Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022912.3
Sequence Length
3829 nt
GC Content
0.4252
AGUCUGGCGGCGGCUGCCGUGAGCUGACUGACGUUCCGGGAACGCCGCAGCAGCCCGCGCCGCCCGCAGCCUAGCCGAGCCGCGCCGCCCGGGCCUCGCCCGCCCGCCUGCCCGCCAUGGUGUCAUGGAUCAUCUCCAGGCUGGUGGUGCUUAUAUUUGGCACCCUUUACCCUGCGUAUUAUUCCUACAAGGCUGUGAAAUCAAAGGACAUUAAGGAAUAUGUCAAAUGGAUGAUGUACUGGAUUAUAUUUGCACUUUUCACCACAGCAGAGACAUUCACAGACAUCUUCCUUUGUUGGUUUCCAUUCUAUUAUGAACUAAAAAUAGCAUUUGUAGCCUGGCUGCUGUCUCCCUACACAAAAGGCUCCAGCCUCCUGUACAGGAAGUUUGUACAUCCCACGCUAUCUUCAAAAGAAAAGGAAAUCGAUGAUUGUCUGGUCCAAGCAAAAGACCGAAGUUACGAUGCCCUUGUGCACUUCGGGAAGCGGGGCUUGAACGUGGCCGCCACAGCGGCUGUGAUGGCUGCUUCCAAGGGACAGGGUGCCUUAUCGGAGAGACUGCGGAGCUUCAGCAUGCAGGACCUCACCACCAUCAGGGGAGACGGCGCCCCUGCUCCCUCGGGCCCCCCACCACCGGGGUCUGGGCGGGCCAGCGGCAAACACGGCCAGCCUAAGAUGUCCAGGAGUGCUUCUGAGAGCGCUAGCAGCUCAGGCACCGCCUAGAAUCCUUCGAUCUCGCUUCAGGAAGAAAAGUACCUCAUCCUCGGCCACCGAAACCACGUGAGUGAGAUGAGCCAACAGCACCGGAUCCACAGAAUGUUUCUUCUCUGCCUUAAAGAGCUAUUCACUAAUAACAUAGAAAUCCGCAAGCUGGGUGUGCUUUGAGUGUGCAGCCUCACAAACAUGGCCUUUUCUCUCUCCCCUUCCACUUUUAAGGAUUUAUUUUUUUCCCCCUUUUCUUUAUUUUGCUGGGGAGAGGCUAAAGGGAAAGGUAGUAGGGGCGGGGGUGGUGACCUUUAAGUCUUCUGAGGUUGGUAAUUUUCCACAAUUGGAUUGUCAUUAUAGACAGCAGUGUGUUUUUUAGAAAGAUAAGAGAAUCACCCCUAUGCUGCUGAGAUGUACAUUUGUAAUUUAUCUGUUGCAUACUUAGUUUUUAGUCCUGUAAAUGCAAACACAGCAUUUUUUACAACUUUCUUUGUUCUUGGUACUUAUACUUUGAACUAUGAUGUACAUAUUUAUGGCUUUUGGCUUUUAAUAUAAUGGACUUGCAAGGGCUGCCAGAGGUUCUGAUAUGUAAGAAAACUGCAAAAACAAAUAUAGACAAAUAUUUUGAUUCUAGAGAACGUCUCAGAUGUGCUUAUAAAGCUUCCAAAUACAACUCCAGUAAGACAUCCCUUUCCCUGCAGGAGUGUGGUCUAUAUUCUUUAGAUAGUUGUUUAGUCAAAAGACCAGACAAGUUACAAACUAAGAGAAACAAUAUUUCACAACACAGUAAAGUGUGAUGAGAGGUCAGGGGAACAUCCCAGUAAAAGAGAAGAGUCACAGGAAGCUCAUCUCCUCCCUGGAUUCUGGAUUAGGAGCUUCUGAAUCUUUUCCAGGGAUAGGCAGGUAGCUCACUCUUGGUGCAAUUUCUUGAGGAUGGGAACAUGUAGAGCUGCUGGAAGGAGUAAUUCUGUGCUUGACAAAGGACGAUUUCUCCUUUAUCGUGACCAGUGCUGCCGAUUUCCUGACAGAGGAGCUUACACUCUGAGCACCUUGUUUUAGCGAACUCUAGCAAAACUUGUUUAGCUUAGCAAAAACAAACACACAAAAAACUGAGAACUCUGCUGUUUCAGAUAUGCCAUAACAUACAUCUGAAACACAUGUGUAACAAUCAAAAUGGUGGGCUCUAGAAUGGUUUUGGAGCUCGAGAUCUUCAUGGGUUAGACUUGCUGGUCAGACCCAGGAGCACCUGUGGCUCACACCUUCUGUUCCCCUCCUGGCCUGUGCAGAAUGUAAACAGCAGACUCAUACUCAAUGGGCACUACAGGCCUUAUCAGACGUUUUAUACAAGCCUGGAUUGCUUAGUAGGGGAAUAAGGCAUUCUCUGAGGGGGCUUUCCACUUAGAUUGAGAAUUUUAUUUGAAAAGAAUCUGGUUUAAAUGGCAUUGUGGUCCGAGGUAGCUGCUCUCCCCACUGAGAGCUGAGCCGAAAUAUAAGAAUAAUAUAUUUGUGCUUCGAGUUGGUGUUUCUUUCAGUGUAAUGCAUGCAGUGGUCACAACCCAGUUACUCAUAAUAUUUGGAUUGUAUUUGUUCGUAGAUAUGCCCAGAAGACUAGAGAAUUAGUGUUAUAUACCAUAUAGAACUUACUGUCAGUCAACUAUAAACAGGCCCAAUUAAAAACUGUUCCAUUACUACGCAAACACAUAUUAGAGGCCUUUGCUGAUGACACAUUAGCUGGAUCUUAGCCACCCCAGAAAGGGUUUGAUUUGAAGCUGAUUGUUGCCAGAUAUGCAUAUUGGAAUCCCAUCUACCCAUAGUUCCUCUGAAGGUGAUUUUGUAAUUUGCAAAAGGGUAUAGGAAAAUAUACCUAAAAGCGAAUUUGUGGCUGAGAGGAUAAACAGAAGCUGUUUGCUCAUGUUCUGUGCCCCACACCCACCAAUACCUAAAUCUGUUAAGGAAGACAGAAAAUGUUUUCUUUGUGCUCAUUGAGUAGUUCCAGACAGAAGAAGAAUAUACUCUUUAAAAUGUAUUUACCUGUUAGUUGGAAGUACCCAGAAUUAUCAGAAACGAAUGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCUUACACAGCUUCUUAGCAAUUUUUUUUUUUUUGCCGAAACAAUAAAUUGCCUUUAGCAGCAGUUUAAAAUCCUAUCGUGAACAACCUAUAUUUUCGCCAUUUUACAAUGGAGAGUUGUGACAAGUACAGGUUAUCAAGUUUGCACUUAACUAUGCCAAAAAAAGUUUGAAGCGCUCUAUUCUCAGACAUGCUGUAUUAUUACUUCUCAUUCAAGAUUGAAAAAUAUAAAGGUAUCCAAACUCUGUCUUAAUGUAAAUGUAACUAUUUUUCCUUCAAGUGUUGACUAGGGAGUCGGUUUCUCUCUUAAAGACACUCACUGUACAACUGAAAGCAGCUGUCAUAUUUCUGGCAAAAUGUGUUUACGUAUCUGACAAGUUGUACAUUUGUGUAUGAACUGACAUAAAAUGUGAAAGCCUGUAAGUGUACAUGUAGUGGUGUGGUGUUCUGUCUAGAGGAUACAACUGAAUGUUUUUAAUUUGCUGACUUACAGACACAGGCUGUUUACAAAAUGCUAGCUGGAAAGUCUGUAAUGUUCAUGUCAUAACUUUUAGUUAAUUGCCAUUGAGCACCUGUUCUGAGGAGGUGAGAUGUGGACUUGUGCUUAUAAACUGGAGAGUUUAGUCAUAAUCCCUCCUGGCUUUGUGUGAAUAGCUUGCUCACUUUGCUGGCCUUUGAAAUGUGUUCUCCGUGAUAAGCUAUCCAUGUGUUUGUGAUAAGAGUGCUUGUCAACCAUGACCAUCUUUGAGCCUUCCUAGUCCUCCACCUGGCACAGUAUUUGAAAUGGCAAAGGAUGUGCUUCAUCCUCUAACAGUGUACACUCCCAGAGCUGAUAUUCUGGAUUUUGACUGUGCACAUUUCCUCUAGUUCAUGUCUGUAGUCCCUAUAGAAUGAUCUGUAAUAAAAUAGUAUACUGGACUGUGCAUCAAAGGGAUGUAAAAUUACAGUAUUCCAAAGGUUGAAGUUCUGCUGUUUUGUUAUAAUGCCUGAUACACAUCUUGAAUAAAGUCUUAACAUUUUUCUUUUAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1108.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1180.48
Frequency: 0.0000
Diversity: 1056.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.((((((((.((((.(((((((.(((.((((((((((.((((..(((((((((((((((..((.(((..(.((((((.(((..(((((((...))))(((.(((((....(((((....)))))........))))).)))((((((.......)))))).((((((((..(((.......))).)))..))))).......(((((........)))))....(((.(((((.(((((.....(((((.............))))).....)).)))))))).))).((((((((((((.((((....((((......(((((...(((((...(((....)))...)))))....((((....))))..(((((((.....)))))))......))))).))))..))))..))))))))))))......((((.........))))((((((((((.....))))).))))))))..))).))))))..)..))).))....))))).)))..))))))).((.((((((((((((((......(((...(((((..((....)).)))))...))).((.((....))))....)))).))))).))))).))(((((........)))))((((((((((..((.(......).))..)))).....))))))).))).))))).))))).)))))))))))))))))))........(((.(((((((((..(((.((........)).)))((((...))))........))))))))))))...(((((((((.(.((((...((((.........((((((.((.(((.(((((.............(((((.....))))).((((((.(((((((((((..........)))((((..(((((((((...((....((((((...................))))))...))..)))))))))..))))(((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((((((.(((((..((((((..((((....)))).((((......))))(((((((((((...(((((((..............(((....(((((((((((((..((.....))..)).))))).))))))...))).(((((((((((.......)))))..((((((((((((((((...((((...........((((((((((((.((((((..((((....((((((((((((..((...((((...(((((.(((((((((((.((((........((((...(((((((((((.((((((((.(((.(((.((((...)))))))...((((...)))).............(((((((..(((((((....(((.(((((((((.(((((.......)))))(.((((((.(((....))).)))))).).....((((((((........(((((..((((......))))..)))))......((((...)))).......((((.((((........)))).)))).((((((((....(((((.(((...))).)))))..))))))))..(((.....)))..)))))))))))..)))))))))..))))...))).....)))))))(((((.((.((.((.(((....))).)))).))))))).....(((((((.((((((..(((.(((((..(((((((....((((.