Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021103.4
Sequence Length
461 nt
GC Content
0.5336
GUUUCUUGCUGCAGCAACGCGAGUGGGAGCACCAGGAUCUCGGGCUCGGAACGAGACUGCACGGAUUGUUUUAAGAAAAUGGCAGACAAACCAGACAUGGGGGAAAUCGCCAGCUUCGAUAAGGCCAAGCUGAAGAAAACGGAGACGCAGGAGAAGAACACCCUGCCGACCAAAGAGACCAUUGAGCAGGAGAAGCGGAGUGAAAUUUCCUAAGAUCCUGGAGGAUUUCCUACCCCCGUCCUCUUCGAGACCCCAGUCGUGAUGUGGAGGAAGAGCCACCUGCAAGAUGGACACGAGCCACAAGCUGCACUGUGAACCUGGGCACUCCGCGCCGAUGCCACCGGCCUGUGGGUCUCUGAAGGGACCCCCCCCCAAUCGGACUGCCAAAUUCUCCGGUUUGCCCCGGGAUAUUAUAGAAAAUUAUUUGUAUGAAUAAUGAAAAUAAAACACACCUCGUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-135.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -145.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 108.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((....))))((((((((.((((.((........))))))(((((((..(.....)..))))))).((((..((((((.....((.((..((((((...((..((((((.(......).))))))..))...(((((..(((((..........)))))............(((((..(((((....((((((.(((((((((.........))).)))))))).))....(((((((((.(((....))).)))...))))))...))..)))))..)))))...(.((.((((........))))...)).)...))))).((((.......))))....(((((((....))))))).)))))).)))).))))))..))))((((......))))....(((((.(((....))).))))).................)).))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,,{(((,,..}},,(({(({{{|{{{{.((,...,,,,)})))){{{{(((..(.....}..))))}||.{(((..((((((.....((.((..((((((...{(..((((((.(......}.))))))..)}...(((((..(((((.,.......,)))))..........,.(((((..(((((....{{((((.(((((((((.........))}}}))))))).)).,{.((({(((((.(((....))).)))...))))),...},,.)))))..))))).,....(((,{,.|,,,,..,}}}...,}}}}}.))))).((((.......))))..,.(((((((....))))))),)))))).)))).))))))..))))((((......)))),...{((({.{{,.,,,|||.}}})),,,,,.....,,,..,.},,})))))...
Back