Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_031286.4

Sequence Length

751 nt

GC Content

0.5912

GUCGUCUCCCGGCAGUGCAGCUGCCGCUACCGCCGCCCUCUGCCCGCCGGCCCGUCUGUCUACCCCCAGCAUGAGCGGCCUGCGCGUCUACAGCACGUCGGUCACCGGCUCCCGCGAAAUCAAGUCCCAGCAGAGCGAGGUGACCCGAAUCCUGGAUGGGAAGCGCAUCCAAUACCAGCUAGUGGACAUCUCCCAGGACAACGCCCUGAGGGAUGAGAUGCGAGCCUUGGCAGGCAACCCCAAGGCCACCCCACCCCAGAUUGUCAACGGGGACCAGUACUGUGGGGACUAUGAGCUCUUCGUGGAGGCUGUGGAACAAAACACGCUGCAGGAGUUCCUGAAGCUGGCUUGAGUCAAGCCUGUCCAGAGUUCCCCUGCUGGACUCCAUCACCACACUCCCCCCAGCCUUCACCUGGCCAUGAAGGACCUUUUGACCAACUCCCUGUCAUUCCUAACCUAACCUUAGAGUCCCUCCCCCAAUGCAGGCCACUUCUCCUCCCUCCUCUCUAAAUGUAGUCCCCUCUCCUCCAUCUAAAGGCAACAUUCCUUACCCAUUAGUCUCAGAAAUUGUCUUAAGCAACAGCCCCAAAUGCUGGCUGCCCCCAGCCAAGCAUUGGGGCCGCCAUCCUGCCUGGCACUGGCUGAUGGGCACCUCUGUUGGUUCCAUCAGCCAGAGCUCUGCCAAAGGCCCCGCAGUCCCUCUCCCAGGAGGACCCUAGAGGCAAUUAAAUGAUGUCCUGUUCCAUUGGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-264.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -278.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.08

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(.(((((...(((.((((((..((((((...((((.(........).)))).((((((........))).))))))))))))))))))...)).))).)(((((((.((((..((..............)).))))..))))))).......((((((.(...).))))))......(((((((((.......(((((((.......((((((.((((.(.(.(((((((..((...))))))))).......((((...........)))).((.(((.((.(((((.((((.(((....((((((((((.((..........(((.((((....)))).))).((((((...)))))).((((((((.....)).)))))).................))))))))))))..)))))))..((((((..((((.........))))................)).)))).))))))).))).)).).).)))).)))))).......(((((.(((..................))).)))))...............(((..(((((((((.((.....(((((((.(((((((((....))))).))))))))))).((((.......)))).((((((((((((.(((......))))))))))))))).((...(((...)))...)).((((.(((....))))))).)).)))))))))...)))))))))).))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(.(((,(,{{(((.((((((..(({(({...({{(,,....,,..|,}|||.{(((((........))).)}))))))))})))})}}..{||.,,,{{(((((((.((((..((..............)).))))..))))))),}}...,||{{{|}|,.})})}},,,......((((((((({{{{,{.((((,,,....}}}},|||}}}.,,((((.((((((((((((..,,,,..||,..,,,,.{{{{.,.........))))....,....{.(((((((((({(......((((((((((.((..........(((.((((....)))).))).((((((...)))))).((((((((.....)).))))))................,),)))))))))).{((((.{(,.((({,,..((((.........))))...,,..........,)).))}}.}}........},))))}...............,.......))))))))).,........{{.(((((((..{{{...,{......)}....)}}.))))))).}}.....((((({{{(((((((((....))))),,)))))))))).((((.......)))).((((((((((((.(((......))))))))))))))).)).)))))}}})))..)))}{||(((((....)))))}}..|||,|||,.,,....}.))))))).))))))))).