Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021632.4
Sequence Length
2355 nt
GC Content
0.4263
ACUCCAGAAGUAGGAGCAGUUUACGGAAGUGUAACGUUGAGGCCCUUCUUGUGUAUCUGGAGAAAAUAGAGGUUCUGACUCCUCAGGAGCAAAAAACAUAACCUGAAGAGGGAGGAAGUGGAUUUGGGGUUCACCAUUUCUUGGGGCACACUUGAUUGAAAACUGAGACUUCUGAAGAGAAGGCCAGAAGAUACAAAGACAGACCAUCCCAGUUGAAUGCUGUCUUCCAAGAACAGAAGAAAAUGAUCCAGGCCCAGGAAUCCAUAACACUGGAGGAUGUGGCUGUGGACUUCACUUGGGAGGAGUGGCAACUCCUGGGCGCUGCUCAGAAGGACCUGUACCGGGAUGUGAUGUUGGAGAACUACAGCAACCUGGUGGCAGUGGGGUAUCAAGCCAGCAAACCGGAUGCACUCUUCAAGUUGGAACAAGGAGAACAACUGUGGACAAUUGAAGAUGGAAUCCACAGUGGAGCCUGUUCAGACAUAUGGAAAGUUGAUCAUGUGCUGGAGCGCUUGCAGAGUGAAAGCCUGGUGAACAGAAGGAAACCAUGUCAUGAACAUGAUGCAUUUGAAAAUAUUGUUCAUUGCAGCAAAAGUCAGUUUCUGUUAGGGCAAAAUCAUGAUAUAUUUGACUUACGUGGAAAAAGUUUGAAAUCCAAUUUAACUUUAGUUAACCAGAGCAAAGGCUAUGAAAUAAAGAACUCUGUUGAGUUUACUGGAAAUGGGGACUCCUUUCUUCAUGCUAACCAUGAACGACUUCAUACUGCAAUUAAAUUCCCUGCAAGUCAAAAACUCAUCAGCACUAAGUCCCAAUUCAUCAGUCCCAAGCAUCAGAAAACACGAAAAUUAGAGAAGCAUCAUGUGUGCAGUGAAUGUGGGAAAGCCUUCAUCAAGAAGUCUUGGCUAACUGAUCACCAGGUAAUGCAUACAGGAGAGAAACCCCACAGAUGUAGUCUAUGUGAGAAAGCCUUCUCCAGAAAGUUCAUGCUUACUGAACAUCAGCGAACUCAUACAGGAGAAAAACCUUAUGAAUGCCCUGAAUGUGGCAAAGCCUUUCUCAAGAAAUCACGGCUCAACAUACAUCAGAAAACACAUACCGGAGAGAAACCCUAUAUAUGCAGUGAAUGUGGAAAAGGCUUCAUCCAGAAAGGAAAUCUCAUUGUACACCAGCGAAUUCAUACAGGUGAGAAACCUUAUAUAUGCAAUGAAUGUGGAAAAGGCUUCAUUCAGAAGACGUGUCUCAUAGCACAUCAGAGAUUUCACACAGGAAAGACGCCCUUUGUGUGCAGUGAAUGUGGAAAAUCCUGUUCUCAGAAAUCAGGUCUCAUUAAACAUCAAAGAAUUCACACAGGAGAGAAACCCUUUGAAUGUAGUGAAUGUGGGAAAGCCUUUAGCACAAAGCAAAAGCUCAUUGUCCAUCAAAGGACUCAUACAGGAGAGAGACCCUAUGGCUGUAACGAGUGUGGGAAAGCGUUUGCGUAUAUGUCGUGUCUGGUUAAGCAUAAGAGAAUACACACAAGGGAGAAACAAGAGGCAGCCAAGGUGGAAAAUCCUCCUGCAGAGAGGCACAGCUCAUUACACACCAGUGAUGUCAUGCAGGAGAAAAACUCUGCUAACGGGGCGACUACACAAGUGCCUUCUGUGGCCCCUCAGACAUCAUUAAACAUCAGCGGCCUCCUCGCAAACAGGAACGUAGUCCUUGUGGGACAGCCAGUGGUCAGAUGUGCAGCCUCAGGAGAUAACAGAGGAUUUGCACAGGACAGAAACCUUGUGAAUGCAGUGAAUGUGGUUGUGCCUUCCGUGAUCAAUUAUGUCUUAUUUUAUGUUACAGAAAACCCAUAGGAAGAAAACUCAGAUCUAUGUGGAAAAGGGUUGAGCAAAAAUUUGUAGUUCAUUAUGUGGCCGAAAAGCAUACACUGAGAGAACAUGUAUAAGGCUGAGAUAGCCUGAUAAACUCAUCCUAUUAAAAUGUAUGCUGUGAUACACAGGCAAAUUUGAUGUUAACCUAAGCACAUACACAGCAAUUGCUCGACUGUGUCAAUUAAAUGAGUAAAGGAAGCCCAAGUACUUUUAAGUGGAGGAAAUGAAGUACUGUGAAUUUUUAAAACAGAUGAGAUAAUUGGUGUCGGGAGUGUUGCAGUGACUGAAAAGCUUCAUAAGGGGCAGUUGGUGGGAAAGGGCUAAUACUGUAAUGGUGGAAUGUGGGACACAUAUGUGUCAAUUCAGUUUCCUUAGACCAGUGCCAGUGUGGAGGAUUAAUUGAAAACCAGGACCAUAAACUUUCAGAACUUUGUAUUAUGCAGAGGGAUCUGUGAAACUAGUCAAUUUGUUUCAUUAAACAAAUAUUUUAAAAUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-628.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -676.24
