Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_032100.1

Sequence Length

2463 nt

GC Content

0.5229

AUGGGAGGGAGCUGCGCGCAGAGGCGCCGGGCCGGCCCGCGGCAGGUGCUAUUUCCUUUGCUGCUGCCUUUGUUCUACCCCACCCUGAGUGAGCCGAUCCGCUACUCGAUUCCGGAGGAGCUGGCCAAGGGCUCGGUGGUGGGGAACCUCGCUAAGGAUCUAGGGCUCAGUGUCCUGGAUGUGUCGGCUCGCAAGCUGCGAGUGAGCGCGGAGAAGCUGCACUUCAGCGUAGACGCGGAGAGCGGGGACUUACUUGUGAAGAACCGAAUAGACCGUGAGCAAAUAUGCAAAGAGAGAAGAAGAUGUGAGUUGCAAUUGGAAGCUGUGGUGGAAAAUCCUUUAAAUAUUUUUCAUGUCAUUGUGGUGAUUGAGGAUGUUAAUGACCACGCCCCUCAAUUUGAUAAAAAGGAAAUACAUUUAGAAAUUUUCGAAUCUGCAUCCGCUGGUACACGACUAUCGCUUGACCCUGCCACGGAUCCUGAUAUAAACAUAAACUCAAUUAAAGAUUAUAAGAUAAACUCUAAUCCUUAUUUUUCAUUAAUGGUUAGAGUUAAUUCCGAUGGUGGCAAAUACCCAGAGUUAUCUCUGGAGAAACUCCUAGACCGGGAAGAACAGAGAUCUCAUAGCUUGAUAUUGACUGCCUUGGACGGAGGGGACCCACCAAGAAGUGCCACCGCUCACAUAGAAAUUUCUGUCAAGGAUACCAAUGAUAACCCCCCGGUUUUCAGCAGAGACGAAUAUAGAAUUAGUCUUAGUGAAAAUCUGCCCCCUGGGUCCCCUGUGUUGCAAGUGACAGCCACUGACCAGGAUGAGGGGGUCAAUGCUGAGAUAAACUACUACUUCCGAAGCACUGCCCAGAGCACAAAACAUAUGUUCUCAUUGGAUGAGAAAACAGGUAUGAUUAAGAAUAACCAGUCAUUUGAUUUUGAAGAUGUAGAAAGGUACACCAUGGAAGUGGAAGCGAAGGACGGAGGUGGUCUCUCUACCCAGUGUAAAGUAAUCAUAGAAAUCCUUGAUGAAAACGACAACAGCCCAGAAAUAAUCAUCACUUCUCUCUCUGAUCAGAUUUUGGAGAAUUCACCUCCAGGAAUGGUUGUUGCCCUCUUCAAAACACGGGAUCUGGAUUUCGGAGGAAAUGGAGAAGUCAGGUGUAAUAUAGAAACAGACAUUCCAUUCAAGAUUUAUUCUUCUUCCAAUAACUACUACAAACUGGUGACAGAUGGAGCCCUGGACCGAGAGCAGACACCAGAAUACAAUGUCACCAUCGUAGCCACUGACAGGGGCAAGCCGCCUCUUUCUUCCAGUAGAAGCAUCACCUUGUAUGUCGCUGACAUCAACGACAACGCCCCAGUUUUCGACCAGACGUCCUACGUGGUCCACGUGGCCGAGAACAACCCGCCAGGAGCCUCCAUUGCGCAAGUGAGCGCCUCUGACCCGGAUUUGGGGCUCAAUGGCCACAUCUCCUACUCUAUAGUGGCGAGUGACCUAGAGCCCCUGGCGGUGUCGUCAUACGUGUCAGUGAGCGCGCAGAGCGGGGUGGUGUUCGCGCAGCGCGCCUUUGAUCACGAGCAGCUGCGCGCCUUCGCGCUCACGCUGCAGGCCCGCGACCACGGCUCGCCCACGCUCAGCGCCAACGUGAGCCUGCGCGUGUUGGUGGGAGACCGCAAUGACAACGCACCGCGGGUGCUGUACCCAGCUCUGGGUCCUGACGGCUCCGCGUUCUUCGAUAUGGUACCUCGCUCUGCAGAGCCCGGCUACCUAGUGACUAAGGUGGUAGCGGUGGACGCCGACUCGGGACACAACGCCUGGCUGUCCUACCACGUGCUGCAGGCCAGUGAGCCCGGACUCUUCAGCCUGGGGCUGCGCACUGGGGAGGUGCGCACGGCUCGAGCCUUAGGCGACAGGGACGCAGCCCGCCAGCGCCUGCUGGUCGCUGUGCGUGACGGUGGACAGCCGCCACUCUCUGCCACCGCCACGCUUCAUCUGGUCUUCGCAGACAACUUGCAAGAGAUACUGCCAGACCUCAGCGACCGCCCUGUACUCUCUGACCCCCAGGCUGAACUGCAGUUUUACCUGGUGGUGGCCUUGGCCUUAAUCUCAGUGCUCUUCCUCCUCGCCGUGAUUCUGGCCAUUGCCUUGCGCCUGCGACGCUCUCUCAGCCCUGCUACUUGGGACUGCUUCCAUCCUGGUCUCUGUGUCAAGUCUGGACCUGUAGUUCCCCCCAACUACAGUGAGGGGACUUUGCCUUAUUCUUAUAAUCUGUGCAUUGCACAUACGGGUACAAAAGAGUUUAAUUUCCUAAAAUGCAGUGUGCCCCUACAUUCCAAUGAAGACAUGGUUUGCAGUGUUUCUCCUGGAGCCUUAAUUCCACCUCAUGGUGGGGAGGAUUUGACUUCACAUCCUGAGACUCUGACUUCGGUGAGUUUCUCUUUUUUGUGUGUGAUUUAUCUAAUAGUCUACUAG

