Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022449.4
Sequence Length
1603 nt
GC Content
0.5889
GCCCUGAAACCUUCUGGGAGGAGAAGAGGCCUGACCUUGGCGCUGGGGUCCAGUGGGCAUUGCUCUGGUCCGAGGCUGCUGCUCUUGACCUCUGCUCUGCGGCUGUUUUCCAUUGGAGUAGAGGCUCCUCCUGUCCUGUCCUGCCUGUGGAGGGAAGCAAACCUUCCCCUGGACCAGAGAGAGGAGAAAGCGGAGACAGGUAGCAACGCUGUGGACUGGUGAUGACAGGCUCUUCAGCUCCCUGCAAGUGACCGGGCCUGGGGAACAGGGCAUGGCACAGGCACACAGGACCCCCCAGCCCAGGGCUGCCCCCAGCCAGCCCCGUGUGUUCAAGCUGGUUCUCCUGGGAAGUGGCUCCGUGGGUAAGUCCAGCUUGGCUCUUCGGUACGUGAAGAACGACUUCAAGAGUAUCCUGCCUACGGUGGGCUGUGCGUUCUUCACAAAGGUGGUGGAUGUGGGUGCCACCUCUCUGAAGCUUGAGAUCUGGGACACAGCUGGCCAGGAGAAGUACCACAGCGUCUGCCACCUCUACUUCAGGGGUGCCAACGCUGCGCUUCUGGUGUACGACAUCACCAGGAAGGAUUCCUUCCUCAAGGCUCAGCAGUGGCUGAAGGACCUGGAGGAGGAGCUGCACCCAGGAGAAGUCCUGGUGAUGCUGGUGGGCAACAAGACGGACCUCAGCCAGGAGCGGGAGGUGACCUUCCAGGAAGGGAAGGAGUUUGCCGACAGCCAGAAGUUGCUGUUCAUGGAAACUUCGGCCAAACUGAACCACCAGGUGUCGGAGGUGUUCAAUACAGUGGCCCAAGAGCUACUGCAGAGAAGCGACGAGGAGGGCCAGGCUCUACGGGGGGAUGCAGCUGUGGCUCUGAACAAGGGGCCCGCGAGGCAGGCCAAAUGCUGCGCCCACUAGGUGCAGCCACUCCUGGGGGCUGUGGGGAAGACACCCCCUGCCUGGGCCAUGGCCAGCUCUAGGUGGAUUCUGAUUCACUGUCAAUGCUGGGUUGCUCCCGAGCCCUAGAUGUUCCUGGAAGUUGGCCCCCUUUAUGAAAACCACUUCCCACAGCCAGUGGGAACUGCCAGAGGAAGAUCUGGCGUCACAUGGCUCCCAGGAAAGUGCUGUGCCCUAUCCCCACUGAUACCAUCUGAUUCCCCGAUGCCUGUGCCUGUUCCACCUGGACGGUGGCCCCCUCAGCCUGGCAGCCUCUGGACAGAGAGGAAGGAAGGAUUGGAAAAGUCCCCGCAGCACAGCGACGGUGGGAAGAUGCCUUACGUCUGAUCUUGAUGGGGGCACUGGCCUGGAGCCUGGGCCCACCUGCUUCUGGGGGGUUGGGGAGCAGGCCAGAUGGAGGUGGUGGUGCCAGGAAGAAAUGGAGCGAUGACUGACUGUGGGGUGGGCCCAGGAUUUCCACAUCUUGGUGAAGUUGCCCCUGGGAAGGGCAGCUGGGGGCAGUGGCGCCAGUUCCCUUCCAUGGUCUCCCGGCUGGCAAUGUGGUGAAGCUGAGUUUCUGUCCAAUGAGCAGGAAGAUUCUGAGACAUUUCGCCUGAGAUAUAAGUUGUACUGCGUAUGCAGUUUUUCCUCCAAAAAUUAAAUUGCUUUUGACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-689.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -718.58
Frequency: 0.0000
Diversity: 360.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((.(((...(((((((.(((..(((((..((((((.((((((((((.(((..(((((((..((((((.((((((((((.....(((((((((((.((.......))..)))))))))))((((.(.(.((((.(((((((.(.((((((.......)))))).).))..))).)).)))).)..).))))...)))))))..))).)))))))))))))...((((....))))...(((..(((.((((.((((.....)))).).))))))..)))))).)))))))..)))))))))(((((((((((..((((.....((((..(((((((....((((((((((((((.(((.(..((((..((((((((((.(((.(((.....))))))..))))))....((((((((((.((((((((((((.((((....)))).))))))..((.(((..((((........))))..))).)))))))).))).((.......)).((((((.((.(((((((.....))))))).))))))))...((((((((........)))))))).((.(((((.((((.(((((((((....)))))..).))).)))))))))))((((((((((....)))))).).)))..))))))).))))