Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021126.8
Sequence Length
1350 nt
GC Content
0.6652
GUGCCGGAGUCUCCUCCCUUUGGUCCGCUGCAGGUUGGUGGCGGGAGGAGGGGACAGCUGCGGGCGCGGGGAGGGGGCGCCGCGCCGCGGGGGCCAUGGCGGAGCCAGGAAGCCGGGAGUCCGAGACCCGGGCCCGCAGCCCGAGUGUCGCCGCCAUGGCUUCGCCGCAGCUCUGCCGCGCGCUGGUGUCGGCGCAAUGGGUGGCGGAGGCGCUGCGGGCCCCGCGCGCUGGGCAGCCUCUGCAGCUGCUGGACGCCUCCUGGUACCUGCCGAAGCUGGGGCGCGACGCGCGACGCGAGUUCGAGGAGCGCCACAUCCCGGGCGCCGCUUUCUUCGACAUCGACCAGUGCAGCGACCGCACCUCGCCCUACGACCACAUGCUGCCCGGGGCCGAGCAUUUCGCGGAGUACGCAGGCCGCCUGGGCGUGGGCGCGGCCACCCACGUCGUGAUCUACGACGCCAGCGACCAGGGCCUCUACUCCGCCCCGCGCGUCUGGUGGAUGUUCCGCGCCUUCGGCCACCACGCCGUGUCACUGCUUGAUGGCGGCCUCCGCCACUGGCUGCGCCAGAACCUCCCGCUCAGCUCCGGCAAGAGCCAACCUGCUCCCGCCGAGUUCCGCGCUCAGCUCGACCCCGCCUUCAUCAAGACCUACGAGGACAUCAAGGAGAACCUGGAAUCCCGGCGCUUCCAGGUGGUGGACUCCCGAGCCACUGGCAGGUUCCGCGGCACCGAGCCCGAGCCCCGAGACGGCAUUGAACCUGGCCACAUCCCAGGUACCGUGAACAUCCCCUUCACAGACUUCCUGAGCCAGGAGGGGCUGGAGAAGAGCCCUGAGGAGAUCCGCCAUCUGUUCCAGGAGAAGAAAGUGGACCUGUCUAAGCCACUGGUGGCCACGUGUGGCUCUGGCGUCACAGCCUGCCACGUGGCACUAGGGGCCUACCUCUGCGGCAAGCCAGACGUGCCCAUCUACGAUGGCUCCUGGGUGGAGUGGUACAUGCGCGCCCGGCCCGAGGAUGUCAUCUCAGAGGGCCGGGGGAAGACCCACUGAAGCUGGGCAGGACACAGGCGAGCUCAGGUGAUGCCGGCCACCAGCAAUGCCUGGCCUGGUAGCUCCGCUUCUGCUUUCACCAAGAGAGUGUUUCUUCACUCAACUCAGGUGGCAUUUGGGGUGACAUCUCAAAGGCCAGGAAUUCCGUUGACUUGUUGGCUGCCAGUAGGGGCGGGAGGAAAGGCGGAGGCGAGCCCUGGAGGAGGGAGGCCACAACUCCGAGCUGCCCACCUGGUGCUGAGCUGGGGCCCCGCCUCCUUUCUGUUUUAUUUUUGAGGAAAUAAAAUAACCAAGUGCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-634.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -656.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 311.53
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.(..(((((((((..((((..((.(((((..(((..(((((.((((.((((((..((((((((((((.((((((((((.((((((((..(((((((((((((....(((.....(((.((.(((((.....))))).)).)))))))).)))))))))))..))))..)))))))).))))))((((((.(.(((((((((((((((((((...))))((.(((((((((.((.((((.(((((((....))).)))).)))).)).((.((((.(((.((((((...(((..((((((((((((........))))).....)))))))..))).....))).)))..))).)))))).............))))))))).))((((((...(((((.((.....(((((...(((((((((.(((.(((((..(((((((...)))))))...(((....((((.........))))..)))....))))).)))))))))))).)))))...)).)))))....))))))..))).)))))))))))).).))))))....))))))....(((((.(((..((((......))))..)))))))).))))))))))).).)))).))))).))).))))).)).))))...)))).))....)))..))))))))...(((((((((((((((((((((.((.(..(((((.(.(((.....))))))))).).))..))).))).((((((.......))))))...(((((.......))))).....(((((...)))))((((((.......))))))..)))).))))))))))).((((((........(((..((((((((.(((.((((((.((((..(((((...(((......))).))))))))))))))).)))..((.(((((.....).)))).))((((.(((..((((((((((((((.(.(((((....)).))).).)))).)))).))))))..)))))))((((((....))).)))....)))))))).)))..((.((.(((((((.(((.((...)).))).))))))).)).)).((((.(((((((((((..((....(((((......)))))........((((.((((((((...)))))))).))))....(((((((..((((((((...))))))))))))))))).)))))))))))))))))))))((((((((((.....((((.((((((((....)).))..))))))))....))))))))))(((((((((((....))))))))))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((...((((((((((...((((((((,.(((((..(((..(((((.((((.((((((.,((((((((((((.((((((((({{((((((((..(((((((((((((..{{(((....,||{.((.(((((.....))))).)}.))))}})).)))))))))))..))))..)))))))).))))))((((((.(.(((((((((((((((((((...})))((.(((((((((.((.((((.(((((({....})).)))).)))).)).|||((((((((.{((((,...(((..((((((((((((........))))).....)))))))..)))....}))).}))..})).,}}}))}},..........))))))))).)){((({{...{((((.((..{..(((((...(((((((((,(((,(({{{..(((((({...})))))),,.(((.,,.((((.........)))),}}})},,,))))).})}})))))))).)))))..,}|,})))}....}}}}))..)))})))))))))))).).))))))....))))))....{(((,{(((..((((......))))..)))))))}.))))))))))).).)))).))))).))).))))).|{.|||..{{.|{{,,..||}||,.,})})},.||||((((((((((((((((({(((.(({(..(((({,(.(((.....)))))))))}).})..))).}}}.((((((.......))))))...(((((.......)))))....,(((((...)))))|(((((.......)))))}..)))).))))))))))).,{,,||.,.....})))))))....,,.(((.(((((,{((((({{{(((...(((......))).))))))))))))))).)))...((((((((((,,((({|,((.((((.(((..((((((((((((((,(.(((({....}).)))}),}))).}))).))))))..)))))))))(((,....))).,.({(((,(({(|||,(.(((((,.{{,{{((((.{{{.{{.,,)),))}.))))))))))}}}.}))).))}}},{{{{{{.,,..|,(((((......)))))..|},.}}|(((.((((((((...)))))))).)))}{{....}},,,..,,,,})))))))).))))))).))))))}.,)))...)))){((||((({((((((((((.....((((.((((((((....)).))..))))})))....))))))))))|((((((((((....)))))))))),.))}.).)))...
Back