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-860.50 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -905.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 677.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((.(((((((((((((((((((.(((((((((((.((((((.((............(((((((((((.(((((((((((((((((((..((((....(((.(((.......))).))))))).....)))))).)))))))..(((.....)))(((((((((.....)))))))))((((..(((((((...)))))))..))))((...(((((..(((..(((....)))(.((((((((((((......((((((((((...((.((((.((((....)))...................(((.((..(((((((..((((((((((((.........))))))).......((((((.(((((.....))))).))))))(((((((.((((.......((((((..........))))))..(((.(.(((((.((((((((((...)))..))....)))))))))).).))).............................(((.((((((((((.(((........))).)))))))))).))).....((((((......((((((....))))))......((((.....))))....(((.(((.(((.....))).)))..))).((((((((.((((((((((......((((....))))...(((((....)))))...((...))..(((.((((....)))).)))(((((.....((..(((.....)))..)).....)))))....)))))))))).)))).)))).....))))))...)))).)))))))(((........)))..)))))..))))))).)))))(((((((((............(((((((...)))))))....(((((........)).)))...(((((........)))))......((((((((((....))))..(((((((..(((((((((.(((((...(((((.............(((((((..(((........((((((((((((...................))))......((((((((.......))))))))..))))))))(((............)))))).)))))))(((((((((((((..(((..((...........)).))).)))))))..(((.....)))))))))........((((....((((((((..((.....((((..............))))....)).))))))))..)))).)))))..)))))...)))))))))((((......))))((((((((((((.((((((((((((....(((.(((((((((((((((.(((...(.((.....)).)....))).)))))))...(((.((((.(((((.(((.....)))))).)).))))...)))....(((((((...((.(((.((.((.(((....))))).))))).))..)))))))))).))))).)))....))))))))).....)))..)))))))))))).((((((((((..............)).)))))))))))))))...(((((.((((((.((((......(((.((....))..))).....)))).)))))))))))...((((....)))).........(((((...)))))))))))..)))))))))..).)))))).)).))))))))....))).))))))))).).)))..))))).))))).))).)))))))))))(((((((((((...((........))..)))).)))).))))).)))))).))))...).))))))....((((((((((((.((((((((.....)))))))).(((....)))(((((.(((((((..(((((.(....).).))))(((((((((.(((((.((((((.(((..........))))))))).))))).......(((((..((((....(((....)))...)))).))))).))))))))))))))).)..))))).))))))))))))..(((((((((..((((((.(((..(((((..((((.(.(((...........))).).))))..)))))..((.((((....)))).)).......)))))))))..)))))))))..........)))))))))).............)))))))))))))((((.(((((((........))))))).........(((((...)))))...(((((((......((((......))))......))))))).(((((..(((.(((((...(((((.(((........)))))))).....