Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021127.3
Sequence Length
1899 nt
GC Content
0.3665
AGAGUUUCCCGGGCACUCACCGUGUGUAGUUGGCAUCUCCGCGCGUCCGGACACCCGAUCCCAGCAUCCCUGCCUGCAGGACUGUUCGUGUUCAGCUCGCGUCCUGCAGCUGUCCGAGGUGCUCCAGUUGGAGGCUGAGGUUCCCGGGCUCUGUAGCUGAGUGGGCGGCGGCACCGGCGGAGAUGCCUGGGAAGAAGGCGCGCAAGAACGCUCAACCGAGCCCCGCGCGGGCUCCAGCAGAGCUGGAAGUCGAGUGUGCUACUCAACUCAGGAGAUUUGGAGACAAACUGAACUUCCGGCAGAAACUUCUGAAUCUGAUAUCCAAACUCUUCUGCUCAGGAACCUGACUGCAUCAAAAACUUGCAUGAGGGGACUCCUUCAAAAGAGUUUUCUCAGGAGGUGCACGUUUCAUCAAUUUGAAGAAAGACUGCAUUGUAAUUGAGAGGAAUGUGAAGGUGCAUUCAUGGGUGCCCUUGGAAACGGAAGAUGGAAUACAUCAAAGUGAAUUUCUGUUCAAGUUUUCCCAGAUUAUCAUUCUUUGGGAUGAGAGAACAUUAUAAAACCACUUUGUUUAUUUUAAAGCAAGAAUGGAAGACCCUUGAAAAUAAAGAAGUAAUUAUUGACACAUUUCUUUUUUACUUAGAGAAUCGUUCUAGUGUUUUUGCCGAAGAUUACCGCUGGCCUACUGUGAAGGGAGAUGACCUGUGAUUAGACUGGGCGGCUGGGGAGAAACAGUUCAGUGCAUUGUUGUUGUUGCUGUUUUUGGUGUUUUGCUUUUCAGUGCCAACUCAGCACAUUGUAUAUGAUUCGGUUUAUACAUAUUACCUUGUUAUAAUGAAAAAACUCAUUCUGAGAACACUGAAAUGUUAUACUCAGUGUUGAUUUCUUCGGUCACUACACAACGUAAAAUCAUUUGUUUCUUUUGACUCAAAUUGUAUUGCUUCUGUUCAGAUGAUCUUUCAUUCAAUGUGUUCCUGUUGGGCGUUACUAGAAACUAUGGAAAACUGGAAAAUAACUUUGAAAAAAUUGGAUAAAGUAUAGGAGGGUUACUUGGGGCCAGUAAAUCAGUAGACUGAACAUUCAAUAUAAUAAAAGAACAUGGGGAUUUUGUAUAACCAGGGAUAAUAAAAAGAAAAAAGAAGUUAAUUUUUAAUUGAUGUUUUUGAAACUUAGUAGAACAAAUAUUCAGAAGUAACUUGAUAAGAUAUGAAUGUUUCUAAAGAAGUUUCUAAAGGUUCGGAAAAUGCUCCUUGUCACAUUAGUGUGCAUCCUACAAAAAGUGAUCUCUUAAUGUAAAUUAAGAAUAUUUUCAUAAUUGGAAUAUACUUUUCUUAAAAAAAAGGAACAGUUAGUUCUCAUCUAGAAUGAAAGUUCCAUAUAUGCAUUGGUGAAUAUAUAUGUAUACACAUACUUACAUACUUAUAUGGGUAUCUGUAUAGAUAAUUUGUAUUAGAGUAUUAUAUAGCUUCUUAGUAGGGUCUCAAGUAAGUUUCAUUUUUUUUAUCUGGGCUAUAUACAGUCCUCAAAUAAAUAAUGUCUUGAUUUUAUUUCAGCAGGAAUAAUUUUAUUUAUUUUGCCUAUUUAUAAUUAAAGUAUUUUUCUUUAGUUUGAAAAUGUGUAUUAAAGUUACAUUUUUGAGUUACAAGAGUCUUAUAACUACUUGAAUUUUUAGUUAAAAUGUCUUAAUGUAGGUUGUAGUCACUUUAGAUGGAAAAUUACCUCACAUCUGUUUUCUUCAGUAUUACUUAAGAUUGUUUAUUUAGUGGUAGAGAGUUUUUUUUUUCAGCCUAGAGGCAGCUAUUUUACCAUCUGGUAUUUAUGGUCUAAUUUGUAUUUAAACAUAUGCACACAUAUAAAAGUUGAUACUGUGGCAGUAAACUAUUAAAAGUUUUCACUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-494.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -533.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 495.66
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((.(((((((((....(((((.((.((((((((((((((((((....))).((((((((((.(((((((((((((.((..((.....))..))))))))))(((((((.....((((.(((((.(((((..((...)).))).)).))))))))))))))))......))))).)))).))))))....)))))))......((((....))))(((....))).((((((...))))))(((.(((((...))))).)))(((((((((((((..((..(((......)))((((....))))....))...)))))).))))))).((((....)))).((((.........))))(((((((((((........)))))))))))))))))))(((((((.((((((((.((.....)).))....))))))..)))))))..)).)))))...)))))))))..))))))(((((((((((((((((((((((..(((.(((((...((.(((((((.........))))))).))..)))))....)))..)))))))...............(((((((((((..(((((.....(((((((((....((.((..((((((.......))))))..))))..((((....((((((((.......((((..((((.((((.(((((.(((..........((((....))))..(((((((((.....(((....)))....))))))))))))))))).)))).))))))))..(((((((...(((((...