Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_021642.5

Sequence Length

2643 nt

GC Content

0.4521

ACAGUGCUGGGAUGACUAUGGAGACCCAAAUGUCUCAGAAUGUAUGUCCCAGAAACCUGUGGCUGCUUCAACCAUUGACAGUUUUGCUGCUGCUGGCUUCUGCAGACAGUCAAGCUGCUCCCCCAAAGGCUGUGCUGAAACUUGAGCCCCCGUGGAUCAACGUGCUCCAGGAGGACUCUGUGACUCUGACAUGCCAGGGGGCUCGCAGCCCUGAGAGCGACUCCAUUCAGUGGUUCCACAAUGGGAAUCUCAUUCCCACCCACACGCAGCCCAGCUACAGGUUCAAGGCCAACAACAAUGACAGCGGGGAGUACACGUGCCAGACUGGCCAGACCAGCCUCAGCGACCCUGUGCAUCUGACUGUGCUUUCCGAAUGGCUGGUGCUCCAGACCCCUCACCUGGAGUUCCAGGAGGGAGAAACCAUCAUGCUGAGGUGCCACAGCUGGAAGGACAAGCCUCUGGUCAAGGUCACAUUCUUCCAGAAUGGAAAAUCCCAGAAAUUCUCCCAUUUGGAUCCCACCUUCUCCAUCCCACAAGCAAACCACAGUCACAGUGGUGAUUACCACUGCACAGGAAACAUAGGCUACACGCUGUUCUCAUCCAAGCCUGUGACCAUCACUGUCCAAGUGCCCAGCAUGGGCAGCUCUUCACCAAUGGGGAUCAUUGUGGCUGUGGUCAUUGCGACUGCUGUAGCAGCCAUUGUUGCUGCUGUAGUGGCCUUGAUCUACUGCAGGAAAAAGCGGAUUUCAGCCAAUUCCACUGAUCCUGUGAAGGCUGCCCAAUUUGAGCCACCUGGACGUCAAAUGAUUGCCAUCAGAAAGAGACAACUUGAAGAAACCAACAAUGACUAUGAAACAGCUGACGGCGGCUACAUGACUCUGAACCCCAGGGCACCUACUGACGAUGAUAAAAACAUCUACCUGACUCUUCCUCCCAACGACCAUGUCAACAGUAAUAACUAAAGAGUAACGUUAUGCCAUGUGGUCAUACUCUCAGCUUGCUGAGUGGAUGACAAAAAGAGGGGAAUUGUUAAAGGAAAAUUUAAAUGGAGACUGGAAAAAUCCUGAGCAAACAAAACCACCUGGCCCUUAGAAAUAGCUUUAACUUUGCUUAAACUACAAACACAAGCAAAACUUCACGGGGUCAUACUACAUACAAGCAUAAGCAAAACUUAACUUGGAUCAUUUCUGGUAAAUGCUUAUGUUAGAAAUAAGACAACCCCAGCCAAUCACAAGCAGCCUACUAACAUAUAAUUAGGUGACUAGGGACUUUCUAAGAAGAUACCUACCCCCAAAAAACAAUUAUGUAAUUGAAAACCAACCGAUUGCCUUUAUUUUGCUUCCACAUUUUCCCAAUAAAUACUUGCCUGUGACAUUUUGCCACUGGAACACUAAACUUCAUGAAUUGCGCCUCAGAUUUUUCCUUUAACAUCUUUUUUUUUUUUGACAGAGUCUCAAUCUGUUACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGUGCUAUCUUGGCUCACUGCAAACCCGCCUCCCAGGUUUAAGCGAUUCUCAUGCCUCAGCCUCCCAGUAGCUGGGAUUAGAGGCAUGUGCCAUCAUACCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUUAUUUUUUUUUUUUAGUAGAGACAGGGUUUCGCAAUGUUGGCCAGGCCGAUCUCGAACUUCUGGCCUCUAGCGAUCUGCCCGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUGACCAGCAUCAGCCCCAAUGUCCAGCCUCUUUAACAUCUUCUUUCCUAUGCCCUCUCUGUGGAUCCCUACUGCUGGUUUCUGCCUUCUCCAUGCUGAGAACAAAAUCACCUAUUCACUGCUUAUGCAGUCGGAAGCUCCAGAAGAACAAAGAGCCCAAUUACCAGAACCACAUUAAGUCUCCAUUGUUUUGCCUUGGGAUUUGAGAAGAGAAUUAGAGAGGUGAGGAUCUGGUAUUUCCUGGACUAAAUUCCCCUUGGGGAAGACGAAGGGAUGCUGCAGUUCCAAAAGAGAAGGACUCUUCCAGAGUCAUCUACCUGAGUCCCAAAGCUCCCUGUCCUGAAAGCCACAGACAAUAUGGUCCCAAAUGACUGACUGCACCUUCUGUGCCUCAGCCGUUCUUGACAUCAAGAAUCUUCUGUUCCACAUCCACACAGCCAAUACAAUUAGUCAAACCACUGUUAUUAACAGAUGUAGCAACAUGAGAAACGCUUAUGUUACAGGUUACAUGAGAGCAAUCAUGUAAGUCUAUAUGACUUCAGAAAUGUUAAAAUAGACUAACCUCUAACAACAAAUUAAAAGUGAUUGUUUCAAGGUGAUGCAAUUAUUGAUGACCUAUUUUAUUUUUCUAUAAUGAUCAUAUAUUACCUUUGUAAUAAAACAUUAUAACCAAAACAUUCUGUUUACCUUUUCAGGGCUGUAUUGAUUGGGGUGUAGACUGAACUAUCCGGGGUCUGUUUCUUUUCGGUGAUGAAAGUCUUGAGAAGGUAGUAAUGGAUAAGAUGUGAGGGAGAGGAGAGAGGGAGAUUUGGAGUGUAGGGUGAGUGCCCCUCUUCUUAGAACUGAAUACUCUUCUUCUAAUGAACUUGUAUUCUUGUUUCCAUGUCUUCUUCCCUUUCCUUCUAUAGCAAAUAAAGCAUUCACUUUGUUUUGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-791.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -839.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 470.49

