Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_025128.5
Sequence Length
2364 nt
GC Content
0.6062
GACAGGAAGGAGCCGGUCCAGGCUCCGGGGGCUGGGAAAGGGCGCGUCUCAAAGGCUGGCUGGAGUGGAGCCAAGGGAAAAGAUCGUUAGAGACAGCGCCCCUGACCAACCACUUAGAGCAGCGCAGGGGUGGGAGGGCGGCCGCAGGCUCUCCUCUCGUUAGUGCCCCCUGUGUUUGGGGCCCCGUGAUCUCAACGGUCCUGCCCUCGGUCUCCCUCUUCCCCCGCCCCGCCCUGGGCCAGGUGUUCGAAUCCCGACUCCAGAACUGGCGGCGUCCCAGUCCCGCGGGCGUGGAGCGCCGGAGGACCCGCCCUCGGGCUCAUGGCGGCCCCGGUCCGCCUGGGCCGGAAGCGCCCGCUGCCUGCCUGUCCCAACCCGCUCUUCGUUCGCUGGCUGACCGAGUGGCGGGACGAGGCGACCCGCAGCAGGCGCCGCACGCGCUUCGUAUUUCAGAAGGCGCUGCGUUCCCUCCGACGGUACCCACUGCCGCUGCGCAGCGGGAAGGAAGCUAAGAUCCUACAGCACUUCGGAGACGGGCUCUGCCGGAUGCUGGACGAGCGGCUGCAGCGGCACCGAACAUCGGGCGGUGACCAUGCCCCGGACUCACCAUCUGGAGAGAACAGUCCAGCCCCGCAGGGGCGACUUGCGGAAGUCCAGGACUCUUCCAUGCCAGUUCCUGCCCAGCCCAAAGCGGGAGGCUCUGGCAGCUACUGGCCAGCUCGGCACUCAGGAGCCCGAGUGAUACUGCUGGUGCUCUACCGGGAGCACCUGAAUCCUAAUGGUCACCACUUCUUAACCAAGGAGGAGCUGCUGCAGAGGUGUGCUCAGAAGUCCCCCAGGGUAGCCCCUGGGAGUGCUCGACCCUGGCCAGCCCUCCGCUCCCUCCUUCACAGGAACCUGGUCCUCAGGACACACCAGCCAGCCAGGUACUCAUUGACCCCAGAGGGCCUGGAGCUGGCCCAGAAGUUGGCCGAGUCAGAAGGCCUGAGCUUGCUGAAUGUGGGCAUCGGGCCCAAGGAGCCCCCUGGGGAGGAGACAGCAGUGCCAGGAGCAGCUUCAGCAGAGCUUGCCAGUGAAGCAGGGGUCCAGCAGCAGCCACUGGAGCUGAGGCCUGGAGAGUACAGGGUGCUGUUGUGUGUGGACAUUGGCGAGACCCGGGGGGGCGGGCACAGGCCGGAGCUGCUCCGAGAGCUACAGCGGCUGCACGUGACCCACACGGUGCGCAAGCUGCACGUUGGAGAUUUUGUGUGGGUGGCCCAGGAGACCAAUCCUAGAGACCCAGCAAACCCUGGGGAGUUGGUACUGGAUCACAUUGUGGAGCGCAAGCGACUGGAUGACCUUUGCAGCAGCAUCAUCGACGGCCGCUUCCGGGAGCAGAAGUUCCGGCUGAAGCGCUGUGGUCUGGAGCGCCGGGUAUACCUGGUGGAAGAGCAUGGUUCCGUCCACAACCUCAGCCUUCCUGAGAGCACACUGCUGCAGGCUGUCACCAACACUCAGGUCAUUGAUGGCUUUUUUGUGAAGCGCACAGCAGACAUUAAGGAGUCAGCCGCCUACCUGGCCCUCUUGACGCGGGGCCUGCAGAGACUCUACCAGGGCCACACCCUACGCAGCCGCCCCUGGGGAACCCCUGGGAACCCUGAAUCAGGGGCCAUGACCUCUCCAAACCCUCUCUGCUCACUCCUCACCUUCAGUGACUUCAACGCAGGAGCCAUCAAGAAUAAGGCCCAGUCGGUGCGAGAAGUGUUUGCCCGGCAGCUGAUGCAGGUGCGCGGAGUGAGUGGGGAGAAGGCAGCAGCCCUGGUGGAUCGAUACAGCACCCCUGCCAGCCUCCUGGCCGCCUAUGAUGCCUGUGCCACCCCCAAGGAACAAGAGACACUGCUGAGCACCAUUAAGUGUGGGCGUCUACAGAGGAAUCUGGGGCCUGCUCUGAGCAGGACCUUAUCCCAGCUCUACUGCAGCUACGGCCCCUUGACCUGAGCUUAUGCCGUGAAACAGCCCCCAGCCCCCGUCUGUCCCCCAACCCAGGCUAGCCAGCCUUUUAACAACAUCUUUUGGGGUACAAUUAGAAUCUAAGUGUUUGCAGCCAUAUGUGUCAUGUAGAAGAUGCCUAGCCCUGGGGACCUUGUGAAAUACGCAGGAACCAGGGAUACCAUCUGGUCCAGUGGUUUUUAAACAAAGCUGCUUAGCACCUGGAAUUCCCUGGUCAGGGAGAUGGAGUCAGUGGGGCAUUGCAGCUUGGAAUCUAUUUUAUGUCACCAGUUGGUCCUCAUCAAAUAAAAUUUCCUUAGGAGUGCAGAGGGCUCAUUGGGAAAAUAAAAAUAAUAAAAAUAAAUAAAACUUCCUAAAAGAAAAGAUUGAAAACCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1007.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1045.84
