Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_030666.4
Sequence Length
2476 nt
GC Content
0.4342
CCUGACCUCGCACCCAGCUCGGAGCCCGGAGCGUGCCUCGGCGGCCUGUCGGUUUUCACCAUGGAGCAGCUGAGCUCAGCAAACACCCGCUUCGCCUUGGACCUGUUCCUGGCGUUGAGUGAGAACAAUCCGGCUGGAAACAUCUUCAUCUCUCCCUUCAGCAUUUCAUCUGCUAUGGCCAUGGUUUUUCUGGGGACCAGAGGUAACACGGCAGCACAGCUGUCCAAGACUUUCCAUUUCAACACGGUUGAAGAGGUUCAUUCAAGAUUCCAGAGUCUGAAUGCUGAUAUCAACAAACGUGGAGCGUCUUAUAUUCUGAAACUUGCUAAUAGAUUAUAUGGAGAGAAAACUUACAAUUUCCUUCCUGAGUUCUUGGUUUCGACUCAGAAAACAUAUGGUGCUGACCUGGCCAGUGUGGAUUUUCAGCAUGCCUCUGAAGAUGCAAGGAAGACCAUAAACCAGUGGGUCAAAGGACAGACAGAAGGAAAAAUUCCGGAACUGUUGGCUUCGGGCAUGGUUGAUAACAUGACCAAACUUGUGCUAGUAAAUGCCAUCUAUUUCAAGGGAAACUGGAAGGAUAAAUUCAUGAAAGAAGCCACGACGAAUGCACCAUUCAGAUUGAAUAAGAAAGACAGAAAAACUGUGAAAAUGAUGUAUCAGAAGAAAAAAUUUGCAUAUGGCUACAUCGAGGACCUUAAGUGCCGUGUGCUGGAACUGCCUUACCAAGGCGAGGAGCUCAGCAUGGUCAUCCUGCUGCCGGAUGACAUUGAGGACGAGUCCACGGGCCUGAAGAAGAUUGAGGAACAGUUGACUUUGGAAAAGUUGCAUGAGUGGACUAAACCUGAGAAUCUCGAUUUCAUUGAAGUUAAUGUCAGCUUGCCCAGGUUCAAACUGGAAGAGAGUUACACUCUCAACUCCGACCUCGCCCGCCUAGGUGUGCAGGAUCUCUUUAACAGUAGCAAGGCUGAUCUGUCUGGCAUGUCAGGAGCCAGAGAUAUUUUUAUAUCAAAAAUUGUCCACAAGUCAUUUGUGGAAGUGAAUGAAGAGGGAACAGAGGCGGCAGCUGCCACAGCAGGCAUCGCAACUUUCUGCAUGUUGAUGCCCGAAGAAAAUUUCACUGCCGACCAUCCAUUCCUUUUCUUUAUUCGGCAUAAUUCCUCAGGUAGCAUCCUAUUCUUGGGGAGAUUUUCUUCCCCUUAGAAGAAAGAGACUGUAGCAAUACAAAAAUCAAGCUUAGUGCUUUAUUACCUGAGUUUUUAAUAGAGCCAAUAUGUCUUAUAUCUUUACCAAUAAAACCACUGUUCAGAAACAAGUCUUUCAUUUUCUUUGUAAGUUUGGCUCUGUUGGCUGUUUACACCCAUGAAUUUUGGCAUGGGUAUCUAUUUUUCUUUUUUACAUUGAAAAAAAUCCAGUGGUUGCUUUUGAAUGCAUCAAGUAAAGAAGAAGAAAAGAAUACAUCCGAUGCGUAGAUUCUUGACCAUGUAGUAAUCUAUAAAAUUGCUAUAUCCUCCUGAUAGCCAUGGGAAAACAUGAUAAGAUGGUCAUUUAUUUUGCAGUUAGAAUUUUGGAAGCCACAAAAUAGACAGACACCCUGACUGUUGAAGGGAGGUUUAAAAACAGAUAUUCAAUUGAAAUGUAAGAGAGCACCCCAAUUGAGAGCCCAGGUUACGAAGACAAGCUUGCCUCGCCUGACUUUUCUGUCCCUUGUUCUGCAGGAUUAGUAUUCUGUUACAGACCUCUAGUUUUUAGACUCUUCAAUUAAAGGGCCAAUGGUUAUAACCUGCAUUCCCUUUUUUGUUCUUCUUUAUGUAUAAUAUAUAGUUCAUGUGGCGCUGCAUGAAAUCAAGAAGUGGGUGUCUUAGGAUAAAAGAUACCAAGAGUCUACAAAAAUAACCAUGUAGUAAGAUAAACUGCUGAACAAAGGUUUUACUGUUAGCCACCUUCUCAUGUGUUUUCUUUUCUCUUUUUCUUUUUCUUUCUUUCUUUCUUUUUUUUUUUUUUGAGACAGAGUCUUGCUCUGUUACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACGAUCUCAGCUCACCGCAACCUCUGCCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCUUGCUUCAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUAUAGGCAUGCACCACUAGGCCUGGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGGGGUUUUUCCAUGUUGGCCAGGCUGGUCCCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCGCGCACCUCAGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCUACCAUGCCUGGCCUUCUCAUGUGUUUUCUGAUUAAGGCUCUUGACUUCCAAGGCUGUGUGGGGAGAUGGGGUGGGGGCUCUUGGACUGAUAUAAAACUUUGUCAAAUGUAGUUCUUUGAAUGGAGCUUGAAACGCCGCAUAUUCUUGCUCCCACAAGGAUAGUGGGCAUCAUGAAUUAAUAAAACGUCCUAGGAUUCUGCAAGCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-746.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -794.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 430.98
