Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032020.5
Sequence Length
2385 nt
GC Content
0.4419
GCGGCAUACUCAGCGGCAGAGACGGAAGAACAGCGCUCCCGAGGCCGCGGGAGCCUGCAGAGAGGACAGCCGGCCUGCGCCGGGACAUGCGGCCCCAGGAGCUCCCCAGGCUCGCGUUCCCGUUGCUGCUGUUGCUGUUGCUGCUGCUGCCGCCGCCGCCGUGCCCUGCCCACAGCGCCACGCGCUUCGACCCCACCUGGGAGUCCCUGGACGCCCGCCAGCUGCCCGCGUGGUUUGACCAGGCCAAGUUCGGCAUCUUCAUCCACUGGGGAGUGUUUUCCGUGCCCAGCUUCGGUAGCGAGUGGUUCUGGUGGUAUUGGCAAAAGGAAAAGAUACCGAAGUAUGUGGAAUUUAUGAAAGAUAAUUACCCUCCUAGUUUCAAAUAUGAAGAUUUUGGACCACUAUUUACAGCAAAAUUUUUUAAUGCCAACCAGUGGGCAGAUAUUUUUCAGGCCUCUGGUGCCAAAUACAUUGUCUUAACUUCCAAACAUCAUGAAGGCUUUACCUUGUGGGGGUCAGAAUAUUCGUGGAACUGGAAUGCCAUAGAUGAGGGGCCCAAGAGGGACAUUGUCAAGGAACUUGAGGUAGCCAUUAGGAACAGAACUGACCUGCGUUUUGGACUGUACUAUUCCCUUUUUGAAUGGUUUCAUCCGCUCUUCCUUGAGGAUGAAUCCAGUUCAUUCCAUAAGCGGCAAUUUCCAGUUUCUAAGACAUUGCCAGAGCUCUAUGAGUUAGUGAACAACUAUCAGCCUGAGGUUCUGUGGUCGGAUGGUGACGGAGGAGCACCGGAUCAAUACUGGAACAGCACAGGCUUCUUGGCCUGGUUAUAUAAUGAAAGCCCAGUUCGGGGCACAGUAGUCACCAAUGAUCGUUGGGGAGCUGGUAGCAUCUGUAAGCAUGGUGGCUUCUAUACCUGCAGUGAUCGUUAUAACCCAGGACAUCUUUUGCCACAUAAAUGGGAAAACUGCAUGACAAUAGACAAACUGUCCUGGGGCUAUAGGAGGGAAGCUGGAAUCUCUGACUAUCUUACAAUUGAAGAAUUGGUGAAGCAACUUGUAGAGACAGUUUCAUGUGGAGGAAAUCUUUUGAUGAAUAUUGGGCCCACACUAGAUGGCACCAUUUCUGUAGUUUUUGAGGAGCGACUGAGGCAAAUGGGGUCCUGGCUAAAAGUCAAUGGAGAAGCUAUUUAUGAAACCCAUACCUGGCGAUCCCAGAAUGACACUGUCACCCCAGAUGUGUGGUACACAUCCAAGCCUAAAGAAAAAUUAGUCUAUGCCAUUUUUCUUAAAUGGCCCACAUCAGGACAGCUGUUCCUUGGCCAUCCCAAAGCUAUUCUGGGGGCAACAGAGGUGAAACUACUGGGCCAUGGACAGCCACUUAACUGGAUUUCUUUGGAGCAAAAUGGCAUUAUGGUAGAACUGCCACAGCUAACCAUUCAUCAGAUGCCGUGUAAAUGGGGCUGGGCUCUAGCCCUGACUAAUGUGAUCUAAAGUGCAGCAGAGUGGCUGAUGCUGCAAGUUAUGUCUAAGGCUAGGAACUAUCAGGUGUCUAUAAUUGUAGCACAUGGAGAAAGCAAAUGUAAAACUGGAUAAGAAAAUUAUUUUGGCAGUUCAGCCCUUUCCCUUUUUCCCACUAAAUUUUUUCUUAAAUUACCCAUGUAACCAUUUUAACUCUCCAGUGCACUUUGCCAUUAAAGUCUCUUCACAUUGAUUUGUUUCCAUGUGUGACUCAGAGGUGAGAAUUUUUUCACAUUAUAGUAGCAAGGAAUUGGUGGUAUUAUGGACCGAACUGAAAAUUUUAUGUUGAAGCCAUAUCCCCCAUGAUUAUAUAGUUAUGCAUCACUUAAUAUGGGGAUAUUUUCUGGGAAAUGCAUUGCUAGUCAAUUUUUUUUUGUGCCAACAUCAUAGAGUGUAUUUACAAAAUCCUAGAUGGCAUAGCCUACUACACACCUAAUGUGUAUGGUAUAGACUGUUGCUCCUAGGCUACAGACAUAUACAGCAUGUUACUGAAUACUGUAGGCAAUAGUAACAGUGGUAUUUGUAUAUCGAAACAUAUGGAAACAUAGAGAAGGUACAGUAAAAAUACUGUAAAAUAAAUGGUGCACCUGUAUAGGGCACUUACCACGAAUGGAGCUUACAGGACUGGAAGUUGCUCUGGGUGAGUCAGUGAGUGAAUGUGAAGGCCUAGGACAUUAUUGAACACUGCCAGACUUUAUAAAUACUGUAUGCUUAGGCUACACUACAUUUAUAAAAAAAAGUUUUUCUUUCUUCAAUUAUAAAUUAACAUAAGUGUACUGUAACUUUACAAACGUUUUAAUUUUUAAAACCUUUUUGGCUCUUUUGUAAUAACACUUAGCUUAAAACAUAAACUCAUUGUGCAAAUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-725.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -766.65