((((((.(((((((.((.......(((((...))))).......)).))))))).............((((...((((((((((((((((((......))))..)))))..((((.(((.....((((...))))(((((((((((...))))))))))).....((((.((((((.((((....)))).))))))))))))).))))......((.((((((.(.((....))...).)))))).)).))))))))))))).......(.((.((((((((((..((((((..(((((.....((((..(((.(((....))).))).))))(((((((((((((....))).))))....))))))......)))))....))))))......))).))))))))).)(((..(.((((((......)))))).).))).(((((((.......))))))))))))).))))....))))))))))).).)))))).))).)))))))...........))).))))))))..))))))))))).))))..........((.((((......)))).))......)))))))))))).))).))))).......(((((.............)))))..........)))).)).)))))))))))).........((((.((((((((((((......((((......))))..)))))..))))))))))))))))))))).))))(((....)))......)))))))).(((((...((((((((.(((((((....(((((((......)))))))....))))))).((((.((.(.((....((((((..((......))..))))))..))).)).))))...........((((((((((((((((.....)))))))))).(((((...)))))......)))))).(((((......))))).....((((((.((........)))))))).))))))))))))).((((..(((((((((((((((........(((((.....)))))........)))))))))))))))........((((((((........))))))))........)))).................))))....)))).))))))))))))....))))))...........((.(((((((...........))))..))).))))).)))).)))))))))))...)))))))))))...))))))........)))))))..)))..)))))))))............)))))))))))....((((((....((((((.......))))))....))))))...))))).))).))))))..(((((......)))))...((((((..(((((...((((((.....)))))))))))....))))))....)))))))))).)))).))))))...))))).)))))..))))((((((((...(((((((.(((.......((..(((((((((((...((((((.........)).)))).....)))))))).)))))......))).)))))))..(((((((((((((.((((((..(.(((((.((..(.(((.(((((....((((((....))))))..)))))))))..)).))))).)..))))))..)))))....((((((((......(((.(((.....((((((((((((((......)).)))).....)))))))).....))))))....(((.((....))..))).....))).))))).....))))))))((((((.....))))))......(((((((.((((((((......)))))).....)).)))))))...)))))))).((((.(((((((...)))))))))))..((((((((((((((((((((.....((((((.....))))))......))))))..................))))))))))))))..))).))).........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.((((((((.((((.(((((((.(((.((((({((({.{(({{{,{{{{{{{(((({((,,((.({{..||{|{||,||||,{({(((((...))}}|{{.(((((....({{{{,...}}}||,.,,,,..}|||},||||(((((.......||||||,{.,.{{{{,,{{.......{{{{{{|{{({{{{{{{{{,..(((((........))))).,,.(((.(((((.(((((.....(((((.............))))).....)).)))))))).))).}|,||||||||{.({{.....|}||......}}}}}.}}}}|||...(((((..((((...,.......||||..}}))),..((((((({...,})))))}.,,,.,|||,{,{{,..,,}}.{{{{,,|{{{,|{{{{.{{,((((.........))))||||||||||}..}}))}}}.}}}}}))},,))),))||}|.,,{{|||{||....|}}})})))..)))))))}||.||||{{||||||||...{,{({(,{.(((((..((....)).)))))..,}||.||.((....})}},},.)))|||}|||.|||||{{((((((........))))))})||{}||||.|.|}}...},)}))),)))).,}}}}}}}}}},}}},))))).))))).)))))))))))))))))))........{((.{((((((({{{(((.((........)).))){(((...)))}.......,)))))))))))}...,{(((((((.(.((((.{{(((,,,{{,...,,,,,,..||}|,|,|||,{........||,..