Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024102.4
Sequence Length
2456 nt
GC Content
0.4817
AGAGGUGCACCACGUGGGGUUUGCUGCCGGAGCGGAGUCUCCGGCCGGCGUCCAGUUUGAGUCUAGGUUGGAGUUGGAACCGUGGAGAUGCGGAAGGAAACCCCACCCCCCCUAGUGCCCCCGGCGGCCCGGGAGUGGAAUCUUCCCCCAAAUGCGCCCGCCUGCAUGGAACGGCAGUUGGAGGCUGCGCGGUACCGGUCCGAUGGGGCGCUUCUCCUCGGGGCCUCCAGCCUGAGUGGGCGCUGCUGGGCCGGCUCCCUCUGGCUUUUUAAGGACCCCUGUGCCGCCCCCAACGAAGGCUUCUGCUCCGCCGGAGUCCAAACGGAGGCUGGAGUGGCUGACCUCACUUGGGUUGGGGAGAGAGGUAUUCUAGUGGCCUCCGAUUCAGGUGCUGUUGAAUUGUGGGAACUAGAUGAGAAUGAGACACUUAUUGUCAGCAAGUUCUGCAAGUAUGAGCAUGAUGACAUUGUGUCUACAGUCAGUGUCUUGAGCUCUGGCACACAAGCUGUCAGUGGUAGCAAAGACAUCUGCAUCAAGGUUUGGGACCUUGCUCAGCAGGUGGUACUGAGUUCAUACCGAGCUCAUGCUGCUCAGGUCACUUGUGUUGCUGCCUCUCCUCACAAGGACUCUGUGUUUCUUUCAUGCAGCGAGGACAAUAGAAUUUUACUCUGGGAUACCCGCUGUCCCAAGCCAGCAUCACAGAUUGGCUGCAGUGCGCCUGGCUACCUUCCUACCUCGCUGGCUUGGCAUCCUCAGCAAAGUGAAGUCUUUGUCUUUGGUGAUGAGAAUGGGACAGUCUCCCUUGUGGACACCAAGAGUACAAGCUGUGUCCUGAGCUCAGCUGUACACUCCCAGUGUGUCACUGGGCUGGUGUUCUCCCCACACAGUGUUCCCUUCCUGGCCUCUCUCAGUGAAGACUGCUCACUUGCUGUGCUGGACUCAAGCCUUUCUGAGUUGUUUAGAAGCCAAGCCCACAGAGACUUUGUGAGAGAUGCGACUUGGUCCCCGCUCAAUCACUCCCUGCUUACCACAGUGGGCUGGGACCAUCAGGUCGUCCACCACGUUGUGCCCACAGAACCUCUCCCAGCCCCUGGACCUGCAAGUGUUACUGAGUAGAUUGGAUUUAAGACAAAAAGCAAGUCCCCCAUGAGUGUCCACUUCUUUGCCCUGCCCUCUCAGCUUGUGAGACAACACAGGAGCCUUCUAUAGUAUGUUGAUAUGCUAGAUCUGUGCCGUUAAUAGGCAUCGUCUCUCAGCCUGAGGGAGGCUGGAUUCUGGGUUCCUGUAGUCACAGGGAGGAAAAGCUUUCUUAAAAAUGGACAUGUAUGUGCGUGUGAGUGUGUGUGUAGAUUUAUAGUUUUUGGUAGUGGCAGGAAUAAAAAAAAUCCAUCCUACAUCUUCCCUAAGCACUGCCUCUCUCUCACCCCCCAAAACAAGUUGACGAAAGGGUUUUAUGUAGCUGUCUAUGAGGAAUUGGCCGUGUCUGGGUGGGUUAUGGGAUGUGGGCAUCCCUGGGUUCUUGGAAGCAGCUCUUAUGCUACUCAUAGAGAUGGGAUUGACUUUAUUUUUUUAUAGUGCUUAAUUCACCAUUAUGAGAAAUGCUUCCAGUCACAAAAAUGCAGCCCAGCUCACUCUGAGGAAGAAGCAGGACUUGGUACGGUUUUACACAACUCCUUACCAUUAAACUGAAUCAGAAAUCCAUUUUCUGGCUGAAUAAAAAGUUUGGCUUGCCUGUGUAAUGCCCACUCCCUUCCCCCUGGCUCCCUAGUGAUGGGACAUAUAUGAGAGAGAAGUGUUUUUCUAUCAUAGACACCAUAGGGGAAAGUUUGGGGAUGAAGGAGAGCUUAAAGGUGUUUCAAUUAAGUUAGAAAACUGACACAGGCUGUUGAGAAUUCUUUGCCACUUUUCCCACCCCAAAACAGCAUGGGGCCUGACAUCUUCUGCCCUGGUCCCCUUUCUCUUGAUGUGGAAAGUCUGAAUGCAGUAUUUAUAGACUUCUAAGGUUUUAAAAUCCAGUAUCAAGAAGAAAAUCAGAAAUACUGGUUGGUGAAAUAAAGAGUUUAGGCAUUGUUGGCCUGUCUUUUUUGAAGCAUGUGUGUUAUGUGUAGUUAGAUAUAUUUCACUUAUGUGAGUCAUCAUGGUGUUGGUCUUGUAGCCCAUUAUUUUUCCUGUGCUUCCCCAGCUUCCCAAAGUAGCUAGUUAGAACUUAAGGUAAAUAUUUAUUCUUGGGUUGGUGGAGUGGAUAUUGCCAGUUAGGAGUCAUGGAUCAAUUACUGAUUAUAUUGAAAGUAAAUAUAAUCAAUUAUGUACUUUUGAGCUUUGCAGGUUCAAUUUAGGUAAAAAUCACAUUAUGAAACUGGGAAAGUCUGAAGGAAUAUGGGCAAAAUAUUUCUCAGUAAAGCUUCCAUGCUUCACCCUUGACAUGAUUACCCUUGAGUAAAACAUGGGAAUUUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-839.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -887.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 586.57
