Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024682.3
Sequence Length
2095 nt
GC Content
0.6286
AGUGGGGCCUUCGGCGGCGACUAUGGAAGGAGCCGGCUACAGGGUGGUGUUUGAGAAGGGCGGAGUGUACCUGCACACCAGCGCUAAGAAGUAUCAGGACCGAGACUCUCUCAUCGCUGGUGUCAUCCGUGUCGUGGAAAAGGACAAUGACGUCCUCCUGCACUGGGCUCCUGUAGAGGAGGCUGGAGAUUCCACCCAAAUCCUCUUCUCCAAGAAGGACUCCAGUGGGGGUGACUCAUGUGCUUCUGAGGAGGAACCAACCUUUGACCCCGGCUAUGAACCUGACUGGGCUGUCAUCAGCACUGUGCGGCCACAGCUCUGCCACUCAGAGCCCACGAGAGGUGCAGAGCCCAGCUGCCCCCAGGGCUCCUGGGCCUUCUCAGUGAGUCUGGGGGAGCUAAAGUCCAUCCGCCGCUCCAAGCCAGGCCUCAGCUGGGCCUACCUGGUUCUGGUGACCCAGGCUGGAGGUUCCCUGCCCGCACUGCACUUCCACCGCGGGGGCACCCGCGCCCUGCUCCGCGUCCUCAGCCGCUACCUGCUGUUGGCCAGCUCCCCGCAGGACUCCCGCCUCUACCUUGUCUUCCCCCACGACUCCUCUGCUCUCUCCAACUCCUUCCACCACCUGCAGCUCUUUGACCAGGACAGCUCCAAUGUGGUGUCACGCUUCCUCCAGGAUCCCUACUCCACCACCUUCAGCAGCUUCUCCCGAGUGACCAACUUCUUCCGGGGUGCCCUGCAGCCACAGCCUGAGGGAGCCGCCUCCGACCUUCCCCCGCCACCCGACGAUGAGCCCGAGCCUGGAUUCGAGGUCAUUUCCUGUGUGGAGCUGGGGCCUCGGCCAACCGUGGAGCGGGGCCCUCCAGUUACAGAGGAGGAGUGGGCACGCCACGUGGGCCCUGAAGGUCGCCUGCAGCAGGUCCCUGAGCUGAAGAACCGGAUCUUCUCGGGGGGUCUGAGCCCCAGCCUGCGGCGCGAGGCCUGGAAGUUCCUCCUAGGGUACCUCAGCUGGGAAGGCACAGCUGAGGAGCACAAGGCCCACAUACGCAAGAAAACGGAUGAGUAUUUCCGCAUGAAGCUGCAGUGGAAAUCUGUGAGCCCUGAGCAGGAGCGGAGAAACUCACUUCUGCAUGGAUACCGCAGCCUCAUCGAAAGGGAUGUGAGCCGCACUGACAGGACCAACAAGUUCUACGAGGGUCCCGAGAACCCGGGGCUGGGCCUGCUGAACGAUAUCCUCCUCACCUACUGCAUGUAUCACUUCGACCUCGGCUACGUCCAGGGCAUGAGUGAUCUUCUCUCCCCGAUCCUCUACGUCAUUCAGAACGAGGUGGAUGCUUUCUGGUGUUUCUGUGGCUUCAUGGAGCUCGUGCAAGGGAACUUUGAAGAGAGCCAGGAGACCAUGAAGCGGCAACUCGGGCGACUGCUGCUGCUCCUGAGGGUGCUGGACCCCCUGCUCUGCGACUUCCUGGAUUCCCAGGACUCCGGCUCUCUCUGCUUCUGUUUCCGGUGGCUGCUCAUCUGGUUCAAGAGGGAAUUCCCCUUCCCGGAUGUCCUUCGGCUGUGGGAGGUGCUGUGGACAGGGCUCCCUGGCCCCAAUCUGCACCUGCUGGUGGCCUGCGCCAUCCUGGACAUGGAGAGGGACACCCUCAUGCUGUCCGGCUUCGGCUCCAAUGAGAUCCUCAAGCACAUCAACGAGCUGACUAUGAAGCUGAGCGUGGAGGACGUGCUGACCCGCGCCGAGGCCCUGCACCGCCAGCUAACCGCCUGCCCCGAGCUGCCCCACAACGUGCAGGAGAUCCUGGGGCUGGCCCCGCCCGCAGAGCCCCACAGCCCCUCGCCCACCGCCUCCCCGCUGCCUCUGUCGCCCACCCGGGCCCCGCCCACCCCGCCGCCCUCCACGGACACAGCCCCGCAGCCCGACAGCAGCCUGGAGAUCCUGCCCGAGGAGGAGGACGAGGGCGCCGACUCCUAACCCCGCCAGGCAGCCUCGUUCUGCACAGGCACUUUAGCCCGAGCCAGGCACACCUGCGAGGGGGCAGGUGUGCUCCGCCGCCCUGCUGAUAAGCUGGCUUCAUUAAACUGACACUUCUCAUGUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-864.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -899.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 804.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((...(((((((.....((......))((((.(.((((((((((((....(((((((((((((.((((((((((((...((((((.((......)).))).)))...)))))))))..((((.....)))).(((.(((.(((.(((..(((.(((((((.((((..((((((((.(((.(......))))...))))))))......)))).))))))).))).))))))))).))).(((((((((.........((((((((((.........).)))))..))))((((((..(((((((((((((((((.....))))))((.((((((((((.......((((.((((((((.((((((((....))))).)))))))))))))))...((((((.(.(((((((..(((((.(((((((((.((((.(((((((..((((.((((((..((((.((((..((((((.(((((........(((((....)))))(((((((((((((...(((((.((.....)).)))))((((((((.(((((((.....(((((......(((.........)))(((...((((.(((..........((((((.((.((((.(((.....))).)))).))..))))))....((((((((..(((.......)))..........((((....(((((...((......))...)))))....)))).((....))..)))))))).................((........))..)))...))))..)))...)))))....))))))).))))))))(((....)))...)))))))))))))(((((.........))))).((((.....))))...((((.....))))