(((((((((((((........)).)))))........((((...))))...))))))....)))))...)))))))..))))))))....))))...........(((((..((....))..)))))...))))))))).)))))..).)))))))))).)))))))))....(((((((((((((((........((((.((((((((((((((.......((((((((.....((((.((((((((((((......((((....)))).....................(.(((..((.....))..))).)................(((((((((.........(((..((((.(((((((..(((((...(((((((...................))))))))))))...))))))).))))..)))...(((((((...(((((.....((((.....))))....))))).(((((((....)))))))..((((((((...((((((..(((((((((......)))))).)))..)))).))......)))))))).(((.........)))..(((((((((.((((((.(((((..((((....))))))))).)))))).)))...)))))).)))))))...))))))))).....)))))))))))).)))).....))))))))(((((......)))))..((((((((((..(((((............)))))......))))))))))(((.(((((..((((((((.......))))))))...))))).))))))))))))..))))).)))).(((((((......))).))))..))))))))...)))))))..((((((((.....((.(.......))).....)))).))))..))))))).(((((((((((.(((((((..((((((((((((((((((..........(((....))))))).)))))))).)))).))..)))))))....(((((........))))).........))).))))))))..((((((((((......)))))..))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((.(((((((((..,.(((((,((.((((((((((((((((((....))).((((((((((.(((((((((((((.({..({.....)}.,)}))))))))(((({(((....(((,{(((((,(({(({.{,...))})}),)).})))))))))}}))))}}}...))))).))))}})))))....)))))))......((((....)))){{{....))},((((((...)))))|(((.{((({,,.}}}}}.},|(((((((((((((..|,..||{....,,)))((((....})))....}}...)))))).))))))).{(((....)))).((((.........))))(((((((((((........))))))))))))))))))){{{((((.((({,,}}},|....,}},)}),..,}}})}..}||||||..,,.))))),).)))))))))..))))))(((((((((((((((({{(((((..{{,.(((((...({.(((((((.........))))))).})..)))))....,,,..)))))||{{{......}},,,.((((((((((,..(((({.....(((((((((....,,.,,..((((((.......)))))).,|||,..((((....((((((((...,{{{(((({,((((.{((({{{{,,.,||}.....,},.,|||}},})}})..{((((((((.,,..(((....))),,..))))))))}|||||}}},|}}|.}}}|)}}}.,((((|{{...(((((,{{(,,({{.,||,||....,,..})}}}}||{{{.....,|||,,.)))),,||||||}..,.,}}}),}})))))}}..)))))))).,..)))),,,}.......(((((..((....))..))))).},))))))))).}))))..}.)))))))))).))))))))).,{{(((((((((((((({........((((.((((((((((((((.......((((((((.....((((.((((((((((((......((((....))))..................,.,{,,(({,(({,{..,,,,||,.,...............{((({,((((({{...})))}}}.})}}}(((((((..((((,..{(((((((....,,.......,.....))))))))))))...)))))))..,|}|}},{.|,,,}.,})).}||(((.,,..||{|.,..,|}}}..,|)})}}.(((((((....))))))),,{{{((((....}|||||,,{,{{{{|||.......,||||{,,|..||||{.....}}}))}},,))}}}{(({((((.((((({...{{.(((.((((((.(((((,,{((,....)}))))))).)))))).))),,.,.)))))).)))}}))}),}|}},,,,,},.)))))))))))).)))).....))))))))(((((......)))))..{(((((((({..{,{{{...,,,,,,,..}})))}|||..)))))))))){{{.{{(((..((((((((.......)))))))).,}}}}}).)}}})))))))}.,))))).)))).(((((((......))).))))..})))))))...))))))},}|||{{({{,{...,|,},.,{{{{{{{.....,,,)}.)))}}))))))).(((((((((((.(((((((..((((((((((((((((((.,,,,,....{{{.,,,))})))).}))))))).)))).)}..)))))))....{(({{........}}}}}..,,,,...))),,))))))).{((((((((((......)))))..))))),
Back