Frequency: 0.0000
Diversity: 558.04
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.....(((((((((.(((((...(((((((((((((......)))))))..((((...((....))...))))(((((((.((((((((...((....))...))).))))))))))..)).)))))).))))).)))))))))..)))))(((((.((((((((((((((((...)))))..((((((....))).))).(((((...((((..((((((.((.((((...)))).)).(((((.(((((.......((((....))))......))))).))))).))))))..)))).)))))((((..(((((..((((((........(((((.((((...((((.....))))......(((...(((((....))))).....)))))))))))).........))))))..)))))))))))))))))..........)))...))))).....((((((((...((((((((....((.((.((((((.(((((...))))).....(((((((((...(((..((((((.......((((((((...((.((.((((.(((((((.(((((.(((.(((((((..((((((.((........)).....(((((((.......)))))))(((((((.(........).)))))))..)))))).)))).)))..))).))))).)))))))..)))).))))....(((((((((((.((..((..(((((((((((..(((((.(.((((.....)))).).)))))..))).....(((((....(((.((((((....)))))))))...........((((......)))).))))).((.(((((....))))).))))))))))((..((((((.((((((((((((...((((.(((...........(((((((((..((((.(((......))).))))(((........)))......)))))))))))).))))..)))))))..........)))))))))))..))........))...))))))))))))).....(((((..(((((....))))).)))))..)))))))).......)))))))))..((((((((((...(((((((((..((((...((((((...(((.....((((.(((.((.((((..((((.....))))..))))..)))))...))))...)))))))))(((((((...)))))))...))))...........(((((((((((..........((((((((.......((..(((((.....(((..((((.........))))))))))))..))........))))))))...(((((((((..(((.(...(((((((.((..(((((((((((((((..(((...))))).)))))......))))))))......((((((((...))))))))........)).)))))))).)))..))))))))).........((((((((...((((...(((..((((..(((((((......((((.((((((....(((((....(((((....(((((.......(((......)))........)))))......(((((......)))))..))).))...)))))....))))))))))((((((....))))))((((((((((.((......))...))))))...))))((((((....))))))...(((.((.(((....))).)).))))))))))....)))).........)))..))))(((((((((((((((....))))))).............))))))))..(((((((((((((((.(((.............(((....)))...))))))))))).......))))))).))))))))....((((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))).((((((((.(((((((((..((((((.....)))))).))))))))))))))))).......((((....)))).......(((((((....)))))))........(((((.(((....))))))))..))))))))))))))).)).)).))))))))((((.....))))((((((((..((((..((((.((((...((((((......((((((.(((((((((..((((.((....))))))....)))))))))..((((.....))))....................((((........)))).......