Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_021808.3

Sequence Length

1744 nt

GC Content

0.6256

GGCGCUUCUGAAGACGGGUGGGCAGACGAUGGAGGACGAGGCUCUGUCCCGCCCCUGCAGAGCUUCCUUCGUUCCGGCCCCUUCCAGCGAAGGGCAGGGCUCCGAGCAGAGACAACAGACAGAAACCCAGAAACCACCUGCCACGAUGUGAACCUGAUGCAGAAACGCGGUUCGCUCCCUCGGGAUGCAAAGGCCAACUUCAGCCUGGCACGGCGGCGCCGCGGACUCCACCAUCCCGGGGAAGGAGCCGGACCCCUGUGUGGCAGUGUGGCGGCAGCAUGGAGGUGCUGCCCUGCUCCCGCGUGGCCCACAUCGAGCGCACCAGGAAGCCCUACAACAACGACAUUGACUACUAUGCCAAGCGCAACGCCCUGCGCGCCGCCGAGGUGUGGAUGGAUGACUUCAAGUCCCACGUGUACAUGGCCUGGAACAUCCCCAUGUCGAACCCAGGGGUGGACUUCGGGGACGUGUCUGAGAGGCUGGCCCUGCGUCAGAGGCUGAAGUGUCGCAGCUUCAAGUGGUACCUGGAGAACGUGUACCCGGAGAUGAGGGUCUACAACAACACCCUCACGUACGGAGAGGUGAGAAACAGCAAAGCCAGUGCCUACUGUCUGGACCAGGGAGCGGAGGACGGCGACCGGGCGAUCCUCUACCCCUGCCACGGGAUGUCCUCCCAGCUGGUGCGGUACAGCGCUGAUGGACUGCUGCAGCUGGGGCCUCUGGGCUCCACAGCCUUCUUGCCUGACUCCAAGUGUCUGGUGGAUGACGGCACGGGCCGCAUGCCCACCCUGAAGAAGUGUGAGGAUGUGGCGCGGCCAACACAGCGGCUGUGGGACUUCACCCAGAGUGGCCCCAUUGUGAGCCGGGCCACGGGCCGCUGCCUGGAGGUGGAGAUGUCCAAAGAUGCCAACUUUGGGCUCCGGCUGGUGGUACAGAGGUGCUCGGGGCAGAAGUGGAUGAUCAGAAACUGGAUCAAACACGCACGGCACUGACCCCACCUCCGCCCGGACCCCCACAGACCUCGGGAAGGCGCUGGGCCGAGCCAGUGUGGCUGAGUGACCGGGGUGUGCCCGGCAGACACAGCAGGACAGGGCUCUAUGUGCGGCCAGGACAGCAGAGGCUGAGGGGCCGGGGUGUGGCUGAGUGACCAGGGUGUCACCCACUGCAUCUGGAGUACAGCUUCUCCUAGGACAGGCGGCUCUACCCGAGGGAGGGCGUCUGGGGACAGUGAUGCCAACUCAAACACGUGCCUUCUCCACGGUAUCUCCUGGCCAGGCUGCUGGGACAGCCGCCGCCUCUGCAUGUACCACAGCCCCCCACGCCCCAUAGGGAGGCCAAGCCCCGGACCAUGCACCAGGCUGCACCCUGGUGUCUUCCACCCGCAGGCCUCCCAUGCUCCAAGCAGCCUCCCCCAGCACUUGCGGCCGCUCAGCCCUCCAACCAAGACCUAAGUCACACAUCAUAAUGCAGCUCCUUGUGGUCUGGUAAGAGGGGUGCUGGAGGACAUGGACAGCGACAAACCUGAGGCCGUGUCUAGGAGGCUGGCACGACUGCUUCAGCAGAGACCAAAUAAAGAGAGGAUUAGGCAGCAGCACUGUGUGUGUCUUCCUGGGAGCCGAGCUGGGGGUUGGGGCCCGGUCCCACCUCUUUCCCAGGCACCUGGGCCCUGCCGCAGCCCAGCCCCUUGCCUGUUUUAAUAAAUACAGUUUUAUUGGCGCCCAGCCACAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-749.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -776.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 433.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((....((((((((((((..(((.((((.(((.((((((((((.........))))))))))....(((((((((((((...(((..(.(((((((...((((((........................(((((((((((..............((((.....((((((..((((.((((((((..((((........)))).)).((((...)))).((......))))))))))))..)))))).....))))))))))).)))).((((((((....)))))))))))))).(((.((((.....(((((((....(((....))).......)).).)))).......)))).)))....))))))).)..))).))))((((.(((...((((...))))...))).)))).)))).))))).))))))))))...)))((((((((.....((((.((((...(.(.(((((....((((((((((((((((((......))))))...((((((((((((((((((...(((((.((.(((((........(((((((.......))).))))............(((.((((...((((((.((.(((((.(.((((((..((......))..)))))).))))))....(((....)))((((((((..(((((.((.......)).)))))..))))))))((((((((((((.