((((((....)))))).(((((.((....)).)))))(((((((..........)))))))))))).))).)))))..........)))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{(((.(((((({(((((((((((({(((((((((((.((((((.(({..........,(((((((((({.((,,,,(((((((((((((..((({..,,(({.(((.......))).}))}))).....)))))).)))))))..,,({{{{.|||(((((((((.....))))))))){{((((((((((..,{{||||||{{(|||{,....}}}|}}))}}}||{,.,.}}}(.((((((((({{{,,,,..(((((((({(...((,(((({,(({....}))..{{{{{{,.{{{{.,{{{(,,{{,..((((,,({{(({(({({,,,{||,,,...,|||||||.,,....{(((((.(((((.....))))).)))))},,,,,{,...,}},,.,,,}}|,,.......,{{,|||||}..{((.(.(((((.(((((,,{({...,,}..})....)))))))))).}.))}.......,,...,........,.,},,..{{,.((((((((((.(((........))).)))))))))).,,},.{{{(((((({.....((((((....))))))......((((.....)))}....(((.(((.(((.....))).)))..))).(((((,,({{{{{,,|||.}}}}}..,|}}}}})),)}.....||,,}|})}|{{{{(({{..{.{((({.(({....|||(((({,{.(((((.,{{.....,,,.))))}.,)))}}})),{{{{,,|}}}}|,|||{,|{{.,,||{{...,,)))))}))))),},))))))},.{{{{{|,|,...,,,||{{||||||,.||,,|(({,{{,||......,,..{,(((((((...)))))),.,,.{{{{{,.......}}.,}}.,|{,{{{.{||{|.,.|.{(({......)))},|,|.},,))}),.|{{{,{{.}|||||||||.,,{{|...|||||,...,..}}}}}.|,.}|||}}|}|,,,....,|,||||||}}|......}}},..}}}}}}}})))|,..,..((((((((.......))))))}}.}))}}}}}},,.,,|,,,...}}|))}|}}|}}}}}}}((((({(((((({..(((..{(...........)).))).)))))))..,{{.....)))))))))........((({....(({{{{||,.{(,,,,,({((,,{.,,,,{.,...}}}}....},.})))}})),.)))}.}}}}}..{||||{..,,,)))))),{((......}))|((((((((((((.{(((((((((((..,,(((.{((((({{(((((((.(((..,(,((.....)).,.,,,))).)))))))...(((.((((.(((({,(((.....)))))).)).))))...)))....(((((((...((.(((.((.(({(((....))))).))))).))..)))))))})),))))).))}....)))))))))}..,.|}}..}))))))))))),(((((((({,{(,,........}.)).)))))))}|}}}}))}}.}}}))|||||{({((((.....{(({{((...|||...)})}....)))})))||,({(((((,((((....))))...}))},))).,))))))),)}))},,,.)))))}))),},.}}))))})).))))))))....))),))))))))).).))))}}))}..)))))}))).}))))))))))|{{((((((({...{(,,......}},,)))).)))).)}))).)))))).))))...}.)))))).,..{(((((((((((.((((((((.....)))))))).(((....)))(((((.(((((((..(((({.{,...}.),}))),((((((((.(((((.((((((.(((..........))))))))).))))).......(((((..((((....(((....)))...)))).))))).))))))))})))))).).,})))).)))))))))))}..(((({{,.{,{,{{{|||(((..(((((..((((.(.({(,..........})).).))))..)))))..))),{||,.,,))),,}}......|||||.}}}}..,)))})))),,,,.....,|||||}||||.,,,,,.....,,|||||}}}}}}})||||||((((((.,....,.)))))},.........(((((...))))},,.(((((((......((((......))))......))))))).,.{{,,(((,.(,{{{|||||..|.,{|,||||,...)))))}},....((((((....)))))),{((({.{(....)).))))}||||||{,,((...,|||))||}),|.....,},)})})}}|,,,,....)))}......