Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022464.5
Sequence Length
1889 nt
GC Content
0.5834
AGACGGUCGCCGCCGCGUUUGCGCAGGGGGAGCUGGUCGCCGCCGCGGCCGCCUGGAAUUGUGGGAGUUGUGUCUGCCACUCGGCUGCCGGAGGCCGAAGGUCCCUGACUAUGGCUCCCCAGAGCCUGCCUUCAUCUAGGAUGGCUCCUCUGGGCAUGCUGCUUGGGCUGCUGAUGGCCGCCUGCUUCACCUUCUGCCUCAGUCAUCAGAACCUGAAGGAGUUUGCCCUGACCAACCCAGAGAAGAGCAGCACCAAAGAAACAGAGAGAAAAGAAACCAAAGCCGAGGAGGAGCUGGAUGCCGAAGUCCUGGAGGUGUUCCACCCGACGCAUGAGUGGCAGGCCCUUCAGCCAGGGCAGGCUGUCCCUGCAGGAUCCCACGUACGGCUGAAUCUUCAGACUGGGGAAAGAGAGGCAAAACUCCAAUAUGAGGACAAGUUCCGAAAUAAUUUGAAAGGCAAAAGGCUGGAUAUCAACACCAACACCUACACAUCUCAGGAUCUCAAGAGUGCACUGGCAAAAUUCAAGGAGGGGGCAGAGAUGGAGAGUUCAAAGGAAGACAAGGCAAGGCAGGCUGAGGUAAAGCGGCUCUUCCGCCCCAUUGAGGAACUGAAGAAAGACUUUGAUGAGCUGAAUGUUGUCAUUGAGACUGACAUGCAGAUCAUGGUACGGCUGAUCAACAAGUUCAAUAGUUCCAGCUCCAGUUUGGAAGAGAAGAUUGCUGCGCUCUUUGAUCUUGAAUAUUAUGUCCAUCAGAUGGACAAUGCGCAGGACCUGCUUUCCUUUGGUGGUCUUCAAGUGGUGAUCAAUGGGCUGAACAGCACAGAGCCCCUCGUGAAGGAGUAUGCUGCGUUUGUGCUGGGCGCUGCCUUUUCCAGCAACCCCAAGGUCCAGGUGGAGGCCAUCGAAGGGGGAGCCCUGCAGAAGCUGCUGGUCAUCCUGGCCACGGAGCAGCCGCUCACUGCAAAGAAGAAGGUCCUGUUUGCACUGUGCUCCCUGCUGCGCCACUUCCCCUAUGCCCAGCGGCAGUUCCUGAAGCUCGGGGGGCUGCAGGUCCUGAGGACCCUGGUGCAGGAGAAGGGCACGGAGGUGCUCGCCGUGCGCGUGGUCACACUGCUCUACGACCUGGUCACGGAGAAGAUGUUCGCCGAGGAGGAGGCUGAGCUGACCCAGGAGAUGUCCCCAGAGAAGCUGCAGCAGUAUCGCCAGGUACACCUCCUGCCAGGCCUGUGGGAACAGGGCUGGUGCGAGAUCACGGCCCACCUCCUGGCGCUGCCCGAGCAUGAUGCCCGUGAGAAGGUGCUGCAGACACUGGGCGUCCUCCUGACCACCUGCCGGGACCGCUACCGUCAGGACCCCCAGCUCGGCAGGACACUGGCCAGCCUGCAGGCUGAGUACCAGGUGCUGGCCAGCCUGGAGCUGCAGGAUGGUGAGGACGAGGGCUACUUCCAGGAGCUGCUGGGCUCUGUCAACAGCUUGCUGAAGGAGCUGAGAUGAGGCCCCACACCAGGACUGGACUGGGAUGCCGCUAGUGAGGCUGAGGGGUGCCAGCGUGGGUGGGCUUCUCAGGCAGGAGGACAUCUUGGCAGUGCUGGCUUGGCCAUUAAAUGGAAACCUGAAGGCCAUCCUCUUUCUGCUGUGUGUCUGUGUAGACUGGGCACAGCCCUGUGGCCGGGGGGUCAGGUGAGUGGUUGGGUGAUGGGCUCUGCUGACGUGCAGGGCUCAGCCCAGGGCAUCCAGGAACAGGCUCCAGGGCAGGAACCUGGGCCCAGGAGUUGCAAGUCUCUGCUUCUUACCAAGCAGCAGCUCUGUACCUUGGGAAGUCGCUUAAUUGCUCUGAGCUUGUUUCCUCAUCUGUCAGGAGUGCCAUUAAAGGAGAAAAAUCACGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-769.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -801.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 566.79
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((((((...((((..(((((((((((((((....)))))))...((..(((.((((((((((((.(((..((((((......)))))).)))....))).))))))))))))..)).(((((((........(((((((((.(((.(((((((((((.((.(.(.(((...((.(((((..(((((..........)))))..))))).))...))).).).)).))))......))))))).............................)))..)))))))))((((......)))))))))))))))).)))..))))...))))).(((......)))..))).)))))))...(((((.(((..(((((((((...((((((...(((((..............)))))...))))))..))..)))............(((.....((.((........))))....))).......((((((((..(((((((((...((((..(((......(((((...((........))...((((((.........((..(((.......))).))))))))))))).....(((((((..(((.....(((((.(((((..((((((((.......))))).)))..........))))).)))))....)))..)))))))...((((...))))...)))..))))))))))))).))))))))......(((((((...))))))).))))..))))))))((((((((((((((((((..(((.((.