Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_021975.4

Sequence Length

2517 nt

GC Content

0.5860

AUUUCCGCCUCUGGCGAAUGGCUCGUCUGUAGUGCACGCCGCGGGCCCAGCUGCGACCCCGGCCCCGCCCCCGGGACCCCGGCCAUGGACGAACUGUUCCCCCUCAUCUUCCCGGCAGAGCCAGCCCAGGCCUCUGGCCCCUAUGUGGAGAUCAUUGAGCAGCCCAAGCAGCGGGGCAUGCGCUUCCGCUACAAGUGCGAGGGGCGCUCCGCGGGCAGCAUCCCAGGCGAGAGGAGCACAGAUACCACCAAGACCCACCCCACCAUCAAGAUCAAUGGCUACACAGGACCAGGGACAGUGCGCAUCUCCCUGGUCACCAAGGACCCUCCUCACCGGCCUCACCCCCACGAGCUUGUAGGAAAGGACUGCCGGGAUGGCUUCUAUGAGGCUGAGCUCUGCCCGGACCGCUGCAUCCACAGUUUCCAGAACCUGGGAAUCCAGUGUGUGAAGAAGCGGGACCUGGAGCAGGCUAUCAGUCAGCGCAUCCAGACCAACAACAACCCCUUCCAAGUUCCUAUAGAAGAGCAGCGUGGGGACUACGACCUGAAUGCUGUGCGGCUCUGCUUCCAGGUGACAGUGCGGGACCCAUCAGGCAGGCCCCUCCGCCUGCCGCCUGUCCUUUCUCAUCCCAUCUUUGACAAUCGUGCCCCCAACACUGCCGAGCUCAAGAUCUGCCGAGUGAACCGAAACUCUGGCAGCUGCCUCGGUGGGGAUGAGAUCUUCCUACUGUGUGACAAGGUGCAGAAAGAGGACAUUGAGGUGUAUUUCACGGGACCAGGCUGGGAGGCCCGAGGCUCCUUUUCGCAAGCUGAUGUGCACCGACAAGUGGCCAUUGUGUUCCGGACCCCUCCCUACGCAGACCCCAGCCUGCAGGCUCCUGUGCGUGUCUCCAUGCAGCUGCGGCGGCCUUCCGACCGGGAGCUCAGUGAGCCCAUGGAAUUCCAGUACCUGCCAGAUACAGACGAUCGUCACCGGAUUGAGGAGAAACGUAAAAGGACAUAUGAGACCUUCAAGAGCAUCAUGAAGAAGAGUCCUUUCAGCGGACCCACCGACCCCCGGCCUCCACCUCGACGCAUUGCUGUGCCUUCCCGCAGCUCAGCUUCUGUCCCCAAGCCAGCACCCCAGCCCUAUCCCUUUACGUCAUCCCUGAGCACCAUCAACUAUGAUGAGUUUCCCACCAUGGUGUUUCCUUCUGGGCAGAUCAGCCAGGCCUCGGCCUUGGCCCCGGCCCCUCCCCAAGUCCUGCCCCAGGCUCCAGCCCCUGCCCCUGCUCCAGCCAUGGUAUCAGCUCUGGCCCAGGCCCCAGCCCCUGUCCCAGUCCUAGCCCCAGGCCCUCCUCAGGCUGUGGCCCCACCUGCCCCCAAGCCCACCCAGGCUGGGGAAGGAACGCUGUCAGAGGCCCUGCUGCAGCUGCAGUUUGAUGAUGAAGACCUGGGGGCCUUGCUUGGCAACAGCACAGACCCAGCUGUGUUCACAGACCUGGCAUCCGUCGACAACUCCGAGUUUCAGCAGCUGCUGAACCAGGGCAUACCUGUGGCCCCCCACACAACUGAGCCCAUGCUGAUGGAGUACCCUGAGGCUAUAACUCGCCUAGUGACAGGGGCCCAGAGGCCCCCCGACCCAGCUCCUGCUCCACUGGGGGCCCCGGGGCUCCCCAAUGGCCUCCUUUCAGGAGAUGAAGACUUCUCCUCCAUUGCGGACAUGGACUUCUCAGCCCUGCUGAGUCAGAUCAGCUCCUAAGGGGGUGACGCCUGCCCUCCCCAGAGCACUGGGUUGCAGGGGAUUGAAGCCCUCCAAAAGCACUUACGGAUUCUGGUGGGGUGUGUUCCAACUGCCCCCAACUUUGUGGAUGUCUUCCUUGGAGGGGGGAGCCAUAUUUUAUUCUUUUAUUGUCAGUAUCUGUAUCUCUCUCUCUUUUUGGAGGUGCUUAAGCAGAAGCAUUAACUUCUCUGGAAAGGGGGGAGCUGGGGAAACUCAAACUUUUCCCCUGUCCUGAUGGUCAGCUCCCUUCUCUGUAGGGAACUCUGGGGUCCCCCAUCCCCAUCCUCCAGCUUCUGGUACUCUCCUAGAGACAGAAGCAGGCUGGAGGUAAGGCCUUUGAGCCCACAAAGCCUUAUCAAGUGUCUUCCAUCAUGGAUUCAUUACAGCUUAAUCAAAAUAACGCCCCAGAUACCAGCCCCUGUAUGGCACUGGCAUUGUCCCUGUGCCUAACACCAGCGUUUGAGGGGCUGGCCUUCCUGCCCUACAGAGGUCUCUGCCGGCUCUUUCCUUGCUCAACCAUGGCUGAAGGAAACCAGUGCAACAGCACUGGCUCUCUCCAGGAUCCAGAAGGGGUUUGGUCUGGGACUUCCUUGCUCUCCCUCUUCUCAAGUGCCUUAAUAGUAGGGUAAGUUGUUAAGAGUGGGGGAGAGCAGGCUGGCAGCUCUCCAGUCAGGAGGCAUAGUUUUUACUGAACAAUCAAAGCACUUGGACUCUUGCUCUUUCUACUCUGAACUAAUAAAUCUGUUGCCAAGCUGG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-970.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1011.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 607.31