Frequency: 0.0000
Diversity: 803.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((((......)))))(((((((((((..(((((.((((((.(((((((...((((.((((((.((((....(((((((.((((..(((((((..................((((((((((((((((((.((((...)))).)))))))).......)))))))))).)))))...))..)))))))))))...)))).)).))))))))....(((((..((((.((((..(((.(((...........(((....)))((((((.(((((((...)))).))).))))))))).))).))))..))))....)))))..(((((((....)))))))..(((((.(((((.((((((((((...((((((...(((........))).)))))).))))).)))))....))))).)))))(((((((.((((........))))))).))))...((......))..(((.((((......)))).))).((((........)))).)))).)))..)))))).)))))((((..((.....))..))))((((((((...........((((((.((((((((.(((((((.(((((..(((..(((.(((((.(((((...)))))(((((....)))))..))))).)))...((((((..(((((.(((((.......).))))..)))))..)))))).(((....(((((.((...))))))).....)))((((((((....))))))))....)))..))))).....((((((....))))))((((((((((((((((...(.(((..((..(((((((....))))))).((((((.((.((((((.((((...((((((((((....)))).((.(((((((((..(((((((((..(((..((((((.....((((((.(((((((..(((((((........)))).))))))..(((((((((((((.....)))))).)))))))......)))).))))))............(((.....)))(((((((((.....)))...))))))..(((((((((..(((...)))..)))).)))))...))))))..)))...)))).)))))..)..))).).)))).))))))))))))...))))))(((((((...........)))))))....((.((((((((((((((.....)))))...........))))))))).))((((...((((((........(((((......)))))..)))))).))))........)).))))))..))..))))...)))))))))))))).))....(((((.((((((.(((((....))))).)..)))))))))))))))))..(((((((....))))))).....)))))))))))))).....(((((.....)))))......))))))))(((((((((((...(((((((((......(((((.....)))))((((((..(.((((((((.(((((..(((.....)))....)))))((((((.(((.(..((.(((((((((((..........((.(((((((((((((..((....))..))).....))))))).................(((((((((((((((.((((((((((............((.(((...........))))).(((((.(((((.....)))))))))).)))))...)))))...)))))))))))))))..))).)).)))))))))))))..).)))...))))))..(((....)))..))).))))))))))))...((....))....(((..(.(((..((((.((((.....)))))).))..))).)...)))(((((((((...((((.((........)).))))....))).....)))))).)))))))))....))..))))..))))))))))))))))..(((.((((((...(((((....)))))..............)))))).)))..((((.(((((((...((((.....((((.((((......(((.((...(((((.....((((((.....)))))).((((((((..(((..((.(..(((((((((.....))))))))).).))..)))...)))))))))))))....)).))).)))).))))))))))))))).))))((((((.((.(((((.(((((((..((........