Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_025263.4

Sequence Length

1845 nt

GC Content

0.5127

CCCUUCCUCACUACCCUCCAAAUCCCGCUGCAGCCAUUGCCGCAGACACGAUGCCGAAACGAAAGAAGCAGAAUCAUCACCAGCCACCGACACAGCAGCAGCCCCCGCUGCCCGAGCGGGAAGAGACUGGAGAUGAGGAGGAUGGGAGUCCCAUCGGACCACCCAGCCUUCUGGGCCCUCCCCCCAUGGCCAAUGGAAAACCUGGCGACCCUAAGUCAGCUCUUCACAGAGGUCCUCCAGGAUCAAGGGGACCACUGAUUCCACCACUGCUGAGUCUCCCACCUCCUCCUUGGGGUAGAGGCCCAAUUCGGAGAGGGCUUGGCCCCAGGUCUAGCCCAUAUGGUCGUGGUUGGUGGGGAGUCAAUGCAGAACCUCCUUUUCCGGGGCCAGGCCAUGGGGGUCCCACCAGGGGAAGCUUUCACAAGGAACAGAGAAACCCUCGAAGGCUCAAAAGCUGGUCUCUUAUCAAGAAUACCUGCCCGCCCAAGGAUGACCCCCAGGUUAUGGAAGACAAAUCCGACCGCCCUGUCUGCCGACAUUUUGCCAAAAAGGGCCACUGUCGAUAUGAGGACCUCUGUGCCUUCUACCAUCCAGGCGUCAAUGGACCUCCUCUGUGAGACUGUGCCUUCCCAUCCAGGCUGGAAGGAGCUCUCUGUGACCUAGCGGCCAUUUAUUUCUCUGUAGCCCUAUGAUGGCUACUGUGAGGCUCUUCUAACACCCUCAGUCAGUGACACACCCAUCCCAUCCACCACUUCCCCCGUGUGGGGUCCAGAGUGGUGUUGCAUCACUGGUGCGCGGCAUACGCGCUUUCUUCUGAUCCAGCCUGUAGAGACUCGCCUUUGGGACCCAUCUUUGCUUCCUUUCAGUUGCCUCCUGGAUCUUCUUUCCCGUCAUCAAAUGACUGCUGAACAGGAAACCUCUUUGGUGCUGUUUCUUGUGCAUCUGUCCACCUGUUCCCCAGUAUUGCCCUCAAUUCCUGAGAGCCCUGGAGCGGUUUCCUACCAUUCCCUUCUUUUAGCUGCUUGUUUUAAGUCCUUUUUAUGUGACAUUCCCUACCCCCAAUGUUGUCAGCUGCUUGUGAAACUCAGCCAGGUUGUCUAACCUGGGGUCAAGUUUGGGUGACUGGUGCAGAGUUACUUCCUAAAAGGCCACUCUCCCUGCCUUUGGAUUUCAUAGUUUCUCUGUCAGUAGCAUGAUCCCCACCGCUAUGGUCUAUCUAUGAUCACCGUGCUUUGUGAAACUGUGCAUCCCCUUGUAGCCUUUCUCAGUGUCCGUGGCAUUUUUGUGACUUCCCAGCACUAGAAUAAGUUUUCCUGCCAAAAUGAGUGAGGCGCUUGGUGCCCUCUGGACUUUCCCACUUCCCAACAUGGGAGAAUUGUGAACUUUCCAUCAGACUGCCUCCCUGGCCCUCCCCAUUCUUCUCCUGUUGGUUAUUCUGAGUCUGACACAGACCCAUGACAUGUCUUAUAAAGCCUCCAAUGGCUUUAUCCUACCUAGAUCCCUUCCAGCCCAUUUUAAUUAGACUAUGUCAUUGUGAGGCCACCAGUCCAUUCAUUUGAAUUCUGUGAAUCUCCACCUUGCCUAUCUUUGGGUAGAAGCUGGACAGUACUGUUGCCCUCUUCCAAUCCUCUUCCCCUACAUCCCUGGCACUGGUUGUUUUCUGUGAAAACAGCAGUGAACAGGUUCAGUUUUGAACUGGCCCUGAGGAAAUGGGUCAGGAGUUGUAUUGGCAAGAGGGAGGGGUGAGAGCUGUUGGAGAACUGAGAAUGAGGUUUUUUUUUUUUUUUUCUUUUUAACUUUUUUUAUAUUAGUAAUAAAUGCAGUGGAAACCAGCAUUUUAUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-597.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -630.87