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((.(((((....((((....).)))...))))).))))((((((((((((((((........)))))......(((..(((.((..((........)))).))).)))...(((((((((((((...(((((((.(.((((.....(((((((((((.....(((((((..((.((((((((...)))).)))).)))))))))))))(((((((((((.((((((((.((((((((...((((((.((((((((((....((((...((((......(((((((((...........)))))))))....((((...))))....(((.((((((((..(((((((..((..((((((...((((.((.........((((((..(((((((((((((((.(.((((((((((((((...))))))))....)))).)).).))))).((((((((((((((....(.((..((((.(((...........((((......((((........)))).....))))........))).))))..)))))).)))).))))))).((((((.(((((......(((((((......)))))))....))))).(((((((((.............(((.......))).((((((....((..(((((((((........)))).)))))))..)))))).)))))))))......)))))).(((...(((((....((.(((...(((.(((........((((...(((((((..((....((((......((.(((((((.((((..(((...((((....(((((...(((....)))..)))))......((((....))))(((.(((((.(((((..((((.((((((((....))).)).((.((((...)))))).(((....)))))).))))..........(((((.......))))).))))).)))))..)))...........(((((.((...)).)))))..(.((((.......)))).).(((.....)))...)))).)))..)))).((((((......))))))))))))).))......)))).))..)))))))...))))..))).))))))))..))))).)))((((((.((.......)).)))))).......)))))))))))))))).((((..(((....)))..))))))))))..))))))..))))))))).((((((....((((..((((...((....))...))))..)))).....(((((((((.((((..(((((.((((..((((((((..((.(((....(((..(((((.(((......)))))))).)))...((((.(((........)))))))..(((((((.((..........(((((((.((((.(((...(((((((......)))))))....).)).))))....(((.......)))..((((((....)))))).((((.....)))).))))))))))).))))).)))))..)))).))))...)))).)))))..)))......).)))))))))...(.(((((((.(....(((....)))...).))))))).)))))))...((((((.........((((((........)))))))))))).(((..(((.((.((((((...))))))..)).)))..)))...)))))))).))).......(((((....)))))(((.((((........)))).))).))).).....)))).)))))))))).)))....((.(((((..(.....(((.....)))..)..))))).))..................)))...))))))))..))).)))))..))))).))))))..((.(((((......)))))))((((((((((((((((((((((........))))))).(.((....)).))))))))).((((((((((...((((((((.........(((.(((...(((((((...((((...)))).)))))))))).))).((((((((.((((......)))))))))))).((((...((((...))))..))))...................))))))))..(((((((((...(((....(((((.......))))).....))).......)))))))))........))))))))))(((......)))))))))).)))))))((.(((..((.((...(((((((....))))))))).)).))))).)))).)))))))).)))))))).....((((((((((((((((((((.(((((((....)))))))..)))...)))).)))))))))))))))))).((.((((.....))))))...((((.....))))......((((..........))))..(((......)))...........)))))..))))