Frequency: 0.0000
Diversity: 730.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((.(((.((.....(((.........)))....))))).))......)))))))..(((((((((((((((((.(((((..............))))).))).(((...((((.(((((..((((((((..(((((.((.(.((((............((((((((..((((((((.......((((.((((....((((.((((.....)))).((((((((....((((.......((((((((((....((((......))))...)).)))).)))))))).))))))))((((....))))((((((...)))))).......(((((((((.(((...(((....)))....))).)))))).)))(((((((.((...((((((.....(((..(((.((((.(((.(((((.((....((.(((((((...............)))))))))...))))))).)))...)))).)))..)))...))))))..(((((...)))))...(((((((((.(((((((...(((((((((..(((((((((.(((((......((((..(((..((..(((((((....(((((((......)).)))))...)))))))...((((............))))..(((((....))))).((.(((....))).)).......((((((....))))))(((((.(((.((((((......((((((.....)))))).((((......((((...........))))))))..................)))))).)))..))))).....))..)))..))))......)))))...))))))))).....))).)))))).....))))).(((((....))))).....)).)))))))))...............)).))))))).))))..)))).)))).....))))))))))).))))).(((((((((((...)))).....(((((.(((.......)))))))).....((((.((((....((((((((....))))....)))).....)))))))).........((((((.(((.....(((((((((((....((((..((((((((..((((.....((((((((.((((......))))........((((.....))))...........((((((.((......)).))))))...((.((((......)))).)).)))))))).....((.......))((((((((..(((((((.(((......(((....)))...))).)).)))))..))).))))).(((((((((..((((.....))))...))).)))))).)))).))))))))..)))).(((....)))....((((......))))((((((..(..(.((.((....)))).)..)..))))))........))))))))))))).).)))))))))))))........................)))).)))..)))))))))..((((((((.(((....((((((((((.(..(.(((((((((((((..(((((........)))))....(((((.((................)).)))))...)))))))).......((..(((.(((.((((...((((......)))))))))))..)))..))(((...(((((((((((.(.......).))))..))))))).))).....(((((((((.((.......((.(((((((((((((..((((((..(((((((((...((((...(((((..(((.........(((((....((((((.....(((((((....((((((((.((((.(((((((((......)).)))).)))..))))...(((.((((((...)))))).))).......................(((((...)))))))))))))....)))))))...))))))((((((........).))))).........)))))...((....)).((((((((..............)))))))))))..)))))..)))))))))))))))))))..)))))).).)))))).))......)))))))))))......))))))..).)))))..........((((((((..((((((((....)))))...)))..))))....)))))))))..)))))))))))...))))..))))).))))