Frequency: 0.0000

Diversity: 424.43

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........................((((((((...(((((.(((.......))).((((.((((((((.((((....((((((.((((..(((((((((....((((((.....))))))(((.((((.((((((((.(((((((((((((....))))..(((((....))))).....(((((((((((..(((.....(((((........))))).......(((.(((((.((........))))))).))).........(((((((.((.((((((.((.(((((((((..((((((..........)))))).))))))))....(((.....))).).))..)))))))).)))..))))...((((......)))))))))))))))))).....(((((((.((((.....((((((((((((....(((((((((......((.(((.((((...))))..))).))((......))((((((....))))))(((((............(((((...((.(((....))).))...)))))(((.(((.....(((((((..(((((((..........))))).))..))...))))).....))).))).)))))....(((((((((.((((......(((.((....)).)))......))))((((((.......))))))..(((((............))))).(((((((..((...........((((((((.((((....))))....)))))))).))..))))))).(((((.....)))))..((....))))))))))).........))))))))).....)))))).))))))..))))..)))))))........)))))))........((((..(((((((..........(((((..........)))))......)))))))..))))...((.((((.....)))).))...((((.(((.....))).))))..........)).)))))))).)))))))......(((((.................)))))))))).))))(((((...(((((((....))))))).....))))).)))).))))))(((((..((((((..((((((..........)))))))))......)))..))))).((((..(((((....(((.(...(((((.......)))))).)))..)))))..))))((((......))))((((((((((((.(((((.(((....))).))...(((((....(((......)))......(((((((((.(((...(((((.(((((((......)))....((((((..((((((..(((............((..(((.....)))..))..)))..)))))))))))).......(.(((((...))))).)(((((((((((.((((((((......)))))))).....((.((.....)).))............)))).)))))))...)))).))))))))))))))))).......(((......))).(((((((....)))))))..)))))((((..((.((((((.(((.....((((((((..((((..((((.(((((.((((((((...)))))))))))))..))))((((....))))(((((((.........)))))))....))))..)).))))))))))))))).)))))).)))..)))))))..)))))...)))).)))))))).))))................)))))...))))))))...................

Thermodynamic Ensemble Prediction

........................{{((((({.,.(((((.(((.......))).(({(.((((((((.((({{({((.((((((,({(,,,,.((,{{.},.,{{|||,,...,})))}..|,|,}}||.}}}}((((((.((((.((((....))))..)))).)))))}(((.....(((((((((((..{(({,...(((((........))))).......(((.(((((.({........))))))).)))..,,,....(((((((.((.((((((.{(.,((((((((..((((((..........)))))).))))))))....{{({....}},.}.))..)))))))).)))..))))..,((((......)))),,,))))))))))).))){{.((((((.((((((((((((.((((((((((..((((((((.....{(.((((((.(((..(((...(((((((((((((((..((((((((((((((.((,{({{{...,,,,,.{{{,{||||,.|||||..,||.,....|||||{((.(((..{{.(((((((..(((((((..........))))).))..))...))))).}},.))).)))}}},...{(((((((((((((((((.....({(.(((((.(((........,,,,.((((((.......))))))..,((({,{..........}}}}},{((((((.,((,,..,,....,({(((({{.{{{,..,,))))....)))})))).})..))))))}.(((((.....)))))..,,..|}}}..,}}.,,}.})))}...))).)))))...}}}....))}}))))))))......))))))}..........(((({...})))){(,,(((((((...,......(((((..........)))}}.}....))))))}..}))},..((.((((.....)))).))...((((.(((.....))).))))...,,,..|(({{...|||,,|||,..........{((((...............,,))}))|,||},,,,}}})}.)))),})))}))))))))))))))))..)))))))....)).)))).))..)))..))).))))))}}......))))))))........))))))))))..,{{{{.|{.....,,..|}}}|((((.......))))}..,,,))))))))))....)).)))))).)),{{{{{|(((({|,||{||,|((....}}},}}...{{{((,|.,|||..,,,.|||..,.,.(((((((((.(((...(((((.(((({((......))}....((((({.{((((((..{{({........,,,{{..(((.....)))..}}..,}},,)))))})))))).......{.(((((...))))).}(((((((((((.((((((((......)))))))).....{{.((.....)).}}............)))).))))))}...)))).)))))))))))))))))}....,.{{{......|}},(((((((....))))))}..)})))((((,.((.((((((,(((,,..,((((((((..((((.{((((.(((({,((((((((...)))))))))))))..)))|{(((....})))|((((((.........))))))),,}.))))..)).))))))))))))))).}))))).))),}))))))}..}))))}..,)))})))})))).}},,................))))}...})))))))....,,,,...........