((((...))))))..))))))).)))))))..))))))...................)))))).....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((((......)))))|(((((((({{..({((((,{,{{{,,.((({(({{({((,((((({.{(((,.,,({(((((,((({{{(,(((((,{.,,,,,{{,.,,.,{,((((({((((((((((((.((((,..|||}.}}}}}}}}.....{{|||}}}}}},.))))).,{||,.}}}}}))))}}..,))}},)),)})))))}..,}}}||||||||||{{(((((((((,,,...,,||.{((({{..{{{(((((((,({{({((,{.||||,}||.}||}||{{|{.,},|,)}|},|||||,.|||||{,{{(({||.,,.)))))))..(((((.(((((.((((((((((...((((((.,,(({.....,,.)),.)))))).))))).)))))....))))).)))))((((.(((((((........))))))))))))...,({{{{{.{{{.(((.((((,.....)))).))).((((........)))).,,||,}|}}|)}}.||{{{{||((|{|.,{{{({.,{(({{{((((({((((.((({...}))),}(((((((((...,,(((.{,,...,,|||{,.({,.{((((.(((((...)))))(((({....}))))..))))),)))}..((((((..(((((.(((({.....,,).)))}..)))))..)))))),{((,,,{({({{.{|.,.))))))}.....)}}((((((((....)))))))),}}.}}}..))))))))).((((((....})))))|.||||||||||{({{,,{{||,,.,|{,{(((((((....}}}|}||,{{||||..,{((((((.(({(((({(({{(((((,,.,|||,,((((((.,.|,||.{,,,||{{{..|||||||,(((..,..((((((.(((((({{.,{{((((.,....,.))))},}))}}..(((((((((((((.....)))))).)))))))....,.)))).)))))).}}}}...||.}||||}||,||}|||||,||||.}}}})),,,)},})}.,||||{((((..(((,..))),.)))).}))))}}.,,}},),})))))))))}))})))}.,.}})),},}.,||.}|||||}.|||,||||{{{|||}.})))),||,|||.{{(((((,((,,(((,{{..}}})})})}}..)),)).}}}}}..,.,||||{{((((({{{{,((((,,{{{.||||,|..,|||||,,...,)))))}.,))))},}}}}..,.{,,,||{,.{|}}..}}..},,|||||}}}}|||}}}})).}},,}.{{||||||{{{{.(((((....))))),),,)))))))))),|||}||||,{{{|||||..}}}}||((({{,{{..{|||}..,}},.,,,|{{{|,,,,,)}}}}{(({...})))||,((((({({({,...{{{{{(((,.,,.{{(((((...,,|}}}}.||||||.,,||,.,|||,}|)}|}}||,,,,,}))).}|}}.)}}((((((.(((.{..((.(((((((((((..,..{{,..((.,,,||((({((({...}}},)))..{{|{{...))))),,...,.............(((((((((((((((.((((((((((............((.(((...........))))).(((((.(((((.....)))))))))).)))))...)))))...))))))))))))))).,)),.),.)))))))))))))..}.)))..,)))})),,{,|}}}})))}})))})}.,))))))))}.}|}},..))....{{{..{.{{(.,{{((.((((.....)))))),))..})),}}..))}|||||||||},}||{|.{|}.}},.}})).))))}}}},)))}...))))}},)))},}))),...})}}})}...))))))))}|||||}}((((((.(((..((((((((((.((..((((({,{{((((....(((.(((((.((((...)))).))}.,))..)))...))))..}})))))).)).))))}}}))))...((((((.....)))))).((((((((..(((..,(((..(((((((((.....)))))))))..},)}})))...))))))))..))).))))))..,.|,|||}},{{.{{,|,}||},,.,,((((((.{,.(((((.(((((((..{{........((((...)))}))..))))))).)))))}}..))))}}...................}))))).....................
Back