...))))))))))))).))))..(((((....)))))...........((((((((....))))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((.(((.((..{{.(((.........))).,}.))))).))......)))))))..{(({(((((((((((((.(((((..............))))).))),{((...((((.(((((..(((({{{,,(((({{.{(,(,(({{.,,.....(((.{.(((((,..,|||||,|}}}....,,{,,(((({{..,{((.,,,,.},..})))}|||(((((....((((.......((((((((((....((((......))))...)).)))).)))))))).)))))}||((((....))))||{(((,{{|}||},,,{,,.{(((((((((.(((...(((....)))....))).))))))}}))|((((((.((...((((((.....(((..(((.((((.(((.((((,{((....(.{(((((((...{,.....,....))))))))}...))))))).}))...)))).)))..)))...))))))..{{(({,..}}}}}...(((((((((.({(((((...(((((((((,.(((((((((.,,{,,.....,{{||,,,.}}}||,.,{{{{{{,{,,(((({{({.....,}.||||}.,.|}|||||..{{(,,..,{{{{{{,..,,,...|||||}},.}}},,.({.(((....))).}}.......((((((....)))))).|{||||{||(({{{|,,,,||{(((((.....}}}}}|.{{,{{,,.,,((((......,,,,.})}}}}}},....||,,,,.....,|}))),,,|||,|}|||||||..}|,,||,...||||,.....,..,...}}}))}))),,...}))},))))),....}||||.{{{((,,,.})))|,,..,}}.)))))))))..,.,,,.,,,..,.}}.)))))}|.|||||.||||.|,||{{.,{|||||,||{|,|..|{{{(((({{,((({...}))).,...(((((.(((.......)))))))).{{{,({{..{|{|},,.((((((({.,..}}},,,,,}||}.....}},,}}}}.........,,,((,..,....||,,{{{,{||,|}},.|{||,.||||||||..{{{...,,||,..{{((((((((.....,,,......}}}}|||}}}}..})}}...,.,}}.,|||||.}||}.,}}}))}|.}))).}})}){{{||||||,}}}||||,|||,||||,{{{{{|......,||||,|}))}}}|||||{{{,{{,...,||{{|||...,....})))||||||,..}||||,....{((((((((..{(((.....))))...))).))))))})))).,|||}|||.{|||,.,||.,..))}....((((......)))),{.,.(((({{.{(..(({{.{{{||{{..,..,|||,......{.{|||,||||||,|{,|{|||,,,.,)))))..}}.,,}},,}.},}}.,....})),,.,))}})))})),))...,||||||}|,,..{{(((((((((({((.({(,,,(((((((((..((((({{.....})))))....(((((.((..,....,........)).)))))...))))))))}....,,((..(((.(((.((((...((((......)))))))))))..)))..))||{...(((((({((((.{.......).))))..})))))).}}}.....{{{((({,,.||.}}}}}}|,}||||||||||(((..((((({,.,,(((({((,..((({...,,,,.,{{{{|||,.||....||...})||||{|,....(((((((,{{.((((((((.{{{{.{,.{(((,,.....{||{{{||.|||,.|},,..,({{.((((((...}))))).}}}....,,,.,,.,,....})))}}||{{{...))))}))))))))..}})))))))...}}}}}|{{{{{{.....}},,.)))))},..,,,..}),}}..,|{.,..)},||{|||||...,|.,,,,....}}}}})))}}),.)))))..,}}}))))))))}})))))..))))))})))))))),,)}},,..}}}})))}}))}}}.}}}})))}.,}.})))}.,,,|||,..{||||{{{,,|{{(((((....)))))...}))..}))),,.,)})))))))})))))))))),,...))))..))))).))))...))})))))))))).}}}}..(((((....)))))|,.........{((((((|....})))))))............
Back