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((...((((.(((((((...(((((((.((((((((((((.((((((((.((.......((((((((...((..(((.(((((.(((........(((((.(...((..((((((((((....)))))...(((....))).......((((..((((.((((......))..)).)))).))))))))).))...).)))))))).))))).)))..)))))))))))).))))))))))))))..))))))))))))).......))))))))))).))))((((....((((..((((((((((....(((....)))))).)))))))..).))).....(((((((((((((((((..((((((..(((.((((((((......)))))))).))).))))))(((.((((((...)))))).)))(((.....)))......((((.(((.(((((((..........)))))))))).)))).((((((((((.((.(...(((((((....(((((((..(((((((...)))))))....)))))))....(((((((.....))))))))))))))...).)))))))).)))))))))))(((((((((.(((((((...........((((((((.................(((((((.....)))))))(((((((((..(((.....)))..))))...))))).........))))))))(((((((.((..(((((.(((.((((....(((((((.(((.((((..((((.....)))).(((((((((((...(((((.((((.((.....)).)))))))))...(((((((...))))))).)))))).....)))))(((.(.......))))...))))))).))))))).....))))))).)))))((((((........)))))).....)).))))))).))))))).)))))))))....(((((((((((((.(((((........(((.......)))))))).)))))))...)))))).......(((.((....)).))).)).)))))))).((((((((((((.(((...(((((.((.((((((............)))))).(((((((((((((((((...(((..(((((((((((((((..(((...((((((((((....(((((((....)))))))(((..(((((.......))))).)))((.((((((.....))))))))....)))))))))).)))..((((((......)))))).....(((.(((....))).)))(((((.(.(.(.((((.......((((..((.((((..((((..............)))).)).)).))..)))).))))).).).)))))........))))))))).))..((((((((..((((((.((.((.((((((((..(((((((((.(((....((((.((((((((..(((((((((((((((((..((((((............((((((((((((.((((......)))).).)))).)).)))))))))))..)))))))))..........).)))))))((((...))))......(((((...(((((.((............)).)))))...........((((((.....))))))(((((((.....)))))))...)))))...))))))))))))..))))))...((((.......)))).....((((.((((((....)))))).))))))))))(((((((((((....((((((..(((..((....((((((((........(((((....)))))...(((....((....))...)))..........(((((........)))))...))))))))))..))).)))))).((((((((((((((((((((((((........)).)))))))..............)))).))))))).))))((((((.....))))))(((((...((((((..(((((.......))))).))))))....(((((.(((..((((((......))))))..))).)))))...)))))((((.((((......))))))))..))))))))))).....)))).)))))).))))))))..))))))))(((((((....))).)))))))).))))))))))))))..((.....))..)))))).........((((((((((.......))))))))))...)).)))))...)))))))))))))))(((((((....(((((..(((((((.(..((((.((((((.