Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022119.4
Sequence Length
1383 nt
GC Content
0.6377
ACACACCCUGACCCGCAUCGCCCUGGGUCUCUCGAGCCUGCUGCCUGCUCCCCCGCCCCACCAGCCAUGGUGGUUUCUGGAGCGCCCCCAGCCCUGGGUGGGGGCUGUCUCGGCACCUUCACCUCCCUGCUGCUGCUGGCGUCGACAGCCAUCCUCAAUGCGGCCAGGAUACCUGUUCCCCCAGCCUGUGGGAAGCCCCAGCAGCUGAACCGGGUUGUGGGCGGCGAGGACAGCACUGACAGCGAGUGGCCCUGGAUCGUGAGCAUCCAGAAGAAUGGGACCCACCACUGCGCAGGUUCUCUGCUCACCAGCCGCUGGGUGAUCACUGCUGCCCACUGUUUCAAGGACAACCUGAACAAACCAUACCUGUUCUCUGUGCUGCUGGGGGCCUGGCAGCUGGGGAACCCUGGCUCUCGGUCCCAGAAGGUGGGUGUUGCCUGGGUGGAGCCCCACCCUGUGUAUUCCUGGAAGGAAGGUGCCUGUGCAGACAUUGCCCUGGUGCGUCUCGAGCGCUCCAUACAGUUCUCAGAGCGGGUCCUGCCCAUCUGCCUACCUGAUGCCUCUAUCCACCUCCCUCCAAACACCCACUGCUGGAUCUCAGGCUGGGGGAGCAUCCAAGAUGGAGUUCCCUUGCCCCACCCUCAGACCCUGCAGAAGCUGAAGGUUCCUAUCAUCGACUCGGAAGUCUGCAGCCAUCUGUACUGGCGGGGAGCAGGACAGGGACCCAUCACUGAGGACAUGCUGUGUGCCGGCUACUUGGAGGGGGAGCGGGAUGCUUGUCUGGGCGACUCCGGGGGCCCCCUCAUGUGCCAGGUGGACGGCGCCUGGCUGCUGGCCGGCAUCAUCAGCUGGGGCGAGGGCUGUGCCGAGCGCAACAGGCCCGGGGUCUACAUCAGCCUCUCUGCGCACCGCUCCUGGGUGGAGAAGAUCGUGCAAGGGGUGCAGCUCCGCGGGCGCGCUCAGGGGGGUGGGGCCCUCAGGGCACCGAGCCAGGGCUCUGGGGCCGCCGCGCGCUCCUAGGGCGCAGCGGGACGCGGGGCUCGGAUCUGAAAGGCGGCCAGAUCCACAUCUGGAUCUGGAUCUGCGGCGGCCUCGGGCGGUUUCCCCCGCCGUAAAUAGGCUCAUCUACCUCUACCUCUGGGGGCCCGGACGGCUGCUGCGGAAAGGAAACCCCCUCCCCGACCCGCCCGACGGCCUCAGGCCCCGCCUCCAAGGCAUCAGGCCCCGCCCAACGGCCUCAUGUCCCCGCCCCCACGACUUCCGGCCCCGCCCCGGGCCCCAGCGCUUUUGUGUAUAUAAAUGUUAAUGAUUUUUAUAGGUAUUUGUAACCCUGCCCACAUAUCUUAUUUAUUCCUCCAAUUUCAAUAAAUUAUUUAUUCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-627.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -650.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 319.43
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........((((((........))))))...(((((......(((((((((((.((((((((....)))))).....(((..(((((((.(....).)))))))..)))(((((............)))))..(((((((.(.(((((..((((((.........(((....(((((((((((((((.((....((((((((((.((((.((((.((((((((.(.((.(((((.(((((.(.((((((.(((((((....).)))))).....(((......))).((.((((.....)))).))...)))))).).)).))).)))))))).))))((((.((....))))))....)))))))))))).....))))))))))(((.((.(((((((....))))))))).))).((((..(((((((((((((.((((((....)))))).).)).....((((.(((.((((...(((.((.((((....(((.((((.....)))).)))....((...((((..((((...)))).))))...))..)))).)).))).))))))).)))))))))))))).)))).)).))))))))))))))))))..(((((.((((((((((.((.((.((((....((((((.((((.(((((((............)))).))).))))..)))))))))).)))).)))))...))))))))))..))))))...))))))))))))).....)).)))))))))))..)))))..((((((......(((((((........((((((((.....)))))))).(((((.........))))).((((((.((((((....((((((.....(((((.((.........((((((.(((((....((((.....))))......)))))))))))......)).)))))))))))..(((((((((((((.((((((.((......))))))))))))(((.((((.((...)).)))).)))(((.((((((((.((..(((...((((((((((((((....))))))))).((((((((((((((((((((......))(((.......))).......((((.......))))))))))..)))))))))))).(((......))).......)))))...)))..)).)))))))).)))..(((((.(((((.........))))).))))))))))))))........))))))))))))))))))).((((....)))).((((((.(((...))).))))))(((.......))).))))))..............................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........((((((.....,..}))))}...,{{{{..{{..(((((((((((.((((((((....)))))).....((({,(((((((,(,...}|))))))).,|}}|((({.{..,,......,},}).}({(((({.{,|{{||,.{{{{{{....,,,,,((,....,((((((((((((((,{({...((((((((((.(((,{((({,((((((((,(.((.{{{((,({{((,(,{{((({.(((((((....).)))))).....(((......))).{(.((((,...,)))).)},,,}})))),),)).))}.)))))))),)}|}(((,{((....)))))),...}}}})))))))).....)))))))))){{|,{{.{(({(((...,)))))))}}.}}|.((((..(((((((((((({.((((((....)))))).).)}.....((((.((.(((((...{.((({..,,|}}..(((.((((.....)))).)))..{{({...((((..((((...)))).))))...,.,}}||}....,,,.)))))}),))))}))))))))).)))).})}))))))))))))))})))..(((((.((((((((((,((.{{.,(((....((((((.((((.{((((((............)))).))).))))..))))))}})).)))).)))))...))))))))))..}))))}...}}})}}}))))}}.....)).)))))))))))..)),,},.{|||||...,,,{{{{|{{.,,,....((((((((.....)))))))).{{|||,.|||.....)))).((((((.((((((....((((((.....(((((.((.,,......((((((.(((((.,..((((.....))))..}...))))))))))),.,}..)).))))))))))).,(((((((((((((.((((((.((......))))))))))))|{(,((((,((,..,),)))).)))(((.((((((((.((..(((...((((((((((((((....))))))))).(((((((((((((((((({{...,{{||({{,,,...,||}.......|||{,,,....)))))))))}..)))))))))))).{((......}}).......)))))...)))..}).)))))))).)))..(((((.(((((.........))))).))))))))))))))........))))))))))))))))))).{(((....)))).{((((({({{..,{|..}}))}|{{||,.,||,,,,.})))),.,......,|..,,,,,,........}|}}},...,,}},......
Back