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.((((((((.(....).)))).(((((((((.((((((.(((....))))))).)).))))))....)))....(((((...((((((((...(((...(((((((((.((((((..((.((..(((((........(((((((....((((.......))))...(((.(((((((....)))))))..))).....((((((...))))))..((((.((((((((((((...))))))((.(((((((((.((((....))))))))))..))).)).......)))))).))))((((.((((...........)))).)))).)))))))..........)))))..)).))))))))...))))))(((((((((((((((.((((((((((((((((((((....(..(((..(((((((((((((((((.((((...........))))((((((.(((.((((((((((.....((((..(.((((....(((((((((........)))))......)))).......)))).)..)))).(((((((..(((((((.((((.(((((..((((.......(((((...))))).....(((((((...(((((((((.(((..............)))............(((((((((.((...(((...)))..)))))))))))(((..........)))((((((((((((...((..(((((((.......)))))))..))(((...(((((((..((((((((..(((((.....)))))..)))))).......))....)))))))...)))(((...)))((((((...))))))..((((.....(((..(((((....((((.((((((...))))))...)))).((((((((.....)).))).))).(((((((((((((..((.((.((.((((((((((.(((((((((.....(((((....)))))........(((((((.....)))))))..(((((((((((((((..((((((((((.(((....)))(((((((((......))).....)))))).(((......))).)))))).)).))..)))))..)))))))))).........(((((((((.......((((.((((((......))))))..))))...((((((((.(((..............))))))).)))).)))))))))...(((((((((((((.....((((((..............((...((((....)))).)).............)))))).)))))))))))))...........((.((((((..((((.((..(((.((((((((((((((.((((...............(((........))))))))))))))))))))).)))......)).))))..)))))).))...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))).((.((((..(((((......)))))...)))).))......((((((.......))))))))))))))))).))))))))))))))).................(((((((...(((......)))...))))))))))))..)))......))))))))..))))))))...))))))))).))))))).(((((((....)))))))............(((((((((((((((((..((((((.....(((....)))......)))))).)))..((((((((((((...)))))).(((((((......)))))))...))))))..((((((((.......)))))))))))))))))..)))))...((.(((((.......)))))))......((((........))))..))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))).))).))))))............((((((((...))))))))..((((((((..(((((.((.(..((((((((((....(((.....)))(((..(((((.((((((.....)))))).)))))...))).))))))))))...).)))))))..)..)))))))....))))))))))))))).))..)))..)....)))))))))))))))..(((((.((.(.((((....)))).).)).).).)))))))).(((((......)))))...((((((((......))))))))......))))))))))))))).....)))...))).))))))))