(((((((.......)))))))))))....))))))..).))))....)))..)))))...)))))))......))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((...((((.(((((((...(((((((.((((((((((({{((((((((.({......,((((((((...((..(((.(((((.({({..{{...,,|{{,|,.,{,..((((({{,{{{{{.{{|||.{.{{,..,,))),||...,((((..((((.({,|......)}.,)).}))).)))))},,),)).}}}.,))))))).))))).)))..)))))))))))).))))))))))))))..))))))))))))).......))))))))))).))))((((..,.{(((..((((((((((....(((....)))))).)))))))..).)))},{(((,,{{(((((((((((((.((((((..(((.((((((((......)))))))).))).))))))......{(((((((....(((((.((.((((.........)))).)).)))))..)))))).}}(((((.((.....)).))))).(((((((((..((.((((((((((((((((((..(((((((...)))))))....)))))))({{.(((((((.....))))))),}||||,,,({.(((((((({{{{{((.((({{((((((((.(((((((...........{(((((((.....{{..........(((((((.....)))))))(((((((((..(((.....)))..)))}..,))))).........)))))))|(((((((.,{,.((((({(((({{((....(((((((.(((.((((..((((.,...,}}}.{({((((((((,{.((((,,((((.((.....)).))))))))).,,(((((((...))))))).)))))),,...}}}}}.||,}...,,.,}}}},..))))))).))))))).}))))))))))).}||,((((((........)))))}...,,)).))))))),))))))).)))))))))))).))|,((((((((,.(((((..{(({...(((......(((.(((((((((.....{((({{{.{{{,.....)))...,).}}}))}.)))))))))))),....)))))))....))))).)...}}}||,,,}......,})))}},...)})))))).}}...)))))))..))))))..))))))))).(((...((((((((((....{((((({....))))))){{,..(((((.......))))).)}}|,,((((((.....))))))),....)))))))))).)))..((((((({...,,,.,|,.....,{|.(((({{....})))}},,||{{{,{,,,,{||{|.,,{||{{{{,,.,.{,,}|||,}.....,},))},},}))),))))))))......)))))))))},,...,)))))..}}}||{.((..((((((.((((((,,.{((((((((..(((((((.(((((((((.(((....((((.((((((((..(((((((,(((((((((,,{{{{{{|},.{{{,{,|.{(((((((((((.{(((......)))).).))))}}).))))))))))}..)))))))))..........}.)))))))((({...})))......{((({...(((((.((..,.....,}..)).))))).....,,,...((((((.....))))))(((((((.....)))))))..,|}}}},,.))))))))))))..)))))}|{{{(((,,,,,{{||||,.,,(((((.{(((({....}))))}.})))}{{(((({{{(((({..{(((((((.((..((((((..{(((((..(((((((...(((((....)))))....,..)))))))..}))))}...}}))))}))))))}}},,.....(((((..({.....}}.))))}}})))))}((((((((((((((((((((((((,.....,})).}))))))..............)))).)))))))},))){(((((.....))))))|{{|,...{(((({..(((((.......))))).))))}),,,.|||||.{{{..{((({{......)))))).,)}).)))))}.,})}}}||||,|||{,.....)})))))},,,,.,,}|,,.{|{|||||{|{|,|||,,,|{||}||..,..{{(({{{(({{{.,,.}}}|}})))))}}}}.))))))))))).))))))).....))))))},,,.....((((((((((.......)))))))))).,{{{.(({{{((((((({...})))))))..,)}))).....,......{{{{.{,,(({{|{{(((,{(((((((.......)))))))))))....})))))..).))))....,,))))))..))))))..))..,,,.))))........
Back