Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_022872.3

Sequence Length

824 nt

GC Content

0.5619

GUUUACUCGCUGCUGUGCCCAUCUAUCAGCAGGCUCCGGGCUGAAGAUUGCUUCUCUUCUCUCCUCCAAGGUCUAGUGACGGAGCCCGCGCGCGGCGCCACCAUGCGGCAGAAGGCGGUAUCGCUUUUCUUGUGCUACCUGCUGCUCUUCACUUGCAGUGGGGUGGAGGCAGGUGAGAAUGCGGGUAAGAAAAAGUGCUCGGAGAGCUCGGACAGCGGCUCCGGGUUCUGGAAGGCCCUGACCUUCAUGGCCGUCGGAGGAGGACUCGCAGUCGCCGGGCUGCCCGCGCUGGGCUUCACCGGCGCCGGCAUCGCGGCCAACUCGGUGGCUGCCUCGCUGAUGAGCUGGUCUGCGAUCCUGAAUGGGGGCGGCGUGCCCGCCGGGGGGCUAGUGGCCACGCUGCAGAGCCUCGGGGCUGGUGGCAGCAGCGUCGUCAUAGGUAAUAUUGGUGCCCUGAUGGGCUACGCCACCCACAAGUAUCUCGAUAGUGAGGAGGAUGAGGAGUAGCCAGCAGCUCCCAGAACCUCUUCUUCCUUCUUGGCCUAACUCUUCCAGUUAGGAUCUAGAACUUUGCCUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGGUUCUCACUAUAUUGUCCAGGCUAGAGUGCAGUGGCUAUUCACAGAUGCGAACAUAGUACACUGCAGCCUCCAACUCCUAGCCUCAAGUGAUCCUCCUGUCUCAACCUCCCAAGUAGGAUUACAAGCAUGCGCCGACGAUGCCCAGAAUCCAGAACUUUGUCUAUCACUCUCCCCAACAACCUAGAUGUGAAAACAGAAUAAACUUCACCCAGAAAACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-320.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -332.96

Frequency: 0.0000

Diversity: 186.39

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((.(((((((..........((.(((((((((..(((((.......)))))..)))......(((....))))))))).)))))))))(((.......))).(((((((....))))))).......((((((((.(((((((((...))))))).)).)))))))).....))))))))).....((....((((((...((((((.((.((.(((((((((..((((.(((...))).))))....(((.....)))(((((((((((((((((((((((((......)))))).)))....))))))....)))))))))).((((.(((......))).)))).((.....))(((.((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((...(((.(.......).))).))))))).))))).........)))).))))).))))).))))).)))....((((((((.....(((((((.((.(((((........)))))))...))))))).((((.((((((((((((.....)))))))....................................((((((((((...(((((....((...(((((((((((((((((((((((.(....).))..))))).))))))........))).))))))))))))))....))))))))))....))))).))))......((....))))).)))))))))))))).)).))))))))....))))))...)).........(((((............)))))..........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(({((((({(((((({........,,||,(((((((((..(((({.......}))))..}}|,.....(((....))))))))).}}}}}}))){{{.....|||}|((((((((....)))))))}}.,}}}{(((((((.(,(((((({...))))))).)).)))))))),,...))))))}},.....,|,.,,((((((...((((((.({.((.(((((((((..((((.(((...))).)))).,,{((({{{{,,||(((((((((((((((((((((((((......))))))},))....))))))....)))))))))).{{((,(,(,.|,,|}||{}}}|{(({...,||(((.((((((((((.(((((.(((((((((.(((((((...(((.(......,).))).))))))).)))}}.......,,)))).))))).))))).))))).))).,,.,,.{({{{.....||{((((,{{.(((({.,,...,.)))}}}}...))))))).{{((.(({(((((((((.....)))))))..,.|||,............................{(((((((((...(((((....((...(((((((((((((((((((((((.{....}.)),.})))).))))))}.......,)),})))))))))))))....)))))))))}....))))).))))......(({{.{{,,,,))))))))))))))).)).)}))))))....))))))....,.........(({{,...,.......,))))),,.,......