((((.(.(((.(((.(((.......))).)))))).)..(((.((.(((((((.(((((.((.....)).))).))))))))).)))))......((.(((.((((......)))).))).))....)))))))))..(((((.(((((..((((((((.(((..((........)).))).))))))))..))))).))))).)))))))..)).))))))..(((..(((((........)))))..))))))))))...))))))).)))))(((((((.(((.....(((((((.((.((((...(((((((.((.(.((((..((.(((((.....)))))))....)))).).))..)))))......(((((....((((....))))...)))))((((((((.((.(((((......))))).))))))))))((((........))))..))...)))).))...)))))))..))).)))))))...(((.......)))...))))))....)))))).))))))....(((..(((((......))))))))))))))).)))))...))))))).))))))))...((((((((..((...(((....((((((((......))))))))..)))....)).))))))))..(((((...((((((((.(((((((..((....))....(((((..((((.((((((((.....(((....)))......)))).))))))))..)))))))))))).((((((((.(((........)))...)))))))).))))))))......((((....))))...........((.((((((((.((((.....)))).)).)))))))).)))))...((((.((...((((((((((.((............)).))).))))))).)).))))))).))))).)))))))))((((((......)))))))))))).........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((....(((((((((((((....(((((((((...((((((((.........)))))))))))))))))||,{|{{{(((....)))))||.,((((((,((,,(((((,,((.((((...........(((((((((((,..,.....,....(({{.....((((((.,((((,(((((((,..((((........)))),||.({((...)))).{{...,,.,))))))))))}.,)))))).....))))))))))).)))).((((((((....)))))))){{((({((((((((.{({{{((,.{{{{.,,{((..,,}}}........,.{,{,|......,}},,..(((((......)))))},,}),..))))))},,,,..{{{{...}))))}})))}.{{{{{{,..(({...}}}}})})},....,,,}}}})}}..,,.((((.((((...(.(.(((((....((((((((((((((((((......)))))).{.((((((((((((((((((..(((.,,.(((((((..........))))))),...))).{{((({.,...,.{{...||{{({((..,((((((({,.(((((.(.((((((,,{(.....,}),.)))))).))))))}).|||{,||||||((({((((..((((,.({.......)).,))))..))))||||(((((((((,(((((((((.{{,,(((.(((.......))).))))),,{..(((.((.(((((((.({(((.((.....)).))).)}))))))).)))))..},....)))))))))......))))))}.}))}}},,,||{|{{{{.(((((.(((((..((((((((.(((...(,{,....,)).))).))))))))..))))).))))).,.{{||{{.||||}||.,..(((..(((((,,...,,.)))))..)))....})).)))}.,,)))))).,((((({(,(({.,.,.(((((((.{({({({..|({(((((.((.(.((((.{({.(((((.....)))))},.,}.)))).}.))..)))))...,.,{{(({.,..((({.|||||}}...}}}|}((((((((.((.(((((......))))).)))))))))}((((.....,,.))))..)}.,.)))}})}}..))))}))},))),))))}))},}||||..,,..,}},..))))))....)))))).)))))).,,,(((..(((((......))))))))))))))).)))))...)))))}},))))))))...((((((((..((...(((....((((((((......))))))))..)))....)).)))))))).,|{{{,..,((((((((.(((((((..({....})....(((((..(((,,((((((((.....(({....}))......)))).))))))))..)))))))))))).((((((((.(((.,......)))...)))))))).)))))))),}....((((....))))...,,.........,.}}.,,.}),)))))..)))).)))))))),)).)))))),.{{||}(({,{((((({{(({,({.,,........,)).})),)))))))})).))))}).)))).,.)))))))}}{{((({......)))))})))))).........................