Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_031457.2

Sequence Length

1311 nt

GC Content

0.4905

AGCAUGUAACCUGGCCUGCAUCCAGGAAAUAGAGGACUUCGGAUCCUUCUAACCCUACCACCCAACUGGCCCCAGUACAUUCAUUCUCUCAGGAAAAAAAACAAGGUCCCCACAGCAAAGAAAAGGAAUAGGAUCAAGAGAUACGUGGCUGCUGGCAGAGCAAGCAUGAAUUCGAUGACUUCAGCAGUUCCGGUGGCCAAUUCUGUGUUGGUGGUGGCACCCCACAAUGGUUAUCCUGUGACCCCAGGAAUUAUGUCUCACGUGCCCCUGUAUCCAAACAGCCAGCCGCAAGUCCACCUAGUUCCUGGGAACCCACCUAGUUUGGUGUCGAAUGUGAAUGGGCAGCCUGUGCAGAAAGCUCUGAAAGAAGGCAAAACCUUGGGGGCCAUCCAGAUCAUCAUUGGCCUGGCUCACAUCGGCCUCGGCUCCAUCAUGGCGACGGUUCUCGUAGGGGAAUACCUGUCUAUUUCAUUCUACGGAGGCUUUCCCUUCUGGGGAGGCUUGUGGUUUAUCAUUUCAGGAUCUCUCUCCGUGGCAGCAGAAAAUCAGCCAUAUUCUUAUUGCCUGCUGUCUGGCAGUUUGGGCUUGAACAUCGUCAGUGCAAUCUGCUCUGCAGUUGGAGUCAUACUCUUCAUCACAGAUCUAAGUAUUCCCCACCCAUAUGCCUACCCCGACUAUUAUCCUUACGCCUGGGGUGUGAACCCUGGAAUGGCGAUUUCUGGCGUGCUGCUGGUCUUCUGCCUCCUGGAGUUUGGCAUCGCAUGCGCAUCUUCCCACUUUGGCUGCCAGUUGGUCUGCUGUCAAUCAAGCAAUGUGAGUGUCAUCUAUCCAAACAUCUAUGCAGCAAACCCAGUGAUCACCCCAGAACCGGUGACCUCACCACCAAGUUAUUCCAGUGAGAUCCAAGCAAAUAAGUAAGGCUACAGAUUCUGGAAGCAUCUUUCACUGGGACCAAAAGAAGUCCUCCUCCCUUUCUGGGCUUCCAUAACCCAGGUCGUUCCUGUUCUGACAGCUGAGGAAACGUCUCUCCCACUGUUUGUACUCUCACCUUCAUUCUUCAAUUCAGUCUAGGAAACCAUGCUGUUUCUCUAUCAAGAAGAAGACAGAGAUUUUAAACAGAUGUUAACCAAGAGGGACUCCCUAGGGCACAUGCAUCAGCACAUAUGUGGGCAUCCAGCCUCUGGGGCCUUGGCACACACACAUUCGUGUGCUCUGCUGCAUGUGAGCUUGUGGGUUAGAGGAACAAAUAUCUAGACAUUCAAUCUUCACUCUUUCAAUUGUGCAUUCAUUUAAUAAAUAGAUACUGAGCAU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-396.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -421.10

Frequency: 0.0000

Diversity: 370.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((......(((.((.(((((((..(((((((((..(((((((.........(((((.......((((...(((((((....((.(((((..........(((((((((((((.((((..........(((....)))...((((((((((.(..((((((((.......))).)))..))..).)))))))))).)))).)))).)))).)).)))(((...)))...))))).)).(((((((((((.((((..((.((..((((......))))...))))..))...)).)))))))))))....((((......))))..)))))))...)))).((((...((((....)))).....)))).......((.((((((.((((.......))))..)))))).))..(((((((.(........).))).)))).(((((((((((((......))))))..)))))))((((((((((....)))))))))))))))..........)))))))......(((((((((((((.((.(((((..........((.(((((..(((((.(((.(((.((......))))).))).)))))..))))).))(((((((((..((......))....)))))......................)))).............(((((((....))))))).)))))))))))).)).)))))).)))))))))..)))))))))..)))...))))))((((((........(((.((((((((((..((((........))))...((((((((.((((((((....(((((((((((..(((((((((((((........)))))..........(((...((((((...((((..(((...........)))...))))))))))....))))))))))).......(((((((............))))))).....((((((..((((((.((.(((((..((.(((........)))))(((((((...((((..((((.(((((..........((((((((......))))).)))..)))))))))...))))...))))))).)))))...)).))))))..))).)))(((((((....)))....))))(((.(((((...))))))))..(((((((........))))))).))))))))).)).....)))).))))(((.......))).))))))))............))))))).))).)))..........)))).....))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{.{{{..(((((,,.,...|)))}....,((({{{{{{{(.{{{{{{{{{{{{..,..{{{,,..,((((,..(((((((....((.(((((..........(((((((((((((.((((........,.{((....))}.}.((((((((((.{..(({(((((,....,.})).)))..))..).)))))))))).)))).)))),}))).)).))),{,...,}},,.))))).)).(((((((((((.({((..((.((..((((......))))...))))..))...)}.)))))))))))....((((......))))..)))))))...)))).((((...((((....)))).....))))......|||||(((((,{{{{....,...}||||.((((,,,,,,||||{{||||.....,.|{{||,((,,,,|{{.(((((((((.,,...........,,{({{((((((((((....))))))))}|||||...........,{||.....,)))},((((((((..{{{.{(,.,,...}}.))},,)))))))).{((((.(((.(({{((......))))).))).))))|{((..,.,((((,...,}})),}}...)))}.....))))))))),,,....,}},{(({{{{............,.,,,|}))))},|,...||||,|||||{{{(,((((.{(({(((,((,.,.,,||,...((((,,,((({(({(((({({{,,.........{(((,.(|{((..,,.,|)}|),}},...,)),}))))}})))})....}))),,,.,},,.))))}}..,)))),}}}),)})))),,..((((....}}}),,,..},,.{(((((((((({{{,.{,......||,..}}),|.,},,})))}.,....))))))))))}......|||||||,,..........)))}}}},....}))))|,,||{{{{,{,,|||{||||||||,...{{{{{||.{{(((((((...((((..((((.(((((.......,..{(((((((......))))).)))..)))))))))...))))...))))))).))........})))))).||||,|||({{((((,.{{{({,...,))){||,|{{{|,,.))))))))..(((((((........))))))),})}))}))))))))},))))))))))))},}...{(((((...{{{.,,,...(((..........))).....}},.},,...)))))}.,,.)}..