Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_032101.3

Sequence Length

2760 nt

GC Content

0.5232

AACAGAAAAGAAAACCAGCUCCCACACAGAGGCUCCCGGCUGCGCAGACCUUGCCCAGCACACCAGAUUGCCAGCUCCGAGACCCGGGACUCCUCCUGUCCUGGGCCGAAUGCUCUUUUAGCGCGGUAGAGUGCACUUUCUCCAACUGGAAAAGCGGGGACCCAGCGAGAACCCGAGCGAACGAUGGGAGGGAGCUGCGCGCAGAGGCGCCGGGCCGGCCCGCGGCAGGUACUAUUUCCUUUGCUGCUGCCUUUGUUCUACCCCACGCUGUGUGAGCCGAUCCGCUACUCGAUUCCGGAGGAGCUGGCCAAGGGCUCGGUGGUGGGGAACCUCGCUAAGGAUCUAGGGCUUAGUGUCCUGGAUGUGUCGGCUCGCGAGCUGCGAGUGAGCGCGGAGAAGCUGCACUUCAGCGUAGACGCGCAGAGCGGGGACUUACUUGUGAAGGACCGAAUAGACCGUGAGCAAAUAUGCAAAGAGAGAAGAAGAUGUGAGUUGCAAUUGGAAGCUGUGGUGGAAAAUCCUUUAAAUAUUUUUCAUGUCAUUGUGGUGAUUGAGGAUGUUAAUGACCACGCCCCUCAAUUCCGGAAAGAUGAAAUAAACUUAGAAAUCAGUGAAUCCGUCAGCCUGGGGAUGGGAACAAUUCUUGAGUCUGCAGAAGAUCCUGAUAUUAGUAUGAAUUCGCUGAGCAAAUACCAACUAAGUCCUAACGAGUAUUUCUCAUUGGUGGAGAAAGACAAUCCUGAUGGUGGCAAAUAUCCAGAAUUAGUAUUGCAGAAGACUCUGGACCGAGAAACGCAGAGCGCUCACCACUUGGUACUGACCGCCUUAGAUGGUGGGGACCCUCCCCGAAGCGGUACUGCUCAGAUAAGAAUCCUGGUAAUAGAUGCCAAUGACAACCCCCCAGUGUUCAGCCAGGACGUGUACAGGGUUAGCCUUCGGGAAGACGUGCCUCCAGGCACCUCCAUCCUGAGAGUGAAGGCCACUGACCAGGACGAGGGCAUCAACUCAGAGAUCACUUAUUCCUUCUUUGGUGUGGCUGACAAAGCUCAGCACGUGUUCUCUCUGGAUUACACUACAGGAAACAUUCUAACUCAGCAGCCUUUGGAUUUUGAAGAAGUAGAAAGAUAUACGAUAAACAUAGAAGCAAAAGACCGAGGAUCUCUCUCAACACGGUGUAAAGUAAUUGUAGAAGUUGUAGACGAAAACGACAACAGCCCAGAAAUAAUCAUCACGUCACUCUCUGAUCAGAUUAUGGAGGAUUCCCCUCCAGGAGUGGUUGUUGCCCUCUUCAAAACACGGGACCAAGACUCAGGGGAAAAUGGGGAAGUCAGGUGUAGCUUAAGUAGAGGUGUUCCAUUUAAGAUUCAUUCUUCUUCUAAUAAUUACUACAAGCUAGUAACAGAUGAGGCCCUGGAUCGGGAGCAGACCCCAGAGUACAACGUCACCAUCGCAGCCACAGACAGGGGCAAGCCUCCGUUAUCCUCCAGCAAAACCAUAACCCUGCACAUUACUGACGUCAAUGACAACGCGCCGGUUUUCGGACAGUCAGCCUACCUGGUCCACGUGCCAGAAAACAACCAGCCGGGUGCCUCCAUAGCGCAAGUCAGUGCCUCUGACCCAGACUUCGGGCUCAACGGCCGUGUCUCCUACUCUCUCAUUGCCAGCGACCUGGAGUCACGAACGCUGUCGUCCUACGUGUCCGUGAGCGCGCAGAGCGGGGUGGUGUUCGCGCAGCGCGCCUUCGACCACGAGCAGCUGCGCACCUUCGAGCUCACGCUGCAGGCCCGCGACCAGGGCUCGCCCGCGCUCAGCGCCAAUGUGAGCCUGCGCGUGUUGGUGGGCGACCGUAACGACAACGCACCGCGGGUGCUGUACCCUGCGCUGGGUCCCGACGGCUCCGCGCUCUUCGACACAGUGCCGCGGGCCGCGCAGCCAGGCUACCUGGUGACCAAGGUGGUGGCCGUGGACGCGGACUCGGGGCACAAUGCCUGGCUGUCCUACCACGUGGUGCAGGCCAGUGAGCCCGGGCUCUUCAGCCUGGGGCUGCGAACAGGCGAGGUGCGCAUGGUGCGUGCUUUGGGUGACAAGGACUCGGUCCGCCAGCGCCUGCUAGUCGCUGUAAGAGAUGGAGGACAGCCACCCCUUUCAGCCACUGCCACGCUGCACCUGGUGUUCGCAGAUAGCUUGCAAGAGGUACUGCCGGAUUUCAGCGACCAUCCCACACCCUCUGACUCCCAGGCUGAGAUGCAGUUUUACCUGGUGGUGGCCUUGGCCUUGAUUUCUGUGCUCUUUCUCCUCGCGGUGAUUCUAGCUAUUGCUCUACGCCUGCGACAGUCUUUCAGCCCUACUGCAGGAGACUGCUUUGAGUCAGUUCUCUGCUCCAAGUCCGGACCUGUGGGUCCCCCCAACUACAGUGAGGGAACGUUGCCCUAUGCCUAUAAUUUUUGUGUGCCUGGGGAUCAAAUGAAUCCAGAAUUUAAUUUUUUCACAUCUGUUGAUCAUUGUCCAGCCACACAAGAUAACCUCAACAAAGAUAGCAUGCUACUGGCUAGCAUUUUAACUCCCAGCGUUGAAGCAGAUAAGAAGAUUCUUAAACAGGUAAGUAUUUAAAAAUGUAUUUAAUCCUUUUUAUAUUACAAUAUGCCAAUAUAUUCCAAUAUAGUGGUAUUAUUUUAAGAUUCUAGAUAACUUCUUCAUAGAGUUCGCAAAAUAUAGGUCAAAUUUAUGGUUAUCAUUAUUAAAACAAAAGUUUAAAUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-935.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -982.52