(((((...)))))((((((...(((((......)))))))))))((.(((.....)))))))))).))).)))..)))).)))).))).)))))))..))))))).)))).))))))))).......(((.(((...((........))....((.((((((((.((......))))))))))))))).)))))).)).)))))))((((......))))).))))))...))).)))).)))...))..)))).)))))))....(((((......))))).....(((((((......))))))).....))))))......)))))))))......))).))).))))))).))).((((..(((((((((..(((.((((..........)))))))..(((........))).(((((........((.((((((.((((((((.(((..(((...(((((...)))))..)))..))))))).)))))))))).))....(((((((.(..((.((....(((((.((((........((((((((...((((((....))))))((((((.((((.((((...((((...((.(((.((((((((((...(((.(((....)))))).)))))).......(((.((((.((((((..(((.((((....))))...)))....))))))((((((((..((((.......(((((..(.(((((...))))).)..)))))(((((((((.....((((...))))(((((.((..((.(((.(((....)).).))).))...)).))))).......))))))))).))))))))))))...))))..)))..)))).)))))..)))).)))))))).)).))))..(((...)))))))))))....)))))))))((.....))......)).))..).)))))))....((((...))))...))))))))))....))))..))))..((((..(((..((.((((((............(((((..((.((....))))..))))).......)))))).)).)))..)))).))))))))...))))))))).(((((((((((......))))))))))).)))))))..(((....))).)))))))))....((.(((.......)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((((...({{((({,{,..,,.,(((({{(({,.{{((((((((...({(.,(((((((((({{{.(({(((((((((.,.((((((.((......)).))).))).,.)))))))))..,{{{.,,,,|||}.,((,(({{(((.(((..(((.(((((((.(((({.((((((((.(((.,......,)))...)))))))).,....)))).))))))).))).)))))))}}.}}}.{((((((((.........{{{{{{{(({......,,{|.}}|||,{||||,(((({..((((((({{{{((((((.....)))))},,.{{,(((((((||.||..((((.(((((((((((((((((....))))).))))))))))))))}...{{{{{{.,,((((({{..{{{{||(((((((((.((((.(((((((..(({||((((((..((((.((((..((((((.((((|,,||{,,,(((((,,,.}}}))||||{{{{(((|{...,((((,||....,))})})))({|{{{|{.{{|((({.....{{{{{.....,|||.....,|}}}}}{{|,|,(|||,|||..........((((((.{{.((((.{{{.....}}}.}))).}}..))))))....(((((((({(((,.......,,,..........((((...,{(((({(,{,......},..,|)))|.|,.||}},|,....|}}})))))})},|,,.,,}.........,{{{,,..|..|,,||}|..||||..|}|.,|)})}),...}}}})}).))}|||||(((.,,,)}}...}})))}})))))){{(((,,,..,,.,))))}.((((|,..,|},})))||{{,.{.,|||{{||{{||||||||({{,|{||||,,|,.,,,|.}}}}}|||||((({....}}}}),}}|})))).))).)))..)))).)))).))).))))}))..|))}})).}))).))))))))).,|.,..{{|,({(,..{{,.......||{{,,,{.{{((((((.{{......)}))))))})})}}}.}})))).)},}}})))}(({,..,,.,))))),,}))}}..,}}}}||}}.}},...}}}.)))).))))))),,..{((((......))))}....,|{{{(((......))))))),}}}})))))}......})))))))}......))},))},))))))}.}|||({{,.,||},|||{{..(((.({{{..,.,.,...}}}}}}|,,||||...{{{{{||||||}},||{...,{|||(,,,,{(({((((({(((.{(((.,.(((((...)))}}..||}||}|,|}}}.)))))))))|}}}.,,|{{|{|,|}|||||||}|,.,{{(((,{{|{,}..,..,({||||||...((((((....)))))),|}}||}||||,|,{{..,,||,,,}{{,{{|.{{{(((((((...{{(,(((....}))))).))))))}..,..,(((,((((|{((({({{{((.{,(({{,.,,,}|||||,.,||}}}}}}{{{(((((..{{{|..,,,.,(((((.{{{(((((...))))).).})))))|((((((((,|...{(((...)))}{((((.((..({,(((.{{{....)).).))).)),.,)).))))).....},))))))))),}))}}}|}||||,..,,||,.||,.,|})}|}}},,....,},)))))}}}.,,||||||||||,,.),}}))}))))}}}}}))))}}}}|,.|,},}}||,,..||{{{..|{{{||||.....((((..,||.......}}.}}}}....{||..}}}}..,.)|}}}..},}})))))..)},).,}}}),}))})}||}{((,(({{{..|||..}}},,.....,,,,,)))}})))))))))||.|,|||......)))}|,||,.(((((((((((......))))))))))).}))))}},,|{{....))),)))}}},,.....{{.{{{.......)))).
Back