Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022874.2
Sequence Length
1545 nt
GC Content
0.4136
CCACAAAUGUGGGAGGGCGAUAACCACUCGUAGAAAGCGUGAGAAGUUACUACAAGCGGUCCUCCCGGCCACCGUACUGUUCCGCUCCCAGAAGCCCCGGGCGGCGGAAGUCGUCACUCUUAAGAAGGGACGGGGCCCCACGCUGCGCACCCGCGGGUUUGCUAUGGCGAUGAGCAGCGGCGGCAGUGGUGGCGGCGUCCCGGAGCAGGAGGAUUCCGUGCUGUUCCGGCGCGGCACAGGCCAGAGCGAUGAUUCUGACAUUUGGGAUGAUACAGCACUGAUAAAAGCAUAUGAUAAAGCUGUGGCUUCAUUUAAGCAUGCUCUAAAGAAUGGUGACAUUUGUGAAACUUCGGGUAAACCAAAAACCACACCUAAAAGAAAACCUGCUAAGAAGAAUAAAAGCCAAAAGAAGAAUACUGCAGCUUCCUUACAACAGUGGAAAGUUGGGGACAAAUGUUCUGCCAUUUGGUCAGAAGACGGUUGCAUUUACCCAGCUACCAUUGCUUCAAUUGAUUUUAAGAGAGAAACCUGUGUUGUGGUUUACACUGGAUAUGGAAAUAGAGAGGAGCAAAAUCUGUCCGAUCUACUUUCCCCAAUCUGUGAAGUAGCUAAUAAUAUAGAACAAAAUGCUCAAGAGAAUGAAAAUGAAAGCCAAGUUUCAACAGAUGAAAGUGAGAACUCCAGGUCUCCUGGAAAUAAAUCAGAUAACAUCAAGCCCAAAUCUGCUCCAUGGAACUCUUUUCUCCCUCCACCACCCCCCAUGCCAGGGCCAAGACUGGGACCAGGAAAGAUAAUUCCCCCACCACCUCCCAUAUGUCCAGAUUCUCUUGAUGAUGCUGAUGCUUUGGGAAGUAUGUUAAUUUCAUGGUACAUGAGUGGCUAUCAUACUGGCUAUUAUAUGGGUUUCAGACAAAAUCAAAAAGAAGGAAGGUGCUCACAUUCCUUAAAUUAAGGAGAAAUGCUGGCAUAGAGCAGCACUAAAUGACACCACUAAAGAAACGAUCAGACAGAUCUGGAAUGUGAAGCGUUAUAGAAGAUAACUGGCCUCAUUUCUUCAAAAUAUCAAGUGUUGGGAAAGAAAAAAGGAAGUGGAAUGGGUAACUCUUCUUGAUUAAAAGUUAUGUAAUAACCAAAUGCAAUGUGAAAUAUUUUACUGGACUCUAUUUUGAAAAACCAUCUGUAAAAGACUGGGGUGGGGGUGGGAGGCCAGCACGGUGGUGAGGCAGUUGAGAAAAUUUGAAUGUGGAUUAGAUUUUGAAUGAUAUUGGAUAAUUAUUGGUAAUUUUAUGAGCUGUGAGAAGGGUGUUGUAGUUUAUAAAAGACUGUCUUAAUUUGCAUACUUAAGCAUUUAGGAAUGAAGUGUUAGAGUGUCUUAAAAUGUUUCAAAUGGUUUAACAAAAUGUAUGUGAGGCGUAUGUGGCAAAAUGUUACAGAAUCUAACUGGUGGACAUGGCUGUUCAUUGUACUGUUUUUUUCUAUCUUCUAUAUGUUUAAAAGUAUAUAAUAAAAAUAUUUAAUUUUUUUUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-414.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -446.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 399.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((((((......(((.((.((((..(((.......))).)))).)).))))))))).((((((..((((..((((........((((((((((((....)))))).(((((...))))).))))))....((((((.((..(((.(........).))).)).)))))))))))))))))))).(((..(((((((((.(.(....).).))))))))))))(((....)))(((((.((.(((((((...))))))).))(((((......................))))).((((.....))))..)))))...........)))))))))...((((.((((............................))))..)))).....((((....((((((..((((((((.((((((((.((((((..(((((((...((((((((((((....)).))))........)))))).))))))).)))))).(((..((........))..)))..(((((((((((((..(((.((((..(((((((((..(((.((.....)))))..)))).)))))...)))))))....)))).)))))))))........(((((..(((((...