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......(((((((.((....(((((......))))).....))..)))))))..((((((((((((...(((((((((.(((((.((((((((........)))).)))).)))))((((...((..((((((..........((((((((.(((.....((((.((..((((..........))))))))))))))))))))))))))).)).))))........)))))))))......(((((((...))))))).......))))))..((((((((((...))))......(((((((((((((((((((.((..((((...(((((....((....))....))).)).)))))))))))))))))..(((((((((((((((.........)))))).((((((.(((((((.((.((..((((........))))..)).)).......(((((......((.((((((...)))))))).....)))))..))))))).)))))).....(((((((..((((.((((........((((.(((((((....)))))))..(((((((....((((....((((...((((((.(((((((((...)))).(((((.((((.(((..((((((((.((((((.....(((((((.((((((((.(((((..((.(((((.((((((((....)))))))).))))).))..)))))..((((........))))....))))))....)).)))))))))))))))))))))..))).).))).)))))((((..((.(((...((...(((......)))...))...))))).))))........((((((.((.(((((((((.(((((.....)))))....(((((..((((.......))))....((((...((........))....)))).)))))(((((...........)))))..)))))))))...)).)))))).((((.(((((((.(((((((((((((..(((((((((((((.....((((((...((((((.....(((((((..........((((..(((((......))))).(((((((.............))))))).......(((((.............((((((((((....((.(((.(((....))).))).))))))))))))............))))).))))......((..(((((............)))))..)).(((....(((....)))......)))...............(((((((.........)))))))......))))))).....)))))).............((.(((.((...)).))).)).........))))))................)))))))))))))..)))))))))))))..((((((.(((((((......((((.((..((((((((.((((...))))))))))))..)).))))..))))))...).))))))((((((((....((((((...))))))...))))))))...)))).))).))))............((((((((..........))))))))..((((.((((......(((((((.((....))....)))))))....))))...))))((....)).......)).))).)))))).))))...))))(((..((((.((((((((((..((((((((((((.((.....(.(((((..(.((.((.(((((.(((..(((((......)))))............((((((((....))))).))).((((............))))........)))))))))).)).)..))))).)....))..)))))...)))))))...))))))))))..)))).)))..)))))))))))........)))))))).)).)))))((.(.(((((((......(((..((((((....(((....)))....)))))).....)))..((((.((.......))))))....((((......))))))))))).).))((((...(((..(((((((....)))))))...)))...))))..))).))))))..................))))))))......))))))((((((((.....))))))))))))))(((((((......)))))))(((((((.((((.........))))..)))))))............((((...(((((((.(((((..((((.((.(((...))))).))))............(((((((......((((((....))))))...)))))))......(((((((((((((((((((((((((.((((((..((((..((((((...........)))))).))))..)))))).....)))))))))))))))..))))))....))))((((((((((...(((((((((.(((((....((((....)))).(((....)))...((((((..(((.......)))...))))))....))))).)))))))))))))))))))...........))))).)))))))..))