Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_032054.2
Sequence Length
3622 nt
GC Content
0.4978
GACCCGACUCUGCUCCCUCCAUACUAAACACACAGACCAGACAAGCUCCUACGAAAAGCCAACGCUCCACGCCCAUUUUCGUCAGGGAAUAUGUACCCAUCGGCUUUAGAUAAAUAAGGAAACAGCAGGCUGAACCAGAACUAAGAGAAAAUUGGGCAGAGAGAAGGCAAUGGCGAGUCCACCUAGGGGCUGGGGCUGCGGAGAGCUGCUGCUGCCCUUCAUGCUCCUGGGGACGCUGUGCGAGCCAGGAUCCGGGCAGAUCCGCUACUCGAUGCCGGAGGAGCUGGACAAAGGCUCCUUCGUCGGCAACAUAGCCAAGGACCUUGGGCUGGAGCCCCAGGAGCUGGCGGAGCGCGGAGUCCGCAUCGUCUCCAGAGGUAGGACGCAGCUUUUUGCCCUGAACCCGCGAAGCGGCAGCUUGGUCACCGCGGGCAGGAUAGACCGGGAGGAGCUCUGCGCUCAGAGCCCACUGUGUGUGGUGAACUUUAACAUCUUGGUUGAGAACAAAAUGAAAAUUUAUGGAGUAGAAGUAGAAAUAAUCGAUAUUAAUGAUAACUUCCCGCGUUUCCGGGAUGAAGAGUUAAAAGUAAAAGUUAAUGAAAAUGCGGCUGCAGGGACACGGUUAGUGCUUCCCUUCGCGCGGGAUGCGGAUGUGGGUGUGAACUCUCUCCGGAGUUACCAGCUCAGCUCCAAUCUGCACUUCUCUCUGGAUGUGGUAAGCGGAACUGAUGGACAAAAGUAUCCGGAGCUGGUGUUGGAACAGCCCCUAGACCGCGAGAAAGAGACUGUUCACGACCUCCUCCUCACAGCUUUAGAUGGCGGAGACCCGGUACUCUCCGGCACCACGCACAUCCGUGUUACGGUCCUCGACGCAAACGACAAUGCGCCCCUGUUCACCCCAUCCGAGUACAGCGUGAGUGUUCCAGAGAACAUACCUGUGGGCACUCGGCUGCUCAUGCUAACCGCCACGGAUCCAGAUGAGGGAAUAAACGGGAAAUUGACCUACUCUUUUCGCAAUGAAGAAGAAAAAAUUUCGGAGACUUUCCAACUUGAUUCCAACCUGGGGGAAAUCUCAACUCUACAAUCACUGGACUAUGAAGAAUCCAGAUUCUACCUCAUGGAAGUGGUAGCUCAGGAUGGAGGCGCUCUUGUUGCCAGCGCUAAGGUGGUGGUCACAGUACAGGACGUGAAUGACAAUGCCCCCGAAGUGAUCCUCACCUCUCUGACCAGUUCGAUCUCUGAAGACUGUCUUCCCGGAACUGUAAUCGCGCUGUUUAGCGUACAUGAUGGUGAUUCUGGAGAAAAUGGUGAGAUUGCAUGCUCUAUUCCUAGGAAUUUGCCUUUUAAAUUGGAGAAGUCAGUUGAUAAUUACUAUCACCUAUUAACAACUAGGGACCUGGACAGAGAAGAGACUUCAGAUUAUAAUAUCACUUUAACCGUCAUGGACCAUGGAACCCCGCCCCUCUCUACAGAAAGCCACAUCCCCUUGAAAGUAGCAGACGUUAAUGACAACCCACCCAAUUUCCCUCAAGCCUCCUACUCCACCUCUGUCACAGAAAACAAUCCCAGAGGUGUCUCUAUCUUCUCUGUGACAGCCCAUGACCCCGACAGCGGCGACAACGCUCGAGUCACCUACUCCCUGGCUGAAGACACAUUUCAGGGGGCGCCCUUGUCCUCCUAUGUAUCCAUUAACUCUGACACCGGUGUCCUGUAUGCUCUGAGAUCCUUCGACUAUGAGCAGUUGAGAGACCUACAGUUGUGGGUGACAGCCAGCGACAGUGGGAACCCUCCACUUAGCAGCAACGUGUCGCUGAGCCUGUUUGUGCUGGACCAGAACGACAAUACGCCUGAGAUCCUGUACCCCGCCCUCCCCACAGACGGUUCCACGGGCGUGGAGCUGGCGCCUCGCUCCGCAGAACCUGGCUACCUGGUGACCAAGGUGGUAGCGGUGGACAAAGAUUCAGGCCAGAACGCCUGGCUGUCCUACCGCCUGCUUAAGGCCAGCGAGCCAGGACUCUUUGCGGUUGGGCUGCACACGGGCGAGGUGCGCACAGCGCGAGCCCUGCUGGACAGAGACGCGCUCAAGCAGAGCCUCGUGGUGGCCGUCGAAGACCAUGGCCAGCCCCCUCUGUCAGCCACCUUCACGGUCACCGUUGCCGUGGCCGACAGGAUCCCUGACAUCCUGGCUGACCUAGGCAGUAUCAAGACCCCCAUUGACCCUGAGGAUCUGGACCUCACACUCUAUCUUGUGGUGGCAGUGGCUGCAGUCUCCUGCGUCUUCCUGGCCUUCGUCAUCGUGCUGCUGGUGCUCAGACUGAGGCGCUGGCACAAGUCACGCCUGCUUCAGGCUGAAGGCAGCAGGUUGGCGGGUGUGCCCGCCUCGCACUUUGUGGGCGUGGAUGGGGUUCGGGCUUUCCUGCAGACCUAUUCCCACGAGGUCUCCCUCACCGCGGACUCGAGGAAGAGUCACCUGAUCUUUCCCCAGCCCAACUACGCAGACACGCUCCUUAGUGAAGAGAGCUGUGAGAAAAGCGAGCCUCUUCUGAUGUCUGAUAAGGUAGAUGCAAACAAAGAAGAACGGCGAGUUCAGGUUAGUUUUCUCUUUCGGUAAGGAUGACCAGAACAUUUUCAUUUGUUUCCUUUUUCAUGUUUCUGUCAUAUUCAGAAUCAGCUAGUUAUGUAAAUAGUGGAACAUUAUUUGCUGUAUUGGAGAUUAAUUUUUUUUAUAUAAUUCAUGCUUUCUCCAUUUGUUUUCAAAUUCUGUUUUGGGAAGUCUAGCUGAUAUCUGUAGACUUAAGUGAAACAAAUACCUUAAAGGAAAGUGGUUAAAUAUAAUCAUUUUACCCAAAUAUUUUGUUAUAUUGGAACUGCAGUUCUAUUAAUAGAAAAGAUGUUUUAUUUAUUCAAAUUGUUAGAUAUAUUGUUCUCUUUUGAGUGUCUGCCUAGACACCAUUAGUGAAUGUGUUUUGGAAAGGAUAAUGUAUAGGACUGAUAUUUUAGUCUACCUGAAAUUUGUUUAAGGAAAUAAUUUACAGUAUUUACAUAAAUCAGUGGAAAGGUACAGAGAACUUCUGGGUCAUAAAUAUCAGAAAAGAGGCCGGGUGCGGUGGCUGACGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGGGCGGAUCACGAGGUCAGGAGAUCGAGACCAUCCUGGCUAACACGGUGAAACCCUGUUCUACUAAAAAUACAAAAAAUUAGCCGGGCGUGGUGGCAGGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGAAGGCUGAGGCAGGAGAAUGGGGUGAACCCGGGAGGAGGAGCUUGCAGUAAGCCGAGAUCGCGCCACUGCACUCCAGCCUGGGAGACAGAACGAGACUCCGUCUCAAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAAAUAUCAGAAAAGUAGAUAAAAUUUAUAUUAAUGAUAACAUGUAGCAUUCUAAAGUCUGGAAAGUUUGUGUUAAGCCAUGUAGUUAUUGGAUAUGUGGGCUUGUUGAGAGAAGAAAUCAGUGUAAAGGAACCUUAAGGUUGGGCUUCGUUCUGUGAUGUAAAGCCUCCAGAGAGUUACAUACUGCUGCACUCAAUAAAUGUAAAUAUGUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1199.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1266.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 1022.55
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((((((.(((((((....((((((((........((((((((......(((..(.(((...((((((((((.((.(((........))).(((((((....................)))))))...........))))))).))))).))).)..)))...((.(....).)))))))))).((((((((.((((((.(((((((...((.((((.(((((((((..(((((.((.....((((.((...((((((((((.....((((((((((.......))))))))))..(((......)))......((.((((....)))).))))).))))))))).)))))).)))))))))))))).)))).)).)))))..((((.((((..((((((((((....))))......)))))))))).)))).....)).)))))).)))....))))).))))))))((((........))))(((........)))..........)))))))..).)))))).........(((((((..((((((((((......))))).....))))).........)))))))...(((.((((((((((((((.....)))..)))))..))((((((((((((((((.(((((((((((....))))))((((((((............(((.(((....))).))).....(((((((..........))).))))))))))))((((((((((.(.((............)).).)))))).))))((((.((((.........)).)).))))..((((......)))))).))).)))))))))))...(((((..((((....((((((.(((((..........((((((((((.((((.(((((((.(((.((.......)).))))))))))))))............(((((...((((..(((((((((......((((((.......(((((.......)))))......)))))).((((.(((((..(.............)..))))))))).............(((((((....))..)))))))))..))))))))).))))).)))).)))))).)))))..))))))(((.(((....))).)))..........((.(((........)))))...(((((....(((...((((((.((((.((((((((.....(((((.(((((((((((((....(((((....))))).....)))))...))))).))).))))))))))).....(((((.....(((......))).......)))))........(((((.....)))))((((........)))))).)))).)))))).)))))))).(((......)))........))))..))))).......)))))...(((....))).)))).)))....((((..(((((((..(((...)))......(((((....(((.(((..((((....((((((((................))))))))......((((((((..(((((((((((...((((.(((((.(((.........))).))..