(((((((...)))))))...)))))).......))))))..))))))))...))))..)))))))).)).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.....(((((((((.(((((...(((((((((((((......)))))))..((((...((....))..,))))({(((((.((((((((...((....,}},.))).))))))))))..)).)))))).))))).)))))))))..))})){((({.((((((((((((((((...))))}..((((((....))).))).(((((.,,{{((..((({((.((,((({..,|}}}.||,{((({.(((({..,,,.,{{{{,,,.)))}......))))).)))}}.))})))..))))}})))){(({..(((((..,{(({{,....,.,{((((.((((...{{{{.....))}}......{{(.,{(((({....})}}},||,.))}))))}))}}.........)))))}..))))))))})))))))).......,,.))),.,))))).....{{{{{{{{..,((((((((....{(.((.((((((,{(((,..,}))}}.....,((((((((...(((..((((((,,.{{..((((((({...((.((.((((.(((((((.(((((.(((.(((((((..((((((.((........)).....(((((((.......)))))))(((((((.(........).)))))))..)))))).)))).)))..))).))))).)))))))..)))).))))...,(((((((((((.((..{(..(((((((((((..(((((.(,((((..,,,||}|.,.}}})).,))).....{((((,...{((.((((((....))))))))}...........((((......)))).)}}}}.|{.(((({....))))),}}))))))))((..((((((.((((((((((((.,.((((.(((...........(((((((((,,{(((,(({......||}.}}},,|,.,},.,...,),.....)))))))))))).)))),.))))))),,.....,,.)))))))))))..)).....,,,})...}}))))))))))).,...(((((..(((((....)))),.)))))..)))))))).}},}..}))))))))..((((((((((...(((((((((..((((...((((({..,(((.....((((.(((.((.((((..((((.....))))..))))..)))))...))))...)))))))))(((((((...)))))))...))))...........(((((((((((,....,,...((((((({.....,,((..(((((,,..,(((..((((.,.....,.))))}||}}|||,,}}....,,.,))})))}}|,,(((((((((..(((.{...(((((((.({..((((((((((((({{..(((...)))}}.}))))......))))))))......((((((((...))))))))..,....}),.)))))))}.)))..))))))))).,.|.....(((((({{...,|(({{{{,,,.,{{|{|||{|{{,,,.||,|||{.{(((((.,,.{((((,...{{(((,(((((({{...,||,(({,,,...}},......,..,|||,,,..,|{,,|||,,,.}..,,..|||.|}..,||}},....}}}|||||}},((((({.{{|{,||,((((((((((.((......))...))))))...))))((((((....)))))).,,.}}}|.}}||}}.,)))}))})},|}}||....{{{,||,...,}},.))},,,,}}{(((((((((((((({...|||}}}}....,..,,,,,})))))))}.,||{||||||||||||,|||,.........||{|{{{...|||{..,,},)))),,,}}},,,.)))))),.))))))))....{(((((.....)))))))))))))))))))))))))))))))))))).((((((((.(((((((((..((((((.....)))))).))))))))))))))))).......((((....)))).......(((((((....)))))))........(((((.(((....))))))))..))))))))))))))).)).),.))))))))|{{{..,,.)))}((((((((..((((..((({,((((...((((((......((((((.,{{{((({(,.{(((.((....))}}}}.,..||||||}}}..{(((.....}}}}.,....,||,,,,,,....,}}}}}},.{{{|....}}}}...(((((({...}))))))...)))))).......)))))}..))))))))...))))..)))))))).)),,,})},
Back