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((({.(((((..,,((((,,,,|.,||,,.}}|||.||}}(({(((((({{,{{((.,,{|,..}})))..,}}}||{,,(({,{|..||,,,.....||,|.|}},|||{{{(((((((((((((...{((((((.(.((((.....{((((((((((.....(((((((..((.((((((({...}))).)))).)))))))))))))(((((((((((.((((((((.((((((((...{{,(((.((((((((((....{{{{...{(((......(((((((((.........,.)))))))))....((((...))))....(((.((((((((..(((((((..((..(((((({{{(((,.((({,,...}}|||{{{,.(((((((((((((((.{.((((((((((((((...))))))))....)))).)).}.))))).((((((((((((((....(,((,,((((.(((...........((((..,...((((........))))...,.)))).....,..))).}))),,))}))).)))),})))))).{(((((.(((({.,..,.(((((((......)))))))...,|||||.(((((((((......,......(((.......))),((((((....{(..(((((((((........)))).))))))),.))))))})))))))))....,.|}||||.,,,...{|{||,,..{|,|||,,.(((,(((,.....,.((((...(((((((..((....((((......((.(((((((.{(((..{{{...{.(({{,{(({((,,,(({....}))..,}|||{.....,{{|}},.||||{({,((((({,,,,|}}|||{,{|({{{((....}}}.))}||}||{|}}.)})))}.{((....))}},,.|||}.,,.,{|{{.((((({{{...{|,}}|,||}},.,|||,,{||||{...,.....(((((.({...)).)))))..,.||||,,,..,})},,...{{{.....)))}),),,},}}),,)})),||||||......}))))}))))))).))......)))).))..)))))))...))))..,}}.}}}}}}}),,))))).}}}{{{{||,||.|...,.)).}})))).......))))))))))}}}|||{(((,..,}}}..})))}}))),..,,,,..))))))..))))))))).{(((((.{,,((((,.((((,,,{({,..}}}}|})))|.}}}),..,.(((((((((,,(((..(((((.((((..((((((((,,((.(((....(((..((((,{(((......)))))))).)))...{{{{,{{{,,{{,{|{|,|||||{{({((({{.,{.{{.,,,,.,((({(((.{(({.(||...{((((((......)))))))..,,).)}.}}},...}||{....,..}}}},|{{{||,,,,))})},.||||}}...,}||{||},,,))))).,.})).))))).,)))).))))...)))).)))))..))).}....}.)))))))))...{.(((((((.{....(((....)))...,.))))))).,)))))},(.((((((.........((((((........)))))))))))).))|..,((,((.((((((...))))))..}}.})),.}},...)))))))).))).,,....(((((....))))),{|.|(((........)))).}},.}}}.......))}}.)))))))))).)))....{{,(((((..((({..(((.....)))..))))})))}}),.................,})...))))))))..))).)))))..})))).))))))..((.(((((......)))))))(((((((((((((({(((((((........))))))).(.((....)).)))))))),,((((((((((...((((((((.........{{,.((({{.(((((((.,.((((...)))),)))))))})).))),((((((({,((((......)))))))))))).{(((...((({...})))..)}}}...................))))))))..(((((((((,,..(((((.((,......},.)))))..}}..,,.......)))))))))........)))))))))){{{......}})})))))).))))))}{{.|||{,(.{((,..(((((((....))))))).)}))}})))).)))).)))))))).)))))))).....((((((((((((((((((((.(((((((....))))))}..)))...)))).)))))))))))))))))).((.((((.....))))))..,(({{....,||,,...,,.{{{{...|,.,.,.})))..{{{......))}...........))))).,))))))