(((((.(((((.((....(((((((((((((((..((((.....(((....))).......))))..)))))))).......)))))))..(((((((......)))))))..((((((....))))))(((((((((((((((((((.....)))))............)))))))).).))))).((((.(((((((..((......)).))).).))).))))...(((((((((.....(((((((((....)))))))))(((((((((.(((.(((.(((((((..(((((.....((((((..((((((((((.....((((((......)))))).))))).)))))))))))...)))))..)))))))..))).((((((...))))))..))))))))))))((...))((((((.(((((.(((........).)).))))).).)))))(((((((((.((((....(((((((......)))...)))).))))))))))))).(((((..((.((.((((((.......))))))..)).))..))))).........(((((((..((.(((((.......)))))..(((..((((.(((((((.(.((((((((.(.(((((((((.((((((((((((((.(.(((((((.....((((.(((((((((((((....)))).))..))))))).)))).))))))).).)))))(((.((((((((((((((((((((((....((((((..(((((....)))).)..))))))))))))))))(((((........(((((......)))))..(((((((((((((...((((..(((((..((((((....)))((((((.(((((.......)).)))))))))((.(((((....((((((((((...(((((.((((((((........))).......(((..((((..((((((..((((((((((.((((((((((((............(((.....(((((((((((((....((((((((((...)))))))))).....((((((...........................))))))....((((((((......))))))))..))))))))).))))..)))..))).)))))))))........((((((((((((....)))))))))).))......((((((((...((((((....)))))).))))))))))))))))))..))))))..))))..)))......))))).))))).))))))))))))))).))...)))..))))).))))...))..........(((((((....)))))))..(((.((.((((((....)))))).)).))).................)))))))).))).....((((((..........)))))).((((((.((((((((((.....)))).)))..))).)).))))))))))).)))))))))).)))..)))))))))))))....((((((((((((((((.(((...))).))).....................)))))))).))))).))))).).)))))))).).))))).)).))))..)))...))..)))))))........)).))))).)).((((((..((((....)).)).)))))))).))))).))))).......(((((...)))))....................................(((((..((.((((((...)))))).))..)))))(((((((((((((((.....))))......))))))...))))).))).))))...))))))).)))).))))))))...........))))..))).))))))))...(.(((((.((.((...)).))))))).).......)))))))..)))).............)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{..{({(((((({,(((((((,...((((((((......,.((((((((.{,...((({..,(((...((((((((((.((.(((........))).(((((((....................}))))))...........))))))),})))).},).}..}))..}||}...}},...)))))))),((((((((.((((((.(((((((..,((.{(((.(((((((((..(((((.{,..,,,((((.((...((((((((((..,({((((((((((.......))))))))}}.}|||,.....}||,{{...||,||{(,,,.}}}),))))).))))))))).))))})})))))))))))))).))))})).)))))..{{{|,((((..(((((({(((....)))}.,,...)))))))))).,}},.....)).)))))).)))....))))).)))))))){{{{....,,,,|}},,{,}}},,,..,,,,||.......)))))))..),}))))}.....,...,,{{{{{..{,{({(((((......))))).....,)))}....,....,,,,.,....{((.((((({((((((((.....)))..)))))..))((((({((((((((((.(((((((((((....}))))}{((((((({(,(((..,{{{(((,((,....})).)))}...,||||,||...{{{....,,,.)))))))))))}((((((((((.{.({.........,..,}.).)))))).))))