(((((...((((...(((...((((....(((....((((((...))))))......))).....))))....(.(((((((.((((((......(((((((((((.((((((.....(((...((((.....((((....((((......))))))))(((((.(((((..((((((.((((.(((((..((((((.(((((((..((((((.....((((((...)))))).......))))))..)))......)))).)))).))..)))))..))))....((((.(((...((((((...))))))....(((((........))))).....)))))))...........((((.....))))((((((((((((.(((((........(((..(((..(((((((..(((((...)))))..).))))))..))).))).......))))).))))..........(((((...)))))...............))))))))))))))((......))....((((((.....))).))).))))))))))..)))).))).)))))))))).....)))))))......)))))).))))))).)..)))..))))....)))))....))))).)))))))))...)))).))))))))......(((((..(((..((((.(((.(((((....))))).)))))))...)))..)))))...((((((((....((((....)))).....))))))))..((((((...))))))((((...((((((((((((....)))))))))....)))...)))).))))))....)))).........................(((((((((......)))))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((((((((,.....{((.((.((((..(((.......))).)))).)).))))))))).((((((..((((,.((((,.......((((((((((((....)))))).(((({...})))).))))))..,.((((((.((,{(({.{.....}..},))).)).)))))))))))))))))))){,(({.(((((((((.(.(....).).))))))))),))|,|...,|||({(((.{(.((((({{...})))))).}|{{{((..,.,,,...,..,,,......)))})}||||..,..,|}|,,}}}}}...,.,}}.,.)))))))))...,,,,((({......................,...,,,}|...{|{{{{....,{{{....,{{{{,..((((((((.(((((,{,.((((((..(((((((...((((((((((((....)).)))),.....,.)))))}.))))))).)))))).{({..{{,....,,,,,,,},...(((((((((((((,.(((.((((..(((((((((..(((.((.....)))))..)))).)))))...)))))))....)))),}))))))))........(((((.,(((,(,..(((((...((((.,{(({...({((....(((....((((((...))))))......))}.....})))......(((((((.((((((......(((((((((({{((((((.,,,.({(,,,{{{(.....{(((.,,.((((......})))||||(((((,(((({..((((((.,(({.{((((,.((((((.((({{{{,,((((((.....{(((((...)))))|,,,,||.)))))),,))),,.,,,)})}.)))).)}..)))},..}}||{{,,({(({(((,,{(((((,...}}}}}},...(((((........)))))......,.,.||,,,........{,{(,,...}}))|}}||||||,.|}(((({.....,},|||..(((..(((((((..(((((...)))))..)}}}))))..))).)))}}..,}})}},}}))))}},,,,...,|||||,|,}}},),.....,,..{{||,.,,,}}},))))}){{......),....{{{(((.....))).))).)))))))}))..)})).}}}.)))))))))).....)))))))......)))))).)))))))})..})}..))))....)))))..,.,)))).)))))}})}..})))}.))))))))......(((((..(((..(({{.(((.(((((....})))).)))}))},,,)))..)))))...((((((((.,{,((((....)))).,}}.)))))))).{((((({...})))))},,,....{{.{(((((({....))))))))},...)))}}}})}}.)))))),||{||,,...,,|||,,........,,,,,..(((((((((.....,}))))))},....
Back