(((......))).)).)))...(((((((....((((....(((((((((.(((.((((.((.(((((....((..((((........)).))..))....))))).)).)))).))).)))).)).)))..))))((((((((...(((((..((((((.((((.(....(((((((((....((.(.((((((((.((.....(((((..((((((((((((((((((..(((((((.(((.((.(((((...)))))......((((((..((((.((..(((.(((((((((.(((((....))).))..)))).........(((.(((....))).)))((((((..((((((((......(((....))).......)))).)))).(((((....))))).))))))(((((.(((((....))))).))))))))))))).))))))..))))))))))).)))))))..((((((((((...............))).))))))).((((.(((((((((.(((.((..........)).)))..(((((..((((...(((((((((((...((.......)).)).))))))))))))))))))))))).)))).)))).((((....)))))))))))))).(((((.((((..((((((.......)))))).)))).)))))((..((((.......))))..)).)))...)).)))..))))).))))))).))).).))....)))))))))...).)))).)))))).)))))(((((.(((...((...))))).)))))..........(((((((((((....))))...))))))).)))))))))))))))((((((((....(((((..((((((((((......)))))))))))))))((....)).(((((((((((.(((((((.....(((.((((((.((.((((((..((((((......))))))..))).)))))))))))...))).....))))))))))))))))))))))))))...)))).))))))))))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((.((((((((((,,.((((,.(((((((({((((((.,,.}||||||,,.((..,,({((,((,,,,,,|},||}}{{{{{{.,,,,.)))))}.))}....))),,,}))))))),|,|||.{(((,,.,,,|||,{(({{{((((,(((,(((((((((((.{(,{,(,(((.{.{{,(((({..(({((,........,)))}}.,))))).)),,,))),|.}.}}.})}||.,,,|}))))}}.........................,...}||.,}}}))}}}}{{,,,,,...}}|||||}||}}}}}}.}}}..}}}}.,.))))}.{(((((((.((({.{(,.(({{(({((.{((({,{{{{.{{{{{(((,|..{{{||{..,||||{.....,.,.,....))))}...}}}|||,,,,,|,|.....,,}}))..,|||,..,||.(({.......,,))..{{{{{.......((((((((..((((((((,..,((((..(((......(((((...,..,,,...|))...((((({....,,...{{..(((.......})).))))))))))))).....(((((((..({,..,{{(((((.(((((.,(({(((({....,,||}}}}.,}}..,,,,,,,.))))).))))}..}})))..)))))))..,((({...})))...)))..))))))))))))).))))))))......(((((((...))))))).{{{(((((((({(((((((((((((((((((((..(((.,(((..((((..(..(((((((((((..(((......)))...),.}}.}))))))))..)((((.......))))...)))).))))))..)))))))))))))))))))))),,|((((.|{(,{(((|({|.,.,}|||,.,,||}}}}.||,,.}|}|}.....,.})))))))).,))){{(((({(.((.((({((({..,{,{{...(({,,{{{(({{((((({,...}}}))))))))).(((((...))))).)))})))),})..))))})|}||||}.,,||||||||,|.||||...)}))(({{(,{(((..(({(((.{(,.{{{|||{||,{(((((.{((((,||{|,,,{(((((.(((.((..{.((.((((...)))).)).,..)).))).)))))|((((.(((((....))))).))))}},}.,.,)}))))),.))))))))))}..,,})))))}.,},})))}))..}}}).,.{((({(((.{{{.(((((((((.((.(((((((((.......{{....)).......,||}}}|||}...((,((((,((({{{{|{{.....(({{((.,,.,,,,))))))))))))))).)))).)){|{,{(({{..,,,|{{{,,,||,)}})))}}}}))..((((((.......)))))).{{.(((({{{(((.(((.(.(((((((.....(((.,....,.))).....))).))))).)))))))))))))).))))))))))).))),(((((....((..(((((.(({...{,...},))).))))).}),....))))),.))))))))))))),.}}),)))))))),)))).)))))))).))))),}}.{(((((..((((((((((......)))))))))))))))}((({(((((((((((((({{(((((((.....,{{.((((((.(,{((((({,,((((((......)))))).,))).)))))))))))...})}.....)))))))))))))))))))).........))).)))).......{,......}}.,...
Back