Frequency: 0.0000

Diversity: 663.70

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

................((((........(((((.((((((((.((((..(((((((.............(((((((((....((((((((.......))))))))......((((...(((((.(((((((((((((((((((...((......((((.............))))......))...)))))))).)))))((((((((((((...))))..((((((((........))..)))))).))))))))))))))...)))))...))))...((((...........)))))))))))))....(((((((((((((((...((.(((...((((((((((((..(((..((.((((....(((((((.((((.((((((((........))).))))))))).....(((.....)))((..(((.(....))))..))........)))))))..)))).)).....(((((((((.(((((((..((.(((((..((..(((((((((.........)))))))))..)).((((((.(((((.....))))).))))))...((((.((((((...((((......(((........))).....))))...)))))).)))).((....((((((.(((((......((((((.....(((...(((.(((((..........((..(((((.((((.(((((..(((((((.((((.(((...(((((.(((((......(((((((..(((((((((.((.(.(((((............))))))..))((((((.(((.......)))..)).))))(((((...)))))...)))))))))............(((((((..(((..(((......(((((..((.(((((.....)))))))....))))).((.(((((((.((.(((((....))))).))..))))))).))...)))..)))))))))).((((((((.....((((((............))))))((((((((.....))))..)))))))))))))))))))..))))))))))...................((((((.(((((.....(((........)))..............)))))..)))))).))).)))).)).)))))..))))).))))....(((((.(.((....)).).)))))......((((((((((.(.......)))))..))))))(((((.....)))))(((((.(((....))))))))........)))))..)).))))).)))..))).....))))))))))))))))).....)).))))).))..))))))))))))))))......(((((.....))))))))....))))))))))))...))))).)))).((........))))))))).))))........))))))).....(((((..............))))).))))......((((((((..(((.(((......))).)))))).))))).....(((((......)))))........)))))))).)))))....((((......)))).((((...))))..((((((((((((((((((.((((...((.((.......)).))...)))).))))...)))))........(((((...(((((((....((((.((((.(((((((((((..((..(((....))))).)))))))......)))))))).))))..(((((((....((((((((..((((...))))....))))))))..((((((((.(((....)))...)))).))))..)))))))(((((((((......))))....)))))..)))))))...))))).(((((.(((((((((...(((((((((((((...)))....))))))).))).))))).)))).))))).....((((((((.((((...)))).))).))))))))))))))((..((((((((((((((((((((..((.((((((((.(((((.(((((..(((((....(..(((.((((..(((((.((...)).)))))...).))).)))..)...))))).....)).)))))))).)).)))))).))))))))))..........(((((...((..((((..........))))..)).)))))...))))))))))))..)).((((((..((((((((((((((((((..((((.((((((((......((((((((.....(((....)))...)))).))))(((((((((((.....)))..))))))))(((.(((.(((....)))))).)))...(((((....)))))(((..((....))..)))(((((((...............(((((((((.(((((((((((..((....((((.......))))....))..))))))....))))).)))))))))............((.(((.((((((.....)))))).))).))..)))))))((((.((.((...(((.(((((((.((((((((((........)))))))..)))..............((((((.(((((....))))).))))))...))))))).)))...)).)).))))..)))))..)))))))..)))))))......))))))))))).))))))