Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024409.4
Sequence Length
1055 nt
GC Content
0.5213
AGAGCGCACCCAGCCGGCGCCGCGCAGCACUGGGACCCUGCUCGCCCUGCAGCCCAGCCAGCCUGCUCCGCAUCCCCCUGCUGGUCUGCCCGCCGACCUGCGCGCCCUCGCUGCCGCCCGUGUGCGCCCCUCGACCCCAGCGGCACCAUGCAUCUCUCCCAGCUGCUGGCCUGCGCCCUGCUGCUCACGCUGCUCUCCCUCCGGCCCUCCGAAGCCAAGCCCGGGGCGCCGCCGAAGGUCCCGCGAACCCCGCCGGCAGAGGAGCUGGCCGAGCCGCAGGCUGCGGGCGGCGGUCAGAAGAAGGGCGACAAGGCUCCCGGGGGCGGGGGCGCCAAUCUCAAGGGCGACCGGUCGCGACUGCUCCGGGACCUGCGCGUGGACACCAAGUCGCGGGCAGCGUGGGCUCGCCUUCUGCAAGAGCACCCCAACGCGCGCAAAUACAAAGGAGCCAACAAGAAGGGCUUGUCCAAGGGCUGCUUCGGCCUCAAGCUGGACCGAAUCGGCUCCAUGAGCGGCCUGGGAUGUUAGUGCGGCGCCCCCUGGCGGCGGAUCGGGAACUGGCUCCGUUGUGCUGAGGUCAUCUUUGGUCAUCAGCCUCCAGCAUCUGGAAACACCUCCAACGCAAUGUGGCUUUUACAUUUCUUUCUUUCUUUCUUUUUUUUUCCUGGUACUGGGAAUACACAACACCAGCUGUUUUAUUAUUAUUUGGGGAGGGGGUUGUGAUUUUAUUAUUUGUUUUUUUAAAAUGAAAAAUAAAAAGUUAUAUAUUAUAUAUAUAUUAUAUACAUGAAACACACACACCUACACCGACUUGAUGACAAGGGACAGUUUUUAAGAGACUGACAGAACCAGCUGUAAAACAUUGCUGUUUGUAAAUUCAUGUCAUGCAUAAAUGUAUUUAUGUUGUAAAGCUAUUUAUAUUGUUUAUAAAGAGAUAUUUAUAAAAAUUUUAUUUAUGUAACUAAAUGAAAGAAGUCAAUCAUUGUAAUGUUUUUGUCCUAACUAGUUAAAAAAAAUGUAAAAAAAAAAAAGUCAUUCCAUGAAUAUCUUGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-366.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -386.19
Frequency: 0.0000
Diversity: 228.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((..((((..(((((((((((((((((((...((((.......)))))))))((((.((((((.(((......))).((((.((((.......((.(((((((((((.(((.((.(((.(((((.((((((.(((((((.................)))))))(((((((.(((((.((((..((((((...((((.(((........)))..(((((((((((.(((...)))...)))..)))))..))).))))))).))).)))).))))).)))))))...))))....)).)))))))).))....))).))))))))))))).......))))))))((((.((.......)).))))(((((((((((.....)))(.(((((((....))).)))).)(((....)))......))))))))........((((((.........((((((.....((((((...))))))))))))..........))))))..)))))).))))..)))).))))))))))..))))..)))..((((((...((((.(((((((..(((((.......(((.....)))(((((...)))))...)))))...))))))).))))(((((((((................(((((..(((((..(((((...........((((((((((.((((((..(.((...(((((((((.((((((..((((((((((......))))))))))....((((((.(((....))).)))))).)))))))))).)).)))...)).)..)))))).......(((((((...)))))))..)))).)))))).((((((((((((.(((....(((((....((((((((((........(((((((.((.((((((.....)))))).))...)))))))......)))))))))).....)))))......))).))..))))))))))..))))))))))..))))))))))))))..........((((...))))...))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....(((..((((..(((((((((((((((((((...((((.......)))))))))({((,((((((.(((......})).((((.((((...{{..((.(((((((((((.(((.({.(((.(((((,(((((({(((((((.................))))))}(((((((.(((((.((((..((((((({,,{{(((((.,,,,,..{{...}}.|||||{{{,{{{...))}...}}}..,,,))}})),,).))))).))).)))).))))).))))))),}.)))).,..)}.)))))))).))....))).))))))))))))).......))))))))((((.((.......)).))))(((((((((((.....))){,(((({((....))).))}}..{((....))}......))))))))........|(((((.........||}|||,....((((((.,{|||||......,}}.}}},,.}))))))..)))))).))))..)))).))))))))))..))))..)))..{({((({.{((((.(((((((,((((((......,|{{.....))){{{||,..}))))...}}}))}}.}}}}}}}.}}}{(((((({{...............{((((((..(((((..(((((...........(((((({(((.,{{{{{.{({({.,(({({,((((.((((((..((((((((((......))))))))))..,.{(((((.{{{,,,,))).)))))}.)))))))))).,).))).,.))}),,||}}},,}}}.,.(((((((...))))))).,,})}.}))))).(((((((((({(.(((....(((((....((((((((((.,,,,...(((((((.({.((((((.....)))))).})...))))))),,},..)))))))))).....)))))......))).))..))))))))))..))))))))))..)))))))))))))),.......}}}}}}}}}.})}....,.......
Back