Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_024065.5

Sequence Length

1038 nt

GC Content

0.4326

GCGCGUGCACAAAAGAGAGCUGAGGGGCGGGGGCGCUGCGGCACAGCUGGUUUGAGCAACUGAACUGGAAACAAGAUGCAGGACCCCAACGCAGACACUGAAUGGAAUGACAUCUUACGCAAAAAGGGUAUCUUACCCCCCAAGGAAAGUCUGAAAGAAUUGGAAGAGGAGGCAGAAGAGGAGCAGCGCAUCCUCCAGCAGUCAGUGGUGAAAACAUAUGAAGAUAUGACUUUGGAAGAGCUGGAGGAUCAUGAAGACGAGUUUAAUGAGGAGGAUGAACGUGCUAUUGAAAUGUACAGACGGCGGAGACUGGCUGAGUGGAAAGCAACUAAACUGAAGAAUAAAUUCGGAGAAGUUUUGGAGAUCUCAGGGAAGGAUUAUGUUCAAGAAGUUACCAAAGCUGGCGAGGGCUUGUGGGUCAUCUUGCACCUUUACAAACAAGGAAUUCCCCUCUGUGCCCUGAUAAAUCAGCACCUCAGUGGACUUGCCAGGAAGUUUCCUGAUGUCAAAUUUAUCAAAGCCAUUUCAACAACCUGCAUACCCAAUUAUCCUGAUAGGAAUCUGCCCACGAUAUUUGUUUACCUGGAAGGAGAUAUCAAGGCUCAGUUUAUUGGUCCUCUGGUGUUUGGCGGCAUGAACCUGACAAGAGAUGAGUUGGAAUGGAAACUGUCUGAAUCUGGAGCAAUUAUGACAGACCUGGAGGAAAACCCUAAGAAGCCGAUUGAAGACGUGUUGCUGUCCUCAGUGCGGCGCUCUGUCCUCAUGAAGAGGGACAGCGAUUCCGAGGGUGACUGAGGCUACAGCUUCUAUCACAUGCCGAACUUUCUUGUGACAAAUUGUCUGGAUUUUUUAAAAAAGGAAAAAGCAAGAAUGAAUCCUUGUGGUUUUUAGUUUUGUAUAAAUUAUGUUUCAAAUCUUUACAUUUUGGAAAUAAUCAUUGCUGGAGAUUCUGUUAAAUAUUUUGGAACUCUUUUUUUUUUUAAAUUAUAGUAUUUCCUCUAAAAAAAAUUAAAACCAGCCAUUUGUAUGGCAAAUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-273.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -290.18

Frequency: 0.0000

Diversity: 257.92

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((.....((..((((.((((((((((..(((((......(((((((........)))))))........)))))..))))..))).........(((......)))............(((((...)))))))).((((((..(((((((((..(((((((....(((((....(((((...(((.(((((((((((....))....(((((....))))).((((((((..((((.....((((((.(((((((...((((((..(.((((...(((........(((((((.((.(((.....(((........))).......(((((.......)))))...((((((((.(((.((...(((........)))..)).))).)))))))).(((((((((....))))..))))).((((.......))))...))))))))))))..((((((((..(.((.((((.((((((......)))))).)))).)))..)))))))).)))...)))).)..))).)))..(((((....((((.........(((...(((((((.(((......))).)))))))..)))))))...)))))((((((((.(((((.((...((..((.((....((((.((((........))))))))...)).))..))....)).)))))))))))))............(((((((((.((((......)))).))))).)))))))).))).)))))).......))))..))))))))((((..(((((....)))))..))))((((.(((((.(((...((((...)))).)))............(((((..(((((........)))))..)))))))))).))))..(((((.(((((((.........)))))))))))).)))))))))))).))))).....)))))...))))))).))))))......)))..)))))).................))))..)))))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.((((((....,({,.((((.((((((((((..(((((......(((((((,......})))))))........)))))..))))..)))......,{.,((......))),,..........(((((...)))))))).((((((..(((,(({{{..((((((({{{.(((((....(((((...((,{(((((((((,,.,,,|,....(((((....))))).((((((((..((((,,,,,((((((.(((((((,,.((.((((.(,({...((((,.{{{{{{{({(((((.((.(((,..,.{((..,,....}}}..,,...(((((.......)))))...((((((((.(((.((..,(({........)))..)).))).)))))))).(({(((({{,,,,||}}..))))},|{{{.......)))}..,))))))))))||..((((((((..(.((.((((.((((((......)))))).)))).)))..))))))))..}}}}}))))},....,})))..,,,|||.}}||,||,{{.....{{(...(((((((.(((......))).)))))))..)))}},},}},,)))||||||||,((({(.{{,..{{..{(.{{....{{{{.{{((,,......}}|||||}.,.|}.}}..}},,,.,),)))}}}|}}|||,...,}}}..,..(((((((((.((({......}))).))))).))))}})),}}|,|}}}}}.......))))..))))))))((((..(((((....)))))..)))),,||,|{{{,.{{{,,,((({...}))).,}|{{{,,{.,,,..|||{{..(((((.......,}}}}},,}))))},)))})},...|{{{{.{((((((.........))))))})))}}.)))))))))))).))))).....)))))...)))))))))),}}}...,,.)))..)))))).................)))),.)))))))))).......