{{(({....,})))},((((((.((((((((({{..........))|((((..(((((((((...,,....((((((...................))))))...,}..)))))))))..)}}}(((((((((((.(((((((((.(((..(((((((((((((.(((((..((((({..((((....)))).((((......))))(((((((((((.,,({{,.,,|,||||,..,,...,{,,||,(((((((((((({..((,,...}}..})}})))).}}))}}...|||.(((((((((((.......))))}..{((((((((((({(((...((((.....,,....(((((((({{((.((((((..{(((....((((((((((((,,(({,.{{{{..,(((((.(((((((((({{((((,,......((((...(((((((((({.((((((({.(({.{{{.((((...})))})},{,{(((...,}))............,{{{,|||,||||||,{,,{{({{{{{{(((({({{{{||,,}}}|||||,,,.((((((.(((....))).)))))}.|.....,||,,{{{........(((((..((((......))))..))))),},|}|||||,..{|{|{......((((,(,((..(({{{{{((,((((((((((((((....(((((,((,...))).}))))..)))))))}..}|,}}}}})))...))))),,)}..})))))..,,.}))))...}}}.,,{.}|||||{(((((.{(,({.((.(((....))).)))),},)))))}....(((((((.((((((..,{,.(((((..(((((((,..,((((.((((((.(((((((.((.....,,(((({...})))).}}....)).))))))).............{(((...(((({(((((((((((((......)))}.,)))))},||{{,|{{|....,{{,...,}}}(((((((((({...})))))))))),,,..{{{{.((((((.((((....)))).))))))}}}}|||,|}}||,,|,{{{,({{(((,(,((..,.}}..,|,}}}}}}|}}..}))))))}}}}},.,,...{,((.({{{(({(({..{(((({..{{{{...,,.|||{,.{{{.{{{...,)))}))).)))},{{{(((((({({....})).))))}}..,}}}}|.,,,,|||||,}}..)))})),,,,,.))}.})))))))).}|||.|{|((((((......)))))).,,)),.(((((((.......))))))))))))).)))).},.))))))})))).).,},))).))).)))))))...,}}}}..,))).})))))))..))))))))))).)))).,........((.((((,....,)))).))...,..)))))))))))).))).))))).......{((((.............))))),,,,,,....},,,.,.,})))))))))))...,{,,,,({{{,||||||{{{{((..{{{{{(((......))))..}}}}}..}}}}}}}}))})))))))))).)}}}{((....}}}......)))))))),{(((({{((((((((({{((((((....(((((((......)))))))....))))))}.((((.((.{.((,,,,((({,({{,,...}}},,,}))}))).,)}).)).))))...........,,,({(((((((((((.....))))))))))}.||,,..{|.(((.(((((({{{{..(,,(({{{{{.,,,......}}}}))}..))}}}..,))))).))).))},,,,,,}}}...,,...(((((((((((((((........(((((.....)))))........)))))))))))))))....,,,.,|||||||}}}}}}.})}}|||||........,.,}}}}}....,.,,.....))))....)))}.))))))))))))....})}))),,....,{{,,{{,,,,,||{.|,,.......,}}}}}},},}}}}}.}))),)))))))))))...)))))})))))...))))))........)))))))..)))..))))))))}............)))))))))))....((((((....((((((.......))))))....))))))..,)))))}})).)))))},,{((((......})}}}..,|||||,,|||{,,,|.{{{,{{{.{{{{{{({(((........))))}}},})))},)))})})})).))))}}.,.))))).)))))},}))}((((((((...(((((((.(((....,,.{(..(((((((((((.,.((((({.........)},)))).,...)))))))).))))).}}...))).)))))))..{((((((((((((.((((((..(.(((((.((..(.(((.(((((....((((((....))))))..)))))))))..)).))))).)..))))))..))))),...{(((((((..,{{,({(,({(,....((((((((,,(({{{,....}),)}}}.}}..)))))))).....)))))).}},|||.|,....}}..},,.....))).))))}.....}))))))}((((((.....))))))......(((((((.((((((({......}))))).....)).)))))))...)))))))).((((.(((((((...)))))))))))..((((((((((((((({((((,,,,.((((((.....)))))}......))))}},,,...,,....,,,.,)))))))))))))))..))).))).......,,{{,.,{,{,.......,,,},...........
Back