Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021131.5
Sequence Length
2666 nt
GC Content
0.5923
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Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1148.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1195.61
Frequency: 0.0000
Diversity: 776.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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