..))))...).))))))))(((.(((.(.((((((((((.((..(((((((.(.((((((........))))))...).)))))))..))....(((((.(((..........))))))))......((((((..(.(((.((....)).)))..).....))))))(((((...((((.(((.((((..((((..((((..((((..((((.((((.(((((...((((((((.....))))))))....(((..((((.(.((((......))))).)))))))...))))).)).))..)))).))))..))))..))))..)))).))).)))).))))).......)))))))))).).))))))...........))))))))).)))))))..)))).((((((......))))))(((....)))(((((((.((((.(((.((((...((((((.......((((..(((((((.(((.(((((.((((((.((((..(((.(((..((.......))..))).)))..))).).))).((..(((((.....)))))))))))))))))).))).))))))))(((((.((((.......))))))))).((((((((...(((.(((((.(((......)))))))).)))..))))))))..(..(((.((.((.(((........))).)).)).)))..).)))))).)))).))).)))).(((......)))........))))))).)))).))))))))))).)).)))..)))))))))).))).))..))).((((((..(((((((((.((..(((.(((........))))))..)).))...)))))))...............(((((....)))))..................))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{,,(,...{{{{,,{{{{{|||||.(((..(.((((((.((((((((((.(((.,(((((((..((((({.((((((((({,,,{.(((((((((({.((.......))..,)))))))))){{{(,(,(.((((.(((((,{.,.(({((({{{....,)))))}),)},.))).)).)))).,..}.)))).,,)))))))..))).})))))))))))).}.((((....))))...(((..(((.((((.((((.....)))).).))))))..)))))).)))}}))}})))))))))}.))){{..((((((...,,{,,,,{{{|||||{{,{((({(({.,,,,,|||.,}}}..||,}|}}||||((,{{{,{{{..((((((((((|{,...,|}},..((((((...))))))}},,|))))))))))..{(((((((|||||,,{|||}}}}((((,...,,,.}}},.,||,,,}})))))))),.))||{{||,,}.{{{|||,||,||||{{{.....}))))})}}})})))).)))}||((((........))))||{{(((...)))}||||,,|||(((((....))))}..,.}}|{|||||||||||{(,|{{((({....)))))).,..((({|{.{{{{{,.....,,{{{{{.{{,....}}.,)}||}..((((((......)))))).,,))))).})}))(((((.((.(((((((((((..(((((((....(((......)))..))))))){({(((..{.(((((((......))))))).}..)}}})..,((((.(((((((((((...((((.(((.((((..((((..((((..((((,.((((.{(((.(((((...((((((((.....))))))))....{{{,,((((.(.((((......))))).))))}}},..))))).)),)}..)))).))))..))))..))))..)))).))).)))).)))))((((......))))....))))))))))...({(({{(((((((((((((((((((((...((((..(((((..((((((((((...((((((.((((({(.(((.((((...((((((.......{(((..(((((((.((,{(((({,((((((.((((..(((.(((..((.......))..))).)))..))).).))).((..(((((.....)))))))))))))))))).))).))))}}}|(((({.((((.......))))})))),((((((((...(((.(((((.(((......)))))))).)))..))))))))..(..(((.((.((.(((........))).)).)).)))..).)))))).)))).))).)))))).{.,....,,}.((((((((,{....})))))))))))))).))))))))))....))))).)))).)))),})))))..))))).)))).)).}))))..))),,))))))).))..)))))....{{{{(.,..)})}}....,,,,,{{{||...,))))))))))))))}..............,,,,....
Back