((((.(({{.........}}.)).))))..((((......)))))),})).))))))))))}...(((((..((((,...((((((.(((((..........((((((((({.((((.(((((({{(((.((.......)).))))))))))))))|,,..,,,....(((((...((({.,((((({{{{....{{{,,,,,..}}...((((({{.....)))))}}|.....,}}}.((((.(((((..{,,{....},....),,))))})))).............((((({{....,},.)))))})))..))))))))).))))),))}}.)))))).)))))..)))))),,,.|{{...{|||{,||((((......((.(((........)))})...,,,||}}}},||}}}((((((.((((.{(((((((.....(((((.((((((((({{{{.{{{(((((....)))))....}))}}}..}))))).))).)))))))))))}....{((({,,...(((......))}.......})))).,,,},|,(((((.....))))}((((........)))))).)))).)))))).|}}.,,,}.(((......)))........})))..))))).......)))))...{{{....})}.)))).))}....{(((..(((((((,.({{,..{,.......(((((....(((.(((..((((,,..((((((((.....,..........))))))))......((((((((.,(((((((((({,,.,(((,,((({,{....)))}}}.)))..,..(((((.(((((.,,....,{{{{{(((({((((,,{{((,,,,,,,({.,,|},.......}}}}..|||}||||,..,,{{{,||||{(,{{{{{||..,,,,)}))))}..((((((....))))))(((((((((((((((((((.....}))))}...........}))))))).)},)))},((((.(((((((..((......)).))).).))).||||,.{(((({{{{,.....(((((((((....)))))))))(((((((({.((({(((.(((((((.,(((((.....((((((..((((((((({..,..{(((((......))))))}))))).)))))))))))...))))).,)))))))..,,),|||||,.,}))})),..,)))))})))))||.,|||((((({.(((((.{{{.{.,...,},)}.})))).)}}))))|{(((((((.{..,...}}))))|(|,.{{{|,|{{{||{{,|,,,,{((||||,,..,,,)))}}}}.((((,,.,,,,..}}||})|||||||,|}},|||.{{,..,,({(((((,,,{.(((((.......))))}{{(((,,((,,.{|||||{,|,|(((((((.(.(((((((({{((((((((((((((.(.(((((((.....((((.(((((((({((((....)))).)),.))))))).)))).))))))).).)))))(((.(((((((((({{((({{({(((.,.,((((((,,(((((....)))).|,,)))))}))))))))))||{{{.{,,,{{|({(((..,,,,|}}||..,,|||{|||||,,,||||,,,..{{||..{{{||{{{{,|,}{{{|{||||{||,......}|.,||||||||({,((({({,..{{{{{{{|{|...{{{{|,|{{{{||,..|||{.{{{{{.|{||||{{,.,}},}))}|||}}},|||}.,,,,,{{((((((((((...,,...,,..(((.,...(((((((((((((.,..((((((((((...)))))))))).....((((((................,,.........))))))....{(((((((......))))))))..))))))))).)))).,)))..}}).)))))}}}}........({((((((((((....)))))))))).}}.,{{{{((((,{{{{,.((((((....)))))}.}}})))},,}}}))))}||||||.,|..,,,,.}}}|||,,|||||||||}}||.||||||,,,,)))))}}}..,),},,))}}},}}}}..,})}},|||||..(((((((....)))))))..{{|||||{||{{{,,,,)))))}.}}.},},,,,},},,..,}},)})},,}))).}|)},.,.})))}}})),....,,}}}}}..,}}}))}}}}}}|))}|}|,},}|||.,...,{{|{|,...})))))))).)))))))))).)))..))))))))))))),...((((((((((((((((.(((...})).))).....................)))))))).))))).))))).).))))})}}.|.))))).}),),))}.)))}.,)),.)}}))))}}..}}}}))})),||{|,.((((((..((((....)).)).))))))))}))))).)))))...,...(((((...)))))............................,..,,...(((({.....{{{|||,..)))))).}|,,|||||(((((,(((,(((((.....))))}.}}},)))))}..,}}}}}.))),})))...,))))))}}))),)))))))).....,.,...))))..))).))))))))...,.||{{{,|{,{{...}},||}}}}),),,,....)))))))..)))}.............)))...
Back