...)))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.........{{.((({{(((.{{{{.,.(((((.((((((((.({((..(((((((..,..........(((((((((..,.((((((((.......)))))))),|,...((((...(((((.(((((((((((((((((((...{(......((((..{.....,.}..))))......)}...)))))))).)))))((((((((((((...))))..((((((((........)),.}))))).))))))))))))))...)))))...)))),,.{(({...........)))}))))))))).,.,(((((((((((((((...((,(((...((((((((((((.,,(({(({,,{{{{(.,(((({((.,(((((.{(,,((((((,{...,,,,.)))).))))..}).)))}).,)}||,.||{,|..,,,,)),,)}...{(.((((((.(({....)))...((((((,{{.,.{((((((((.{{.((....((((((((...{{{,,{{{{{.....{((({{.{,.{(.(((.((((((((.{{{........))}..)))))))}))).)},,)))))}.....}}}}}..((((((...((.(((..((.((((((({......,{{{{,({((,{.{,,{{{(((({({{..,,.....,,,.(((((((..{(((..,,..,{,,..,.{{{{.{{{|||.,,||.,|||},,,.{{{(.(((((,,(((......,|||,.}}}}}.}}|}{,,,...,})}},|,,{{{...{({,,,}}}|||{{{,||,|||.....|||||..}}.,)))(((({...))))),..,,)))}.))))}}}.......{((((((....,,{{{,...,...,,.,....})}}}|.)))))))}}})).)}))))}.,,})))|}},}}},(((((....))))).}))))))).))..))).)).)))))){|{{{{.((((((((..,{.((((((............))))))}|{{{(((({......)))))}))))))))))))))}},.))))))))....)),}.))))))}.}}.{((({((.(((((.....(((........)))..............)))))..)))))).)))))))}..)))))).)}.{{{{{{({{{{{{(((((.,.,{....)}}},||}||{,....{((((({(({.{.,......))))..)))))}(((((.....)))))|{{{{.{||,,.,)}}}))},....,{{{,,|{{.....{{{{,.,,....)))},..))).,)))}..{{{{{{{.{{{,..,}),)}))}}),..},,}}}}))))).,}}}}|||||,...,}}},,,,,..,.))))))))))))...)))}).)))).{{,.....,.}}})))))).)))).,.,.,.,|}}}}}}.,...{{{,.......{,......,,,,,.})))......((((((((..{((.(((......))).))}))).))))).....(((((......)))))........)))))))).)))))....{{{{..,,,,|}}}.,|||,,.}}}|..((((((((((((((((((.((((...((.((.......)).))...)))).))))...)))))........(((((...(((((((.,(.(((({((((.({{{(((((((..((..(((....))))).)))))))......}}))})}},}}||{{(((((((....((((((((..((((...))))....))))))))|.((((((((.{((....))}...)))),,)))..))))))),|||||{||.,,..,))))},,.,}}))},)))))))...))))).(((((.(((((((((...(((((((((({{{...}}}....))))))).))).))))).)))).))))).....((((((((.((((...)))).))))))))))))))))))(({{{(((((((((({((((((((,.{(.((((((((.(((((.(((((..(((((.,..(..(((.((((..(((((.({...}).)))))...).))).)))..).,.))))).....))}}))))))).)).)))))).)))))))))).......,..(((((...((..((((.,,...,,..))))..)).)))))..,})))))))))))}.)).{,,,,,.,||||||,|||,(((((((..((((.(((({{((......((((((((.....(((....)))...)))).))))((((((({({(,....}}),.))))))))(((.(((.(((....)))))).)))...(((((....)))))(((,.{{....)),.))){((((((......,........(((((((((.(((((((((((..((....{(((.......})),....))..))))))....))))).)))))))))............,|.{{{.((((((.....)))))).}}}.,,..))))))}((((.((.{{...(((.(((((({.((((((((((........)))))))..)))............,,((((((.(((((....))))).)))))}.,,})))))).)))...,,.)).))))..))))}.})))))))..))))))).....})))),)),},,.|,||||....)))}........