Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021250.4
Sequence Length
1390 nt
GC Content
0.5576
GCAUUUCUCCUCUGUGCUCAUUGCCACAUGCAGCUCAGCCUGGGCUACACAGCCAGGUGUCAGAUGUGUCUCUGCUGAUCUGAGUCUGCCUGUGGCAUGGACCUGCAUCUUCCCUGAAGCAUCUCCAGGGCUGAAAAAUCACUGACCAUGGCACCAUGGUCUCAUCCAUCUGCACAGCUGCAGCCAGUGGGAGGAGACGCCGUGAGCCCUGCCCUCAUGGUUCUGCUCUGCCUCGGGCUGAGUCUGGGCCCCAGGACCCACGUGCAGGCAGGGAACCUCUCCAAAGCCACCCUCUGGGCUGAGCCAGGCUCUGUGAUCAGCCGGGGGAACUCUGUGACCAUCCGGUGUCAGGGGACCCUGGAGGCCCAGGAAUACCGUCUGGUUAAAGAGGGAAGCCCAGAACCCUGGGACACACAGAACCCACUGGAGCCCAAGAACAAGGCCAGAUUCUCCAUCCCAUCCAUGACAGAGCACCAUGCAGGGAGAUACCGCUGUUACUACUACAGCCCUGCAGGCUGGUCAGAGCCCAGCGACCCCCUGGAGCUGGUGGUGACAGGAUUCUACAACAAACCCACCCUCUCAGCCCUGCCCAGUCCUGUGGUGACCUCAGGAGAGAACGUGACCCUCCAGUGUGGCUCACGGCUGAGAUUCGACAGGUUCAUUCUGACUGAGGAAGGAGACCACAAGCUCUCCUGGACCUUGGACUCACAGCUGACCCCCAGUGGGCAGUUCCAGGCCCUGUUCCCUGUGGGCCCUGUGACCCCCAGCCACAGGUGGAUGCUCAGAUGCUAUGGCUCUCGCAGGCAUAUCCUGCAGGUAUGGUCAGAACCCAGUGACCUCCUGGAGAUUCCGGUCUCAGGAGCAGCUGAUAACCUCAGUCCGUCACAAAACAAGUCUGACUCUGGGACUGCCUCACACCUUCAGGAUUACGCAGUAGAGAAUCUCAUCCGCAUGGGCAUGGCCGGCUUGAUCCUGGUGGUCCUUGGGAUUCUGAUAUUUCAGGAUUGGCACAGCCAGAGAAGCCCCCAAGCUGCAGCUGGAAGGUGAACAGAAGAGAGAACAAUGCACCAUUGAAUGCUGGAGCCUUGGAAGCGAAUCUGAUGGUCCUAGGAGGUUCGGGAAGACCAUCUGAGGCCUAUGCCAUCUGGACUGUCUGCUGGCAAUUUCUUUUUUUCUUUCUUUUCUUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCACCAGGCUGGAAUGCAGUGGCGCAAUCUGGGCUCACUGCAACCUCCGCCUCUCGGGUUCAAGUGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCUGGCAAUUUCUAGAGGGAGGAAUGGGUGUUUGAGUGCAGAGACACUGGUCUGGGGUGAUCCAUGGAGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-537.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -562.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 329.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((((.((....))))))).(((((...........)))))))))).)))).)))))))...(((((..((((((((..((.....((((((((((..((((((((((((((....))))))).............((((((((((...((((.(((((....(.(..(((((((..((((((((((....(((.(((((...))))))))..)))))))...)))..)))))))..))))))).........((((((.(((.((((((.((((((.....((((((...((((.((((((..(((((((..(((.((.....)))))..).))))))..)))))).))))((....))....))))))....)))))).))........((((((.((...(((((........((((...((((.........))))..))))......(((((.......)))))....(((((((((((..((((((((..((((((..(((((.(((.(((((..((((((............((((((((.....(..(((((.((...)).)))))..)...((((.((........)).))))))))))))...((((((.((....(((((((((.((((((........))))))...))))))..))).(((((.(((.....))))))))...)).))))))...)))))).))))).))).)))))..)))).))..((......)).((((.((((....((..((((((.((((..((.(((..(((((....((((((.((((....))))))))))..(((((.....)))))..((((...........)))).))))).)))))....)))).))))))...))....))))...)))).))).))))).)))))))))))...))))).)).))))))(((((((....))))))))))).))))))))).....)))).))))))))))(((((.(((.((((((((((((((((...)))))....((((.((((((((......))))).))).))))(((((((.((.((((..((((((((....))).)).)))..)))).)).).)))))).....))))))))))).))).)))))..........................((((((((...))))))))(((((((.(((.(((((((((.((...)).)).)))))))...)))))))....)))...)))))))........)))))).))))......))..)))))))).)))))...))))))))))(((....)))((((....)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{(((((((((((((((.(((((((.(((((((((((((({((....))))))).(((((........},,))))}))))).)))).))))))).,.((((,..((((((((..((.,...((((((((((..((((((((((((((....))))))).....(((((...((((((((((..{((((,(((((.{,,({(,,{{{{{{{,,|||||{((((....(((.{((((...)}||||||.,}}))})}...})}..)))))|}..,,}))))...||,...(((({(((((,,(((({.{|||{|.},,,||{|||}..((((.{(((((..(((((((..(((.{(.....)))))..),,)))))..)))))}.)))}||...{||{{..,,))))}...}}}}}}.}}..}}},,,|||{{|.,{..}|||||..}}}}}.||||,|.,,{{...{{.{,,||||{{|||,......(((((.......))))),,,}|((((((((((..((((((((.,({((((..(((((.(((.(((((..{(((({.....,......((((((((..,..(..(((((.((...)).)))))..)...((((,((......,.)).)))))))))))).,,,.((({.,...|||,.,,}}}}}((((((.,....}.))))))((.{({{(((,,....((((.{{{.,,,,}))})))))}))),)},}},...)))))).))))).))).)))))..)))).))..{{....,,|}.,,{{,((((,,..((.,((((((.((((.,((.(((..(((((,,..((((({{((((....))))))))))..(((((.....)))))..((({...........}))).))))).)))}).,,.)))).)))))).,.)).,,.))))...,}}}.))).))))).))))))))))}...}))))},)}}|||||(((((((....)))))))||||.,,))))},}.....)))}.)))))))))){,|||}|{,.(((((((((({((({(,..}}}}}....,|((,{({(((((......}}}}}.}|}|},|{(((((((.((.{(((..{{{{{(({....))).)).)))..)))}.)).),)}}))),....,}}}))))))).}}},))}}}........................,,((((((((...)))))))),((((((.(((.(((((((((.({...}).)).)))))))...)))))))...,)}}...))))))).,......)))))).))))......))..)))))))).})))).}.))))))))))(((....)))|(({....}))}.)))))}
Back