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{((,(((((((({({....(((((......))))).....}}.|}))))}|.((((((((((((..{{{,...,}||((((((.((((((((........)))).)))).))))))..........(((((((.((.....{((((((((.(((.....((((.((..((((..,.......)))))})))))))))))))))}.||{{{(({(((,.,||....}})),})))},....(((((((...)))))))....,,))))))))))))))))))),.,||{,,........(((((((,,..,,...,{,{{{{...}))),...,,{((({..|....(((((((...((((((((,(({.,..,((({(((.(((((((.........))))))).||||,.(((((((.{{.{{..,(((.||,.,,.,,,|{({{((({...{{{(,,,,...}}}|,...|}))})))),.})}.....,)))}...))))))).,,||||....,,,...,))),.)},..,).}}}.)))))))).((((((....)))))))))))))......}))))...))))))}.,,,}||.,))))||{,...}}}}.(((((.((((.(((..((((((((.((((((.....(((((((.((((((((.(((((..((.(((((.((((((((....)))))))).))))).))..)))))..((((........))))....))))))....)).)))))))))))))))))))))..))).),})).)))))(((((((((((({,((((....(((((((,{{,.......,.....((((((......((((((.((.(((((((((.(((((.....)))))....{{{{{..((((.......))))....((((...{{........}}....)))).}}))){({((...........)))))..)))))))))...)).)))))).((((.(((((((.,((((((((((((..(((((((((((((,{{..{{((((..,((((((.....(((((((......,...{({{.,{{{({.....,|},,..(((((((.............))))))).......(((((..,.{{.....,.((((((((((....({.(((.(((....})).))).},)))))))))).,.....}},..))))).}}},......{(..(((((.,..........)))))..}}{((,.,{{{|,..},))...}}}...................(((((((.........)))))))......))))))).....}))))).............((.(((.(,...}).))).)).........}}}}}},,........,,,}}.))))))))))))),,))))))))))}||(((((.......)))))},...((((.((..((((((((.((({...})))))))))))..)).)))).(((((.....,,{{{,{,((((((((....((((((...))))))...)))))))),|{..||{{.{{{{((..,..,,,{...,{{{{{{{..........))))))}}..((((.((((...,..(((((((.{{....}}....)))))))....))))...))))((....))....,,,,|||||||}}}}},,,)))}..,,.,,,..{(((.((((((((((..((((((((((((.((.....,.(((((..{.((.((.(((({((((..(((((......)))))............,{{(((((....))))).|}}.((((............))))........)))))))))).)}.)..))))).}....))..)))))...)))))))...))))))))))..)))),})},....)))))......{((((....))))}(({..(((((.(((...,..{,.....(({..((((({...|))))).)))....),),,,...))))))))))){(({..{,{({(((.....,((((......}.,,}}}}|,,,..})))))).))))..(((((((....)))))))....,,.....))))))).)))).........))))))...,.(((((...})))).,}|,|,{(((((((.....)))))))),,{{||(((((((......))))))}(((((((.((((.........))))..))))))).}}}}................,}},.}))))))....)))))))))))))..))))..............(((((((......((((((....))))))...))))))).,,,,,(({,(({{{((((((((((((((((.{{{(,({{((((.,{(((((,..,.......)))))),}))},,))))).}....))))))))))))))),.,})))),..,}|||((((((((((...(((((((((.(((({...,((({....}))),||,.,..}||{{.((((((..,{{,,,....)))...))))))..}}))))).))))))))))))))))))).,,.,,,{{{{{{{,.....}}}))))))))..