...)))))....))))))))))(((((((((((((((........))))).....((((((......))))))(((..(.((((.((((((((......)))))))))))))..)))..............)))).))))....))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((,((({((((,(...,},}}}},{({((((((.((((((.(((....))))))).)).)))))),.,.}}.....(((((...((((((((...({{...{{(((((({{((((((..((.((..(((((........(((((((....((((.......}}}}..,(((.(((((({,,,,|}}}))),,))}..,..((((((...))))}).{((((.((((((,{{,,{...|||||}{,{{,.(((((,,((({....}))))))))),}..}.)),,}....)))))).))))},,{.{{||,,,...,,,..,})}.,,},.)))))))..........)))))..)).))))))))}..))))))(((((((((((((((.(((({((((((((({(((((....{..(((..(((((((((((((((((.((((((......))})}))((((((.(((.((((((((({.....((((..(.((((.,{.(((((((((........)))),.....})))).,.....)))).)..)))),(((((((..(((((((.((((.(((({.,((((.......(((((...))))).....(((((((...(((((((((.{{,..,..........,)),............(((((((((.((...{{{...}}}..))))))))))){((..........}}}((((((((((((...((..(((((((.......)))))))..))(((...(((((((,.,(((,((,..,,||,}}}..)}|}},{||||,,.,,}}},))....)))))))...)))(((...}}}((((((...))))))..((((..{..(((..(((((....{(((.((((((...))))))...)))}.((((((((.....)).))).))).(((((((((((((..{,,((.((.((((((((((.(((((((((.....(((((....)))))........(((((((,...,))))))).,{((((((((((((((..(((((((((({(((....))}(((((((((.......},.,},,)))))).(({,.....))).)))))).)).))..)))))..)))))))))},}.......(((((((({..,,,,.((((.((((((,...,,})))))..}))),,,,||,,.((((....}})}......{(((.....))))..}))))))))...,{(((((((((((.....((((((...........,,,,..,,((({....}))}.)}.,}..........)))))).)))))))))))}|.,,....,,.,((.((((((..(((({(((((((.((((((((((((((.((((......,,....,,.{((........))})))))))))))))))))).))},)},..)).))))..)))))).))...((((((((((.......)))))))))).)))))))))))),{(.{(((,.{((((......))))}.,.)))).))......((((((.......))))))))))))))),))))))))))))))))).{{{.....,,......(((((((...(((......)))...))))))))))))..)))...,..))))))))..))))))))...))))))))).))))))).(((((((....)))))))...{{,......|{((,((((((((({{(..((((((.....(((....)))......)))))).})}..((((((((((((...}))))).(((((((,....,)))))))...})))))..((((((((.......))))))))))))))))).,}},,,...{{.(((((.......)))))})......((({........))))..))))))))).)))))))))))..))))))))))))))))).))).)))))}............((((((((...))))))))..((((((((,.(((((,((.(..((((((((((....(((.....))){((..(((((.((((((.....)))))).))))}...))).))))))))))...).)))))))..),,)))))))....))))))))))))))).))..)))..}....)))))})))))))))..((({{,(,.{.((((....)))).}.},,}.}.)))))))).(((((......)))))...((((((((......))))))))......,)))))))))))))).....))}...))).)))))))).,.))))),,,.)))))))))){{((({(((((((((........))))).....((((((......)))))){{{...{(({(.((((((((......))))))))}))))}.}}}..............)))).))))....,,......
Back