Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021019.5
Sequence Length
708 nt
GC Content
0.5339
GCCAUUACUGCAGGAAAAGGUCCCGGAGAGCUGAGCAGUCAAGAUGUGUGACUUCACCGAAGACCAGACCGCAGAGUUCAAGGAGGCCUUCCAGCUGUUUGACCGAACAGGUGAUGGCAAGAUCCUGUACAGCCAGUGUGGGGAUGUGAUGAGGGCCCUGGGCCAGAACCCUACCAACGCCGAGGUGCUCAAGGUCCUGGGGAACCCCAAGAGUGAUGAGAUGAAUGUGAAGGUGCUGGACUUUGAGCACUUUCUGCCCAUGCUGCAGACAGUGGCCAAGAACAAGGACCAGGGCACCUAUGAGGAUUAUGUCGAAGGACUUCGGGUGUUUGACAAGGAAGGAAAUGGCACCGUCAUGGGUGCUGAAAUCCGGCAUGUUCUUGUCACACUGGGUGAGAAGAUGACAGAGGAAGAAGUAGAGAUGCUGGUGGCAGGGCAUGAGGACAGCAAUGGUUGUAUCAACUAUGAAGCGUUUGUGAGGCAUAUCCUGUCGGGGUGACGGGCCCAUGGGGCGGAGCUCGUCCGCAUGGUGCUGAAUGGCUGAGGACCUUCCCAGUCUCCCCAGAGUCCGUGCCUUUCCCUGUGUGAAUUUUGUAUCUAGCCUAAAGUUUCCCUAGGCUUUCUUGUCUCAGCAACUUUCCCAUCUUGUCUCUCUUGGAUGAUGUUUGCCGUCAGCAUUCACCAAAUAAACUUGCUCUCUGGGCCCUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-251.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -264.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 137.01
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(((..(((((((...(((((..((.(((....((.((..((((...))))))))))).))..)))))..)).)))))))).))(((((....)))))))))))))).(.(((((.((((.....))))))))).)...((((((((.(((((((.(((.((((........)))).....))).))))......(((((((.(((((((((.....(((((((((........)))))))))......(((((.((((((((((.(((((((.(((....(((((((((((((....(((((.....((((..((.....))...))))....))))))).)))))))))))....)))....))))))))))))..((((((.((((.(.(((.(((.(((.(((..(((.((((.(((((.(((((.(((((((.(((((((...)))))))...((.((...)).)).....(((((.....)))))((((...))))...))).)))).))).)).)))...(((((.(((...)))))))).)))))).)))..))).))).))).))).).)))).))))))(((((.........))))).....)))))))))).......))))))))).)))))))..((((.....))))((((...............))))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((({{(.(((..(((((((...(((((..((.(((....{{.(({.,,,|}}.},,,.},,))).))..)))))..)).)))))))).}|(((((....)))))))))))))).(.(((((.((((.....)))}))))).)...((((((((.((((,{(..{{,{,,,...,{,.,|}}},,...))),}}})},....(((((((.(((((((((...{,(((((((((.,....,.))))))))).,,...(((((.(((((((((,{(((((((.(((....((((((((((({(....(((((.....((((..{(.....))...))))....))))))).)))))))))))....)))....)))))))))))).,{(((((.((((.(.(((.(((.(({.(((..(({.((((.((((((({{((.{{(((((.(((((((...)))))))...||.{{,,,,,.}),,.,|||||||....}}}}||{((((({((((....}))))).))))),}))}...(((((.(((...)))))))).)))))).)))..))).))).))).))).}.)))).)))))||((((..,......)))))}....)))))))))).......))))))))).))))))).{(,((..{,{,,,,,|||..,,.,........,,)))),,.))))))))
Back