Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_020995.4
Sequence Length
1242 nt
GC Content
0.4992
ACUGCUCUUCCAGAGGCAAGACCAACCAAGAUGAGUGACCUGGGAGCUGUCAUUUCCCUCCUGCUCUGGGGACGACAGCUUUUUGCACUGUACUCAGGCAAUGAUGUCACGGAUAUUUCAGAUGACCGCUUCCCGAAGCCCCCUGAGAUUGCAAAUGGCUAUGUGGAGCACUUGUUUCGCUACCAGUGUAAGAACUACUACAGACUGCGCACAGAAGGAGAUGGAGUAUACACCUUAAAUGAUAAGAAGCAGUGGAUAAAUAAGGCUGUUGGAGAUAAACUUCCUGAAUGUGAAGCAGUAUGUGGGAAGCCCAAGAAUCCGGCAAACCCAGUGCAGCGGAUCCUGGGUGGACACCUGGAUGCCAAAGGCAGCUUUCCCUGGCAGGCUAAGAUGGUUUCCCACCAUAAUCUCACCACAGGGGCCACGCUGAUCAAUGAACAAUGGCUGCUGACCACGGCUAAAAAUCUCUUCCUGAACCAUUCAGAAAAUGCAACAGCGAAAGACAUUGCCCCUACUUUAACACUCUAUGUGGGGAAAAAGCAGCUUGUAGAGAUUGAGAAGGUGGUUCUACACCCUAACUACCACCAGGUAGAUAUUGGGCUCAUCAAACUCAAACAGAAGGUGCUUGUUAAUGAGAGAGUGAUGCCCAUCUGCCUACCUUCAAAGAAUUAUGCAGAAGUAGGGCGUGUGGGUUACGUGUCUGGCUGGGGACAAAGUGACAACUUUAAACUUACUGACCAUCUGAAGUAUGUCAUGCUGCCUGUGGCUGACCAAUACGAUUGCAUAACGCAUUAUGAAGGCAGCACAUGCCCCAAAUGGAAGGCACCGAAGAGCCCUGUAGGGGUGCAGCCCAUACUGAACGAACACACCUUCUGUGUCGGCAUGUCUAAGUACCAGGAAGACACCUGCUAUGGCGAUGCGGGCAGUGCCUUUGCCGUUCACGACCUGGAGGAGGACACCUGGUACGCGGCUGGGAUCCUAAGCUUUGAUAAGAGCUGUGCUGUGGCUGAGUAUGGUGUGUAUGUGAAGGUGACUUCCAUCCAGCACUGGGUUCAGAAGACCAUAGCUGAGAACUAAUGCAAGGCUGGCCGGAAGCCCUUGCCUGAAAGCAAGAUUUCAGCCUGGAAGAGGGCAAAGUGGACGGGAGUGGACAGGAGUGGAUGCGAUAAGAUGUGGUUUGAAGCUGAUGGGUGCCAGCCCUGCAUUGCUGAGUCAAUCAAUAAAGAGCUUUCUUUUGACCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-395.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -417.59
Frequency: 0.0000
Diversity: 475.96
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((..(((.((((((.(((.(........).)))((((((((...(((((........))))).)))))))).((((.(((....)))))))...((((.((..((((((...((.(((((.((((..((((.((....(((((..(((.((.(((((((....)))))))))))).)))))......(((((.(((((.((((..(((((.............((((.....)))).((((((...........))))))..........)))))...))))..))))).)))))...(((.........))).((((((((((.........((((((((((((((((.((((..(((.(((......)))..)))....)))).)))(((((((..(((((((((((((((..((((.............((((((((((.((.......(((((((..(((((...))))).....((....)).....(((((((((((((.............)))))).....))))..)))))))))).((((((((((((..((((((..(((((....))))).(((.((((((.((...(((((((((.......)))))..))))...(((..((((((.(((((..((((.............))))..))))).)))))))))((((((..((((((.((..((((((((((((...............)))))).))))))(((((((.(((....))).......(((.....)))......)))))))...)))))))...)..)))))).)).)))))).)))))))))(((......)))...)))).))))))))))))))))).)))...((((((((....(.(((.(((.((((.((..(((((.....)))))...)))).)))))))).)....)))))))).))))..)).)))..((((((....))))))...)))))).))))))))))).........)))))...)))))))))))))))))).......(((..(((((((.((..(((.((((.(((.....)))...))))....))))).))))))).))).)).))))........))))))))).))))))))..)).)))).....))))))...)))..)))..((((((........)))).)).........))))))..............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,(({((((((,.(((,,,.{({.{(,.{,{,.{{{,{{|||((((((((..,(((({........))))).)))))))),{(((.(((..,,|}}}}}|.,.,(((,{,{{,,,{||.,.||,|{(({{{{{{.,{{({,{({,,.{((({..(((.{{.(((((((....)))))))}}))).)))}}...,..{{{{(.(((((.((((..(((((.,{,.,,...|,|(((,.....|,,,.{(((((...........)})))},.........}))))...))))..))))).}||||{,{(((.....,{({({|..(((((({{{........||||||{{,,{{||||},((({.,({{{((,..,,|||||||||,...,||||,}}}|||||},.,|}|||,.||||((((((.((..((({{...,,..(((((((,....,,|,.....,{|{,{{,((((,...|))))....,||,.,,}|},.,},..}}))((((((.............))))))....}))))))}}}....))))}..}||||}}}}},{,{((({.(((((....)))))....{(((((({({...(((({((({......,)))))..)))).,.}))).)))))||{(({(..{(((...,......,,,))}},})))})})})))}}}}.|}}})}},}))||,,{..((((((((((((...............)))))).))))))|||||||.||||...}|,.......(((,,..,|||,|,|,.,}|||||||,}|||||...})},})))}.....,{||,,{{{{|||}|{{,((({{{.,....{({{({({,|||,||||||}{||{|{{{..((((((((....,.(((.({{.((((.,{|,{{(({.....)))))}}.,,)).))}}}))).},...))))))))..|||||||.|||..((((((,...||}}||,,|||||{{{|{{|},|||||||.|||.|{||,,,.}})))))})}))))))}}))}}}....}}}}}||,,||..||..|,|}||||}|||,,,..}}}||{}}}|{{{{,,,,,.)))))}|||,,..},))))....,,,.}}}}}}))),))}},)}}},}}|}},},,.,})})))),..}}}.,)))}},,}},}))}})),.)))|.|||{.......||||,,..}}}}}})},...
Back