGAUUCAAACAGAGACUCCCAGUCCCCCUCAGCAUCUUCCCUGAAUCACAGCCCCAGCUCCUUGACCCCCAUCUAGGUGCCAAAUGUUCAUCUGCAACCGCUAUGCAGUCUGGUGAGAGGGAGACAGCCAUCACAUAGAAAGUGACCGUACGGGUUUUUAAUCACUGCUGGGUGGGGUGGGGGUAGGGGGAUUGUCCUGGCUUUGUCGACAAAGUCCCACUUCCCCGAGUAUUAAGGGCCCUUGGUAUCAAGUGAGGUAAAUUCACCCAUCACAGGGUCUCGCCCUACCAUCCUGGAAUUAUUUCACUUUUAAGAUAAAUGCACUAUUUCACUGUUCGCCUCCCAUUCUAAGGAGGUGAGGUGGUUGGAAUAAAAACAGUUCCUGUCUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1672.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1752.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 1027.41
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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